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[期刊] 中国农业科学
[作者]
张小白 昝林森 王洪宝 郝瑞杰 杨彦杰
【目的】研究秦川牛THRSP基因第一外显子184bp处C/T错义突变与部分肉质性状的关系。【方法】选取405头相同饲养条件下无亲缘关系的18～20月龄的秦川牛,利用PCR-SSCP技术对THRSP基因进行个体基因型分析;运用SPSS统计软件中的GLM模型分析该SNP与93头秦川牛部分肉用性能指标的相关性。【结果】该位点引发THRSP基因第51个氨基酸由缬氨酸(GTG)变为丙氨酸(GCG)。多态信息含量为0.3583,属于中度多态,杂合度为0.4676,有效等位基因数为1.8783。卡方检验显示该位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.01)。相关分析结果显示,该位点基因型与嫩度...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
宋付标 昝林森 王洪程 王洪宝 田万强 王虹 钟昕
【目的】对秦川牛Chemerin基因第2和第6外显子进行SNPs检测,并研究其与秦川牛肉质性状的相关性。【方法】采用DNA直接测序技术并结合PCR-SSCP方法,对324头2~3岁秦川牛Chemerin基因第2和第6外显子进行多态性分析,用最小二乘法拟合线性模型对Chemerin基因不同基因型与秦川牛肉质性状(宰前活质量、胴体质量、背膘厚、大理石花纹评分、系水力、眼肌面积和嫩度)进行关联分析。【结果】秦川牛Chemerin基因第2外显子868 bp处发生了A→G突变,第6外显子2 948 bp处发生了C→G突变;用PCR-SSCP方法检测得到AA、AG、GG、EE和EF 5种基因型,其基因型频...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
余横伟 桂林生 胡言 昝林森
【目的】探索脂肪酸结合蛋白3(Fat acid binding proteins 3,FABP3)及脂肪酸结合蛋白4(FABP4)基因对秦川牛肉用新品系肉用性状的影响,为秦川肉牛的选育提供理论基础。【方法】随机选择1824月龄健康的秦川肉牛571头,尾静脉采血10mL/头,提取血液DNA,PCR扩增FABP3及FABP4基因,检测其单核苷酸多态性(SNP)位点,并分析SNP位点基因型和单倍型组合对肉牛肉用性状(背膘厚、眼肌面积、肌间脂肪含量)的影响。【结果】测序发现,在FABP3基因第3个内含子上检测出1
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
刘嫣然 吴森 王晓宇 昝林森
【目的】研究秦川肉牛FGF2基因的多态性及其与肉牛生长和肉质性状的关联性。【方法】选取1824月龄的健康秦川肉牛384头,测定其生长和肉质性状指标,采集血样,采用DNA技术检测FGF2基因全部外显子中的单核苷酸突变位点,对突变位点进行基因型分型,研究其单核苷酸基因多态性(SNP),并以一般线性模型(GLM)分析该SNP位点与秦川肉牛生长和肉质性状的关联性。【结果】在第1、2外显子上未发现突变位点,在第3外显子上存在4个SNP突变位点:SV1(g.A54740>T),SV2(g.A54758>C),SV3(
关键词：
秦川肉牛 FGF2基因 多态性 关联分析
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
王卓 昝林森
【目的】分析秦川牛心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP)第1外显子的遗传变异与部分肉用性能指标的相关性。【方法】随机选择相同饲养条件下的146头18~20月龄秦川牛阉牛,采用PCR-SSCP结合测序技术,对秦川牛H-FABP基因第1外显子的遗传变异进行检测;运用SPSS统计程序中的GLM模型,分析其与部分肉用性能指标的关系。【结果】秦川牛H-FABP基因第1外显子130 bp处具有PCR-SSCP可检测到的SNP位点:Y=T→C。对该SNP位点具有不同基因型的个体进行分型并与88头秦川牛的肉用性状指标进行GLM分析,表明AB型个体的后腿围、背膘厚、大理石花纹等性状极显著高于AA型个体(P<0....
[期刊] 西南农业学报
[作者]
樊月圆 富国文 昝林森 李卫真 王绍卿
以6个牛品种(秦川牛、南阳牛、郏县红牛、鲁西牛、安格斯和夏南牛)共计717个个体为研究对象,采用PCR-SSCP方法与DNA测序相结合的方法,对PPARδ基因全部编码区及部分内含子区域的SNPs位点进行检测,并分析了SNPs位点与秦川牛的部分胴体、肉质性状的相关性。结果表明,在检测样本中,未检测到编码区的突变,仅在PPARδ基因第2内含子上发现了1个61 C→T的突变。χ2检验显示,在该位点,南阳牛和夏南牛处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),其余4个群体均处于Hardy-Wein-berg不平衡状态(P<0.05);除夏南牛群体处于中度多态,其余5个群体均属于低度多态;相...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
邓冠群 昝林森 王洪宝 桂林生
【目的】研究秦川牛SIRT3基因的多态性及其对秦川牛体尺、肉用性状的影响，以探索改善秦川牛体尺、肉用性状的分子育种方法。【方法】随机选择相近饲喂条件下468头18~24月龄健康秦川母牛，采用DNA直接测序技术进行SIRT3基因全区域遗传变异检测。运用SPSS16.0软件中最小二乘法拟合线性模型，对SIRT3基因不同基因型与秦川牛体尺(体斜长、体高、腰高、尻长、腰角宽、胸深、胸围和坐骨端宽)和肉质性状(背膘厚、眼肌面积和肌肉脂肪含量)进行关联分析。【结果】经DNA测序发现，秦川牛SIRT3基因在第4内含子上存在2个突变位点，分别为C22522T突变和C22680G突变，均存在3种基因型。χ2检验...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
邓冠群 昝林森 王洪宝 桂林生
【目的】研究秦川牛ＳＩＲＴ３基因的多态性及其对秦川牛体尺、肉用性状的影响，以探索改善秦川牛体尺、肉用性状的分子育种方法。【方法】随机选择相近饲喂条件下４６８头１８～２４月龄健康秦川母牛，采用ＤＮＡ直接测序技术进行ＳＩＲＴ３基因全区域遗传变异检测。运用ＳＰＳＳ１６．０软件中最小二乘法拟合线性模型，对ＳＩＲＴ３基因不同基因型与秦川牛体尺（体斜长、体高、腰高、尻长、腰角宽、胸深、胸围和坐骨端宽）和肉质性状（背膘厚、眼肌面积和肌肉脂肪含量）进行关联分析。【结果】经ＤＮＡ测序发现，秦川牛ＳＩＲＴ３基因在第４内含子上存在２个突变位点，分别为Ｃ２２５２２Ｔ突变和Ｃ２２６８０Ｇ突变，均存在３种基因型。χ２检验．．．
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
徐春瑛1 刘智1 傅颖滢1 李艳1 许晓波2 王厚江3 陈杰1*
以猪Integrinalpha9(ITGA-9)基因为候选基因,通过相关分析发掘该基因与三元杂种猪滴水损失性状关联的分子遗传标记。采用PCR-SSCP和RT-PCR方法对98头洋三元杂交猪ITGA-9基因第3内含子进行多态性检测,分析其与滴水损失性状和ITGA-9基因表达水平的关系。在ITGA-9基因第3内含子1791碱基处发现c.7698+1791 C>T突变,C和T等位基因频率分别为0.469和0.531。统计分析表明,CC型个体的滴水损失显著低于TT型个体(P<0.05),且CC型个体mRNA表达水平显著低于TT型个体(P<0.05)。ITGA-9基因mRNA表达水平与相应的滴水损失性状...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
徐春瑛 刘智 傅颖滢 李艳 许晓波 王厚江 陈杰
以猪整联蛋白α9(Integrin alpha 9,ITGA-9)基因为候选基因,通过相关分析发掘该基因与三元杂种猪滴水损失性状关联的分子遗传标记。采用PCR-SSCP和RT-PCR方法对98头洋三元杂种猪ITGA-9基因第3内含子进行多态性检测,分析其与滴水损失性状和ITGA-9基因表达水平的关系。结果表明:在ITGA-9基因第3内含子1791碱基处发现c.158+1731C>T突变,C和T等位基因频率分别为0.469和0.531。统计分析表明,CC型个体的滴水损失显著低于TT型个体(P<0.05),且CC型个体mRNA表达水平显著低于TT型个体。ITGA-9基因mRNA表达水平与相应的滴水...
[期刊] 华北农学报
[作者]
牛晓亮 李彥清 胡江 罗玉柱 郭淑珍 闫伟 杨树猛
为检测CAPN4基因在牦牛群体中的多态性,分析CAPN4基因启动子区突变对甘南牦牛胴体及肉质性状的影响,寻找与牦牛此类性状相关的分子遗传标记。采用PCR-SSCP技术检测830头甘南牦牛、大通牦牛和天祝白牦牛CAPN4基因启动子区突变并分析其多态性,运用SPSS 19.0软件中的GLM模型分析基因突变对甘南牦牛胴体及肉质性状的影响。牦牛CAPN4基因启动子区存在a.-1222G>A的单碱基突变,检测到AA、AB和BB 3种基因型。相关性分析结果表明,a.-1222G>A的突变对不同年龄甘南牦牛胴体和肉质性状有一定影响,其中4,6岁牦牛BB型个体熟肉率显著高于AA型或AB型(P<0.05);3,...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王芳霞
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
孙维斌 陈宏 雷雪芹 张夫千 雷初朝 李瑞彪 张英汉 昝林森
以 IGFBP- 3基因作为侯选基因 ,对秦川牛群体中 IGFBP- 3位点与秦川牛高档牛肉产量的关系进行了分析。结果发现 ,不同基因型对秦川牛高档牛肉产出率有一定影响 ,AA、AB及 BB型个体的屠宰率、净肉率及西冷、牛柳、眼肉和嫩肩肉的产率逐渐降低 ,但差异不显著 (P>0 .0 5 ) ;AA型个体的眼肌面积大于 BB型个体 (P
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
王晓宇 李安宁 桂林生 Sayed Haidar Abbas Raza 吴森 昝林森
【目的】探究秦川肉牛CGI58基因5′-调控区中1个新单核苷酸多态（single nucleotide polymorphism，SNP）位点与肉品质的关联性，及其对该基因启动子活性的影响。【方法】选取1824月龄的480头秦川肉牛为研究对象，测定其肌内脂肪含量、眼肌面积和背膘厚等肉品质性状指标。颈静脉采集试验牛血样，提取DNA样品，PCR扩增CGI58基因5′-调控区，通过直接测序技术检测其单核苷酸多态性，并使用SAS（version 8.1）提供的一般线性模型（GLM）对单核苷酸多态位点与肉质性状进行
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
刘亚轩 肖石军 郭长明 陈福珍 林金玉 陈晓燕 沈金清 杨锋 林长光
选择对仔猪腹泻有显著影响的产肠毒素大肠杆菌(ETEC)F4ac的受体基因MUC13为研究对象,采用PCR-SNaPshot判型与常规育种技术相结合的方法,对544头大白猪核心育种群进行基因判定及基因型与生长、肉质性状相关性的研究.结果表明,大白猪MUC13基因型分布大小为:腹泻易感杂合基因型GA>腹泻抗性纯合基因型GG>腹泻易感纯合基因型AA,腹泻抗性有利基因G的等位基因频率为0.669,腹泻易感不利基因A的等位基因频率为0.331.3种基因型个体达100kg日龄及其估计育种值(EBV)、达100 kg背膘厚及其EBV的大小为:AA>GA>GG;眼肌面积、肌内脂肪含量和估计瘦肉率的大小为:GG...
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