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[期刊] 中国农业科学
[作者]
王亚娴 杨藩 王华岩
【目的】Ｓａｌｌ４是一种锌指结构转录因子，对建立和维持动物多能干细胞具有重要意义。为探索猪Ｓａｌｌ４的表达和转录调控机制，克隆了猪Ｓａｌｌ４启动子，对其进行了功能验证和核心调控区的筛选。【方法】从猪基因组中克隆获得２．１ ｋｂ Ｓａｌｌ４启动子片段，并构建相应的报告载体；将报告载体ｐ Ｅ２．１转染不同种类的细胞，进行细胞特异性表达检测；采用实时荧光定量ｐＣＲ方法，检测Ｓａｌｌ４在猪不同组织和细胞中的表达变化；通过生物信息学方法，分析Ｓａｌｌ４启动子上各种关键顺式作用元件和潜在的转录结合位点；将多能转录因子ＯＣｔ４、ＳＯｘ２、ｋｌｆ４、ＭｙＣ、ＥＳＲＲａ／ｂ和ＳＭａｄ与Ｓａｌｌ４启动子共转染２９．．．
关键词：
猪 Sall4 启动子 多能性 转录调控
[期刊] 华北农学报
[作者]
赵艳 翟莹 李珊珊 杨晓杰 刘丽丽
研究大豆蔗糖结合蛋白基因(sbp)的表达方式及其启动子的调控活性,为揭示sbp基因表达本质及其启动子功能研究、利用提供理论依据。利用qRT-PCR方法,检测sbp基因在不同逆境胁迫条件下及不同组织中的表达方式;利用PCR方法,克隆sbp基因5'端上游序列并对其进行预测分析;在转基因烟草中,研究sbp基因启动子在干旱胁迫条件下及不同组织中的调控活性。sbp基因受干旱诱导上调,而在盐、低温、ABA诱导下表达下降。sbp基因在大豆根、茎、叶、花中的相对表达量低,而在种子中的相对表达量高。克隆获得sbp基因5'端
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李辉 刘庆友 石德顺
【目的】为获得高启动效率的乳腺特异启动子，对荷斯坦奶牛、娟姗牛和奶水牛的β－酪蛋白基因启动子进行比较研究。【方法】对Ｇｅｎｂａｎｋ中所收录的荷斯坦奶牛、娟姗牛和水牛β－酪蛋白基因启动子序列进行比对分析，按照保守序列分别设计启动子区和３′端ｐｌｏｙ ａ序列引物，同时设计人ＩＦｎα－２ｂ基因和ｅＧＦｐ－ｎｅｏ筛选序列引物并引入预先设计的酶切位点以方便载体构建。采集静脉血液，提取基因组Ｄｎａ。ｐＣＲ克隆β－酪蛋白基因启动子区和３′端ｐｌｏｙ ａ区，同时以实验室保存质粒为模板克隆人ＩＦｎα－２ｂ基因和ｅＧＦｐ－ｎｅｏ筛选序列。测序正确后，将各片段按设计顺序依次插入ｐ ＭＤ１８－Ｔ骨架中，构建成ｐ ＨＳ．．．
[期刊] 中国农业科学
[作者]
杜星 曾强 刘禄 李琦琦 杨柳 潘增祥 李齐发
【目的】前期研究证实linc-NORFA作为母猪繁殖性状候选基因参与调控卵泡闭锁与卵泡颗粒细胞凋亡过程,进一步鉴定二花脸猪linc-NORFA核心启动子并分析其转录调控机制,为解析linc-NORFA介导猪卵泡闭锁的分子机制奠定理论基础并提供新的研究思路。【方法】采集二花脸猪耳组织样品并提取基因组DNA,利用PCR扩增和测序技术获得二花脸猪linc-NORFA5′调控区序列;通过构建缺失表达荧光报告载体并利用荧光素酶活性试验鉴定二花脸猪linc-NORFA核心启动子;利用生物信息学分析二花脸猪linc-NORFA核心启动子区序列特征与潜在的转录因子结合位点;构建猪FOXO1真核生物表达载体并进一步采用Western blot、qRT-PCR以及荧光素酶活性试验分析转录因子FOXO1过表达对二花脸猪linc-NORFA转录的影响;利用染色质免疫沉淀(ChIP)技术鉴定转录因子FOXO1与二花脸猪linc-NORFA核心启动子区的结合能力。【结果】通过克隆测序与序列拼接共获得二花脸猪linc-NORFA 5′调控区序列1 734 bp,其中包含两个潜在的CpG岛;利用荧光素酶活性试验证实linc-NORFA核心启动子位于-988—-684 bp(转录起始位点作为+1),生物信息学分析表明二花脸猪linc-NORFA核心启动子上包含多个转录因子的结合元件,例如ESR2、FOXO1、E2F1、BRCA1以及NFIC等;另外,ChIP试验还证实在猪卵巢颗粒细胞中FOXO1作为转录因子直接靶向结合在linc-NORFA的核心启动子区;进一步通过试验证实FOXO1过表达可显著下调linc-NORFA核心启动子区活性(P<0.01),同时显著抑制体外培养的猪卵巢颗粒细胞中linc-NORFA的表达(P<0.01)。【结论】鉴定了二花脸猪linc-NORFA核心启动子区,同时证实FOXO1作为转录因子能够与linc-NORFA核心启动子区特异性结合,进而抑制后者的转录活性与表达。研究结果对探究linc-NORFA在猪卵泡闭锁过程中显著下调的分子机制具有重要意义。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
韩立强 王月影 王林枫 朱河水 钟凯 褚贝贝 杨国宇
【目的】固醇调节元件结合蛋白１（ＳＲＥＢＰ１）作为核转录因子，对于细胞脂肪合成酶基因的表达发挥着重要的调控作用。论文旨在奶牛乳腺上皮细胞中研究ＳＲＥＢＰ１对于ＳＣＤ１基因启动子的转录调控作用，为进一步明确ＳＲＥＢＰ１对于靶基因的转录调控机制提供理论基础。【方法】以荷斯坦奶牛乳腺组织的Ｃ ＤＮＡ为模板，采用分段克隆的方法获得ＳＲＥＢＰ１基因的编码序列，通过重组酶与ＰＣ ＤＮＡ３．１载体进行重组环化构建ＰＣ ＤＮＡ３．１－ＳＲＥＢＰ１表达载体，将构建的载体测序验证后提取质粒，转染奶牛乳腺上皮细胞。以ＥＩＦ３Ｋ基因为内参基因，采用荧光定量ＰＣＲ检测ＳＲＥＢＰ１基因ｍ ＲＮＡ的表达差异；采用免疫荧光的．．．
[期刊] 中国农业科学
[作者]
韩凤桐 林秀坤 刘娣 吴宁 廖冰
【目的】Sry是大多数哺乳动物雄性性别发育的决定基因,但人们仍未找到其表达的调控规律,本试验对牛Sry5′端调控序列作了初步的研究,为深入研究牛Sry的表达调控奠定了基础。【方法】克隆牛Sry5′端侧翼1056bp长的DNA序列,利用生物信息学方法对这一区域内潜在的转录起始位点进行了预测,并构建了10个不同长度的缺失牛Sry5′部分侧翼序列的报告基因载体;进一步分离了胎牛生殖嵴,进行生殖嵴细胞的原代培养,并对胎牛生殖嵴细胞进行了性别和特征鉴定;最后利用荧光素酶双报告基因分析系统,在生殖嵴细胞内检测了牛Sry核心启动子区域的位置。【结果】体外培养的生殖嵴细胞可以表达雄性生殖嵴细胞的特征基因Sry...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
赵毅昂 魏大为 张久盘 宋雅萍 姜超 王兴平 罗仍卓么 马云
为鉴定牛叉头框转录因子1(Forkhead box,FoxO1)的核心启动子区及其关键转录因子，利用PCR扩增牛FoxO1基因的启动子序列，同时设计7个逐段缺失片段引物扩增其启动子逐段缺失片段，进一步将其构建双荧光素酶报告载体并分别转染小鼠C2C12和3T3-L1细胞系，通过检测不同缺失片段荧光素酶报告载体的活性，以确定牛FoxO1启动子的核心区域；使用Genomatix和JASPAR在线软件预测牛FoxO1基因启动子核心区域的关键转录因子，采用定点突变试验在小鼠C2C12细胞系中初步鉴定预测的关键转录因子对FoxO1的转录调控作用。结果表明：1）成功扩增了牛FoxO1的启动子区1 920bp序列，获得了FoxO1基因启动子序列的7个逐段缺失片段序列；2）经双荧光素酶报告试验进一步证实，牛FoxO1基因核心启动子位于-285/-27区域；3）预测并通过定点突变试验鉴定出MEF2A、KLF4、HOXA5和KLF5转录因子对FoxO1基因的转录活性具有关键调控作用。综上，本研究初步鉴定出牛FoxO1基因启动子核心区（-285/-27）内转录因子MEF2A、KLF4、HOXA5和KLF5对FoxO1基因有重要的转录调控作用，为FoxO1基因对牛肌肉脂肪发育过程中的转录调控机制奠定了一定理论基础。
[期刊] 华北农学报
[作者]
汪亮 李忠秋 唐晓东 张海峰 刘娣 张冬杰
ATP6V0A4基因编码V-ATP酶的一个亚基,与H~+转运相关,是遗传性远端肾小管性酸中毒的致病基因。在前期研究中发现,民猪在遭受冷应激后其背脂中ATP6V0A4基因的转录水平发生了显著上升(P
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
巨婷婷 吕文涛 于渤洋 刘洋 姜美华 许玲 赵泽平 尹靖东
为研究胞内氯离子通道5基因(Chloride intracellular channel 5,CLIC5)广泛参与调节细胞内的各项生理活动与生化反应,并探讨该基因自身的表达调控机制,以小鼠基因组序列为模板,利用PCR技术扩增小鼠CLIC5基因5′上游调控序列,将其插入荧光素酶报告基因表达载体(pGL3-Basic)中,同时采用5′侧翼区缺失的方法构建了7个缺失不同DNA片段的荧光素酶表达载体。重组质粒与海肾荧光素酶载体(phRL-TK)共同瞬时转染HEK-293细胞,经双荧光素酶报告基因活性分析后,确定CLIC5基因的核心启动子区。利用生物信息学方法预测其中转录因子结合位点及启动子区甲基化状况...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
郑艳玲 唐爽 张涌
为了克隆山羊β-酪蛋白基因的调控区并检测5′调控区的启动子活性,利用Long PCR技术对西农莎能奶山羊β-酪蛋白基因(CSN2)5′和3′调控区进行了克隆(5′调控区分两段进行克隆,3′调控区进行直接克隆)、测序,将克隆的5′调控区的两个片段通过共有的单一性酶切位点HindⅢ融合成一个长为6.7 kb的片段,用其替代表达载体pEGFP-C1上原来的启动子CMV,指导报告基因绿色荧光蛋白(GFP)在山羊乳腺上皮细胞中的瞬时表达。结果表明,克隆的GC 3.3、GC 4.3、GC 6.6 3个片段与GenBank中登录的山羊CSN2基因相应序列相比,同源性均为99%,其包含了TATA box、GC...
[期刊] 华北农学报
[作者]
龙熙 袁晓 陈力 吴平先 张亮 潘红梅 郭宗义 柴捷
旨在初步分析猪CRYBB2的启动子活性以及转录调控元件。利用生物信息学分析、PCR扩增、基因克隆、细胞转染、双荧光素酶活性分析等方法，获得了CRYBB2启动子区域的序列特征，构建了不同片段长度的CRYBB2启动子区的双荧光素酶报告基因载体并分析了其荧光素酶活性，进而确定了CRYBB2的核心启动子区域以及关键的调控区域，最后还预测了关键调控区域的转录因子及其结合位点。结果表明，CRYBB2候选启动子区可能包含4个核心启动子以及1个CpG岛，-52～-3 bp可能为CRYBB2基因的核心启动子区域，-505～-19 bp为CRYBB2基因启动子的关键调控区域，且发挥正向调节作用，而-2 060～-505 bp不存在任何对CRYBB2基因启动子活性有影响的调控元件；CRYBB2启动子的关键调控区域包含多个潜在的转录因子结合位点，如TBP、NFIA、FOXP1、NKX2-8、KLF4、Tcf3、Crx、SNAI3、Rfx1和CREB1等。为进一步研究猪CRYBB2的表达机制奠定了基础。
[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
贾小明 张焕玲
为了研究CaMV35S启动子驱动的FT基因对转基因杨树Populus早期开花的影响,利用Gateway技术构建了35S::FT基因表达载体,并对杨树进行了遗传转化,从转基因杨树花的发育、花器官变异等方面初步探讨了35S::FT促进杨树早期开花性能。结果表明:35S::FT转基因杨树分生组织属性的改变及初始花结构的形成发生于试管培养阶段;花开始发育后如不及时把开花植株继代培养或转至土壤温室培养,初始花结构会凋谢枯萎,不能继续发育。转基因植株花器官的分化与发育发生于温室培养阶段的3~5周内,能够分化出典型的花器官,但发育不完全,具雌雄蕊、花盘结构,无成熟苞片结构,雄蕊不能成熟发育。35S::FT诱...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
张晨 王利凯 包亮 龙湍 陈春丽 须健
为研究水稻中PLT基因的表达及功能,利用同源序列分析,在水稻基因数据库中检索到2个与拟南芥PLT基因高度同源的基因序列,命名为OsPLT7和OsPLT11。根据进一步预测的PLT启动子序列设计引物,以水稻品种中花11的基因组DNA为模板,用PCR方法扩增得到PLT7、PLT11的启动子片段,克隆至含有报告基因的表达载体上并转化水稻。通过GUS染色观察T1代转基因阳性植株,发现OsPLT7和OsPLT11在水稻根部干细胞小生境和中柱部位表达,表达模式类似于其同源基因在拟南芥中的表达谱。
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
陈笛 王鹏杰 郑玉成 林浥 郑知临 陈桂信 叶乃兴
根据茉莉花转录组数据,采用RT-PCR技术,克隆了茉莉花甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶(MVD)基因,命名为JsMVD(GenBank登录号为MH311041.1).采用染色体步移技术分离JsMVD基因5′端上游调控序列,通过实时荧光定量PCR技术检测JsMVD基因在茉莉花植株不同组织及不同激素处理下的表达水平.测序结果表明,JsMVD基因全长cDNA序列的长度为1 500 bp,包含长度为1 269 bp的开放阅读框(ORF),共编码422个氨基酸,亚细胞定位预测该蛋白可能位于细胞质上.JsMVD蛋白含有GHMP激酶N-端和C-端保守结构域,具有多个保守氨基酸残基及ATP结合位点,与野生油橄榄的相似性最高,相似系数达到88%,且进化树显示两者的亲缘关系最近.JsMVD基因5′端启动子序列长度为893 bp,该调控序列包含多种植物激素响应元件和光响应元件.实时荧光定量PCR技术检测结果表明,JsMVD基因在成熟花中的表达量最高,从高到低依次为成熟花、花蕾、茎、叶、根,且受GA、IAA和ABA不同程度的诱导.
[期刊] 西南农业学报
[作者]
赵艳 刘晓鑫 翟莹 曹慧 吴琼
在不同逆境胁迫、激素条件下,检测大豆各器官中lox2基因表达方式,并对其启动子的序列及功能进行预测。利用qPT-PCR方法,检测大豆lox2基因表达方式;此外,通过PCR方法,克隆获得大豆lox2基因5’端上游序列,利用启动子在线软件进行预测分析。结果表明,该基因受干旱诱导,诱导表达量随处理时间增强;在盐、低温、ABA条件处理下,诱导表达下降,下降的表达量不随处理时间而变化。大豆lox2基因在大豆根、茎、叶、花中的相对表达量低,而在种子中的相对表达量高。克隆获得大豆lox2基因5’端上游2016 bp序列
关键词：
大豆 lox2基因 启动子 克隆
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