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[期刊] 海洋渔业
[作者]
王超 陈爱华 曹奕 吴杨平 张雨 姚国兴 蔡永祥
为探究中国辽东半岛海域（辽宁群体）、长江口及其两翼海域（江苏群体）、台湾海峡西部海域（福建群体）、珠江口及其两翼海域（广东群体）、北部湾海域（广西群体）以及日本伊势湾海域（三重群体）６个不同海域文蛤（Ｍｅｒｅｔｒｉｘ Ｍｅｒｅｔｒｉｘ）地理群体的亲缘关系，采用１８Ｓ ｒｒＮＡ基因、线粒体细胞色素氧化酶ｃ亚基Ⅰ（ｃＯⅠ）及１６Ｓ ｒｒＮＡ基因３种分子标记进行序列测定与分析。测序结果显示，３种基因序列长度分别在１ ８５４、６５８、５９６ ｂｐ左右；１８Ｓ ｒｒＮＡ基因碱基组成无偏异，序列较为保守；ｃＯⅠ与１６Ｓ ｒｒＮＡ基因Ａ＋ｔ平均含量明显大于Ｇ＋ｃ含量，符合线粒体基因组成特征。通过ＭｅＧ Ａｌ．．．
[期刊] 海洋渔业
[作者]
陈爱华 吴杨平 姚国兴 张志伟 吴建平
对丽文蛤和文蛤的可量性状进行了单因子方差分析、主成分分析、聚类分析和判别分析,比较了两者的形态差异。单因子方差分析结果显示,丽文蛤与文蛤在10个比例性状中存在着7~8个显著差异(P<0.05)。建立了5个判别函数,其判别准确率P1为69.51%~98.75%,P2为76.67%~...
关键词：
丽文蛤 文蛤 形态差异 多元分析
[期刊] 海洋渔业
[作者]
吴杨平 陈爱华 姚国兴 张雨 蔡永祥 王超 高波 张如国
从采自江苏如东(S)、广西北海(G)、日本本州(J)的3个不同地理群体文蛤(Meretrix meretrix)中选取红壳色个体组成亲贝群,并以5%的选择压力从中挑选最大壳长个体作为育种基础群,按照双列杂交的方式,建立9个交配组合,每组3个家系。实际获得6个交配组合(Gs、Gj、Sg、Sj、Gg、Ss),共18个家系,比较各家系的育种值,对家系进行综合评价,并进行配合力的测定和杂交优势分析,筛选最优杂交组合。结果表明,早期存在母本效应,自13日龄之后,杂交组合(Gs、Gj、Sg和Sj)的壳长均大于自繁组合(Gg和Ss),且杂交优势越来越显著。杂交组的Kung育种值和综合评定值均大于自繁组,其中...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘秀云 李慧 刘志国 赵锦 刘孟军
【目的】枣原产中国，种质资源丰富。对来自中国２２个省区不同用途的２５５个枣品种进行ＳＳＲ分析，揭示这些不同产地来源的枣种质资源之间的亲缘关系和群体遗传结构，为枣种质资源的科学管理和分子标记辅助育种提供参考。【方法】利用改良ＣＴＡＢ提取供试枣种质的基因组ＤＮＡ，以前期枣基因组测序挖掘出的ＳＳＲ引物为基础，进行高效率引物筛选，并利用ＳＳＲ分子标记技术对２５５份枣种质资源的基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增，然后利用８％聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，银染后显色。根据条带有无统计数据，计算出多态性位点百分率（ＰＩＣ），用ＮＴＳＹＳ软件进行ＵＰＧＭＡ聚类分析；利用ＳＴＲＵＣＴＵＲｅ软件分析群体遗传结构，计算出最适群体．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
肖国强 林志华 董迎辉 柴雪良 陆荣茂 刘保忠
为了培育文蛤新品种,开展了不同地理群体文蛤(山东野生群体和江苏野生群体)的自繁和互交实验,获得了2个自繁群体和2个互交群体,运用方差分析对4个群体子一代的浮游幼虫和稚贝(1～12月龄)的主要性状进行了比较。结果表明,各实验组的受精率、受精卵的孵化率、胚胎发育和浮游幼虫生长无明显差异;2个月龄内稚贝各实验组生长发育差异不明显;3-12月龄稚贝生长性状主要表现为S♀×J♂>S♀×S♂>J♀×S♂>J♀×J♂,其中前3个组合之间差异不显著,但均与第四组合差异显著;互交组的杂种优势率范围在6%～168%。杂种优势在不同性状表现不同,活体重的杂种优势高于壳长、壳高和壳厚;同时各性状指标受季节性温度变化影...
关键词：
文蛤 种群 自繁 生长 杂种优势
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
么宗利 王慧 周凯 来琦芳
运用3种多元统计分析方法,比较研究了我国青蛤5个地理群体(福建、浙江、江苏、天津及辽宁)的形态差异。选择了14个可量性状和6个地区生态特征参数进行主成分分析和聚类分析。结果表明,江苏、天津和辽宁的形态较接近,其中福建群体的趋异差异最大。主成分分析构建了3个主成分。其贡献率:主成分1为28.05%,主成分2为18.6%,主成分3为14.0%,累计贡献率为60.65%。逐步判别选入8个贡献率较大的性状进行判别分析。结果显示,5个群体形态差异显著(P<0.01)。建立了5群体判别函数,其判别准确率P1为35%~90%,P2为73.7%~86%。综合判别率为67.5%。青蛤形态学差异是遗传和环境共同作...
[期刊] 水产学报
[作者]
马朋 刘萍 李健
对脊尾白虾的莱州湾、海洲湾、象山湾3个野生群体共计62个个体的核糖体RNA转录单元内间隔区ITS1基因片段进行克隆和测序,对序列特点进行分析,并结合GenBank数据库中已有的长臂虾亚科ITS1同源序列虾类进行系统分析。结果显示,脊尾白虾的ITS1序列具有长度多态性,其长度为345~384 bp,62条序列GC的平均含量显著高于AT含量;共检测到79个变异位点,39种单倍型,多态位点比例为21.7%;海洲湾群体遗传多样性指数最高,象山湾群体次之,莱州湾群体最低。在脊尾白虾ITS1序列中发现微卫星序列共有8处,重复序列类型为(GC)n、(AG)n、(GGC)n、(GGA)n、(AT)n、(GA)...
关键词：
脊尾白虾 ITS1 遗传多样性 系统进化
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
杨坤梅 杨璧嘉 胡梦露 任书娴 李宗艳
[目的]探究西南牡丹品种群与不同种源牡丹品种的亲缘关系,为其栽培起源研究提供基础资料。[方法]以50个中原牡丹品种、20个西南牡丹品种、18个西北牡丹品种、6个国外牡丹品种、1个江南牡丹品种和2个野生种共计9 6份不同地理种源牡丹为材料,利用36个目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism,SCoT)引物进行PCR扩增,筛选多态性比率好的条带,利用NTSYS-pc软件计算品种间的遗传相似性系数,在此基础上,采用UPGMA聚类分析个体间的亲缘关系。[结果]多态性好的引物共有18个,用其对96个牡丹样本进行扩增,共获得182条扩增条带,其中多态性条带172个,多态性比率为94.50%;96个样本间的遗传相似性系数在0.5523～0.868 1,品种间遗传差异较大,其中遗传相似性系数最大的是西北牡丹品种2与品种3,而紫斑牡丹与豆绿和中甸紫2的遗传相似性系数最小。在遗传相似性系数为0.693 1时,96个牡丹样本聚为8支,第1支由15个中原牡丹品种、4个西南牡丹品种和1个江南品种组成;第2支由2个西南牡丹品种丽江紫3和昭通粉1组成;第3支由35个中原传统牡丹品种聚成;第4支包括3个日本品种、1个法国品种和14个西南品种;第5支由17个紫斑牡丹杂交品种聚成;第6支仅有紫斑牡丹1个样本;第7支仅有黄牡丹1个样本;第8支由美国品种海黄和法国品种金晃聚成。[结论]西南牡丹品种与日本牡丹关系最近,与中原牡丹也有着近缘关系,而与其他种源的品种群关系较远。产地对西南牡丹品种的亲缘关系影响较大。
关键词：
牡丹 遗传多样性 SCoT标记 亲缘关系
[期刊] 中国水产科学
[作者]
滕爽爽 方军 金文辉 肖国强 邵艳卿 柴雪良 张炯明
为研究斧文蛤(Meretrix lamarckii)不同地理群体(浙江苍南群体、福建长乐群体、福建宁德群体以及广东汕头群体)的遗传结构和系统发生关系,采用13对微卫星分子标记,对4个不同地理群体进行了分析。结果显示,13对引物共检测出63个等位基因,每个位点等位基因数(Na)2~7个,平均每个位点观测等位基因数(Na)为4.87;有效等位基因数(Ne)为1.927~2.591;平均观测杂合度(Ho)为0.437~0.562;平均期望杂合度(He)为0.446~0.549;平均多态信息含量(PIC)为0.383~0.490;Hardy-Weinberg平衡检验表明,4个群体的大部分微卫星位点都偏...
关键词：
斧文蛤 微卫星 遗传多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
赫崇波 丛林林 葛陇利 刘卫东 周遵春 高祥刚
应用AFLP标记技术对辽宁和山东沿海文蛤(Meretrix meretrix)养殖群体和野生群体的遗传多样性进行分析。采用7对AFLP引物组合对5个群体(3个野生群体,2个养殖群体)150个个体进行扩增,共得到364个的位点。5个群体内的多态位点比例为84.3945%~87.6465%,总多态位点比例为99.6300%。群体的Nei’s基因多样性指数(H)为0.2301~0.2634;群体的Shannon多样性指数为0.3617~0.4248,群体间的遗传距离为0.0394~0.1609,群体内个体间的遗传距离为0.2592~0.5360。辽宁大洼野生群体和山东河口野生群体的多态位点比例、Sh...
关键词：
文蛤 AFLP 遗传多样性
[期刊] 林业科学
[作者]
阿地力·沙塔尔 张伟 程晓甜 朱银飞 骆有庆 陈梦
枣实蝇是一种高度危险性外来有害生物。对吐鲁番市、KSS、HSX和HMS4个不同地区采集的枣实蝇mtDNACOI基因片段测序,并进行序列比较和系统发育分析。结果表明:采自吐鲁番市、HSX、HMS的枣实蝇遗传距离最近,为0.002,其相似性高达99.8%。吐鲁番市枣实蝇和HMS枣实蝇分别与KSS枣实蝇的遗传距离最远,为0.062,其相似性为94.1%。对以上几个地点采集的枣实蝇基因序列与已公开报道的外群蔷薇咔实蝇Carpomya schineriR248FJ571365.1、蔷薇咔实蝇Carpomya schineriR141FJ571364.1、樱桃绕实蝇Rhagoletis cerasiGQ1...
关键词：
枣实蝇 COI基因 PCR 线粒体DNA
[期刊] 海洋渔业
[作者]
荆圆圆 胡凡光 刘广斌 吴海一 孙铭 陈群 张天文
为研究山东沿海不同地理群体中国蛤蜊(Mactra chinensis)形态差异和地理分化特点，运用多变量形态度量学方法，通过方差分析、主成分分析、聚类分析和判别分析对日照东港(DG)、烟台海阳(HY)、青岛黄岛(HD)、威海文登(WD)和东营垦利(KL)5个中国蛤蜊野生群体形态数据进行比较分析。生长指标指数显示，文登群体贝壳最厚，黄岛群体贝壳最薄、肥满度最低，海阳群体软体部最肥；5个群体间最大差异系数为0.515～1.245,均小于1.28,尚未达到亚种水平；主成分分析共提取3个主成分，主成分1贡献率为33.71%,主成分2贡献率为27.16%,主成分3贡献率为14.42%,累计贡献率达75.29%;聚类分析结果表明，5个中国蛤蜊群体聚为2类，海阳群体、文登群体和垦利群体聚为一类，东港群体和黄岛群体分别聚为一类；通过判别分析，共建立了4个判别函数，判别准确率为70.0%～94.0%,综合判别率为80.0%。研究结果可为中国蛤蜊的地理群体识别、种质资源保护与利用提供重要依据。
关键词：
中国蛤蜊 地理群体 形态差异分析
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张年国 周裕华 于飞
【目的】研究6个地理群体脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)的形态差异,为脊尾白虾的种质资源保护及其良种选育提供参考依据。【方法】采用单因素方差分析、聚类分析、主成分分析及判别分析等多元分析方法,以体质量和外部形态性状(全长、体长、头胸甲长、头胸甲宽、头胸甲高、第一腹节高、第一腹节宽、额剑长、尾节长、腹部长)为指标,对分别采自中国沿海赣榆、大丰、如东、启东、奉贤、宁海6个地理群体的脊尾白虾进行比较分析。【结果】(1)脊尾白虾群体的形态性状差异明显,其中宁海群体与其他群体差异最明显,大丰群体与赣榆、奉贤群体最为相近。(2)聚类分析发现,赣榆群体与大丰群体欧氏距离最短,形态最为接近,宁海群体趋异程度最大。(3)贡献最大的3个主成分的方差贡献率分别为27.490%,23.819%和18.039%,累积方差贡献率高达69.348%,其中主成分1中负荷值最大的为头胸甲宽/体长(0.749)。(4)得到6个地理群体脊尾白虾的判别函数,判别准确率P1为48.30%～75.00%,P2为50.00%～93.75%,综合判别率为60.60%,6个群体间各性状比例的差异系数均<1.28。【结论】不同地理群体脊尾白虾存在一定程度的外部形态差异,但这种形态差异尚未达到亚种水平。
关键词：
脊尾白虾 地理群体 形态差异 判别分析
[期刊] 海洋渔业
[作者]
杨琴 赵峰 宋超 张涛 苗中博 庄平
为研究长江口及其邻近海域凤鲚(Coilia mystus)群体的形态差异,分别采集江苏吕四(吕四群体)、上海崇明(崇明群体)、浙江舟山(舟山群体)和浙江温州(温州群体)近岸海域的凤鲚共160尾,测量获得了11个传统形态可量性状和19个框架结构数据,将其转化为29个形态比例指标,并进行了多元统计分析。非参数检验分析表明:除吻长/体长以外,凤鲚4个群体其它性状比例均存在显著性差异(P
[期刊] 中国水产科学
[作者]
宋超 杨琴 赵峰 张涛 胡丽娟 庄平
为探明相邻海域凤鲚(Coilia mystus)群体间的差异性，分别采集江苏吕四(吕四群体)、上海崇明(崇明群体)、浙江舟山(舟山群体)和浙江温州(温州群体)邻近海域的凤鲚共240尾。以凤鲚矢耳石为研究对象，利用耳石测量法和耳石框架法获得21个测量参数，通过公式转化为20个形态指标数据，并进行多元统计分析。非参数检验显示4个群体间14个形态指标具有显著性差异(P<0.05)；主成分分析构建了7个反映耳石形态特征的主成分，累计贡献率为81.79%，结果显示不同群体耳石的整体形态相似，各群体间的耳石形态差异主要体现在局部的框架形态指标；利用贡献率最大的9个形态指标构建了4个群体的判别方程，温州群体的判别准确率最高为96.7%，其次是崇明群体(66.7%)、吕四群体(60.0%)和舟山群体(58.3%)；聚类分析表明崇明和舟山群体距离最近，其次为吕四群体，与温州群体距离最远。结果表明：崇明、舟山和吕四群体的矢耳石形态差异较小，而温州群体与这3个群体的差异最大，可单独确立为一个生态群体。可见，短距离洄游性凤鲚不同群体间耳石形态差异大小与不同群体间地理阻隔程度相关。
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