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[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)  [作者] 高利华  马国辅  陈超  邢军  张建生  吴井生  
采用混合基因组DNA池PCR扩增和测序技术,对小梅山猪、枫泾猪、大白猪pgr基因的外显子区域进行扫描,共发现1个单核甘酸多态性位点(SNP)。外显子1序列中1 319 bp处发生C→T的碱基突变,即C1319T,未引起氨基酸的变化,属于同义突变;针对突变位点,建立错配PCR–限制性长度多态性(RFLP)方法进行检测,发现3种猪的pgr基因可以分为AA、BB、AB 3个基因型,小梅山和枫泾猪有AA、AB 2种基因型,大白猪中有BB、AB 2种基因型。
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 查丽莎  储明星  狄冉  陈宏权  方丽  张宝云  马月辉  李奎  
设计15对引物,采用PCR-SSCP技术检测孕酮受体(progesterone receptor,PGR)基因全部9个外显子在小尾寒羊、湖羊、特克塞尔和多赛特中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对小尾寒羊产羔数的影响。只有引物P9扩增片段具有多态性。对于P9扩增片段,在小尾寒羊、湖羊和多赛特中均检测到AA、AG和GG型,在特克塞尔中只检测到AA和AG型。测序表明GG型与AA型相比在217 bp处有一单碱基突变(A→G),但未引起氨基酸变化。GG型和AG型小尾寒羊产羔数均值分别比AA型的多0.97只(P<0.05)和0.64只(P0.05)...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 王凭青  鲁浪  储明星  狄冉  张宝云  方丽  马月辉  李奎  
【目的】寻找与产羔数相关的遗传标记,为山羊高繁殖力的标记辅助选择提供科学依据。【方法】设计15对引物,采用PCR-SSCP技术检测孕酮受体(progesterone receptor,PGR)基因全部9个外显子在济宁青山羊、波尔山羊、辽宁绒山羊和安哥拉山羊中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对山羊繁殖力的影响。【结果】只有引物P1、P8与P9扩增片段具有多态性。对于P1扩增片段,济宁青山羊中检测到AA、AB和BB型,其余山羊中均检测到AA和AB型;测序表明BB与AA型相比有一处突变(31G→A),并导致丙氨酸变为苏氨酸;BB基因型济宁青山羊产羔数最小二乘均值比AB基因型多0.52只(P<0.05...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)  [作者] 张善文  陈斌  
以猪孕酮受体(PGR)基因序列为模板设计引物,采用PCR RFLP技术检测PGR基因外显子1在长白猪和大白猪中的单核苷酸多态性,同时研究该基因对猪总产仔数、产活仔数和出生窝重的影响。对于扩增的外显子1片段,在大白猪中检测到GG、AG和AA型,在长白猪中只检测到GG和AG型。测序结果表明,GG型与AA型相比,在326 bp处有一单碱基突变(G→A),该基因所编码的氨基酸则由甘氨酸变为丝氨酸。长白猪GG型总产仔数、产活仔数和出生窝重与AG型总产仔数、产活仔数和出生窝重的差异均没有统计学意义。大白猪AG型总产仔数、产活仔数和出生窝重与GG型总产仔数、产活仔数和出生窝重的差异有统计学意义,大白猪GG型...
[期刊] 渔业科学进展  [作者] 张金勇  史宝  柳学周  徐永江  
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 杨东英  陈宏  张良志  蓝贤勇  张争锋  王新庄  王居强  
利用改进的DNA提取方法和PCR-RFLP技术,对南阳牛、秦川牛、西镇牛、鲁西牛(地方黄牛品种)和荷斯坦奶牛等5个牛品种的263头个体lep tin基因外显子3多态性进行了分析。结果表明,牛lep tin基因外显子3长度为330 bp,存在H aeⅢ和Ap aⅠ限制性内切酶的酶切位点,但在这2个酶切位点上无多态性,2种酶酶切片段长度均为70 bp和260 bp。说明牛lep tin基因外显子3在H aeⅢ和Ap aⅠ2个酶切位点上具有保守性。
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 苏瑛  刘楚吾  叶昌辉  刘丽  张梅芳  张锦  蔡笛扬  
[期刊] 中国农业科学  [作者] 杜晓惠  李丛艳  刘俊莹  牛伟贺  张细权  
【目的】揭示与繁殖性状关系密切的催乳素受体(prolactin receptor,PRLR)基因与中国地方鸡种的就巢性及产蛋性能的关系。【方法】本试验采用PCR-SSCP方法,以576只宁都黄鸡为材料,检测PRLR基因的多态性,并进行多态性与就巢和产蛋性状间的关联分析。【结果】证实了前人研究过的SNP1(T10862C,外显子3)和SNP2(T25670C,外显子6)均与就巢性状无显著关联(P>0.05);SNP2对300 d产蛋量影响显著(P<0.05);新发现的SNP3(G30716A,内含子8)显著影响开产日龄(P<0.05);新发现的SNP4(A31900G,外显子10)极显著地影响就...
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 马百全  魏天雨  吴艳  郭苹  王钧顺  张建生  邢军  刘红林  李齐发  
[目的]本试验旨在研究梅山猪和苏淮猪BMP4(Bone MorPhogenetic Protein 4)基因3'-Utr区序列特征,分析苏淮猪BMP4基因3'-Utr区SnP位点并了解苏淮猪和高繁殖力猪种梅山猪BMP4基因3'-Utr SnP位点多态性。[方法]采用克隆测序技术获得苏淮猪BMP4基因3'-Utr区序列;利用生物信息学方法分析其序列特征;利用池DnA测序技术筛选SnPS,采用AS-Pcr技术分析苏淮猪和梅山猪SnPS位点多态性。[结果]苏淮猪BMP4基因3'-Utr区序列长度为267 BP,含有一个(Ac)9微卫星位点和Poly A结构;在苏淮猪BMP4基因3'-Utr区20 n...
[期刊] 中国农业大学学报  [作者] 张陈华  丁月云  王阳  殷宗俊  
利用现代分子标记技术寻找影响猪产仔数的标记基因座,为应用标记辅助选择培育高繁殖率猪的品种或品系提供依据。本试验采用PCR-RFLP(AluⅠ限制性内切酶)分子标记技术,分析了55头圩猪母猪和63头定远猪母猪的PRLR基因exon 10多态性,并采用最小二乘法分析了PRLR基因多态性对产仔数影响的遗传效应。经检测,圩猪和定远猪exon 10上均存在丰富的多态性。圩猪和定远猪AA、AB和BB型频率分别为0.490 9、0.436 40、.072 7和0.507 9、0.396 80、.095 2;等位基因A的基因频率分别为0.709 1和0.706 3,A为优势基因。被测猪群的基因频率和基因型频率...
[期刊] 中国水产科学  [作者] 张金勇  柳学周  史宝  徐永江  李晓妮  常亚青  王滨  
运用同源克隆和RACE方法获得了半滑舌鳎(Cynoglossus sEmilAEvis)孕酮受体膜组分1(PgRmC1)的C DnA全长序列,生物信息学分析显示,半滑舌鳎PgRmC1 C DnA序列全长1335 bP,开放阅读框长546 bP;其编码的蛋白是单次跨膜蛋白,在n端13~35位氨基酸残基处有一个跨膜区域。半滑舌鳎PgRmC1氨基酸序列与青鳉(oRyziAs lAtiPEs)相似性最高,达到了82.9%;与青斑河鲀(tEtRAoDon nigRoviRiDis)相似度为81.2%。系统进化分析表明,半滑舌鳎PgRmC1与鳉形目和鲀形目鱼类PgRmC1聚为一个分支。采用实时荧光定量Rt...
[期刊] 华北农学报  [作者] 刘博洋  孟纪伦  邱峥艳  芦春艳  秦立红  张国梁  赵志辉  
采用PCR-SSCP方法对58头草原红牛钙激活中性蛋白酶3基因(CAPN3)的单核苷酸多态性进行研究分析,发现其外显子1存在三种基因型AA、AB和BB,测序发现,在外显子1的124位存在碱基突变,由原来的A突变为G,氨基酸水平由天冬氨酸Asp变为天冬酰胺Asn,此SNP位点在此前的研究中未见报道。经遗传多样性分析表明,该位点等位基因A占优势地位,且三种基因型分布符合Hardy-W e inberg平衡。通过显著性差异检验发现,CAPN3基因此位点的多态性对该牛群的屠宰率、净肉率和大理石花纹这三个性状有显著影响(P<0.05),这将为CAPN3作为牛肉肉质性状候选基因提供进一步依据。
[期刊] 华北农学报  [作者] 刘斌  李玉荣  马跃军  赵存发  尉光荣  李金泉  
该研究以内蒙古阿尔巴斯型白绒山羊为研究对象,选择绒山羊催乳素(PRL)及其受体(PRLR)基因部分序列作为候选基因,采用PCR-SSCP分子标记技术和DNA测序技术研究其多态性,然后运用最小二乘方差分析方法,对各基因型间生产性状指标进行差异显著性检验,分析绒山羊PRL、PRLR基因的SNP与绒山羊产绒性状的关系,寻找可用于辅助选择的分子标记。结果表明:PRL基因P1和PRLR基因P3引物位点存在SSCP多态,在PRL基因Exon 5区域存在X76049:g.576 bp C-A突变,该突变导致第176个密码子CCC变成ACC,从而使脯氨酸变成苏氨酸(Pro-Thr)。方差分析表明,该位点多态与...
[期刊] 华北农学报  [作者] 王继英  姜运良  郭建凤  王诚  张印  武英  
为研究FUT I基因对断奶仔猪生长性能的影响,对莱芜黑猪、杜洛克和大约克猪群共752头仔猪样本在FUT I基因M307位点多态性进行检测,并对不同基因型与生长性状的关系进行分析,结果表明:莱芜黑猪、杜洛克和大约克群体在FUT I基因M307位点均存在丰富多态性,且在该突变位点均显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(p<0.01)。莱芜黑猪群体内G基因占优势,而杜洛克和大约克群体内均为A基因稍占优势。3种基因型对杜洛克和大约克仔猪的70日龄保育重(和断奶仔猪腹泻和水肿病密切相关)影响达到显著(p<0.05)或极显著(p<0.01)水平,但对莱芜黑猪的70日龄的保育重无显著影响。结果提示:...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 马喜山  王爱国  刘桂芬  傅金恋  
【目的】研究猪HB-EGF基因的多态性及其与产仔数的关系,寻找与猪产仔数相关的分子遗传标记,以加快猪育种进程。【方法】利用PCR-SSCP技术研究HB-EGF基因外显子多态性,利用最小二乘均数法对其与产仔数的关系进行分析,同时对两个多态位点的方差组分进行了分析。【结果】在两对引物(E5和E7)中各检测到一个多态位点,均出现3种基因型(AA、BB、AB)。E5位点:对于大白猪,在3~8胎中,BB型个体的TNB和NBA均显著高于AA型个体(P<0.05),在所有胎次中,BB型个体的TNB显著高于AA型个体(P<0.05),NBA极显著高于AA型个体(P<0.01),TNB和NBA的遗传主要受基因加...
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