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[期刊] 中国农业科学
[作者]
陈银华 韩淑梅 沙爱华 朱红林 范吉星 谢俊 符秀梅 李小靖
【目的】分析红树植物盐胁迫下基因表达谱,分离识别耐盐相关基因。【方法】分别对红树植物-秋茄进行海水和淡水处理。分时提取总RNA进行等量混合,获得两种不同处理的样品池。采用cDNA-AFLP技术进行表达差异分析。【结果】256对引物组合共筛选了约15 000个cDNA片段,获得差异片段61个。差异基因表达模式分为2类,即海水处理诱导上升和下调表达,其中上升表达的基因片段为36个,下调表达的基因片段为25个;其中38个可视为已知基因。按照其功能分类可分为8大类:基础代谢、跨膜蛋白、信号转导、蛋白质代谢、转录因子、细胞骨架、抗病蛋白、假想蛋白,而其中又以基础代谢相关基因所占比重最大。【结论】构建了红...
[期刊] 华北农学报
[作者]
赵继荣 雒淑珍 张增艳 刘红霞
cDNA-AFLP是一种新的mRNA指纹图谱技术,具有重现性高、准确、可靠的特点,可对生物体转录组进行全面分析,广泛应用于基因表达特性研究、植物遗传标记分析和分离植物基因等方面。近年来随着该技术的不断发展和应用,在研究中取得了很多成果。本研究就cDNA-AFLP技术的原理和特点,在植物基因表达研究中的应用现状和发展前景进行了综述。
关键词:
cDNA-AFLP mRNA 基因表达
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
郭秀林 张正斌 李景娟 李广敏
cDNA-AFLP技术是以mRNA反转录的cDNA为模板进行AFLP分析,在保留AFLP多态性丰富、稳定性高、无需了解序列信息等优点的同时,集中显示了基因组表达序列的多态性差异,可对生物体转录组进行全面、系统的分析,并已成功地用于基因差异显示、表达基因遗传连锁作图和基因克隆等方面。文章综述了cDNA-AFLP在植物抗逆性相关基因表达特性分析及基因分离方面的应用。
[期刊] 林业科学
[作者]
安泽伟 陈根辉 程汉 赵彦宏 谢黎黎 黄华孙
以橡胶树11个抗寒无性系和12个不抗寒无性系为研究对象,利用cDNA-AFLP技术对23个橡胶树无性系低温处理前后的基因表达谱进行差异分析。结果表明:通过100对引物组合的扩增筛选,共获得12条在2组材料中表现一致的差异片段(GenBank登录号:GO269543-GO269554);BLASTn和BLASTx比对分析显示,TDF7-8,TDF5-15,TDF16-103条片段分别与植物抗逆相关的ABC转运蛋白、3-脱氧-D-阿拉伯庚酮糖-7-磷酸合成酶(DAHPS)、WRKY基因有较高相似性,其余9条片段在GenBank未比对到同源序列。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
任洪艳 孙霞 郑成淑 王文莉 孙宪芝 束怀瑞
【目的】分析不同光周期诱导下菊花茎尖差异表达的基因,筛选菊花开花相关基因。【方法】将菊花品种‘神马’分别进行长日照(16h/8h,昼/夜)和短日照(8h/16h,昼/夜)处理后,利用cDNA-AFLP技术筛选菊花茎尖差异表达的转录衍生片段(Transcript-derived fragment,TDFs),并对其进行验证、克隆、测序和生物信息学分析。【结果】64对引物组合检测到2 917个cDNA片段,获得差异表达的TDF共835个,其中584个为上调表达,251个为下调表达。对克隆测序成功的50个差异表达TDF进行分析,结果表明,36个TDF可以在NCBI数据库中找到同源序列。其中31个TD...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
廖宝文 陈玉军 郑松发 郑德璋 昝启杰 王勇军
分别从海南省的三亚、文昌、琼山,广西的防城,广东省的雷州、廉江和深圳采集木榄胚轴,同时种植在深圳湾作种源试验。通过4a的试验表明,7个种源间的成活率、树高、地径和单株生物量的差异达到显著或极显著水平,其中以琼山种源表现最佳,其成活率、树高、地径和生物量分别为90.0%、1.54m、4.97cm、1.358kg,比表现最差的文昌种源分别提高17.8%、17.3%、12.2%、55.9%,比本地的深圳种源分别提高5.5%、18.2%、9.0%、6.1%。根据种源综合评定结果,各种源的优劣排列顺序为:琼山、廉江、深圳、三亚、防城、雷州、文昌。鉴于文昌、雷州种源在深圳湾适应性差,不宜在本地区种植推广。
关键词:
红树林 木榄 种源 生长量 适应性
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
刘秀 郝海坤 庞世龙 姜英
以3个月苗龄的海芒果和黄槿实生苗为试材,进行不同盐分浓度胁迫试验,通过对苗高、地径和根、茎、叶干重进行测定,并分析叶片中叶绿素、丙二醛含量以及叶片相对电导率,综合评价分析了两种半红树植物的耐盐性。结果表明:海芒果可以在盐分浓度(盐质量/土壤质量)低于0.8%时维持生长,黄槿可在盐分浓度低于0.4%时生长,海芒果耐盐性优于黄槿。
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
邱凤英 李志辉 廖宝文
温室内对半红树植物水黄皮幼苗进行7个盐度(5、8、11、14、17、20、23 g.kg-1)的胁迫处理,对各处理下水黄皮生长量、生物量、生理指标和光合速率进行测定,结合10项生长信息指标进行主成分分析。结果表明:水黄皮的苗高增量、地径增量、叶片数增量、根、径、叶干重及总生物量随着盐度的上升均呈下降趋势,在盐度为5和8 g.kg-1的处理下保持较高值,盐度超过11 g.kg-1后骤降;光合速率在盐度为5、8、11 g.kg-1处理下保持较高值,最大值出现在盐度为8 g.kg-1的处理下;SOD活性、游离脯氨酸、质膜透性和丙二醛均有随盐度增大而呈上升趋势;在盐度为5、8 g.kg-1处理下主成分...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
李大志 陈霄 邓子牛 杨宇红 熊兴耀 谢丙炎
应用cDNA-AFLP技术研究番茄根部组织应答BABA(β-Aminobutyric Acid,β-氨基丁酸)诱导后基因转录谱,得到与植物获得性抗性相关的差异表达片段29条,克隆测序后获得10个上调基因片断.经过生物信息学分析和功能预测,其同源基因都是植物体在抗病、抗逆反应中的表达序列标签.根据功能可将其分为5类:第1类是防御反应基因,为病程相关蛋白基因P69家族成员,具有蛋白水解酶功能;第2类是转运蛋白基因,负责细胞内外离子、水和小分子物质的跨膜运输;第3类是信号传导蛋白,是Ca2+信号传导途径上重要的功能蛋白;第4类是分子伴侣蛋白BIF1,协助蛋白质的复性;第5类属功能未知基因.研究表明:...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
潘德灼 林伟彬 谭芳林 陈伟
以秋茄(Kandelia candel)叶片为试验材料,采用RT-PCR的方法获得秋茄查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)基因的cDNA序列,命名为KcCHS,GenBank登录号为KX673194.1.序列分析结果表明,KcCHS基因的cDNA序列长度为1170bp,编码389个氨基酸,属于CHS超家族.序列比对结果显示,秋茄与其他物种的CHS基因核苷酸序列具有较高的相似性,平均达到80%以上.系统进化分析显示,KcCHS基因与余甘子CHS基因亲缘关系最近.实时荧光定量PCR分析表明
关键词:
秋茄 查尔酮合酶基因 克隆 盐胁迫
[期刊] 林业科学
[作者]
乐通潮 张会儒 谭芳林
利用GIS的空间分析功能和影像自动分类原理,在软件ArcGIS10中构建"叶片信息测定器",并利用此工具测定50个不同类型参照面的面积、周长、长度和宽度,来验证自动分类法的可行性和精度。结果表明:面积、周长、长度和宽度的相对误差小于1.3%。分别采用自动分类法、网格法和Photoshop法测定福建漳江口红树林国家级自然保护区的6种不同红树植物叶片(桐花树、白骨壤、老鼠簕、秋茄、黄槿和木榄叶片样本各150个,共900个样本)的面积、周长、叶长和叶宽等叶片信息。结果表明:木榄叶片最大,白骨壤叶片最小,桐花树和白骨壤的叶片大小较为均一,木榄和老鼠簕的叶形较为狭长,黄槿的叶形最接近圆形;自动分类法最为...
关键词:
叶片信息 自动分类法 模型构建器 红树林
[期刊] 中国农业科学
[作者]
秘彩莉 张学勇 温小杰 刘旭
【目的】利用cDNA-AFLP技术对耐盐性受主效基因控制的小麦品系98-160盐胁迫前后基因表达的变化进行分析。【方法】对112个克隆的cDNA差异表达片段进行了Blast-x分析。【结果】约有65.2%的片段与已知基因有较高的同源性,从中筛选出18个与小麦耐盐性密切相关的片段,主要包括转录因子、与离子转运有关的蛋白、信号传导相关蛋白、胁迫相关蛋白以及与蛋白-蛋白相互作用有关的蛋白。以94号片段为基础,通过电子延伸和RT-PCR,克隆了小麦液泡膜ATPaseC亚基(TaVHA-C)的全长cDNA,Northern结果表明,在胁迫的早期(0~2h)TaVHA-C基因的表达基本不变,随着胁迫时间的...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
邱凤英 廖宝文 肖复明
温室内对半红树植物杨叶肖槿幼苗进行7个盐度(5、8、11、14、17、20、23 g.kg-1)的胁迫处理,并对各处理下杨叶肖槿的生长量、生物量、生理指标和光合速率进行测定,结合生理指标进行适应度分析。结果表明:杨叶肖槿的苗高、地径、叶片数、根、茎、叶干质量及总生物量随着盐度的上升均呈下降趋势,在盐度为5、8 g.kg-1处理下保持较高值,盐度超过11 g.kg-1后骤降;光合速率在盐度为5、8、11 g.kg-1处理下保持较高值,最大值出现在盐度为8 g.kg-1的处理;随着盐度的增大,杨叶肖槿幼苗叶绿素总量、叶绿素A含量和根活力呈下降趋势,超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛和游离脯氨酸呈上升...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
李云 郑德璋 廖宝文 郑松发 宋湘豫
采用培养皿-培养箱法和花盆育苗法研究了不同盐度与温度梯度对无瓣海桑种子发芽的影响。结果表明:不同盐度和温度梯度对种子发芽影响差异极显著。有利于种子发芽的温度为25~35℃,盐度为10g/L以下。当盐度为2.5~5.0g/L时,发芽率及胚根长度与淡水对照相一致,但生长粗壮,发芽条件最好;盐度为10.0~15.0g/L时,种子发芽率(出苗率)和胚根长度(幼苗高度)显著降低;盐度15g/L以上时,种子虽能部分发芽,但胚根生长慢,后期坏死,在大田育苗时表现为不能出土萌发。以淡水浇苗床可以降低盐度,促进种子萌发。在低盐度条件下,胚根对Na+、Cl-的吸收随时间逐渐增加而后趋向动态平衡状态,具主动富集的盐...
关键词:
红树植物,无瓣海桑,盐度,温度,种子发芽
[期刊] 林业科学研究
[作者]
廖宝文 郑德璋 郑松发 李云 陈相如 陈正桃
据物候观测,秋茄最佳采种(胚轴)在海南(琼山)为2月上旬至3月初,廉江在2月下旬至4月底,深圳为3月上旬至5月初;采用胚轴插植方法造林并在淤泥松软、风浪大的滩涂适当深栽(2/3种苗长度),半年成活率达88%,用1至多年生小苗或幼树造林,半年成活率小于37%;潮浸深度对幼苗和幼树生长影响极大,选择和规划造林地时,首先应确定宜林滩涂潮汐基面高程,该高程因各地潮汐特点不同而异,深圳湾应大于1.3m;造林初植密度以0.5m×1m或1m×1m适当密植为宜。
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