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[期刊] 华北农学报
[作者]
冷春玲
以柞蚕基因组DNA为材料,采用热不对称交错PCR(TAIL-PCR)技术分离出1 998 bp的DNA序列。将该序列与Genebank上的柞蚕丝素基因DNA序列(AF083334)进行比较分析结果表明,新钓取的DNA片断中1 758 bp的DNA序列为柞蚕丝素基因3′端非编码区未知DNA序列。TAIL-PCR技术为柞蚕丝素基因3′端非编码区未知DNA序列的钓取提供了一种简便、高效的方法。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
付田霞 王学英 李群 杨金琛
柞蚕丝具有多孔性结构。将脱胶后的柞蚕丝经物理及化学方法处理,控制反应时间以制得水解程度不同的柞蚕丝素粉;用扫描电子显微镜及透射电子显微镜观测不同水解时间的柞蚕丝素粉孔径的大小、分布及形状。研究结果发现,物理粉碎及磷酸水解2h以内制得的柞蚕丝素粉内部均具有多孔性结构。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
唐树戈 李宝华 夏泉
水解桑蚕丝是蚕丝在浓度为6mol·L-1的盐酸、恒温110℃的条件下水解24h,使蚕丝完全水解为氨基酸。本试验采用微波处理水解柞蚕丝,确定最佳水解条件为时间30min,功率中档,酸度1.5mol·L-1,恒温水解时间9～11h,恒温水解温度是100℃。实验中增加微波水解阶段,可大大缩短水解时间,而且产物水溶性好,稳定,放置1个月未见沉淀。水解产物的分子量在2000～3000之间。
关键词：
柞蚕丝 水解条件 硫酸 酸碱度
[期刊] 林业科学研究
[作者]
叶学敏 于雪丹 付其迪 郑勇奇 张川红
[目的]筛选出高变异率的叶绿体DNA序列,以进行血皮槭天然群体的谱系地理学研究。[方法]以血皮槭16个天然群体为试材,对叶绿体基因组20个非编码区序列进行测序研究,并利用筛选出的高变异率cpDNA序列初步分析了其遗传变异。[结果]序列比对和系统发育分析结果显示血皮槭cpDNA种内变异非常低,9个cpDNA序列检测到不同程度的变异位点,其中只有4个序列psbJ-petA、ndhF-rpl32、trnD-trnT和trnH-psbA表现出较高的变异水平。[结论]筛选出的4个高变异率cpDNA序列,可以在分子水
[期刊] 中国农业科学
[作者]
杨立勇 刘灶长 周立国 罗华程 罗利军
【目的】建立一种有效分离T-DNA插入突变体侧翼基因组序列的方法。【方法】分离侧翼的目标基因组序列是利用T-DNA标签法研究植物功能基因组学的一个关键步骤,笔者发展稳定高效的Actail-PCR分离技术。该技术一侧引物来自于T-DNA载体,另一侧引物为一个复性控制引物。复性控制引物在3'端为一个14bp的随机简并引物,在5'端非目标尾部序列接上一个通用引物,中间由5个多聚脱氧次黄嘌呤核苷(poly(dI))连接。【结果】Actail-PCR技术将随机简并引物重新编辑成复性控制引物,在40℃的低严谨条件下,3'端的随机简并引物可以与T-DNA插入突变体的侧翼目标区段随机的结合,扩增得到目标片段,...
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘俊莹 迟胜起 张剑峰 张华鹏 王聪聪
为明确马铃薯S病毒内蒙古分离株(Potato Virus S-Inner Mongolia,PVS-IM)3'端序列结构的特点,通过在马铃薯S病毒亚基因组增强子保守区域设计引物,运用3'RACE技术获得了马铃薯S病毒内蒙古分离株3'端序列。比对显示PVS-IM分离株属于PVSO(Ordinary)株系,为有针对性的防治病害以及预测产量损失提供依据;分析还发现PVSO和PVSA(Andean)两株系在外壳蛋白氨基酸N端和亚基因组增强子区域也存在可以区分两株系的差异,为区分两株系提供参考,也为PVS基因组功能以及作用机制的研究奠定基础。
[期刊] 华北农学报
[作者]
王兰萍 耿荣庆 冀德君 常洪 常春芳 李永红
运用PCR分段扩增测序法,获得普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛、水牛(沼泽型和河流型)MSTN基因编码区全序列,进而分析编码区序列的分子进化特征。结果显示,牛MSTN基因编码区全序列长1128 bp,种内核苷酸突变率为0~0.35%,种间核苷酸突变率为0.08%~1.42%。MSTN基因编码区序列存在密码子使用偏好性,29个偏好性密码子约占密码子使用总数的49.2%。核苷酸的替代以转换为主,转换/颠换比为2.9。非同义突变位点远少于同义突变位点,同义与非同义替代速率比全部小于或等于1,表明MSTN基因编码区序列并未受到达尔文正向选择的影响,却受到一定的负向选择作用。分子进化树显示,水牛、瘤牛独自成类...
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
何长青 王红霞 付甜 黄芳芳 闫丽君 徐刚标
利用单因素与正交设计试验,对影响观光木cpDNA-PCR扩增的主要因子进行优化,建立了观光木cpDNA-PCR最适反应体系(20μL),为:50 ng模板DNA、1×PCR buffer、0.2μmol·L-1引物、2 mmol·L-1MgCl2、0.3 mmol·L-1dNTP以及1 U Taq DNA聚合酶;筛选出了适合观光木分子谱系地理学研究的非编码区序列引物,为rpl32-trnL、psbJ-petA、3′rps16-5′trnK、atpI-atpH、petL-psbE。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
曹慧颖 王学英 夏润玺 石生林 李群
用硫酸水解柞蚕丝制取混合氨基酸,采用二次回归正交旋转组合试验,考察硫酸浓度、水解温度和水解时间对氨基酸回收率的影响。结果表明:硫酸浓度6.74～7.49mol·L-1,水解温度95.99～98.29℃,水解时间10h,制取混合氨基酸回收率达到85%。该条件下得到的混合氨基酸产品,经检测符合食品、化妆品添加剂要求。
关键词：
柞蚕丝 氨基酸 硫酸 水解 正交试验
[期刊] 水产学报
[作者]
王筱珊 胡智博 费荣梅
对虾白斑综合征病毒(WSSV)、桃拉综合征病毒(TSV)、传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)是威胁对虾养殖的重要病毒。为了调查这3种病在江苏境内的流行情况,根据世界动物卫生组织(OIE)推荐的《水生动物疾病诊断手册》的PCR检测法对2015年5月—2016年5月采集的1436尾对虾样品进行3种疾病的流行病学调查。结果显示WSSV阳性率为17.20%,TSV阳性率为0%,IHHNV阳性率为39.48%。对江苏不同地区分离出的5株IHHNV进行基因序列分析,数据显示这5个地区的毒株均属于Ⅰ型感染株,与
[期刊] 华北农学报
[作者]
钟鸣 张佳 郭志富 张丽 王磊
为探索朝鲜碱茅的耐盐,耐寒和耐旱的抗性机理,从已知禾本科植物朝鲜碱茅甜菜碱醛脱氢酶(BADH)基因的一段保守区序列,以此序列为研究基础,结合其他禾本科植物的BADH基因保守区序列设计引物,扩增出朝鲜碱茅BADH基因3′端序列及5′端部分序列共1 502 bp。经BLAST比对,结果表明,获得到的朝鲜碱茅BADH基因序列与羊草和大麦的BADH基因的同源性达到89%,含有保守的十肽序列和其后29位与酶功能有关的Cys。
[期刊] 水产学报
[作者]
贡成良 曹广力 薛仁宇 张传溪
序列分析表明:欧洲鳗鲡GH基因从ATG到TAG共计2393bp,有4个外显子、3个内含子,推测编码209个氨基酸。第一内含子存在3个重复单体构成的微卫星序列。同源性分析表明:欧洲鳗鲡GH可分为5个结构域,GDI-GD4区域与GH的活性有关,为GH与其受体专一性结合区域,GD5区域与GH分子的结构、稳定性有关。进化分析表明,鱼类GH分可成3个不同的组,欧洲鳗鲡GH基因属Ⅰ组,Ⅱ组可分含4个内含子基因及含5个内含子基因二个亚组,Ⅲ组GH基因有5个内含子。推测原始的GH基因在进化过程中,通过丢失或增加内含子导致基因歧化。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
高必达 程毅 朱水芳 喻锦秀
提取了7个药用菟丝子种样品的DNA,采用ITS序列扩增通用引物对其进行PCR扩增,并对PCR产物进行克隆和测序.根据所测得菟丝子ITS全长序列与其常见易混品所在属的代表植物ITS序列比对,设计了一对特异性引物并进行了PCR检测.结果表明,此对引物能将药用菟丝子种子与4种易混品区分开来,可以用于药用菟丝子的真伪鉴定.
关键词：
菟丝子 ITS序列 分子鉴定
[期刊] 淡水渔业
[作者]
罗宏伟 段辛斌 王珂 唐锡良 陈大庆
对三峡库区大银鱼(Protosalanx chinensis)、太湖新银鱼(Neosalanx taihuensis)和短吻间银鱼(Hem isalanxbrachyrostralis)共78尾个体的Cyt b基因全序列(1141bp)进行了分析。结果显示,序列有16个变异位点,总变异率为1.4%,其中13个为简约位点。大银鱼的32尾样本有6个单倍型,太湖新银鱼32尾样本有5个单倍型,短吻间银鱼14尾样本中有3个单倍型。大银鱼、太湖新银鱼和短吻间银鱼的单倍型多样性指数(h)分别为0.804±0.032,0.671±0.061,0.385±0.149;核苷酸多样性指数(π)分别为0.00146±...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
刘德林 李大伟 于嘉林 韩成贵
以来自于我国内蒙古、黑龙江和宁夏的3个甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)分离物为材料,采用反转录-PCR方法扩增不同RNA组分的基因片段,经cDNA克隆和序列测定后,与国外报道的BNYVV不同株系和来自于我国不同地区的BNYVV分离物之间进行比较分析。结果表明,BNYVV内蒙呼和浩特分离物(HU)RNA2中的 42 kD至 3’端蛋白编码区长度为 2 435个核苷酸(nt),与法国 F2分离物、德国 G1分离物、日本S分离物的一致性分别为97.7%,94.9%,96.2%;而黑龙江(HEI)、宁夏(NIN)和内蒙包头分离物(BAO)RNA3的 25 kD蛋白编码区则与以往报道的内蒙呼和浩特分离物(...
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