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[期刊] 浙江农林大学学报
[作者]
余望寅 姚冠 扎西拉姆 普琼 刘京晶 周湘
【目的】揭示不同栽培环境对铁皮石斛Dendrobium catenatum内生细菌群落结构的影响,解析与石斛多糖含量存在潜在关联的功能菌种。【方法】针对温室人工基质培养和仿野生立木附生培养2种栽培体系下的铁皮石斛C9品系根、茎、叶等各部组织内生细菌,采用Illumina测序平台的Miseq进行高通量测序分析其菌落结构和多样性,同时利用逐步回归法分析内生细菌分布与组织多糖质量分数的关联性。【结果】铁皮石斛在2种栽培环境不同组织中的菌群结构差异显著(P<0.05),附生立木仿野生环境比温室环境下物种丰富度更高。同时,根部所含分类操作单元(OTUs)数量最多(112～630个),叶部则最少(28～73个)。其中,厚壁菌门Firmicutes(16.7%～34.9%)、拟杆菌门Bacteroidetes(8.7%～35.6%)和变形菌门Proteobacteria(15.9%～42.0%)的OTUs占优势。从菌种生理功能上看,固氮相关的菌种如弗兰克菌科Frankiaceae在树培环境下相对丰度更高,推测可能受树培寡氮环境的影响使固氮菌富集。逐步回归分析结果显示:不动杆菌Acinetobacter在根、茎、叶不同组织中的相对丰度与多糖质量分数变化关联度最大,其次为假单胞菌Pseudomonas。【结论】铁皮石斛内生细菌资源相当丰富,而栽培方式影响菌群分布,且与石斛多糖质量分数具有关联性。图4表1参27
[期刊] 西南农业学报
[作者]
尹利方 陈泽斌 夏体渊 耿开友 赵凤 靳松 李静雯 牛燕芬
对污染铁皮石斛组培苗的内生细菌进行分离和鉴定，为预防铁皮石斛组织培养过程中内生细菌污染提供科学依据。采用ＮＡ培养基分离纯化细菌，通过形态特征、生理生化指标结合１６Ｓ ｒＤＮＡ序列同源性分析，对引起铁皮石斛组培苗污染的内生细菌进行鉴定。引起铁皮石斛组培苗污染的内生细菌为ＳＨ４２菌株，其形态特征及生理生化指标与莫海威芽孢杆菌（ＢＡｃｉｌｌｕＳ ｍｏｊＡｖｅＮＳｉＳ）基本相同；１６Ｓ ｒＤＮＡ序列分析结果表明，ＳＨ４２与Ｂ．ｍｏｊＡｖｅＮＳｉＳ（Ａｍ９４８９７０）聚在同一系统发育分支，其同源性为９９．４％。因此确定引起铁皮石斛组培苗污染的内生细菌ＳＨ４２为莫海威芽孢杆菌。
关键词：
铁皮石斛 组织培养 内生细菌 分离 鉴定
[期刊] 西南农业学报
[作者]
徐文婷 张雅琼 董文汉 白燕冰 李泽生 孙文丽 杨生超 谢世清 梁泉
铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)是典型的菌根植物,共生真菌对铁皮石斛生长具有促进作用。本研究选用草炭土、菇渣、玉米芯等3种基质按不同比例配制了9种固体菌剂,比较测定了9种菌剂在室温条件下菌株的保存情况。选用保存效果最好的基质分别与内生真菌Chs-1-1、R2、S3制备菌剂进行铁皮石斛田间试验,测定了菌剂中内生真菌在铁皮石斛植株内的定殖能力和菌剂的促生效果。结果表明,草炭土的保存效果最好,在6个月后菌体数量达到8.1×107CFU/g;田间试验中,接种处理后铁皮石斛幼苗的存活率显著高于对照,最高者达95.78%;接种菌剂能有效提高幼苗的株高和根...
关键词：
石斛 内生真菌 固体菌剂 促生
[期刊] 林业科学
[作者]
王瑫 李永 朴春根 汪来发 朱天辉
为了解三倍体毛白杨和健杨94树干皮层组织中内生细菌的群落多样性和季节动态变化,利用传统的细菌分离培养,结合16SrDNA序列分析等方法对其进行分析。从2种杨树干部皮层中共计分离纯化细菌菌株532株,分属于26属47种,2种杨树内生细菌组成存在较大差异。其中,从三倍体毛白杨中分离得到18属30个种,以根瘤菌属和芽孢杆菌属为优势菌群;健杨94中分离得到16属22个种,以根瘤菌属、微杆菌属为优势菌群。杨树干部皮层植物内生细菌的多样性丰富。2种杨树内生细菌数量季节变化规律总体表现为夏秋2季均高于冬春2季。2种杨树在4个季节的优势菌群各不相同,随季节变化而变化。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
周灵芝 劳承英 申章佑 李艳英 黄渝岚 韦本辉 胡泊 周佳
【目的】分析连作淮山根际土壤细菌群落结构,为解决淮山连作障碍提供参考依据。【方法】以淮山品种桂淮2号为试验材料,设置定向栽培连作淮山(T)和对照(CK)两个处理,采用Illumina MiSeq高通量测序技术结合土壤理化性质,分析连作淮山根际土壤细菌群落多样性及其与土壤理化因子的关系。【结果】基于细菌16S rRNA基因分析,对6个土壤样品测序共得到有效序列230961条,可操作分类单元(OTU)3423个。各样本检测到细菌群落含33门95纲242目395科780属1524种。Venn图分析结果显示,T处理和CK共有细菌OTUs数1688个,T处理特有OTUs数1388个。T处理土壤细菌的Shannon指数、ACE指数和Chao l指数均极显著高于CK(P<0.01,下同)。物种群落组成分析结果表明,放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、酸杆菌门(Acidobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)是T处理根际土壤细菌的主要优势菌群,占物种群落组成的88.45%。主成分分析结果显示,第一主成分(PC1)和第二主成分(PC2)对细菌群落结构的差异性贡献率分别为81.44%和14.49%,细菌群落结构表现为连作受PC1影响明显。土壤理化性状是影响细菌群落组成的重要因子,与变形菌门、绿弯菌门、拟杆菌门、粘球菌门(Myxococcota)、Patescibacteria、疣微菌门(Verrucomicrobiota)和WPS-2的群落分布显著相关。【结论】淮山连作可提高其根际土壤细菌多样性,其优势细菌群落为放线菌、变形菌、厚壁菌、绿弯菌和酸杆菌;连作淮山土壤pH及水解氮、速效钾和有机质含量的变化是影响其细菌群落组成发生变化的重要因子。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
谢玲 张雯龙 蓝桃菊 陈艳露 覃丽萍 NARISAWA Kazuhiko 刘斌
从不同植物的茎和叶中分离获得２０４株真菌，通过对白菜的致病性测定筛选获得１株能显著促进白菜生长的内生真菌菌株２４Ｌ－４。结合形态学特征观察进行ＩＴＳ－ｒ ＤＮＡ和１８Ｓ－ｒ ＤＮＡ序列分析，对其进行鉴定，确定为ＤｅｖｒＩｅＳＩＡ ＬＡｇｅｒＳＴｒｏｅｍ。该菌株对铁皮石斛组培苗的株高、叶宽、茎径和干质量分别较未接种对照处理增加３３．３％、６５．７％、２７．３％和４５．１％，显著高于对照处理。同时，盆栽试验表明：Ｄ．ＬＡｇｅｒＳＴｒｏｅｍ铁皮石斛盆栽苗的茎径、鲜质量和干质量分别较无接种对照增加１０４．０％、８３．９％和１１４．７％，显著高于对照处理。显微镜观察发现：Ｄ．ＬＡｇｅｒＳＴｒｏｅｍ可定殖．．．
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
游玲 魏琴 郭华 张云
【目的】研究山苍子可培养内生细菌的多样性。【方法】利用添加植物组织浸提液的营养琼脂培养基分离山苍子根、茎、叶及果实中的可培养内生细菌,采用16SrDNA序列鉴定法对分离获得的山苍子可培养内生细菌进行鉴定。同一组织内,对16SrDNA序列及形态完全一样的菌株合并冗余,用Clustalx对分离得到的菌株16SrD-NA进行排序,构建Neighbor-Joining系统进化树,并计算Jaccard指数和多样性指数。【结果】共分离得到52株山苍子可培养内生细菌(根23株、茎8株、叶7株、果实14株),分属于芽孢杆菌属(Bacillus)、类芽孢杆菌属(Paenibacillus)、Paenochrob...
关键词：
山苍子 可培养内生细菌 多样性
[期刊] 西南农业学报
[作者]
宋宇 王鹏 韦月平
【目的】本文探讨了不同稻田栽培模式下土壤细菌群落组成和多样性的变化。【方法】利用高通量测序技术对河蟹共作稻田(SDHXZ)、非洲雁共作稻田(SDFYZ)和单作稻田(SDKBZ)3种栽培模式表层土壤细菌进行高通量测序及分析。【结果】测序共获得240 070个有效序列,3157个OTU,48个门,115个纲,224个目,391个科,721个属和1343个种。Venn图显示3个处理组共有的细菌OTU数是1525个,SDFYZ特有OUT数最多为357个,SDHXZ的ace指数和shannon指数均高于SDFYZ和SDKBZ,说明SDHXZ土壤细菌多样性和丰富度高于其他2个处理。稻田土壤细菌多样性与pH和氨态氮相关性较大,丰富度则与硝态氮呈正相关。3个处理的优势菌门和优势菌属基本相同。PCoA分析图显示3个处理的土壤细菌群落结构差异较大。【结论】SDHXZ表层土壤细菌群落多样性和丰度最高,具有更好的土壤细菌生态基础。该研究可为合理选择水稻栽培模式提供一定理论支持。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
刘莉 王家金 徐蕾 张庭 吴丽华 王翰墨 李智敏 査应洪 林良斌
对云南省收集到的３６个铁皮石斛居群栽培植株进行多糖和生物碱的含量测定，并对不同居群的铁皮石斛的多糖和生物碱含量以及其农艺性状差异进行分析发现：各居群间的株高、叶长、叶宽、丛数、茎粗、石斛碱、多糖等差异极显著。株高最高的是广西石斛２号为１９．３６ ｃｍ，最矮的是文山石斛４号为３．０４ ｃｍ。茎粗最粗的是增靓石斛为０．７４ ｃｍ，最细的是文山石斛２号为０．２８ｃｍ。多糖含量最多的是浙江石斛４号为０．０９５ ｍｇ，与浙江石斛５号和浙江石斛３号差异不显著，与大金石斛等３２个居群差异极其显著；多糖含量最少是文山石斛２号为０．０８５ ｍｇ，与英茂石斛差异不显著，与瑞丽石斛２号等３３个居群差异极其显著。生物．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
谢文霖 杨燕 于龙飞 蒋萍 蒋海峰 罗金洲 余马
【目的】探究感病羊肚菌[Morchella esculenta (L.) Pers.]内生细菌的多样性、丰度及菌群功能。【方法】以健株羊肚菌为对照，提取感病程度为轻度、中度、重度及完全感病的羊肚菌内生细菌基因组总DNA，进行Illumina Miseq高通量测序，并对测序获得的内生细菌ASVs（Amplicon Sequence Variants）进行生物信息学分析，探究羊肚菌子实体感病过程中内生细菌的群落结构及其多样性。【结果】羊肚菌子实体内生细菌菌群丰度指数为：中度感病组>完全感病组>轻度感病组>重度感病组>健康组；多样性指数为：中度感病组>健康组>轻度感病组>重度感病组>完全感病组；均匀度指数为：健康组>重度感病组>轻度感病组>完全感病组>中度感病组。健株羊肚菌子实体内生细菌主要归类于变形菌门（Proteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroidetes），其中假单胞菌属（Pseudomonas）和黄杆菌属（Flavobacterium）为健株羊肚菌内生细菌中的优势属，分别占健株羊肚菌子实体内生细菌总数的46.92%和41.07%。感病羊肚菌子实体中假单胞菌属相对丰度随感病程度增加呈上升趋势，至重度时超过95%，而黄杆菌属相对丰度呈下降趋势，至重度时低于3%。此外，所有感病子实体中均有厚壁菌门（Firmicutes）的内生菌。【结论】对羊肚菌子实体内菌群的平衡调控，如对假单胞菌属内生细菌的抑制及黄杆菌属内生细菌的促生，可能有助于降低羊肚菌大面积病害和减产，保障羊肚菌稳产。
关键词：
羊肚菌 内生菌 多样性 群落结构
[期刊] 西南农业学报
[作者]
夏体渊 陈泽斌 靳松 赵凤 王定康 郭丽红 徐胜光
【目的】为了对施用生物炭后的烟叶细菌的种类变化进行全面而准确的调查。【方法】以烟叶为研究对象,设置4个处理:处1理为施用生物炭50 g/株(Y4.1);处理2为施用生物炭100 g/株(Y5.1);处理3为施生物炭150 g/株(Y6.1)和处理4不施用生物炭作为对照(Y1.1)。应用Illumina测序平台的Mi Seq高通量测序仪对施用生物炭后烟叶内生细菌的16S r DNA-V4区扩增子进行测序。并应用Qiime和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度
关键词：
烟草 内生细菌 生物炭 测序 多样性
[期刊] 华北农学报
[作者]
杨金睿 王文倩 王玥 姚遥 吉泽 李俊逸 陈斌 肖关丽
为明确不同马铃薯品种叶片内生细菌多样性及差异,为马铃薯抗逆性机理及内生菌开发研究提供依据。利用LB培养基对云南省4个主栽马铃薯品种叶片内生细菌进行分离培养,根据形态特征和16S rDNA序列对菌株进行分类鉴定。从青薯9号马铃薯叶片中分离获得内生细菌3门8科9属10种,其中葡萄球菌属和微小杆菌属为优势菌属,相对多度均为18.18%;从会-2马铃薯叶片中分离获得内生细菌4门11科11属12种,其中不动杆菌属和假单胞菌属为优势菌属,相对多度均为15.38%;从合作88马铃薯叶片中分离获得内生细菌4门9科10属13种,其中不动杆菌属为优势菌属,相对多度为23.53%;从丽薯6号马铃薯叶片中分离获得内生细菌4门7科8属17种,其中葡萄球菌属为优势菌属,相对多度为22.22%。4个马铃薯品种叶片中可培养细菌共有37种,其中青薯9号、会-2、合作88和丽薯6号马铃薯叶片中独有的内生细菌分别有4,8,4,10种。马铃薯不同品种叶片内生细菌种类组成及优势菌属不同,可为马铃薯叶片内生菌功能研究提供菌种资源。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王爱华 殷幼平 熊红利 李颜方 李佳 贤家旭 王中康
【目的】对柑橘健康植株和感染黄龙病植株的韧皮部内生细菌的多样性进行比较分析,为研究柑橘植株韧皮部内生细菌与黄龙病菌之间的相互关系奠定基础。【方法】采用常规分离培养与分子鉴定的方法和基于16S rDNA基因的限制性酶切长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)分析的方法。【结果】用常规分离与分子鉴定方法获得10个属细菌类群,其中芽孢杆菌属(Bacillus sp.)、假单胞菌属(Pseudomonas sp.)、考克氏菌属(Kocuria sp.)为无症健株的优势菌群;微杆菌属(Microbacterium sp.)、芽孢杆菌属、假单...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
梁任繁 王益奎 李文嘉 黎炎 吴永官
为了明确我国茄子主要栽培种的遗传背景,对主要来自广西及全国部分地区的54份茄子栽培种进行表形标记和ISSR标记分析。结果表明,在37个表形性状中,表现为多态性有33个,占89.18%;从50条ISSR引物中共筛选出8条多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物,扩增出68条谱带,平均每条引物扩增出8.5条带,多态性带58条,占85.29%;品种间两类型标记遗传相似系数均在0.04～1.00之间,总体平均数分别为0.51、0.60,表明个别品种间遗传差异很大,但群体整体遗传基础相对较狭窄;应用SPSS软件聚类分析,两类标记均能在欧氏距离14～15间将54个栽培种划分为6个类群,其中表形标记类群的划分与...
关键词：
茄子 遗传多样性 形态标记 ISSR标记
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