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[期刊] 中国水产科学
[作者]
王进科 夏德全
用DIG标记Jeffreys人源小卫星 33.6和 33.15为探针 ,与青鱼、草鱼、鲢、鳙、鲤、团头鲂、鳜鱼、尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼基因组DNA进行Southern杂交 ,获得多态性丰富的个体特异性DNA指纹图谱 ,建立了 9种鱼类的非放射性DNA指纹图谱。用DIG标记小卫星探针制作鱼类DNA指纹图谱安全可靠 ,克服了用放射性元素标记探针制作鱼类DNA指纹图谱的限制和不足 ,拓宽了鱼类DNA指纹图谱的应用范围。 9种鱼类的非放射性DNA指纹图谱研究也表明不同的DNA指纹探针在不同的鱼类上揭示的遗传信息不同 ,对鱼类的DNA指纹图谱研究应选择数个适宜的限制酶 /探针组合
关键词：
鱼类 非放射性 DNA指纹图谱
[期刊] 西南农业学报
[作者]
潘璐璐 丁兆堂 段伦才 王玉
本研究以筛选出的12条ISSR引物对14个茶树单株进行PCR扩增。结果表明,共扩增出清晰、重复性好的谱带151个,其中,特异带140条,多态性比例为92.72%;应用引物IR43、IR51组合获得了每份茶树单株的特征谱带,可以有效区分出所有供试材料,建立了14份茶树单株的ISSR指纹图谱;经聚类分析,在相似性系数为0.507处,所有材料被分为4个群体。
关键词：
黄山种 ISSR 指纹图谱
[期刊] 西南农业学报
[作者]
赵科 孙淑霞 李靖 涂美艳 王玲利 何成勇 徐子鸿 江国良 宋海岩 陈栋
【目的】丰富枇杷种质资源鉴定方法，为其发掘和利用提供理论依据。【方法】利用277对EST-SSR标记和1对果肉颜色相关InDel标记，对52份国内外枇杷种质资源和本研究团队创制的杂交后代进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。【结果】筛选出扩增带型清晰、稳定性和重复性好的9对引物，每对引物扩增条带为2～5条，平均85条；多态性条带比率为40.00%～100.00%，平均71.55%；多态性信息含量（PIC）为0.250～0.999，平均0.685。遗传多样性分析显示，52份枇杷种质资源和创制的杂交后代的平均相似系数为0.791；果肉颜色一致或地理分布相近的枇杷种质资源被聚类到相近的分类单元，并且可以准确地将西班牙、日本枇杷种质资源与其他种质资源进行区分。此外，本研究还构建了52份枇杷种质资源的DNA指纹图谱和色块矩阵。【结论】丰富了枇杷种质资源鉴定的分子标记，为今后发掘分子标记紧密连锁的功能基因或片段提供了理论依据。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
王进科 夏德全 吴婷婷
运用 33 6和 33 15两种人源小卫星探针对中国奠基群奥利亚罗非鱼群体进行遗传多态性的DNA指纹图谱研究。结果表明 ,在奥利亚罗非鱼群体中两种探针都能产生个体特异性的DNA指纹图谱 ;两种探针平均检测出 6 2 5条条带 ,其中多态性条带占 5 8 5 % ,个体平均条带数为 7 813 ;奥利亚罗非鱼种群内相似系数为 0 740 ,遗传变异系数为 0 2 6 0 ,证明奥利亚罗非鱼群体的遗传纯度极高 ,遗传多态性很低 ,但仍存在一定的遗传变异 ;DNA指纹图谱中 33 6产生的 7 2kb条带和 33 15产生的 9 4kb条带为奥利亚罗非鱼群体内各个体所共有 ,并且表现出一致的单...
关键词：
奥利亚罗非鱼 遗传多态性 DNA指纹图谱
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘娟 廖康 曼苏尔·那斯尔 孙琪 刘欢 贾杨
【目的】从ISSR分子标记水平分析新疆主栽杏品种(系)的遗传多样性和亲缘关系,构建新疆杏品种(系)的DNA指纹图谱数据库,为杂交育种、品种鉴定和品种分类提供理论依据。【方法】从供试样品中选取表型差异较大的6份材料对100个ISSR引物进行筛选,最终筛选出条带清晰、主带明显、多态性丰富、能够稳定重复且对品种具有较高鉴别力的ISSR特征引物,对48个新疆杏品种(系)进行扩增,采用POPGENE version 1.32软件计算多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),及各材料间的Nei’s遗传相似系数(...
[期刊] 水产学报
[作者]
张倩倩 陈杰 蒋霞云 邹曙明
为对不同鳊鲂鱼类进行群体鉴定和遗传多样性分析,从60对微卫星标记中筛选出18对多态性高的引物,构建了6个鳊鲂鱼类群体的微卫星DNA指纹图谱。结果显示,东江三角鲂、钱塘江三角鲂、厚颌鲂、广东鲂、团头鲂和长春鳊6群体的平均等位基因数(N a)分别为5.17、6.11、3.50、6.56、5.22、5.22,平均期望杂合度(H e)分别为0.634 2、0.720 4、0.546 2、0.681 2、0.675 2、0.559 7,平均多态信息含量(PIC)分别为0.575 6、0.666 9、0.472 0、0.630 6、0.606 4、0.517 0,表明钱塘江三角鲂的遗传多样性最高,厚颌鲂的...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
叶昌荣 戴陆园
本文结合笔者利用非放射性标记法进行限制性酶切片断长度多态性（ＲＦＬＰ）研究的实践经验，综述了近年来逐渐被广泛应用的三种非放射性标记法的产生、发展、原理和应用。
关键词：
非放射性标记法,分子生物学
[期刊] 中国农业科学
[作者]
雷天刚 何永睿 吴鑫 姚利晓 彭爱红 许兰珍 刘小丰 陈善春
【目的】构建柑橘栽培品种(系)的DNA指纹图谱数据库,为建立柑橘种苗纯度及真实性鉴定技术体系和技术规范奠定基础。【方法】利用SSR标记和ISSR标记对102个柑橘栽培品种(系)进行DNA指纹分析,筛选适合的特征引物,构建柑橘栽培品种(系)的指纹图谱数据库。【结果】从200对SSR引物中筛选到重复性好、多态性丰富的12对引物作为柑橘品种(系)鉴定的特征引物,12对SSR特征引物组合可鉴别42个品种(系);在此基础上,对未出现SSR特征指纹的60个品种(系)进行ISSR指纹分析,从40个ISSR引物中筛选到2个可用于品种鉴定的特征引物,结合SSR标记,可快速、准确地鉴别70个柑橘的品种(系)。并利...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
陈惠端 陈美霞 蔡金月 徐鲜钧 方平平 徐建堂 陶爱芬 牛小平 祁建民
以36个黄麻野生种和栽培种为材料,对其基因组DNA进行相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记分析.结果表明:从50对引物中筛选出扩增带型好、品种间带型差异明显、易于识别的34对多态性引物,共扩增出1845条多态性条带,平均每对引物扩增出51.25条,最后从中筛选出14对核心引物构建了36个黄麻品种的DNA指纹图谱,每个品种均有各自特异的DNA指纹,可为黄麻种质资源分子身份证绘制提供依据.
[期刊] 西南农业学报
[作者]
高洁铭 杨世鹏 孙雪梅 王丽慧 李莉 钟启文
[目的]为挖掘菊芋优异种质资源,补充菊芋DNA指纹图谱。[方法]本研究以12份菊芋品种和8份美国菊芋资源为基础,通过8对SSR与7对SRAP引物,检测菊芋基因组DNA差异,对待测品种和资源通过毛细管电泳以进行品种差异鉴定、聚类分析和DNA指纹图谱的构建。[结果]共筛选出14对特异性良好的引物,其中7对SSR引物共扩增出435个位点,具有多态性位点234个,多态性比率为53.7%;8对SRAP引物共扩增出285个位点,具有多态性位点146个,多态性比率为51.2%。聚类分析结果表明,20份菊芋材料被分为六大类,相近地理来源的菊芋大都聚为同一大类,美国菊芋种质资源被单独分为几类。共筛选出6对特异性较高的引物序列,构建了供试菊芋品种和资源的DNA指纹图谱。[结论]为不同产地和来源的菊芋种质资源鉴定和溯源提供了理论基础。结果表明SSR、SRAP标记用于菊芋品种选育及鉴定是可行的。
[期刊] 华北农学报
[作者]
王掌军 王建设 刘玲 刘生祥 陈素生 许勇 王永健
以小卫星DNA YNZ22核心序列为引物,甜瓜DNA为模板,在甜瓜上研究了直接扩增小卫星DNA(DAMD)的优化反应体系,结果表明:在20μL的反应体系中,5种主要成分Taq DNA聚合酶、Mg2+、引物、模板DNA和dNTPs的最适浓度分别为1U,2.5 mmol/L,0.5 mmol/L,30 ng,5 mmol/L。在优化的DAMD-PCR反应体系下,利用该引物在28个甜瓜品种上构建了直接扩增小卫星DNA(DAMD)的指纹图谱,分析结果表明,该引物在28个甜瓜品种上共扩增出13位点,其中9位点具有多态性,多态性条带比率为69%,可一次性从28个甜瓜品种中鉴别出其中的21个,鉴别率高达75...
关键词：
甜瓜 小卫星DNA 指纹图谱
[期刊] 水产学报
[作者]
谢潮添 陈昌生 纪德华 赵国瑞 徐燕 史修周
采用20对简单重复序列(SSR)引物对福建省坛紫菜种质资源库中保存的44个坛紫菜种质材料进行了遗传分析,共检测到了81个多态性位点,每对引物检测到的等位基因介于2～6个之间,平均为4.05个,引物的PIC值介于0.15～0.79之间,平均为0.57。然后根据3对引物(Phes08,Phes03和PC13)扩增出的16个多态性位点构建了44个坛紫菜种质材料的指纹图谱库,使得每一种质材料均具有其特异的DNA指纹图谱。并根据指纹图谱中各扩增位点条带的有无,将指纹图谱转化成了计算机可以识别的数码指纹,开发了相应的数码指纹识别软件,为坛紫菜种质的自动化鉴定及坛紫菜种质资源库的信息化管理奠定了基础。
[期刊] 水产学报
[作者]
宋红梅 白俊杰 叶星 全迎春 李胜杰
采用微卫星DNA指纹图谱技术对奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼和橙色莫桑比克罗非鱼进行品种鉴定和遗传多样性分析。从103对罗非鱼微卫星引物中筛选出82对多态性高、带型清晰稳定的引物,用这82对引物检测3种罗非鱼的遗传结构,共检测到605个等位基因,平均等位基因数7.37个,数据经Popgen32计算和EXCEL工具作图,构建3种罗非鱼的DNA指纹数据库,并绘制了DNA指纹图谱模式图。结果显示,奥利亚罗非鱼、尼罗罗非鱼和橙色莫桑比克罗非鱼的平均观测杂合度分别为0.179 6、0.530 1和0.312 2,平均期望杂合度分别为0.203 2、0.678 6和0.291 3,平均多态信息含量分别为0.07...
关键词：
罗非鱼 指纹图谱 微卫星 种质鉴定
[期刊] 中国农业科学
[作者]
宋海斌 崔喜波 马鸿艳 朱子成 栾非时
【目的】建立甜瓜品种的DNA指纹图谱数据库,实现对甜瓜品种进行快速、准确的鉴定。【方法】应用SSR分子标记技术,首先利用20份具有代表性的甜瓜品种(系)筛选SSR引物,然后对105份不同甜瓜品种(系)进行指纹图谱的构建。【结果】从1 219对SSR引物中筛选出18对引物为105份材料形成了多态性的指纹图谱,其中每对引物可以检测到4—14条数目不等的多态性条带,平均为9条;多态性信息含量(PIC)平均为0.68,变化范围为0.55—0.82。105份材料间的相似系数为0.70—0.99。利用这18对SSR核心引物构建的指纹图谱库能够有效区分所有供试材料,并且为每份材料建立了一份独特的指纹图谱。【...
关键词：
甜瓜 指纹图谱 SSR标记 核心引物
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
宋婉 续九如
该文对应用于果树种质资源鉴定的各种方法进行了系统的论述 .文中介绍了传统的形态学、孢粉学、细胞学以及蛋白质凝胶电泳方法在果树种质资源鉴定方面的应用及能解决的问题 ;论述了目前 5种重要的DNA指纹图谱方法 ,即RFLP、RAPD、小卫星DNA(VNTR)、微卫星DNA(SSR)和AFLP的特点以及在果树种质资源鉴定中的具体应用 ,并对指纹图谱方法在果树遗传研究等方面的应用前景进行了分析
关键词：
果树 种质资源鉴定 DNA指纹图谱
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