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[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
孔德政 刘艺平 杨秋生
利用RAPD标记技术,对8个碗莲品种进行了遗传多态性分析,从70个10碱基随机引物中,筛选出多态性频率较高的引物4个:S87、S110、S130、S473,扩增后共得到14条多态性条带,平均多态性为70%。选择6条清晰度高的多态性条带绘制8个碗莲品种的指纹图谱,在该图谱中每个品种均有各自特异的DNA指纹。研究结果为碗莲品种的鉴定和保护提供了一种有效的方法。
关键词:
碗莲 RAPD DNA指纹
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
明军 张启翔 晏晓兰 邱丽娟
应用银染法AFLP技术,通过筛选的7对Mse I-EcoR I引物组合,建立了162个梅花品种的175个样品指纹。使用NTSYSpc2.1t软件,计算遗传相似性,以SAHN Clustering进行不加权成对算术平均法(UPGMA)聚类分析。其中引物组合E-ACT/M-CAG和E-GA/M-CTC分别仅有两个样品不能区分开,其余引物组合均能鉴别175个样品中的164个以上的样品。7对引物组合的平均鉴别效率达到95.89%,两对引物组合可以鉴别所有样品。以引物组合E-GA/M-CTC为例进行了品种鉴定的聚类分析。所以,用AFLP-DNA指纹图谱来鉴别梅花品种资源,效率是很高的。
关键词:
梅花 AFLP DNA 指纹 品种鉴定
[期刊] 华北农学报
[作者]
姜伟 李雪源 何觉民 陆建农
利用ISSR对8个新疆品种(系)进行指纹图谱构建。通过基因组多态性分析,从60条引物中筛选到11条扩增效果好的引物,用其中2条引物UBC809,UBC841建立8个品种的指纹图谱,统计品种鉴定的置信概率达到1/8388608。结果显示,ISSR分子标记技术对棉花品种的指纹图谱构建具有高效性和准确性。
关键词:
ISSR标记 品种鉴定 指纹图谱
[期刊] 华北农学报
[作者]
郭景伦
模仿育种是一快速、高效、针对性强的(改良)育种方法,但是根据最新国际保护公约规定,所育品种属于依赖性派生品种,侵害了原品种权人的权利。改良品种与原品种的遗传差异多大才算是依赖性派生品种,目前国内外没有标准。以BA为母本,以H28、昌7-29、502、P138、齐319、连87、吉853、京2101、京343、京832为父本组配了10对同母异父玉米杂交组合,研究了杂交组合两两之间的遗传差异。结果表明:遗传差异在20%以下的组合,父本之间具有明确的血缘关系;遗传差异在20%~30%的组合,父本之间有40%具有血缘关系,没有血缘关系的占60%;遗传差异在30%以上的组合,父本之间全部没有血缘关系。无...
关键词:
玉米 依赖性派生 DNA指纹 标准
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
孔德政 刘艺平 田云芳
通过试验比较,分析了CTAB法中EDTA(乙二胺四乙酸)浓度和PVP(聚乙稀吡咯烷酮)对碗莲叶片DNA提纯结果的影响;同时还比较了叶片采集时间及遮光处理对提纯结果的影响。结果确定了适于碗莲叶片基因组DNA提取的方法以及如何选择最合适的材料进行DNA的提取,从而获得RAPD、RFLP、SSR等分子标记手段所需要的高纯度基因组DNA。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
雷天刚 何永睿 吴鑫 姚利晓 彭爱红 许兰珍 刘小丰 陈善春
【目的】构建柑橘栽培品种(系)的DNA指纹图谱数据库,为建立柑橘种苗纯度及真实性鉴定技术体系和技术规范奠定基础。【方法】利用SSR标记和ISSR标记对102个柑橘栽培品种(系)进行DNA指纹分析,筛选适合的特征引物,构建柑橘栽培品种(系)的指纹图谱数据库。【结果】从200对SSR引物中筛选到重复性好、多态性丰富的12对引物作为柑橘品种(系)鉴定的特征引物,12对SSR特征引物组合可鉴别42个品种(系);在此基础上,对未出现SSR特征指纹的60个品种(系)进行ISSR指纹分析,从40个ISSR引物中筛选到2个可用于品种鉴定的特征引物,结合SSR标记,可快速、准确地鉴别70个柑橘的品种(系)。并利...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
明军 张启翔
该文使用AFLP标记法技术 ,以半同胞家系的‘早凝馨’、‘凝馨’ ,全同胞家系选育出的品种‘美人’梅、‘小美人’、‘俏美人’、‘黑美人’和朱砂型相近梅花品种‘徽州骨红’、‘舞朱砂’、‘小骨里红’共计 9个品种为样本 ,选用 7对引物组合E ACT M CAT、E GA M CTC、E ACT M CCA、E ACT M CAC、E ACT M CAG、E ACC M CAG和E ACT M CTC扩增得到 2 97个多态性位点的条带数据 ,分别选用简单匹配系数和Nei(72 )遗传距离系数 ,进行不加权成对算术平均法聚类分析 ,分别建立了聚类树 .分析结果表明 :...
关键词:
梅 AFLP DNA指纹 品种鉴定 家系
[期刊] 中国农业科学
[作者]
宋海斌 崔喜波 马鸿艳 朱子成 栾非时
【目的】建立甜瓜品种的DNA指纹图谱数据库,实现对甜瓜品种进行快速、准确的鉴定。【方法】应用SSR分子标记技术,首先利用20份具有代表性的甜瓜品种(系)筛选SSR引物,然后对105份不同甜瓜品种(系)进行指纹图谱的构建。【结果】从1 219对SSR引物中筛选出18对引物为105份材料形成了多态性的指纹图谱,其中每对引物可以检测到4—14条数目不等的多态性条带,平均为9条;多态性信息含量(PIC)平均为0.68,变化范围为0.55—0.82。105份材料间的相似系数为0.70—0.99。利用这18对SSR核心引物构建的指纹图谱库能够有效区分所有供试材料,并且为每份材料建立了一份独特的指纹图谱。【...
关键词:
甜瓜 指纹图谱 SSR标记 核心引物
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李志远 于海龙 方智远 杨丽梅 刘玉梅 庄木 吕红豪 张扬勇
【目的】搜集生产上的主要甘蓝品种,构建基于SNP标记的品种指纹图谱,为鉴定甘蓝品种的特异性、真实性提供依据。【方法】首先,利用50个甘蓝高代自交系的重测序数据,与甘蓝参考基因组(02-12)进行比对筛选SNP位点。挑选多态性较好、在染色体上均匀分布的SNP位点,并将其转化为KASP标记,利用KASP平台对供试材料进行检测,得到59个甘蓝品种的基因分型数据。根据基因分型数据,筛选出多态性信息含量(PIC)高、无基因型数据缺失且在染色体上均匀分布的标记作为构建指纹图谱的核心标记。将核心标记的分型结果转化为二元编码数据,获得甘蓝品种SNP-DNA指纹图谱。在59个甘蓝品种中随机挑选15个品种,另外增加5个未推广的新组合用于构建人工虚拟混合群体,并利用此群体对甘蓝品种指纹鉴定技术进行验证,检测核心标记构建的SNP-DNA指纹图谱的准确性与可靠性。【结果】利用重测序数据与参考基因组(02-12)进行比对开发SNP标记,最终获得2.54×106个SNP标记。从中筛选出500个SNP位点用于KASP标记开发,平均每条染色体上55.6个。500个SNP位点中有442个成功转化为KASP标记,转化成功率为88.4%。KASP平台检测结果显示,在442个SNP标记中,有25个位点的未分型材料数>5,在后续分析中去除。剩余417个SNP位点的PIC值的变化范围为0.12—0.38,平均值为0.36,表现为中度多态性。在59个供试甘蓝品种中,全部417个SNP位点的杂合度大于30%的有57个,占所有品种的96.6%。其中,品种‘豫生早熟牛心’的杂合度最高,为67.8%。最终筛选出50个SNP位点作为核心标记,并利用这些标记构建甘蓝主要品种的指纹图谱。50个核心位点的PIC值的变化范围为0.35—0.38,平均值为0.36,其中位点Bol2-56的PIC值最高。基于核心SNP标记的聚类分析结果表明,59个品种的遗传相似系数为0.43—0.98。利用人工虚拟混合群体对核心SNP标记进行了验证,结果表明,利用核心标记可对甘蓝品种的特异性和真实性进行有效鉴定。【结论】基于甘蓝自交系重测序数据进行比对,共获得SNP位点2.54×106个;从中筛选获得50个核心SNP标记用于构建59个甘蓝品种的指纹图谱,并采用人工虚拟混合群体对核心SNP标记进行了验证。
关键词:
甘蓝 SNP标记 主要品种 指纹图谱
[期刊] 西南农业学报
[作者]
高洁铭 杨世鹏 孙雪梅 王丽慧 李莉 钟启文
[目的]为挖掘菊芋优异种质资源,补充菊芋DNA指纹图谱。[方法]本研究以12份菊芋品种和8份美国菊芋资源为基础,通过8对SSR与7对SRAP引物,检测菊芋基因组DNA差异,对待测品种和资源通过毛细管电泳以进行品种差异鉴定、聚类分析和DNA指纹图谱的构建。[结果]共筛选出14对特异性良好的引物,其中7对SSR引物共扩增出435个位点,具有多态性位点234个,多态性比率为53.7%;8对SRAP引物共扩增出285个位点,具有多态性位点146个,多态性比率为51.2%。聚类分析结果表明,20份菊芋材料被分为六大类,相近地理来源的菊芋大都聚为同一大类,美国菊芋种质资源被单独分为几类。共筛选出6对特异性较高的引物序列,构建了供试菊芋品种和资源的DNA指纹图谱。[结论]为不同产地和来源的菊芋种质资源鉴定和溯源提供了理论基础。结果表明SSR、SRAP标记用于菊芋品种选育及鉴定是可行的。
[期刊] 华北农学报
[作者]
赵久然 郭景伦 孔艳芳 尉德铭 王元东 卢柏山 邢锦丰 滕海涛 王继东
利用DNA指纹分析技术 ,分析了同母异父 5个杂交组合分别与其父母本之间的遗传距离 ,结果发现 ,每个杂交组合与其相应的父本之间的遗传距离最小 ,所有组合完全一一对应。因此 ,可以通过计算遗传距离来进行玉米亲子鉴定 ,只需计算出玉米杂交种与所有可能父本自交系之间的遗传距离 ,与其遗传距离最小的自交系就是该杂交种的真正父本。
关键词:
DNA指纹 玉米 遗传距离 亲子鉴定
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
宋婉 续九如
该文对应用于果树种质资源鉴定的各种方法进行了系统的论述 .文中介绍了传统的形态学、孢粉学、细胞学以及蛋白质凝胶电泳方法在果树种质资源鉴定方面的应用及能解决的问题 ;论述了目前 5种重要的DNA指纹图谱方法 ,即RFLP、RAPD、小卫星DNA(VNTR)、微卫星DNA(SSR)和AFLP的特点以及在果树种质资源鉴定中的具体应用 ,并对指纹图谱方法在果树遗传研究等方面的应用前景进行了分析
关键词:
果树 种质资源鉴定 DNA指纹图谱
[期刊] 西南农业学报
[作者]
郝豆豆 张勇群 雷鸣 拉多
【目的】基于ITS2条形码技术鉴定藏药材苞叶雪莲,以保证药材质量,确保用药安全。【方法】对采自西藏林芝的苞叶雪莲进行DNA提取,PCR扩增得到ITS序列并测序;所有样品的ITS2序列采用基于隐马尔可夫模型(HMM)的注释方法获得,使用MAGE6.0进行多重序列比对,并构建进化树,同时预测苞叶雪莲ITS2序列的二级结构。【结果】苞叶雪莲及其近缘物种的ITS2序列间存在明显差异,基于ITS2序列的NJ树及ITS2二级结构能将苞叶雪莲及其近缘物种区分开。【结论】ITS2序列可以有效的鉴别苞叶雪莲及其近缘物种,可以为苞叶雪莲的安全用药及合理开发利用提供依据。
关键词:
苞叶雪莲 ITS2 DNA条形码
[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
任佳伦 季梦成 赵爽 刘志高
铁线莲属Clematis为观赏价值极高的藤本植物。铁线莲品种数量繁多,形态变异丰富,遗传背景也相对复杂,品种间存在杂交不亲和性的障碍,对杂交亲本的染色体核型分析等细胞学特征的研究显得十分重要。采用酶解法-去壁低渗火焰干燥法与Giemsa-C分带染色技术,以13个铁线莲品种自然生长的幼嫩根尖为试材,进行染色体参数和核型分析。结果表明:13个品种的染色体均为2n=2x=16,均为二倍体;染色体核型分为2种类型:2n=2x=16=10m+4st+2t,2n=2x=16=10m+6st;随体均在第6条,第7条或第8条染色体上,且位置均在短臂上;13个品种的核型类型均为"2a",具有很大的相似性,说明杂...
关键词:
植物细胞遗传学 铁线莲属 染色体 核型
[期刊] 西南农业学报
[作者]
潘璐璐 丁兆堂 段伦才 王玉
本研究以筛选出的12条ISSR引物对14个茶树单株进行PCR扩增。结果表明,共扩增出清晰、重复性好的谱带151个,其中,特异带140条,多态性比例为92.72%;应用引物IR43、IR51组合获得了每份茶树单株的特征谱带,可以有效区分出所有供试材料,建立了14份茶树单株的ISSR指纹图谱;经聚类分析,在相似性系数为0.507处,所有材料被分为4个群体。
关键词:
黄山种 ISSR 指纹图谱
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