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[期刊] 中国农业科学
[作者]
王小敏 何孔旺 张文文 陈蔚 茅爱华 俞正玉 温立斌 倪艳秀 张雪寒 吕立新 郭容利 周俊明 李彬
【目的】对来自2008-2010年中国华东地区7个不同省市的疑似猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)发病猪场送检的病料进行PRRSV检测,并对其ORF5基因进行测序,确定当前PRRSV在中国华东地区的分子流行病学特征,并分析PRRSV在中国的遗传演化规律。【方法】利用RT-PCR方法对采集的样品进行PRRSV检测,并对PRRSV检测呈阳性的36份病料进行ORF5基因的序列测定和分析。【结果】260份病料中共检测到118份PRRSV阳性样品,阳性率为45.4%。ORF5序列分析和系统进化树分析结果表明,本试验所获得的36株PRRSV毒株序列均属于北美型,与GenBank中高致病性PRRSV(HP-PR...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
薛青红 张彦明 刘湘涛 郎洪武 邹敏 高金源 邓永
【目的】为分析2005-2007年间中国部分省区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特征,了解其遗传演化规律,查明中国目前PRRSV流行毒株现状。【方法】应用病毒分离方法从中国4个省份在2005-2007年间采集的81份疑似蓝耳病病料中分离到36株猪繁殖与呼吸综合征病毒,应用RT-PCR方法对36株PRRSV现地分离株的ORF5基因和Nsp2基因进行扩增和序列分析。【结果】36株现地分离株均属于美洲型PRRSV,ORF5基因全长均为603bp,未发现有基因缺失或插入,编码约200个氨基酸,分离株推导氨基酸序列变异主要发生在9～39位;36个分离株中有15株PRRSVNsp2...
[期刊] 华北农学报
[作者]
李彬 何孔旺 温立斌 茅爱华 王小敏 张雪寒 倪艳秀 周俊明 肖少波 陈焕春
为了确定猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行特点及变异规律,本研究首次对从2006年以来我国长江流域分离到的29株PRRSV的ORF3基因进行了克隆和序列测定,并与国外代表毒株和国内的高致病性PRRSV进行了比较分析。结果表明:所有分离毒株的ORF3基因均编码254个氨基酸,都属于美洲型PRRSV,推导的氨基酸同源性为84.6%～100%,与美洲型PRRSV VR-2332的同源性为85.0%～97.2%;与国内分离的高致病性PRRSV的同源性为86.6%～100%。根据ORF3基因的遗传进化分析,这些毒株可分为两个亚群,毒株HZ24与VR-2332及疫苗株亲缘关系较近,其他分离株与高致...
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
潘栋康 梁坤南 周再知 林明平 王先棒 周文龙 李昆亮 黄桂华
【目的】研究柚木无性系生长性状遗传变异和年度相关性，早期选育速生优良无性系。【方法】采用6株单行小区、6次重复的完全随机区组设计，对海南省乐东县15个柚木无性系大田测定林造林后1～5 a的保存率和生长指标进行方差分析、邓肯多重比较、遗传参数估算和相关性分析，并通过主成分分析，计算综合得分，在此基础上选出速生优良无性系。【结果】造林后5 a，柚木无性系间保存率差异显著（P <0.05），无性系保存率为61.5%～83.33%，平均保存率为73.26%，无性系7509的保存率最高，为83.33%；造林后5 a，柚木无性系间树高、胸径和单株材积均呈极显著差异（P <0.001），其平均值分别为5.29 m、7.29 cm和16.34 dm~3，以无性系74＿12最高，其树高、胸径和单株材积的平均值分别为6.12 m、9.11 cm和27.45 dm~3；造林后1～5 a柚木无性系的树高、胸径和单株材积的变异系数分别为15.02%～19.35%、13.65%～20.14%和31.04%～41.01%，重复力分别为0.697～0.858、0.819～0.847、0.751～0.854；柚木无性系生长性状的年度相关性呈显著水平（P <0.05）。【结论】柚木无性系生长性状间存在稳定的遗传变异，有较高的遗传改良潜力；为琼西南地区筛选出柚木速生无性系74＿12、7114和7509，入选无性系的树高、胸径、单株材积和保存率的平均值分别为5.77 m、8.07 cm、21.27 dm~3和74.61%，分别比对照提高了19.21%、23.60%、75.60%和3.40%。选择后树高、胸径和单株材积的现实增益为9.07%、10.69%和30.20%，遗传增益为7.71%、9.09%和25.67%，入选的3个无性系可作为后续柚木育种和推广的优良材料。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
黄泽彬 李润成 尹德明 颜运秋 刘忠华 丁建 汪镇南 余兴龙
从湖南省内多个出现疑似猪"高热病"症状的猪场采集病料70份,采用RT-PCR方法进行分子流行病学调查.结果检出PRRSV阳性病料54份,阳性率高达77.14%(54/70).对其中8份分别来自娄底、浏阳、永州、双峰、益阳、株洲、宁乡和溆浦的病料中的PRRSV基因组Nsp2高变区部分基因片段进行RT-PCR扩增、克隆和序列测定分析.与国内外美洲型PRRSV分离株比较,序列相似性为72.2%～100%,其中,与公布的高致病性PRRSV缺失变异毒株的同源性最高,序列相似性为98.2%～100%.序列分析表明,这些毒株均是天然存在缺失的变异毒株,其Nsp2均有2个部位出现了缺失,分别为编码1个氨基酸的...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张建勤 孙兆军 陈宏
利用4个微卫星标记对西北地区的固原鸡、固原红鸡和略阳乌鸡群体进行遗传变异分析。结果表明,地方品种固原鸡、略阳鸡和培育品种固原红鸡在4个位点的平均杂合度分别为0.748 7,0.709 2和0.733 2,平均有效等位基因数分别为5.129 0,3.505 8和4.468 9,平均多态信息含量分别为0.716 6,0.646 6和0.570 4。表明固原鸡、略阳鸡和固原红鸡均具有较大的遗传变异。
关键词：
鸡 微卫星标记 遗传变异 西北地区
[期刊] 中国农业科学
[作者]
赵国 刘晓文 钱忠明 薛峰 彭宜 彭大新 刘秀梵
【目的】为确定中国华东地区家禽中禽低致病性禽流感(Low pathogenic avian influenza,LPAI)的流行和分布状况。【方法】2002年7月至2009年9月在江苏省扬州市活禽市场(live poultry markets,LPMs)采集来自不同省份的家禽泄殖腔拭子11 645个,用鸡胚尿囊腔传代接种法分离病毒,进行了长达8年的LPAI的病毒学监测。【结果】禽流感阳性样品1 158个,总分离率9.94%。所分离到的亚型及各亚型分离率从高到低依次为H3、H6、H11、H1、H4、H9、H10、H8。【结论】禽流感的分布季节性非常明显,以冬、春为高,各亚型又有其不同分布特点。到...
关键词：
低致病性禽流感 流行病学 家禽
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
仲岩 张甜 陈钊 程宗明
[目的]本文旨在研究取自欧洲不同生态环境下的森林草莓生态型中的2个NBS-LRR抗病基因，揭示不同生态型中同一基因的遗传变异特征。[方法]选取森林草莓中具有代表性的2个NBS-LRR基因为目的基因，从不同森林草莓生态型中对其进行PCR扩增、测序并得到相应的核苷酸序列。利用ProtParam网站分析其理化性质；利用MEGA v7.0和DNAMAN v7.0对核苷酸序列以及蛋白序列进行多重比对，查找序列突变位点；利用Pfam、SMART、COILS等网站分析基因编码蛋白质的结构域组成；利用MEGA v7.0计算2个基因中不同生态型之间的K_(a)/K_(s)值、Pi值并构建系统进化树，分析其受到的选择压力及遗传进化关系。[结果]以Hawaii4的序列为参照，FvH4＿5g22710和FvH4＿1g15230基因在某些森林草莓生态型中发生了点突变和缺失突变。通过结构域分析可知FvH4＿5g22710基因只在Rx＿N结构域区段发生了突变，而在NB-ARC结构域和LRR基序中没有发生，FvH4＿1g15230基因在其编码的蛋白质RPW8、NB-ARC结构域和LRR基序区段均发生了突变。进化树的拓扑结构显示，来自在同一国家的生态型，其目的基因更偏向于聚类在同一进化枝上；2个基因的平均K_(a)/K_(s)值均小于1，说明它们均受到纯化选择的驱动。[结论] 2个NBS-LRR基因在不同的森林草莓生态型中都有一定程度的变异，这提高了抗病基因的遗传变异程度，可能与提高森林草莓抗病性有一定关联。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
吕振明 许逸天 吴常文 樊甄姣 张建设
为阐述过度捕捞后中国现存鳓(Ilisha elongata)资源的种质状况,采用16SrRNA基因测序技术对青岛、舟山、厦门和广州4个鳓地理群体的种群结构及遗传变异进行研究。通过对4个鳓群体共45个个体的线粒体16SrRNA基因进行测序,获得1个长度为657bp的同源序列。45个个体中共检测到32个多态位点,多态位点比例达4.88%,其中插入或缺失位点10个;45个个体中检测出20个单倍型,单倍型多样性指数(H)达0.812,核苷酸多样性指数(Pi)达0.0031,平均核苷酸差异数(K)达2.016。结果表明,中国现存鳓种群仍具较高的遗传多样性水平。对4个群体的遗传结构进行检测表明,青岛群体与...
关键词：
鳓 16SrRNA基因 遗传变异
[期刊] 华北农学报
[作者]
张猛 张立敏 周正奎 袁峥嵘 黄萌 邓桂馨 刘喜冬 刘利 李姣 高雪 高会江 许尚忠 李俊雅
旨在研究中国西门塔尔牛CACNA2D1基因的遗传变异及其与屠宰性状的关系。本试验与所采用的传统的PCR-SSCP或者PCR-RFLP技术不同,首次借助高通量SNP芯片技术在136头中国西门塔尔牛群体中对CACNA2D1基因的遗传变异进行了研究。结果显示,在中国西门塔尔牛CACNA2D1基因上总计发现12个有效SNP位点,其中4个位点Ho、He和PIC值较低属于中低度多态,8个位点属于高度多态。卡方适合性检验表明,10个位点处于HarDY-Weinberg平衡状态(P>0.05)。各位点遗传变异与屠宰性状进行关联分析显示,位点1不同基因型个体在肉色性状方面差异显著(P<0.05),位点2不同基因...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李波波 孔杰 卢霞 孙犁 隋娟 刘绵宇 罗坤 孟宪红 陈宝龙 曹宝祥 刘宁 栾生
为了评估中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)核心育种群体calcineurin B基因(FcCN-B)表达量的遗传变异水平，从2018年构建的G13代群体中随机选取32个家系，每个家系随机选择20尾个体，分别放入20个网箱中(每个网箱包括32尾虾)，限制饲料投喂量，利用Real-time PCR方法检测每尾虾神经节组织中FcCN-B基因的表达量。结果表明，FcCN-B基因在个体水平上表达明显呈正偏态分布，均值(8.25)大于中位数(6.95)，表明存在极大值个体；极差为43.48，最大值是最小值的44.48倍，个体间表达量的变异系数为66.55%。家系间FcCN-B表达量的变异系数相对较小(19.31%)，最大值仅为最小值的2.20倍。单因素方差分析表明，FcCN-B基因的表达量在家系水平上差异显著(P＜0.05)。利用个体动物模型结合系谱信息，获得FcCN-B基因表达量的遗传力估计值为0.60±0.13。这表明其在育种群体中具有较高的遗传变异水平，遗传改良的潜力大。研究结果为解析中国明对虾竞争行为的分子机理、改良其竞争性提供了重要的参考数据。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
王家妍 莫雅芳 申礼凤 付承志 李昌荣 魏国余
[目的]通过研究不同林龄段桉树生长情况和遗传变化规律,筛选合适桂南地区速生优良的桉树无性系,为桉树良种选育提供参考。[方法]以桂南地区23个桉树无性系为研究对象,对其不同林龄段的胸径、树高、单株材积和保存率进行研究,并估算无性系主要遗传参数。[结果]不同林龄无性系胸径、树高和单株材积存在极显著差异;5.5年生时,单株材积犬于均值的无性系有9个,其中LL13-1单株材积最大,达到0.258 m~3;各生长性状重复力随着林龄增长变化幅度较小,无性系生长受到低中等遗传控制。[结论]根据无性系相对表现比较分析,为桂南地区筛选出的优良无性系为LL13-1、EC148、EC145、LL13-2、GE17和298-1。
[期刊] 水产学报
[作者]
马召腾 刘至治 潘连德 蒋鑫
运用ISSR分子标记技术,分析中国境内松江鲈鱼浙江(Z)、山东(S)、河北(H)、辽宁鸭绿江(Y)等4个不同群体间的遗传变异。从100个ISSR引物中筛选出多态性引物15个,对每群体各30个个体进行分析。每引物的扩增条带为6~17条,共得到有效位点181个,其中多态位点136个,多态位点百分率为75.14%。4群体中,H群体的有效等位基因数、Nei氏基因多样性、Shannon氏信息指数及多态位点百分率为最低,分别为1.258 5、0.153 0、0.2322、49.17%;而Y群体的相应值为最高,分别为1.479 4、0.277 7、0.411 2、74.03%;Z和S两群体的值明显高于H群体...
[期刊] 水产学报
[作者]
岳志芹 王伟继 孔杰 戴继勋
利用AFLP技术对连续4年选育的中国对虾抗白斑病毒群体进行了遗传分析,并比较了不同的数据处理方法对遗传学参数的影响。7个EcoRⅠ/MseⅠ引物组合共产生350个位点,其中202个为多态位点。4代群体的多态位点比例分别为:39.4286%,41.4286%,33.4286%,39.1429%,Nei基因多样性指数分别为:0.1197,0.1259,0.1133,0.1249;4代群体的Shannon多样性指数分别为0.1831,0.1917,0.1702,0.1896。遗传多样性水平除了第3代群体标本明显较低外,其它3代甚为接近,维持在一个恒定的水平。比较了Nei分析、Shannon信息指数分...
关键词：
中国对虾 AFLP 遗传变异 抗病群体
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