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[期刊] 中国农业科学
[作者]
陆许可 王德龙 阴祖军 王俊娟 樊伟丽 王帅 赵小洁 张天豹 叶武威
【目的】探究不同盐胁迫后的棉花基因组DNA甲基化变化情况,并比较分析叶片和根部DNA甲基化变化差异,进而探究DNA甲基化与棉花耐盐性之间的关系。【方法】以陆地棉耐盐品种中9806和盐敏感品种中S9612为试验材料,分别用NaCl和Na2CO3(浓度均为0.4%)处理。提取对照和处理材料的DNA,进行双酶切、连接、预扩增和选择性扩增,然后采用MSAP技术(甲基化敏感扩增多态性)分析棉花幼苗在盐胁迫前后的DNA甲基化情况。从聚丙烯酰胺凝胶中回收纯化多态性片段并进行测序,通过NCBI进行比对分析;设计引物,用实时荧光定量PCR对多态性片段在棉花幼苗中的表达量进行验证。【结果】盐胁迫分析表明不同类型盐...
[期刊] 水产学报
[作者]
朱华平 卢迈新 黄樟翰 高风英 可小丽 刘志刚 李庆勇 刘玉姣
以经过连续多代抗寒选育获得的尼罗罗非鱼耐寒品系为实验材料,采用DNA甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)分析方法从全基因组水平上探讨了低温适应对罗非鱼DNA序列中CCGG位点的甲基化水平的影响。结果显示,选用的18对选择性扩增引物共检测到849个位点。耐寒品系检测到的位点数为411个,对照组为438个,其中发生甲基化的位点数分别为72和104个,总甲基化率分别为17.52%和23.74%;全甲基化位点分别为37个和65个,全甲基化率分别为9.00%和14.84%;半甲基化位点分别为35个和39个,半甲基化率分...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
张鑫 李琪 于红 孔令锋
为探讨干露胁迫对海产贝类基因组DNA甲基化的影响,应用荧光标记甲基化敏感扩增多态性(fluorescencelabeled methylation sensitive amplified polymorphism,F-MSAP)技术,比较了不同干露条件下(0 d、0.5 d、1 d、3 d、5 d、7 d、9 d和11 d)长牡蛎(Crassostrea gigas)基因组DNA甲基化的变化。结果表明,对照组(干露处理0 d)闭壳肌与鳃组织的总体甲基化水平分别为29.76%和29.82%;干露处理0.5
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
张会慧 张秀丽 朱文旭 许楠 李鑫 岳冰冰 王良再 孙广玉
为探讨桑树叶片PSⅡ在中性盐NaCl和碱性盐Na2CO3胁迫下的生理响应,采用快相叶绿素荧光技术研究了不同浓度的NaCl和Na2CO3溶液中PSⅡ功能的快速响应。结果表明:NaCl浓度低于100mmol/L时,叶绿素荧光参数没有明显变化;超过100mmol/L时,桑树叶片的QA被完全还原时所需要的能量(Sm)、吸收光能用于QA-以后的电子传递的量子产额(φE0)、单位反应中心捕获的用于还原QA的能量(TR0/RC)和单位反应中心捕获的用于电子传递的能量(ET0/RC)明显降低,而OJIP曲线上J点的相对可变荧光强度(VJ)、QA被还原的最大速率(M0)、非光化学猝灭的最大量子产额(φD0)和单...
关键词：
桑树 中性盐 碱性盐 PSⅡ
[期刊] 林业科学
[作者]
王娟娟 张文辉
土壤盐渍化是困扰人类的五大土壤问题之一(王春裕等,1997)。我国华北和滨海地区存在大量盐渍化土地,有些区域土壤含盐量达到1%以上(毛建华等,2005),严重影响着当地种植业生产的持续发展,也给园林绿化带来很大困难。大量培育、引种、选择具有耐盐、耐旱特性植物,在干旱和盐渍化地区栽培,不仅能够改善干旱和盐渍化环境,而且能够带来经济效益,是未来园林绿化和林业发展的方向。
关键词：
四翅滨藜 萌发 生长 保护酶
[期刊] 中国水产科学
[作者]
侯艳雯 刘玮 姜蓬垒 张俊芳 韩兵社
低温压力会导致鱼类生理功能失调、机体损伤甚至死亡,鱼类会产生各种适应性变化来应对低温压力,其中涉及的表观遗传学机制越来越受到重视。为了探讨鱼类低温应激压力下的表观遗传学调控机制,本研究对斑马鱼(Daniorerio)胚胎成纤维细胞ZF4进行短期低温胁迫(18℃处理3d、5d和10℃处理3d、5d)和长期低温胁迫(18℃处理30 d),然后用具有不同甲基化敏感性的同裂酶HpaⅡ和MspⅠ对细胞基因组DNA进行酶切以监测细胞基因组DNA甲基化水平变化。结果显示短期低温胁迫下ZF4细胞生长受到抑制甚至死亡,而经过长期低温胁迫的ZF4细胞对低温压力产生了一定适应性。并且低温胁迫下DNA甲基化水平呈现动态变化,短期低温培养细胞的基因组DNA甲基化水平明显增高,但是长期低温培养细胞的DNA甲基化水平反而下降。此外,研究发现抗氧化剂N-乙酰半胱氨酸(N-acetylcysteine,NAC)或者共济失调–毛细血管扩张突变蛋白(ataxia telangiectasia mutated,ATM)抑制剂KU-55933可以抑制18℃5 d低温处理后的ZF4细胞DNA甲基化水平的增高,说明活性氧(reactive oxygen species,ROS)的产生和ATM的激活介导了DNA甲基化水平的增高。本研究结果显示,短期低温刺激下ZF4细胞ROS的产生导致DNA损伤,激活DNA损伤修复机制,进而导致基因组DNA甲基化水平上升,该研究为后期斑马鱼低温胁迫分子机制的研究奠定基础。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
秦桢 李吉涛 李明栋 王佳佳 葛倩倩 刘萍 李健
为探讨盐碱水环境对脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)基因组DNA甲基化的影响，本研究利用MethylRAD-Seq技术探究了长期盐碱水养殖组(SAS)和正常海水养殖对照组(SW)脊尾白虾鳃组织中的DNA甲基化水平，并对关键通路和基因进行了差异表达分析。结果显示，脊尾白虾鳃组织基因组中CG和CWG位点(W=A或T)分别检测到2 347 003和416 176处甲基化，甲基化普遍存在于基因组的基因间区和内含子区域，共筛选到8805个(8189个CG-DMSs和616个CWG-DMSs)差异甲基化位点，盐碱水环境下DNA甲基化水平略有增强。通过KEGG富集分析发现，DMS所在差异表达基因显著富集在HIF-1信号通路和剪接体通路，通路中hif-p、hk和sf3b1等关键基因在脊尾白虾盐碱水环境适应中可能发挥着重要作用；对SW和SAS组差异甲基化基因(DMG)进行筛选，得到158个CG-DMGs和94个CWG-DMGs，其中，富集到脂质代谢和囊泡介导的转运通路中的DMG最多；此外，有一些DNA甲基化位点与基因表达呈负相关，表明DNA甲基化与基因调控之间存在复杂的联系，大部分基因组DNA甲基化对基因表达有正调控效应。本研究结果首次分析了在盐碱水环境下脊尾白虾鳃组织的DNA甲基化水平特征，为解析甲壳类盐碱水环境适应机制提供了基础信息。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
白小青 王金勇 陈英 潘红梅 刘文 李军峰
【目的】探讨荣昌猪基因组DNA甲基化水平随生长发育阶段和组织类型不同而变异的规律。【方法】采用HPLC法分别检测了荣昌猪阉公猪心脏、肝脏、半膜肌3种组织在10,20,35,50,80和100 kg体质量阶段基因组DNA的甲基化水平,分别以体质量和组织类型为影响因素进行单因素方差分析。【结果】与10 kg体质量阶段的基因组DNA甲基化水平相比,3种组织基因组DNA甲基化水平均随个体体质量的增加而呈下降趋势,但不同组织下降的幅度不同:心脏基因组DNA甲基化水平在35 kg时开始明显下降(P<0...
关键词：
荣昌猪 高效液相色谱 DNA甲基化
[期刊] 林业科学研究
[作者]
周贝贝 文明 马庆国 裴东
以‘中宁强’核桃品种成熟叶片为材料,采用优化的MSAP反应体系,在全基因组水平对核DNA进行甲基化修饰位点分析,结果表明:选用20对引物组合,共扩增出1 060条清晰、重复性好的谱带,平均每对引物扩增出53条谱带,其中,甲基化位点241个,甲基化修饰比例为22.73%。对部分核桃DNA甲基化修饰位点进行回收测序,得到10条存在DNA甲基化修饰的DNA序列,BLASTn分析表明,核桃基因组中多种类型的DNA序列存在甲基化修饰现象。
关键词：
核桃 MSAP DNA甲基化 表观遗传学
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
于世河 郑颖 卜鹏图 金山
为研究碱性盐胁迫对科罗拉多蓝杉生理特性的影响,旨在为其在盐碱地上的栽植提供科学指导与理论依据,采用盆栽梯度浓度盐水补给法,对一年生蓝杉进行不同浓度的Na_2CO_3溶液[浓度分别为0(CK),3‰,6‰,9‰]胁迫处理,分别在第10天、第20天、第30天、第40天测定蓝杉叶中叶绿素、可溶性糖、游离脯氨酸、MDA、相对电导率以及SOD和POD等生理指标。结果表明:蓝杉叶中叶绿素a及叶绿素b的含量随着Na_2CO_3浓度的升高而降低,当胁迫时间超过10d,且Na_2CO_3浓度在大于3‰时,其含量显著降低。当胁迫时间超过20d,且Na_2CO_3浓度为9‰时,可溶性糖含量显著升高。游离脯氨酸含量随着Na_2CO_3浓度的升高而升高,当浓度大于3‰时,其含量开始显著升高。相对电导率在在Na_2CO_3浓度超过9‰时,从第20天开始显著升高。SOD与POD活力都随着Na_2CO_3浓度的升高而降低,而MDA含量随着Na_2CO_3浓度的升高而升高,当Na_2CO_3浓度超过3‰时,三者含量出现显著性变化。这说明蓝杉正常生长的碱性盐阈值为3‰,过高盐浓度会损害植株的的生长发育。
关键词：
科罗拉多蓝杉 盐碱胁迫 生理特性
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
田宏 刘洋 张鹤山 蔡化 陈明新
选用扁穗雀麦新品系种子,分别在NaCl和Na2CO3溶液中(均设0(CK)、0.2%、0.4%、0.6%、0.8%、1.0%和1.2%7个处理)进行发芽试验.结果表明,随着盐溶液质量分数的增加,扁穗雀麦新品系种子的相对发芽率、相对发芽指数和相对活力指数与对照(CK)相比均有不同程度的降低.0.2%~0.8%的NaCl对胚根的生长有促进作用,胚根长度比对照平均高40.2%,但胚根生长的程度随盐质量分数的增加而降低.0.2%~1.2%Na2CO3处理下,胚根的生长受抑制,当质量分数为0.8%时,大量无根畸形苗出现.对相对发芽率进行回归分析,扁穗雀麦新品系种子在NaCl胁迫下的适宜值、临界值和极限值...
关键词：
扁穗雀麦新品系 氯化钠 碳酸钠 种子萌发
[期刊] 中国水产科学
[作者]
罗少杰 邓岳文 郑哲 焦钰 王庆恒
通过甲基化敏感多态性扩增（ｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ－ｓｅｎｓｉｔｉｖｅ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ，ｍｓａｐ）技术，检测马氏珠母贝（ｐｉｎｃｔａｄａ ｍａｒｔｅｎｓｉｉ）外套膜的边缘膜区（ｍａｎｔｌｅ ｅｄｇｅ，ｍｅ）、套膜区（ｍａｎｔｌｅ ｐａｌｌｉａｌ，ｍｐ）和中央膜区（ｍａｎｔｌｅ ｃｅｎｔｒａｌ，ｍｃ）的基因组ｄｎａ甲基化修饰水平；回收具特异性的清晰甲基化修饰片段进行测序、比对分析并筛选基因；利用荧光定量ｐｃｒ对筛选基因进行定量分析。结果显示：（１）利用１５对引物进行扩增实验，平均每个个体外套膜３个区域能够产生（１１６３．２５±１２４．３４）条清晰可辨的条带，其．．．
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
程海涛 苏展 曹萍 郭玉华
针对内陆苏打盐碱土pH值高的特点,分别利用0.30mmol·L-1NaCl和0.15mmol·L-1Na2CO3作为胁迫条件,研究了籼粳杂交形成的DH群体的芽期和苗期相关性状的伤害率。结果表明:各性状盐碱伤害率株系间存在明显分离,且Na2CO3伤害率明显高于NaCl,NaCl胁迫条件下芽期和苗期伤害率平均值为8.70和24.93,Na2CO3胁迫条件下分别为19.38和59.73。芽期和苗期的综合伤害率分为高、中、低3个等级,比较发现芽期和苗期的耐盐碱性并不一致。NaCl和Na2CO3伤害差株系间存在很大差异,说明不同株系对碱性胁迫反应存在遗传差异,芽期和苗期的伤害差分为4个级别,其中芽期和苗...
关键词：
水稻 籼粳后代 盐碱胁迫
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
张曼曼 冯兵 罗双双 王卫民 周小云
以二倍体和四倍体泥鳅为研究对象,采用甲基化修饰依赖性内切酶测序技术(MethylRAD-Seq)在全基因组水平上分析泥鳅的DNA甲基化特点及倍性间的DNA甲基化变异。测序结果共得到302 111 684条Methyl-RAD序列标签。与参考基因组比对结果显示,泥鳅的甲基化位点主要分布在基因体区(gene body),其次为内含子区(intron)和基因间区(intergenic),而在其他功能元件上的分布较少。四倍体泥鳅的整体甲基化水平比二倍体高,尤其是在第一外显子区(1st Exon)和转录起始位点上游1 500bp至200bp区(TSS1500),且倍性间差异极显著(P
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
吴彪 杨爱国 孙秀俊 刘志鸿 周丽青 宫一震
为探讨急性温度胁迫对虾夷扇贝（ＰａｔｉｎｏＰｅｃｔｅｎ ｙｅｓｓｏｅｎｓｉｓ）基因组Ｄｎａ甲基化水平的影响，本研究从表观遗传学角度，运用甲基化敏感扩增多态性（Ｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ－ｓｅｎｓｉｔｉｖｅ ａＭＰｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ＰｏｌｙＭｏｒＰｈｉｓＭ，ＭｓａＰ）技术比较分析了升温海水（１７℃和２４℃）急性胁迫虾夷扇贝（原暂养于９℃的海水中）９ ｈ和２４ ｈ后基因组Ｄｎａ甲基化的变化情况。结果显示，９对引物在各组的总扩增位点数为３１４–３３７，总甲基化位点为７９–９４，所占比例为２３．４５％–２８．５１％；所有处理组基因组Ｄｎａ总甲基化率低于对照组，急性升温胁迫使虾夷扇贝基因组Ｄｎａ发生去甲．．．
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