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[期刊] 水产学报
[作者]
庞艳红 孙中武 尹洪滨 王炳谦
The levels of genetic variation at 40 genic loci of 15 isozymic systems in rainbow trout(Oncorhynchus mykiss) were determined among Donaldsons super rainbow trout,rainbow trout from California of USA,rainbow trout from Norway, rainbow trout from Danmark,and Jalo rainbow trout respectively.The geneti...
关键词：
虹鳟 群体 同工酶 遗传结构 遗传变异
[期刊] 中国水产科学
[作者]
赵紫霞 许建 白庆利 杨世勇 蒋立坤 陈葆华 Palti Yniv Gao Guangtu 徐鹏
本研究旨在对国内虹鳟(Oncorhynchus mykiss)代表性养殖群体开展全基因组水平的遗传评估。利用57K单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)芯片,检测了来自不同地域的6个虹鳟养殖群体样本共计48尾,包括黑龙江虹鳟、黑龙江金鳟、四川虹鳟、四川金鳟、北京虹鳟和北京金鳟,共获得有效SNP位点50201个,在中国虹鳟中的多态比例达到97.7%,表明该芯片虽然基于美国和挪威虹鳟群体设计,但对中国群体同样具有良好的适用性。各群体最小等位基因频率均值为0.240~0.267,与国外主流养殖群体相近,黑龙江虹鳟、四川虹鳟和北京虹鳟群体内遗传多样性丰富,多态位点比例为83.6%~84.9%,与国外主流养殖群体相近,而黑龙江金鳟、四川金鳟和北京金鳟,多态位点比例相对较低,在60.2%~76.9%范围内。应用6个中国虹鳟群体和2个美国虹鳟群体数据开展系统发育分析、主成分分析和群体遗传结构STRUCTURE分析,结果显示8个群体可分为3个祖源类群,其中3个金鳟群体为遗传联系较紧密的一个类群,黑龙江虹鳟和北京虹鳟为一个类群,而四川虹鳟与2个美国虹鳟群体为一个类群,部分中国养殖群体中有显著离群个体存在,表明群体遗传背景不均一。本研究表明,高密度SNP芯片在我国虹鳟养殖群体遗传分析中具有广泛的应用前景,能够为种质资源评估、本土化良种培育、制种和引种工作提供基因组水平的参考信息。
关键词：
虹鳟 SNP芯片 遗传多态性 群体结构
[期刊] 中国水产科学
[作者]
徐浩 鲁翠云 郭薇 孙效文
利用30个微卫星标记分析了虹鳟(Oncorhynchus mykiss)4个品系,即芬兰虹鳟、挪威虹鳟、美国金鳟及日本金鳟的遗传多样性,并对部分品系2005年及2011年采集的样品进行了比较分析,揭示了在养殖及育种的选择压力下同品系虹鳟的遗传多样性的变化趋势。结果表明:①30个微卫星标记均可用于4个虹鳟品系的种质鉴定;②4个品系的平均等位基因数为3.77~5.80,平均期望杂合度为0.590 6~0.722 1,平均观察杂合度为0.587 5~0.786 1,平均多态性信息含量为0.535 0~0.647 0,说明4个品系均属高度多态,遗传多样性较高;③计算4个虹鳟品系遗传距离,并进行聚类分析...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
詹金绵 王炳谦 谷伟 刘英杰 杨润清
采用联合异速生长遗传模型,对中国水产科学研究院黑龙江水产研究所渤海冷水性鱼类试验站培育的F1杂交虹鳟(Oncorhynchus mykiss)和F2杂交虹鳟的体质量和体尺性状异速生长进行了遗传分析,旨在为虹鳟及其他水产动物异速生长的遗传参数估计和实现体质量与体型的同步选育奠定理论基础。首先采用逐步回归分析法选择体尺性状对体质量的异速生长显著的性状,建立最优表型联合静态、动态异速生长指数模型,随后构建了两个用于遗传分析多个静态、动态异速生长的随机回归模型。虹鳟多个体尺性状相对体质量的异速生长遗传分析结果表明,体长与体质量具有较大的异速生长指数,为1.633 8,且为正异速生长,而其他体尺性状相对...
关键词：
虹鳟 生长性状 异速生长 遗传分析
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李艳红 李宁 蒋丽 谷伟 张晓慧 杨润清 王炳谦
通过来自渤海、丹麦、道氏、挪威和美国加州的5个虹鳟(Onchorynchus mykiss)养殖群体的完全双列杂交试验,分别在第249天、397天、552天和771天4个时间点观测了体重和体长变化。多重比较分析发现,20个杂交组合与对应5个自繁系之间在体重或体长性状上存在显著差异(P<0.05)。采用最小二乘分析法估算了不同时间点体重和体长的一般配合力、特殊配合力、反交效应、母体效应及自繁效应值。结果显示,只有少数的遗传效应是显著存在的,而且这些遗传效应在不同性状和不同时间点的表现不尽相同。整个观测过程中,渤海群体和道氏杂交组合的体重和体长生长速度都是最快的,并且在体长上与对应的自繁系比较差异...
关键词：
虹鳟 完全双列杂交 配合力分析 生长性状
[期刊] 淡水渔业
[作者]
谷伟 王炳谦 赵吉伟 贾钟贺
自2004年至2009年历经两个世代研究了5个虹鳟(Oncorhynchous mykiss Walbaum)品系的相对繁殖力、绝对繁殖力与形态学指标的关系及其遗传进展。结果显示:美国加州、美国道氏、挪威品系的繁殖力指标好于丹麦和渤海品系。各品系绝对繁殖力与体长呈幂函数关系,即F=7.2071L1.6099(R2=0.6479,P<0.01)。绝对繁殖力随着卵径的增加而呈增加趋势,但卵径达到(0.4±0.1)cm时这一规律不明显。5个品系子一代优势选育系(G1优势选育系)与基础种群相比较,绝对繁殖...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
杨濯羽 张艳萍 娄忠玉 焦文龙 王太
采用１０对微卫星标记分析了道氏虹鳟（ＯｎｃＯｒｈｙｎｃｈｕｓ ｍｙｋｉｓｓ）２２个选育家系的遗传多样性及遗传结构。结果显示：２２个道氏虹鳟家系均具有较高的遗传多样性，在９个微卫星位点共获得７１个等位基因，平均等位基因数为７．８９；平均多态信息含量（Ｐｉｃ）为０．７４；平均观测杂合度（ｈＯ）和期望杂合度（ｈｅ）分别为０．７８０和０．７７１。进行ｈａｒｄｙ－Ｗｅｉｎｂｅｒｇ平衡检验，发现２２个群体在不同位点均发生了不同程度偏离。计算遗传距离，发现部分家系之间遗传距离较大。综合分析，得出２２个道氏虹鳟家系中家系８、家系１１、家系１２、家系２１、家系２８、家系２９遗传多样性相对丰富，具有较大的遗传潜力．．．
[期刊] 中国水产科学
[作者]
张志伟 陈爱华 张志勇 陆勤勤 张朝晖 姚国兴 蔡永祥 吴杨平 曹奕 张雨
运用微卫星标记对大竹蛏(Solen grandis)辽宁丹东(DD)、河北秦皇岛(QHD)、山东日照(RZ)、江苏吕四(LS)和广西北海(BH)近海5个不同地理野生群体共计150个样品进行了遗传多样性分析。结果表明:14个位点多态信息含量范围为0.696~0.853,均呈现高度多态性,每个位点检测到的等位基因数8~22个,共检测到199个等位基因,平均等位基因数为14.2,等位基因丰富度为11.05,5个群体的期望杂合度分别为0.769(DD),0.791(QHD),0.826(RZ),0.815(LS),0.785(BH),观察杂合度分别为0.837(DD),0.812(QHD),0.875...
关键词：
大竹蛏 微卫星 野生群体 遗传多样性
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
董在杰 曲疆奇 苏胜彦 梁政远 明俊超 袁新华 谢庄
运用TRAP标记技术,选取10个多态性较好的引物组合对荷包红鲤、黄河鲤、建鲤、兴国红鲤和黑龙江野鲤等5个鲤群体进行遗传多样性分析,其中固定引物是根据目标候选基因GHR基因的序列设计。结果表明,共扩增出168个位点,其中多态性位点134个,平均多态位点比例为80.41%,平均多态性信息含量为0.29。分子变异方差分析(AMOVA)结果显示群体内的方差贡献率达96.97%,表明各个鲤群体内存在较大的遗传变异。种群再分效应固定指数(FST=0.030 26,P<0.05)表明不同鲤群体间有显著的遗传分化。基于目标候选基因的TRAP标记对5个鲤群体进行聚类分析,结果表明建鲤和兴国红鲤首先聚成一类,然后...
关键词：
鲤 TRAP标记 遗传多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
刘海金 朱晓琛 孙效文 杨立更 薛玲玲 毛连菊
利用16对微卫星分子标记对牙鲆(Paralichthys olivaceus)的5个养殖群体进行遗传多样性分析。结果表明,等位基因数为2~9个,平均等位基因数为6.0625;有效等位基因数1.2596~5.5161,平均有效等位基因数3.692;各位点的杂合度观测值(Ho)0.2200~0.8000;杂合度期望值(He)0.2061~0.8187。各群体之间无偏倚杂合度期望值从小到大依次为丹东、北戴河、威海、青岛、荣成。Kruskal-Wallis检验结果(H=0.672,df=4,P=0.955)则说明,5个群体遗传多样性差异不显著。群体间基因分化系数(GST)为0.0991,各群体之间存在...
关键词：
牙鲆 养殖群体 遗传多样性 微卫星
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
凌去非 李思发 赵金良 张海军
2002年10-11月,应用聚丙烯酰胺凝胶水平电泳,对我国新疆丁群体和从捷克引进的丁鱼岁群体各30尾个体的ADH、IDH、LDH、SDH、SOD、EST、MDH、ME、6PGDH、G3PDH等10种同工酶和1种肌蛋白进行分析。结果发现,我国丁鱼岁群体在EST-2、SOD、ADH和IDH等4种同工酶存在多态,捷克群体在EST-1、ADH和IDH等3种同工酶存在多态。我国新疆丁群体多态位点比例为28.57%,比捷克丁群体高(21.43%)。平均杂合度分别为0.061 9,也比捷克丁群体高(0.035 7)。捷克丁群体存在一定的杂合子缺失现象。因此,从遗传保护角度,应防止引入我国的捷克丁鱼...
关键词：
丁 群体 生化遗传多样性 同工酶
[期刊] 水产学报
[作者]
黄福勇 李明云
30 ayu(Plecoglossus altivelis) samples were collected from the cultural net in Fuxi Town, Ninghai County, Zhejiang Province. Polyarylamide gel electrophoresis was used to detect the expression of isozymes in 8 organs or tissues: eye, liver, kidney, muscle, spleen, heart, gill and pectroral fin. ADH,...
关键词：
香鱼 同工酶 生化遗传分析 遗传多样性
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
徐衡 胡永来 徐义平 金凯 陈鹏
采用形态判别分析和ＳＲＡＰ标记相结合的方法，对浙江沿海彩虹明樱蛤８个群体尤其是乐清湾群体的形态和遗传多样性进行了分析，结果表明：（１）乐清、温岭与台州的群体具有相似的形态结构，而与宁波、舟山群体则差异较大；可以利用形态特征对乐清湾与舟山、宁波湾彩虹明樱蛤群体进行初步鉴别；（２）与舟山、宁波相比，浙江乐清湾群体遗传多样性比较高；乐清湾群体聚为一支，表明它们之间具有更高的遗传相似性。形态和ＳＲＡＰ研究结果一致表明，各群体在形态和遗传相似性方面基本反映了各群体的地理关系，但乐清湾养殖群体与宁波群体更为相近，乐清湾彩虹明樱蛤养殖群体可能会对乐清湾野生群体造成种质混杂。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
陆丽君 马爱军 王新安 岳亮 孟雪松 翟介明 谭林涛 侯仕营
对中国国内主要养殖区域红鳍东方鲀种质资源情况进行调查,采用微卫星标记分析技术,选用20对微卫星引物,对国内来自不同养殖区的5个红鳍东方鲀养殖群体:文登群体(WD)、莱州群体(LZ)、日本群体1(J1)、日本群体2(J2)、唐海群体(THQ),进行遗传多样性分析。实验结果显示,12对引物具有多态性。5个群体的等位基因数为2～8个不等;平均观测杂合度分别为0.27、0.26、0.18、0.25、0.20;平均期望杂合度分别为0.55、0.57、0.69、0.71、0.62;平均多态信息含量排列顺序为J2(0.65)>J1(0.63)>THQ(0.55)>LZ(0.51)>WD(0.48)。分析结果...
关键词：
红鳍东方鲀 养殖群体 微卫星 遗传多态性
[期刊] 水产学报
[作者]
赵文 张雷 毕进红
采用ISSR技术,对辽宁沿海5个毛蚶群体的遗传多样性进行了研究。在选择的12个随机引物中共检测到137个扩增片段,长度在200～2 500 bp,每个个体获得的扩增条带在9～15条不等。利用POPGEN 3.2和MEGA 2统计软件,获得实验数据,确立了5个群体间的亲缘关系。结果表明,毛蚶5个地理群体分化不明显,没有形成不同的地理种群;聚类分析显示,丹东和庄河亲缘关系最近,然后依次为金州、营口、锦州;5个群体无论是在多态位点比例还是在平均杂合度上都处于较高水平,说明毛蚶当前种质资源状况良好,遗传多样性水平较高。
关键词：
毛蚶 遗传多样性 ISSR
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