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[期刊] 西南农业学报
[作者]
张娟丽 张文秀 彭瑾 张龚炜 杨宇 王杰 赖松家
基于病例对照研究的试验设计,本试验对β-防御素135基因(β-defensin 135,DEFB135)非编码区和编码区进行单核酸多态性(SNPs)检测,在5’非编码区(5’-UTR)检测到2个SNPs(c.-47 T>A,c.-40 C>A),3’-UTR区检测到1个SNP(c.*42 C>G),它们处于完全连锁状态。选取c.-40 C>A位点进行基因分型,研究DEFB135基因多态性与家兔非特异性消化道疾病易感性间的相关性。结果发现健康组和肠炎组中等位基因A的频率分别为30%和33%,差异不显著(P>0.05);OR(odds ratio)值为1.11(95%的置信区间:0.849~1.4...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
吴周林 曾予 贾先波 陈仕毅 王杰 赖松家
【目的】研究家兔ＸＫＲ４基因的遗传多态性，并分析其与家兔生长速度的相关性。【方法】以新西兰兔（１８４只）和伊拉兔（１９３只）为研究材料，取其耳部组织，提取ＤＮＡ，ＰＣＲ扩增ＸＫＲ４基因，采用直接测序法寻找ＣＤＳ区单核苷酸多态性（ＳＮＰ）位点，利用ＨＲＭ技术对突变位点进行分型，并分析其与生长性状的相关性。【结果】在家兔ＸＫＲ４基因内检测到３个ＳＮＰ位点（内含子１中的Ｃ．８０４－８Ｃ＞Ｔ及外显子３中的Ｃ．１６６８Ｃ＞Ｔ和Ｃ．１６９８Ｃ＞Ｔ）。针对外显子３中的２个ＳＮＰ位点，对４０个样本直接测序，结果发现仅存在ＣＣ和ＣＴ ２种基因型，且处于完全连锁状态。对２种兔突变位点的群体遗传参数分析发现其总杂合．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
贾伟 张龚炜 陈仕毅 贾先波 赖松家
本文旨在研究家兔BMPR1B基因的多态性及其与生长速度的相关性。采用PCR产物测序方法检测BMPR1B基因编码区的多态性,利用PCR-RFLP技术对候选SNPs位点(c.117G>A)进行基因分型,研究其与家兔生长速度的关联性(N=262)。结果表明,在BMPR1B基因编码区共存在14个SNPs位点,它们分别是c.9C>T、c.54C>T、c.75T>A、c.88C>T、c.96T>C、c.117G>A、c.384A>G、c.392C>T、c.540C>T、c.603T>C、c.1254T>A、c.1332A>G、c.1356A>G及c.1436A>G,除c.392C>T突变致使该基因编码的第...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
李彦宏 胡深强 王杰 贾先波 赖松家
【目的】探究家兔血管生成素样蛋白4(angiopoietin-like protein 4,ANGPTL4)基因第6外显子内的多态性及其与家兔部分生长性状的关联性。【方法】采用PCR产物测序法检测家兔ANGPTL4基因外显子内的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并应用PCRRFLP酶切分型技术对3个家兔品种(天府黑兔、伊拉兔和新西兰兔)共495个群体样本进行酶切分型,分析SNPs与3个家兔品种部分生长性状的关联性。【结果】ANGPTL4基因第6外显子中共检测发现3个遗传变异位点(c.823 G>A为非同义突
[期刊] 华北农学报
[作者]
肖正龙 张龚炜 杨宇 王杰 赖松家
为了研究家兔ATG16L1基因对非特异性消化道紊乱的易感性,试验采用PCR-HRM技术,首次对家兔ATG16L1基因进行单核苷酸多态性(SNP)检测,同时结合低纤维群体结肠ATG16L1基因mRNA表达量进行关联分析。结果表明:ATG16L1基因存在1个SNP位点(c.1482 G>A)与NSDD的易感性相关联;c.1482 G>A位点A等位基因能增加NSDD的易感性(OR=1.43,95%置信区间:1.08～1.91,P<0.05);ATG16L1基因在结肠中的mRNA表达...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
王晓冰 刘至治 李强 张璐菲 张俊彬
为探究金钱鱼(Scatophagus argus)MHC IIβ基因的结构和特性,采用同源克隆和RACE等技术,在获得c DNA全序列的基础上,分析其内含子序列、基因多态性和组织表达情况。结果表明,金钱鱼MHC IIβ基因c DNA序列全长1172 bp,其中5?UTR长34 bp、3?UTR长388 bp、开放阅读框(ORF)长750 bp,编码249个氨基酸,包含信号肽、β1结构域、β2结构域、连接肽(CP)、跨膜区(TM)和胞质区(CYT);MHC IIβ基因由6个外显子和5个内含子组成,其中内含子3将β2结构域分开。从43尾金钱鱼的209个有效克隆中,获得209条不同的核苷酸序列,可归...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
王晓冰 刘至治 李强 张璐菲 张俊彬
为探究金钱鱼（ＳｃａｔｏｐｈａｇｕＳ ａｒｇｕＳ）Ｍｈｃ Ⅱβ基因的结构和特性，采用同源克隆和ｒａｃＥ等技术，在获得ｃＤＮａ全序列的基础上，分析其内含子序列、基因多态性和组织表达情况。结果表明，金钱鱼Ｍｈｃ ＩⅡβ基因ｃＤＮａ序列全长１１７２ ｂｐ，其中５′ｕｔｒ长３４ ｂｐ，３′ｕｔｒ长３８８ ｂｐ，开放阅读框（ｏｒＦ）长７５０ ｂｐ，编码２４９个氨基酸，包含信号肽、β１结构域、β２结构域、连接肽（ｃｐ）、跨膜区（ｔＭ）和胞质区（ｃＹｔ）；Ｍｈｃ Ⅱβ基因由６个外显子和５个内含子组成，其中内含子３将β２结构域分开。从４３尾金钱鱼的２０９个有效克隆中，获得２０９条不同的核苷酸序列，可归为４８个．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
刘声传 鄢东海 周雪 莫雪 胡依然 魏杰 周富裕 周玉锋
为了发掘利用茶树茶树富硒关键酶硒代半胱氨酸甲基转移酶（ＳｅｌｅｎｏｃｙＳｔｅｉｎｅ ｍｅｔｈｙｌｔｒａｎＳｆｅｒａＳｅ，Ｓｍｔ）基因ｃＳＳｍｔ，通过ｒａｃｅ克隆该基因的ｃＤｎａ全长，并通过水培试验，分析该基因在井４３幼苗根叶的表达特征。结果表明：通过该基因ｃＤｎａ的全长克隆，获得５个茶树品种ｃＳＳｍｔ的开放阅读框（ｏｒｆ）全长；对茶树５个品种的ｏｒｆ核苷酸多态性鉴定共检测到１９个多态性位点，包括１７个ＳｎＰＳ和２个ｉｎＤｅｌＳ，平均每５５ ｂＰ检测到１个多态性位点，这些多态位点引起９个氨基酸位点变化；５个茶树品种Ｓｍｔ的氨基酸序列一致性为９９．１５％，出现一定的遗传分化。ｎａ＿２Ｓｅｏ＿３水培．．．
[期刊] 中国水产科学
[作者]
王晓冰 刘至治 李强 张璐菲 张俊彬
为探究金钱鱼(Scatophagus argus)MHC IIβ基因的结构和特性,采用同源克隆和RACE等技术,在获得c DNA全序列的基础上,分析其内含子序列、基因多态性和组织表达情况。结果表明,金钱鱼MHC IIβ基因c DNA序列全长1172 bp,其中5?UTR长34 bp、3?UTR长388 bp、开放阅读框(ORF)长750 bp,编码249个氨基酸,包含信号肽、β1结构域、β2结构域、连接肽(CP)、跨膜区(TM)和胞质区(CYT);MHC IIβ基因由6个外显子和5个内含子组成,其中内含子3将β2结构域分开。从43尾金钱鱼的209个有效克隆中,获得209条不同的核苷酸序列,可归...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李宏俊 王娟 高祥刚 苏浩 刑坤 傅立元 赫崇波
通过表达序列标签法和cDNA末端快速扩增(RACE)技术,分离和克隆了圆斑星鲽(Verasper variegatus)主要组织相容性复合体(MHC)IIB的全长cDNA序列,该cDNA全长为1144bp,5'UTR(untranslated region)为7bp,3'UTR为450bp,开放阅读框(ORF)长度为687bp,可编码228个氨基酸,包含信号肽、抗原结合域(β1)、IGC区(β2)、跨膜区和胞质区5个结构域。同源分析表明,圆斑星鲽MHCIIB氨基酸序列与其他硬骨鱼具有49%～79%的同源性,与鼠、人、红原鸡和护士鲨的相似性较低,分别为34%、33%、31%和30%。圆斑星鲽MH...
[期刊] 水产学报
[作者]
周芬娜 董忠典 李同明 傅咏 王慧
为进一步了解鱼类MHC ⅡA基因的特点及其在免疫反应中的功能,采用同源克隆、RACE-PCR、巢式PCR等技术,从健康的尼罗罗非鱼体获得1 205 bp的MHC ⅡA基因cDNA全序列(Orni-DBA-0101,Genebank登录号:JF719813)及1 388 bp的基因组序列。序列分析发现,尼罗罗非鱼MHC ⅡA基因含4个外显子和3个内含子,开放阅读框长720 bp,编码239个氨基酸。从4尾尼罗罗非鱼中共得到8条不同的cDNA序列,分别编码不同的氨基酸序列。氨基酸序列比对后发现,序列间存在丰富的多态性,且主要集中在α-1区,多态性位点数远远高于半滑舌鳎MHC ⅡA基因。生物信息学分...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
张天睿 刘至治 刘俊 赵雪锦 王成辉
以cDNA为模板进行PCR扩增和克隆分析,从7尾玻璃红鲤(Cyprinus carpio var.wananensis)的70个有效克隆中,获得长度为624 bp的MHC IIα/β不同编码序列25/31个,分属于7/10个不同等位基因,揭示玻璃红鲤MHC II类基因的多态性仍较丰富。其中Cyca-DXA17*01和Cyca-DAB1*1201、Cyca-DAB1*1301、Cyca-DAB3*1901、Cyca-DAB3*2001、Cyca-DAB3*2101、Cyca-DAB3*2201为新发现的7个基因。分析表明,α1/β1结构域的核苷酸/氨基酸变异位点数明显高于α2/β2结构域;α1、...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
吴一尘 杜星 李平华 吴艳 王钧顺 刘红林 李齐发
【目的】获得苏淮猪ＶＲＴＮ基因编码区序列，了解其序列特征和组织表达特征，分析苏淮猪ＶＲＴＮ基因ｉＮｓ２９１位点的多态性。【方法】以苏淮猪卵巢组织ｃ ＤＮＡ为模板，采用克隆测序技术分离获得苏淮猪ＶＲＴＮ基因编码区序列。利用Ｂｉｏ ＥＤｉＴ ７．０软件分析其序列特征和蛋白理化性质。利用ｃｌｕｓＴＡｌ Ｗ软件进行核苷酸和蛋白质序列比对分析。利用ｕｃｓｃ基因组浏览器与ＮｃＢｉ基因组数据库进行猪ＶＲＴＮ基因的染色体定位和基因组结构分析。利用ｓＭＡＲＴ软件预测蛋白质功能域，ｃＰＨＭｏＤＥｌｓ软件预测蛋白质三级结构。随机选取３头成年苏淮猪母猪，屠宰后立即采集心、肝、脾、肺、肾、下丘脑、肌肉和卵巢等组织，提取．．．
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
魏笑笑 王宝维 王雷 杨志刚 贾晓晖 王亚超 于世浩 荆丽珍 岳斌
采用PCR-RFLP技术对琅琊鸡胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)5′非编码区PstⅠ酶切位点的多态性与生长发育的相关性进行分析.结果表明,琅琊鸡该位点存在2种等位基因(A和B),基因频率分别为61.7%和38.3%,其中A等位基因是有利基因.AA型个体活重、半净膛重和脂肪含量极显著高于BB型(P<0.01),其屠体重、全净膛重、腿肌重和胸肌重显著大于AB型和BB型(P<0.05),其剪切力和失水率也高于BB型(P<0.05,P<0.01).结果表明:等位基因A对琅琊鸡的肌肉产量和品质具有正效应.
关键词：
琅琊鸡 IGF-Ⅰ 产肉性能
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