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[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
孙瑞萍 王利心 朱广琴 王建刚 宋宇轩 梁昭义 曹斌云
针对GHR基因exon 9和exon 10设计了2对引物,采用PCR-SSCP技术检测该基因这2个位点在西农萨能羊群上的单核苷酸多态性,同时研究其对产奶性能的影响。结果表明:exon 9具有多态,exon 10不存在多态性。Exon 9位点在西农萨能山羊中检测到NN型和NT型,纯化测序发现有1个SNP位点,NN型与NT型相比在该片段第241 bp处有1个G→T的突变;NN和NT基因型之间产奶量的最小二乘均值差异显著(P<0.05):NN基因型在各胎次产奶量和平均产奶量等指标上均好于NT基因型,其中在第3胎的产奶量和第4胎产奶量2项指标上都达到显著水平(P<0.05)。研究结果提示:GHR基因e...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
王真 王敏 李铭 闫海龙 朱海鲸 陈宏 屈雷 蓝贤勇
【目的】探究生长激素受体(GHR)和生长分化因子9(GDF9)基因多态性与内蒙古白绒山羊生产性状的相关性。【方法】采集452只阿拉善品系内蒙古白绒山羊雌性个体(其中包括382只18月龄左右的育成羊和70只36月龄左右的成年羊)的耳组织并测定其体质量和体尺数据。提取试验羊耳组织的DNA,通过InDel分型和琼脂糖凝胶电泳技术鉴定出452只内蒙古白绒山羊GHR和GDF9基因的多态性,利用SPSS 23.0分析软件探讨其与生产性状的相关性。【结果】在内蒙古白绒山羊GHR基因第1内含子中检测到9-bp插入缺失标记(InDel)位点(NC_022312:g.42801_42809delCTGTGGCAT),该位点属于低度多态(PIC0.05);在GDF9基因3′调控区检测到12-bp InDel位点(NC_022299.1:g.66028950insTACTTTCAACAA),该位点属于中度多态(0.25
[期刊] 华北农学报
[作者]
王国富 吴慧光 孙国权 李俊雅 高雪 王景山 王玉泉 高树新
为了探讨西门塔尔牛乳铁蛋白基因第11外显子多态性,及其与乳房炎和部分乳性状的关系,利用PCR-SS-CP和DNA测序技术,对118头健康牛和38头感染乳房炎牛个体,进行了第11外显子的基因多态性分析。结果发现,健康牛和感染乳房炎牛个体的第11外显子基因型和基因频率分布差异均极显著(P<0.01),感染牛中AA基因型和A基因频率均极显著高于健康牛(P<0.01)。而且,AA基因型个体SCS显著高于AB和BB型个体(P<0.05),AA型个体的乳蛋白极显著高于AB型(P<0.01)、显著高于BB型(P<0.05),而BB型显著高于AB型(P<0.05)。这表明乳铁蛋白基因第11外显子的A基因,可能...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王海滨 罗军 武会娟 韩雪峰 单翠燕 张宁
【目的】山羊FAS基因exon 9-15编码的乙酰/丙二酸单酰基转移酶(acetyl-CoA and malonyl-CoA transacylases,AT/MT)区域对山羊乳短、中链脂肪酸的合成起重要调控作用。本研究针对西农萨能羊乳腺FAS基因exon 9-15进行克隆和序列分析。【方法】以处于泌乳期28d的西农萨能羊乳腺组织mRNA反转录的cDNA为模板,通过RT-PCR方法首次扩增出西农萨能羊乳腺FAS基因exon 9-15的cDNA序列全长及exon 8的3′端和exon 16的5′端部分cDNA序列(GenBank收录号为DQ915966),并对其进行了同源性分析和功能预测。【结果...
[期刊] 华北农学报
[作者]
李彥清 牛晓亮 胡江 闫伟 罗玉柱 王文飙 才让闹日
DRA基因属Bo LA家族Ⅱ类基因,编码Ⅱ类抗原分子的α链,其第2外显子编码的抗原结合区在抗原呈递中发挥重要作用。以天祝白牦牛、大通牦牛、甘南牦牛和普通牛为研究对象,利用PCR-SSCP的方法对Bo LA-DRA基因第2外显子及第2内含子多态性进行了检测。结果表明,DRA基因第2外显子区检测到197位T>C和116位G>A突变,对应A、B和C 3种等位基因,PIC值为0.249~0.424,为中度多态。第2内含子区发现1个A>G、1个T>C突变和1个C>T突变,对应a、b、c和d 4种等位基因,PIC值为0.389~0.515,为中度及高度多态。聚类分析表明,牦牛DRA基因第2外显子区碱基序列...
[期刊] 华北农学报
[作者]
李彥清 牛晓亮 胡江 闫伟 罗玉柱 王文飙 才让闹日
ＤＲＡ基因属Ｂｏ ＬＡ家族Ⅱ类基因，编码Ⅱ类抗原分子的α链，其第２外显子编码的抗原结合区在抗原呈递中发挥重要作用。以天祝白牦牛、大通牦牛、甘南牦牛和普通牛为研究对象，利用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ的方法对Ｂｏ ＬＡ－ＤＲＡ基因第２外显子及第２内含子多态性进行了检测。结果表明，ＤＲＡ基因第２外显子区检测到１９７位Ｔ＞Ｃ和１１６位Ｇ＞Ａ突变，对应Ａ、Ｂ和Ｃ ３种等位基因，ＰＩＣ值为０．２４９～０．４２４，为中度多态。第２内含子区发现１个Ａ＞Ｇ、１个Ｔ＞Ｃ突变和１个Ｃ＞Ｔ突变，对应Ａ、Ｂ、Ｃ和Ｄ ４种等位基因，ＰＩＣ值为０．３８９～０．５１５，为中度及高度多态。聚类分析表明，牦牛ＤＲＡ基因第２外显子区碱基序列．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
王国富 吴慧光 孙国权 许尚忠 李俊雅 高雪 季守财 高树新
探讨牛乳铁蛋白(Bovine lactoferrin blF)基因bLF第四外显子的多态性与乳房炎发生的关系。利用PCR-SSCP技术,分析了bLF基因第四外显子的多态性在86头中国西门塔尔牛中的基因型分布及其多态性与乳房炎的关系。经χ2独立性检验,发现该多态片段3种基因型在健康牛中分布不一致(P<0.05),在患病牛中BB基因型频率较高,说明该多态性与乳房炎存在一定关系,可能是奶牛乳房炎的一个分子标记。
[期刊] 华北农学报
[作者]
韩浩园 李涛 李世凯 宋小雨 李君 哈斯 赵金艳 魏红芳 权凯
为探究GJB6和PRKAA1基因对槐山羊繁殖性能的影响，以122只不同产羔数的槐山羊群体为研究对象，参照NCBI数据库中山羊GJB6和PRKAA1基因参考序列设计引物，利用PCR与测序技术扫描GJB6和PRKAA1基因单核苷酸多态性(SNP),并进行遗传多态性、群体遗传参数分析和基因型与产羔数的关联分析。结果表明，在GJB6基因中检测到2个SNP位点：g.50694819 C>T和g.50694816 T>C,均为同义突变；在PRKAA1基因中检测到3个SNP位点：g.33691489 T>C、g.33693395 A>T和g.33693100 T>C,均位于非编码区。GJB6基因g.50694819 C>T位点和PRKAA1基因g.33693100 T>C位点为低度多态；GJB6基因g.50694816 T>C位点、PRKAA1基因g.33691489 T>C和g.33693395 A>T位点为中度多态。卡方检验结果表明，5个SNP位点均处于Hardy-Weinberg平衡。基因型与产羔数的关联分析结果表明，GJB6基因2个SNP的各个基因型间槐山羊产羔数的差异不显著，不适用于槐山羊群体的多羔性状选育。PRKAA1基因g.33691489 T>C位点的TC基因型个体产羔数显著高于CC基因型，g.33693395 A>T位点AT基因型个体产羔数显著高于AA、TT基因型(P<0.05),且g.33691489 T>C和g.33693395 A>T位点呈现强连锁平衡状态(D′>0.8,r~2>0.33)。单倍型关联分析结果显示，PRKAA1基因TCA单倍型个体的产羔数显著高于CTA、CTT、TTA单倍型个体的产羔数(P<0.05)。因此，槐山羊PRKAA1基因g.33691489 T>C位点TC基因型与g.33693395 A>T位点AT基因型以及TCA单倍型个体具有较高的产羔数，可作为槐山羊产羔数选育的潜在分子标记。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
王真 王敏 李铭 闫海龙 朱海鲸 陈宏 屈雷 蓝贤勇
【目的】探究生长激素受体（GHR）和生长分化因子9（GDF9）基因多态性与内蒙古白绒山羊生产性状的相关性。【方法】采集452只阿拉善品系内蒙古白绒山羊雌性个体（其中包括382只18月龄左右的育成羊和70只36月龄左右的成年羊）的耳组织并测定其体质量和体尺数据。提取试验羊耳组织的DNA，通过InDel分型和琼脂糖凝胶电泳技术鉴定出452只内蒙古白绒山羊GHR和GDF9基因的多态性，利用SPSS 23.0分析软件探讨其与生产性状的相关性。【结果】在内蒙古白绒山羊GHR基因第1内含子中检测到9-bp插入缺失标记（InDel）位点（NC_022312:g.42801_42809delCTGTGGCAT），该位点属于低度多态（PIC＜0.25）且处于哈代温伯格平衡状态（P＞0.05）；在GDF9基因3′调控区检测到12-bp InDel位点（NC_022299.1:g.66028950insTACTTTCAACAA），该位点属于中度多态（0.25＜PIC＜0.50）且处于哈代温伯格非平衡状态（P＜0.05），2个InDel位点均存在纯合插入型、杂合型和纯合缺失型3种基因型。在育成羊中，GHR基因第1内含子中9-bp InDel位点纯合插入基因型个体体质量、体长、胸围和胸宽均值显著大于杂合基因型个体（P＜0.05）；在成年羊中该位点两种基因型间各生长指标差异不显著（P＞0.05）。在育成羊中，GDF9基因3′调控区12-bp InDel位点杂合基因型和纯合缺失基因型个体体质量、体高和胸围均值极显著大于纯合插入基因型（P＜0.01）；在成年羊中，GDF9基因该InDel位点纯合插入基因型个体体质量、胸围和管围均值显著大于纯合缺失基因型（P＜0.05）。【结论】GDF9基因3′调控区12-bp InDel位点和GHR基因第1内含子中9-bp InDel位点多态性与内蒙古白绒山羊体质量和部分生长性状具有显著或极显著的相关性。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
冯会利 石照应 田兴贵 曲月秀 主性 刘若余
以贵州黑山羊和黔北麻羊为材料,根据山羊MSTN基因序列(GenBank登录号:EF588035)设计1对引物,用PCR-RFLP法对该序列进行多态性分析。结果表明:PCR扩增片段207 bp处存在TTTTA的插入,导致出现1个DraI酶切多态性位点,黑山羊纯合野生型(AA)为优势基因型,杂合型(AB)和纯合突变型(BB)为非优势基因型,A等位基因为优势基因;黔北麻羊纯合野生型(CC)为优势基因型,杂合型(CD)和纯合突变型(DD)为非优势基因型,C等位基因为优势基因。
[期刊] 华北农学报
[作者]
田知利 陈杰 胡江 罗玉柱 刘秀 李少斌 郭淑珍 牟永娟
为揭示牦牛抗逆性及抗病育种积累更多的分子遗传学资料，通过检测ＤＲＢ１基因在牦牛和普通牛群体中的变异，分析该基因检测区域遗传参数。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛和普通牛为研究对象。应用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法检测ＢｏＬＡ－ＤＲＢ１基因第１内含子及第２外显子部分序列多态性。ＤＲＢ１基因第１内含子区检测到４处ＳＮＰＳ及１处插入／缺失突变，第２外显子区检测到１７处ＳＮＰＳ，两区域均表现为高度多态；单倍型连锁分析发现２１种ｉＮｔＲｏＮ １－ｅｘｏＮ ２单倍型组型且存在单倍型连锁不平衡现象，Ａ－Ａ１、Ａ－Ｂ１、Ｂ－Ａ１和Ｂ－Ｂ１单倍型在牦牛和普通牛中频率较高；聚类分析表明，牦牛ＤＲＢ１基因第２外显．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
高树新 许尚忠 高雪 马云 韩玉国
利用PCR-SSCP技术,分析了牛主要组织相容性复合物DRA基因外显子2的多态性在236头中国西门塔尔牛、三河牛中的基因型分布及其多态性与乳房炎的关系。结果表明:经χ2独立性检验,发现该多态片段6种基因型在感染乳房炎牛和健康牛之间分布不一致(p<0.01)。在感染乳房炎牛中CC基因型频率最高,在健康牛中BC基因型频率最高。据此推测,CC基因型可能与这两种牛的乳房炎易感性有关,而BC基因型可能与这两种牛的乳房炎抗性有关。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
左北瑶 钱宏光 刘佳森 李蕴华 乌云毕力克 艾肯江 应诗家 王子玉 努尔尼沙 王旭 郭志勤 王锋
以影响不同绵羊品种产羔数的BMPR-IB、BMP15和GDF9基因作为候选基因,采用连接酶检测反应(LDR)法,检测10个突变位点在德国肉用美利奴羊上的多态性及其对产羔数的影响。结果表明:在德国肉用美利奴羊中未发现BMPR-IB基因的FecB突变和BMP15基因的FecXI、FecXB、FecXL、FecXH、FecXG、FecXR突变及GDF9基因的FecGH(G8)、FecTT突变,但在GDF9上检测到G1突变,该突变处于Hardy-Weinberg平衡状态,达到中度多态水平,但其多态性与产羔数无显著性相关。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘重旭 王凭青 张宝云 储明星 邓腊梅 谭颖 樊奇
【目的】阐明西南地区具有代表性的山羊品种脂联素(adiponectin)基因的多态性及其与繁殖性能之间的关系,为山羊高繁殖力的标记辅助选择提供科学依据。【方法】根据牛的ADIPOQ序列设计4对引物,采用PCR-SSCP技术检测ADIPOQ在川东白山羊、大足黑山羊、贵州白山羊、金堂黑山羊、板角山羊、成都麻羊、南江黄羊、古蔺马羊和马头山羊等9个山羊品种中的单核苷酸多态性,同时在贵州白山羊和古蔺马羊两个群体中研究脂联素基因多态性与山羊繁殖力之间的关系。【结果】4对引物中只有引物P4存在多态性。对于P4的扩增片段,在不同的山羊品种中检测到AA、AG和GG 3种基因型,测序分析表明与AA型相比,GG型有...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
孙伟 李达 马月辉 关伟军 储明星 丁家桐 李碧春 张有法 陈玲 吴文忠 周洪
【目的】探讨生长激素受体(growth hormone receptor,GHR)和胰岛素样生长因子-Ⅰ(insulin-likegrowth factor-Ⅰ,IGF-Ⅰ)基因在湖羊不同生长阶段背最长肌中表达丰度与肉质性能的相关性以及这两个基因表达水平的关联性,为湖羊肌肉生长性状的选育提供遗传学资料。【方法】利用荧光定量RT-PCR分析GHR和IGF-Ⅰ基因在湖羊早期生长背最长肌肉组织中的mRNA的发育性变化。【结果】①出生后随着月龄的增加,母羊GHR基因在背最长肌的表达趋势为:先升高后降低再升高再降低最后再升高,最后6月龄到达最高点;公羊GHR在背最长肌的表达趋势为:先升高到2月龄到达一个...
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