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[期刊] 华北农学报
[作者]
张素君 唐丽媛 李兴河 王海涛 刘存敬 张香云 张建宏
通过关联分析挖掘与陆地棉黄萎病抗性关联的分子标记,为陆地棉抗黄萎病性状的分子检测及标记辅助选择育种提供有益参考。选用在棉花基因组上均匀分布多态性较好的237个SSR标记对214份陆地棉材料的基因组变异进行了扫描,并使用Power Marker v3. 25分析群体的遗传多样性,Structure 2. 2分析群体结构,在此基础上结合3年黄萎病抗性鉴定数据,采用Tassel 2. 1中的GLM(Q)方法挖掘与黄萎病抗性相关的QTLs。结果表明,不同陆地棉材料黄萎病发病情况差异显著; 237个标记共检测到280个多态性位点,共计695个等位变异,变异范围2～6个,平均等位变异数2. 479 0;按照基因型数据可将该群体划分为2个亚群;通过关联分析,在不同年份中发掘与黄萎病抗性显著关联(P
关键词：
陆地棉 SSR 黄萎病抗性 关联分析
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
聂以春 刘金兰 刘西钊
对陆地棉栽培种与四个陆地棉半野生种族系杂交的F_2—F_4的抗枯、黄萎病特性鉴定筛选结果表明:四个组合后代抗黄萎性较强,病指在11.5%以下;鄂沙28×莫尔利棉和尖斑棉两个组合后代与对照86—1比较,抗枯萎性最强,鄂沙28×墨西哥棉和阔叶棉组合后代抗枯萎性较差,说明四个半野生种族系具有较强的抗萎性因子存在。对陆地棉与半野生种族系杂交低世代进行连续抗病筛选,抗病效果明显提高。
[期刊] 华北农学报
[作者]
贾银华 孙君灵 周忠丽 潘兆娥 何守朴 庞保印 王立如 杜雄明
黄萎病是棉花主要病害之一,鉴定筛选抗性种质为培育抗病品种提供了材料基础。通过318份国内外陆地棉材料的黄萎病鉴定,筛选到5份抗黄萎病材料,144份耐黄萎病材料。国外材料的黄萎病抗性由于国内材料,黄河流棉区的材料黄萎病抗性优于其他棉区。黄萎病病情指数与棉花纤维长度、纤维强度、马克隆值、整齐度指数存在负相关性。
关键词：
棉花 种质资源 黄萎病 抗性鉴定
[期刊] 华北农学报
[作者]
胡子曜 李秀青 代培红 雷建峰 柳建飞 赵燚 邓嘉辉 刘超 刘晓东 李月
探究陆地棉细胞色素P450基因GhP450-94C1在棉花黄萎病反应中的生物学功能,为棉花黄萎病抗性基因挖掘及抗病育种奠定基础。通过转录组筛选,克隆获得一个细胞色素P450基因GhP450-94C1,利用生物信息学的方法分析该基因的理化性质,通过荧光定量PCR技术分析GhP450-94C1在黄萎病侵染下的表达模式,利用病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术初步探究其在棉花抗黄萎病反应中的生物学功能,结果表明:克隆获得一个陆地棉细胞色素P450基因GhP450-94C1,其开放阅读框(ORF)为1503bp,编码一个含500个氨基酸的酸性、亲水性、不稳定的跨膜蛋白,分子式为C_(2597)H_(4025)N_(691)O_(725)S_(22),相对分子质量为57.23ku,定位于内质网膜,含有一个P450结构域;有86.45%的概率存在信号肽;二级结构预测显示该蛋白含有24个α螺旋和8个β折叠;该基因响应黄萎病菌侵染,抑制其表达后植株对黄萎病菌的敏感性增强;初步证明GhP450-94C1是棉花黄萎病抗性反应的一个正向调控因子。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
杜威世 杜雄明 马峙英
以高抗黄萎病的海岛棉品种" 15-3493"和高感黄萎病的陆地棉品种"石河子875"的175个F2代单株作为标记群体,采用BSA法筛选多态性引物,构建了1个包括3个SSR引物在内的连锁群。通过Mapmaker软件将与黄萎病抗性有关的1个位点定位在该连锁群,该位点与SSR标记BNL3556相距13.1cM,可解释表型变异方差的50.1%,为主效基因位点。
关键词：
棉花 黄萎病 分子标记 连锁图 SSR
[期刊] 华北农学报
[作者]
李根源 汪若海 闫文斌 王浩 马文龙
在对棉叶螨抗性性状(受害级)进行双列杂交分析中,经配合力分析和遗传效应分析表明,加性效应和显性效应对抗性表现的影响均显著。相对来说,加性效应更为重要。基因的分布是不对称的,显性基因多于隐性基因。显性基因是受害级性状的减效基因,隐性基因是增效基因。该性状的狭义遗传力N~2=88.20％。
关键词：
棉叶螨 遗传效应 遗传参数 配合力
[期刊] 华北农学报
[作者]
陆承哲 贾培 武盼 唐叶 石琳芳 陈爱民 彭清忠 吴家和
鉴定陆地棉SKS基因家族成员，解析其演化规律，为棉花抗性育种提供新的候选基因。基于已公布的陆地棉遗传标准系TM-1基因组数据，以陆地棉品种中棉-14为试验材料。通过生物信息学对陆地棉SKS家族成员进行全基因组鉴定，并对其家族成员的染色体分布、进化关系、基因结构、共线性关系等进行预测分析。通过实时荧光定量聚合酶链式反应分析GhSKS13的表达模式，并利用病毒诱导的基因沉默技术初步探究陆地棉SKS13在棉花抵御大丽轮枝菌过程中的功能。共鉴定到48个陆地棉SKS基因，不均匀分布于陆地棉19条染色体上，聚类分析分为5个亚组，基因序列具有较高保守性，共线性关系分析显示，陆地棉SKS基因家族受到纯化选择。组织模式表达分析显示，GhSKS13在陆地棉根组织中优势表达，并且受大丽轮枝菌诱导显著上调表达。GhSKS13沉默植株对大丽轮枝菌抗性减弱，同时抑制病程相关基因GhPR1、GhPR2、GhPR3和GhPR5表达。大丽轮枝菌入侵GhSKS13沉默植株，其过氧化氢(H_2O_2)沉积明显低于对照，暗示GhSKS13促进活性氧(ROS)的形成。总之，明确了陆地棉SKS家族成员的系统进化关系、染色体分布特征和基因结构特征；并阐明了GhSKS13参与棉花对大丽轮枝菌抗性反应。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
姚明镜 张献龙 刘金兰 孙济中
对经γ－射线诱变并利用棉花黄萎病菌培养滤液筛选获得的Ｍ１１０１０１０１０、Ｍ２２０１０和Ｍ２１０１０１５３个抗性细胞系及“珂字２０１”对照细胞系的几个生理生化指标的测定结果表明，在黄萎病菌培养滤液处理的７ｄ内，抗性细胞系的可溶性蛋白质含量、过氧化物酶和多酚氧化酶活性均为先低于后高于对照细胞系。３个抗性细胞系的单宁含量高于对照，棉酚含量低于对照。对Ｍ１１０１０１０１０的测定表明，苏氨酸、谷氨酸、胱氨酸的游离含量增加，缬氨酸、亮氨酸、苯丙氨酸和脯氨酸的游离含量降低。
关键词：
陆地棉 黄萎病 抗性细胞系 生化指标
[期刊] 中国农业科学
[作者]
温小杰 马峙英 王省芬 张桂寅 李喜焕
采用SSR和AFLP分子标记技术,对中国不同年代培育的54个抗枯、黄萎病陆地棉品种(系)分子水平的遗传差异进行了研究。22对SSR引物和20个AFLP引物组合共扩增出446个多态性标记,每个品种平均8.26个。采用SPSS11.5软件计算欧氏距离,中国抗病品种间欧氏距离分布在5.568～11.790之间,平均值为8.906;单一品种欧氏距离平均值为8.530～10.011,高于欧氏距离总平均值的品种共10个,占品种总数的18.52%;85.55%的品种欧氏距离值分布于7.000～10.000之间,表明中国供试抗病品种群体的遗传基础较为狭窄。作为比较对照的4个国外品种间欧氏距离变化在9.055～...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘其宝 李黎贝 张驰 宿俊吉 魏恒玲 王寒涛 喻树迅
【目的】筛选与陆地棉叶片叶绿素含量性状相关联的分子标记,挖掘其优异等位变异及典型材料,为陆地棉分子标记辅助育种提供技术支持。【方法】在3年6个环境中,对185份陆地棉品种(系)组成的自然群体进行倒4叶叶绿素相对含量(soil and plant analyzer development,SPAD)的测定,每年分3个时期(打顶后0、10和20 d)。采用Power Marker 3.25软件计算各位点的多态性信息含量,以分析群体的遗传多样性。利用STRUCTURE 2.3.4软件计算群体结构矩阵(Q),利用
[期刊] 西南农业学报
[作者]
牟方生 毛正轩
利用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术测试分析了棉花萌动种子及棉株感病前后叶片的多酚氧化酶（ＰＰＯ）同工酶。结果表明，罹病反应中叶片ＰＰＯ同工酶谱的变化差异可作为鉴定抗枯、黄萎病大小的生化指标；棉花萌动种子ＰＰＯ同工酶在不同抗枯黄萎病品种间及品种内个体之间表达均存在多态性，确认了分别与抗枯萎病和抗黄萎病性状相关的两条标记酶带。根据这两条标记酶带频率的大小，可鉴定棉花品种（系）的抗性水平。同工酶测试分析后的种子经室内培养后在田间仍能正常生长，其标记酶带与田间抗病性表现一致，因而可作为筛选抗病品种的一种室内方法。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
叶春秀 李全胜 李有忠 庄振刚 谢宗铭
为弄清新疆早熟陆地棉的遗传背景、群体结构及为进一步进行关联分析提供理论支持,运用SSR分子标记技术对41份新疆北疆地区近50年来选育及推广的早熟陆地棉品种进行遗传多样性及群体结构分析。结果表明,8对多态性较好的引物共检测到50个位点,其中多态性位点为33个,多态性比率为66%;PIC(多态信息含量)变幅为0.5680~0.7846,平均值为0.6462。聚类分析结果表明,41份新陆早品种在遗传距离为0.42时可划分为3类,多数品种属于第3大类群。群体结构分析表明,当K=4时,△K值最大,表明可将41份材料分为4个类群,每一个品种均属于4个类群,而不明显属于某一类群。新陆早系列在选育过程中,亲本...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
韦树谷 曾华兰 叶鹏盛 刘朝辉 张骞方 何炼 蒋秋平 代顺冬 李琼英
以参加抗性鉴定的茄子品种为研究材料，应用茄子黄萎病抗病性鉴定标准方法和ＳＲＡＰ标记方法，研究了茄子抗黄萎病性状与ＳＲＡＰ标记的关联性。结果表明，本研究中的８２个茄子品种黄萎病病情指数为１２．５％～８３．３３％，平均病情指数为３１．５７％，病情指数散差较大，离散程度较低，品种间抗病性差异极显著，高抗病或者高感病品种数较少；基于Ｋ＝３时ΔＫ最大将所有品种分为３个亚群，即两个小亚群和一个大亚群；采用ＭＩＭ＿Ｑ＋Ｋ模型对病指均值进行关联分析，共检测到１８个ＳＲＡＰ标记与病指显著关联，其中标记ＥＭ７／ＭＥ７－１１达极显著水平（–ｌｏｇ Ｐ＞３，Ｐ＜０．００１）。这些标记关联性稳定且关联度高，可用于后续分．．．
关键词：
茄子 黄萎病 遗传多样性 关联分析
[期刊] 中国农业科学
[作者]
郭宝生 师恭曜 王凯辉 刘素恩 赵存鹏 王兆晓 耿军义 华金平
目的发掘陆地棉Dirigent-like蛋白基因家族,明确不同黄萎病抗性品种间该基因家族成员的多态性及表达差异。方法利用Illumina Hiseq 2000测序平台,通过RNA-Seq测序技术,获得黄萎病菌侵染陆地棉抗病品种和感病品种的Dirigent-like蛋白基因家族成员Unigene序列;采用生物信息学软件对其进行核苷酸序列及编码蛋白的多重比对和系统进化分析;针对该家族成员设计特异的quantitative real-time PCR引物,在Applied Biosystems 7500 Real Time PCR System上使用SYBR green PCR试剂盒标记反应产物,棉...
[期刊] 华北农学报
[作者]
雷煜 张振楠 胡广 刘建芬 唐叶 张宁 司怀军 吴家和
为了克隆棉花抗黄萎病相关基因,利用生物信息学、病毒诱导基因沉默技术(VIGS)、实时定量PCR(q PCR)和接菌分析来研究棉花WRKY基因对大丽轮枝菌的诱导响应和抗性。结果从棉花中筛选出8个与拟南芥直系同源的棉花抗病相关WRKY基因,这些直系同源WRKY基因表达受到大丽轮枝菌浸染诱导响应。其中有6个GhWRKY基因的表达均受到大丽轮枝菌诱导上调,而GhWRKY70和GhWRKY48的表达量随着不同的时间点呈现上调或下调。GhWRKY22等5个基因表达量在24,72 h分别表现为上调,呈现出双峰曲线。对GhWRKY22表达特征进一步分析,结果显示,GhWRKY22基因在茎里优势表达,同时表达受到大丽轮枝菌、水杨酸和茉莉酸激素的诱导。GhWRKY22基因沉默植株对大丽轮枝菌的敏感性增加,抗病标志基因(PR1、PR3、PR4、PR5、PAL和PDF1. 2)表达量也显著降低,揭示GhWRKY22是通过SA和JA信号途径参与棉花对大丽轮枝菌的响应过程。总之,棉花中8个WRKY基因参与棉花对黄萎病抗性调控,其中GhWRKY22基因正调控棉花的抗性,可作为棉花抗病育种的候选基因。
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