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[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
郝怀志 昝林森 刘丑生 王志刚 张桂香 韩旭 郝荣超
【目的】探讨中国13个绵羊品种内的遗传变异情况及各品种间的亲缘关系。【方法】选用联合国粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的11对微卫星引物,结合荧光-多重PCR技术,检测了10个中国地方绵羊品种和3个引进品种的基因型;通过计算基因频率、多态信息含量和遗传杂合度,以Nei’s遗传距离为基础,采用非加权组对算术平均聚类法(UPGMA)和邻近结合法(NJ)构建聚类图。【结果】13个中外绵羊品种被聚为4类:威宁绵羊、昭通绵羊、汉中绵羊和迪庆绵羊为第Ⅰ类,豫西脂尾羊、太行裘皮羊、泗水裘皮羊、巴什拜羊和策勒黑羊为第Ⅱ类;腾冲绵羊为第Ⅲ类,3个引进品种无角道赛特羊、萨福克羊和特克塞尔羊为第...
关键词：
绵羊品种 微卫星 遗传多样性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
雷承志 姚毅 陈玉林 尹君亮 刘福元
采用5个微卫星位点对4个绵羊品种(小尾寒羊、多浪羊、新疆细毛羊、阿勒泰羊)的遗传多样性进行了分析。结果表明,5个微卫星位点在4个绵羊品种中的平均等位基因数分别为7,6.4,6和6个;多态信息含量分别为0.774 7,0.761 6,0.720 3和0.703 2;有效等位基因数分别为4.978 5,4.835 6,4.182 2和3.935 0;杂合度分别为0.814 4,0.806 2,0.719 7和0.716 7;信息熵分别为1.701 1,1.699 3,1.554 1和1.509 8。
关键词：
绵羊 微卫星 遗传多态性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张子军 凌英会 任春环 程箫 郭晓飞 黄桠峰 陈家宏 赵有璋 章孝荣
【目的】研究甘肃主要肉用绵羊品种(波德代羊、无角陶赛特、蒙古羊、滩羊、小尾寒羊)DNA分子水平上的遗传多样性。【方法】利用世界粮农组织和国际家畜联合会推荐的11对微卫星引物(CSRD0298、RM0509、URB0038、MCM0130、ILSTS004、MCMA008、MNS0094、CSSM0004、OarAE101、BM1329和OarFCB11),对5个肉用绵羊品种分子水平上的遗传多样性及其与生产性能的关联性进行研究。【结果】11个微卫星位点在5个肉用绵羊品种间均呈现高度多态性,构建的系统进化树NJ聚类图将国内的3个肉用绵羊品种(蒙古羊、滩羊、小尾寒羊)与引进的2个肉用绵羊品种(波德代...
关键词：
肉用绵羊 微卫星标记 生产性能 关联性
[期刊] 华北农学报
[作者]
梁瑞圆 陈晓勇 孙洪新 孙少华 敦伟涛 沈志强 刘军峰 王珏
为探讨我国部分地方种群绵羊的起源进化及遗传多样性。对河北小尾寒羊、山东小尾寒羊、苏尼特羊、洼地绵羊、湖羊等5个地方绵羊种群mtDNA D-loop区全序列进行了测序和遗传变异分析,并利用生物信息学方法分析了种群间的亲缘关系以及母系起源。结果表明,5个绵羊种群mtDNA D-loop区序列共发现了135个多态位点,形成了108种单倍型。单倍型多样度为0.974 00.998 0;核苷酸多样度为0.017 200.022 22;全群平均核苷酸差异数K为20.795。NJ系统发育树表明,河北小尾寒羊与洼地绵羊先
关键词：
地方绵羊 线粒体基因组 起源 遗传多样性
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
赵宗胜 贾斌 李大全 王根林
采用垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 ,对罗米丽羊 (RomillyHills)、哈萨克羊、中国美利奴羊、巴什拜羊等 4个群体 171只绵羊的白蛋白 (A1b)、转铁蛋白 (Tf)和脂酶 (Es)共 3个蛋白座位进行了检测 ,发现这 3个蛋白分别出现了3、 4、 3种表型 ,受到 2、 6、 2种基因支配。对这 4个绵羊群体的遗传分析表明 ,中国美利奴 (新疆军垦型 )羊、哈萨克羊、巴什拜羊和罗米丽羊的基因平均杂合度分别为 0 4 96 4、 0 5 0 39、 0 5 35 2和 0 5 2 90。本研究的结果与各品种羊的选育史是吻合的。由于选育目标、过程不同 ,哈萨克羊与巴什拜羊虽然有...
关键词：
血液蛋白 多态性 绵羊 遗传多样性
[期刊] 农业现代化研究
[作者]
王遵宝 努尔力·阿不力孜 赵宗胜 曾献存 张文祥
从国际公共生物数据库检索获得绵羊皮肤组织EST中筛选SSR,搜索到含有SSR的196条EST,共209个SSR位点,占整个绵羊皮肤组织EST数据库的6.3%,其中双碱基重复最多,占总SSR的71.8%,AC/TG重复在双碱基类型中最丰富,占双碱基微卫星序列总数的67%。根据筛选到的SSR设计并合成引物22对,其中18对在中国美利奴羊上有目的扩增条带。选用重复性好、多态性高的5对引物在中国美利奴羊、多浪羊和罗姆尼羊三个群体内进行PCR扩增,共检测到25个等位基因,位点多态信息含量变化范围为0.5030～0.7583,多态信息丰富;三个群体内等位基因类型、频率分布差异较大,发现了半细毛和细毛羊群体...
关键词：
绵羊 毛用性状 EST SSR
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张自富 昝林森 王志刚 张桂香 廖信军 贾善刚 韩旭 于福清 张剑
利用12对微卫星DNA标记对14个中外牛品种进行了遗传多样性分析,通过计算多态信息含量(PIC)、平均杂合度(H)、有效等位基因数(Ne)及聚类分析,评估各品种内遗传变异和各品种间遗传相关。结果表明,12个微卫星座位共检测到170个等位基因,Ne为1.194 7-11.175 2,H为0.618 9-0.782 9;12个位点均为高度多态位点,PIC为0.528 1-0.810 5。恩施黄牛与郧巴牛相聚,枣北牛与南阳牛相聚,然后二者聚为一类;湘西牛自成一类;郏县红牛与秦巴牛相聚,再与黄陂黄牛聚为一类;早胜牛与平陆山地牛聚为一类;安西牛自成一类;德国黄牛与西门塔尔牛相聚后,再与夏洛来牛聚为一类。
关键词：
微卫星 黄牛品种 遗传多样性
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
屠云洁 陈宽维 高玉时 陈国宏 汤青萍 李慧芳
用磁珠富集法筛选的19对微卫星引物和从GenBank搜索12个微卫星引物检测广东4个地方鹅品种的遗传多样性。利用等位基因频率计算各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的遗传距离(DA),分析其遗传多样性。结果表明,31个微卫星引物中有25个微卫星引物在4个鹅群体中的多态信息含量均为中度多态,可作为有效的遗传标记用于各鹅品种的遗传多样性和系统发生关系的分析。4个广东地方鹅品种的平均杂合为0.611 9-0.672 7,均较高,最高的是乌棕鹅(0.672 7),最低的是阳江鹅(0.611 9),且杂合度的高低与PIC的大小体现了较高的一致性,表明广东4个地方鹅品种均具有丰富的...
关键词：
微卫星 鹅 遗传多样性
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
白志元 杨玉花 武国平 卫一超 张瑞军
为保持大豆杂种优势利用中亲本的遗传差异,利用64对SSR引物对68个大豆品种(系)包括53个中国品种(系)和15个美国品种进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果表明,共检测到375个等位基因变异,平均每个位点检测到的等位变异数为5.86个,变化范围为2～12个,其中53个中国品种(系)检测到373个等位基因变异,平均为5.83个,变化范围为2～12个,15个美国品种检测到288个等位基因变异,平均为4.50个,变化范围为2～9个;总的位点多态性信息含量(PIC)变化范围为0.366～0.900,平均为0.677,其中53个中国品种(系)变化范围为0.370～0.909,平均为0.682,15个美国品种变化范围为0.309～0.817,平均为0.590。聚类分析表明:68个大豆品种(系)的遗传相似系数(GS)变幅为0.529～0.973,平均GS值0.707,在相似系数0.65处,可将供试的品种(系)聚为2大类,第Ⅱ类在相似系数0.69处又可分为5个亚类。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
宁礼群 古丽娜·艾山 马合木提·哈力克
为探讨新疆绵羊系统进化与起源,本文测定了新疆10个羊品种的Cytb序列,并进行了系统发育学分析。结果表明,这10个地方绵羊共有37种单倍型,60个多态位点;单倍型多样度为0.785±0.00193,核苷酸多样度为0.00368±0.01185,表明新疆地方绵羊品种的遗传多样性丰富;不论是邻接法(Neighbor Joining)还是最大似然法(Maximum Likelihood)系统进化树都表明新疆地方绵羊共分为3支,说明新疆地方绵羊至少有3个独立的母系起源。本研究为确立新疆地方绵羊种群关系和保护物种资
关键词：
细胞色素b 地方绵羊 遗传多样性 起源
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
郝家胜 周开亚
用 40个 10 寡核苷酸随机引物对中国鹅的 5个品种———狮头鹅、皖西白鹅、太湖鹅、浙东白鹅和四川白鹅进行了随机扩增多态DNA (RAPD)分析。结果表明 ,用筛选出的 14个引物共扩增出 174个DNA片段 ,其中的 48个 (占2 8 2 % )在 5个品种间表现为多态性。根据扩增DNA片段的异同 ,计算了各品种和个体间的遗传多样性指数和遗传距离指数。同时 ,用分子进化遗传分析软件 (MEGA)以UPGMA法和NJ法对遗传距离指数进行了聚类分析。结果显示 ,中国鹅 5品种间的遗传分化可能与人工选择密切相关 ,而和地理分布没有明显的关联。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
王旭 董丽娟 段继华 李赛君 张曙光
利用33对多态性SSR引物对84个茶树品种进行亲缘关系和遗传多样性分析,并基于SSR数据,对供试品种进行UPGMA遗传相似性聚类分析。结果表明:参试品种具有较高的遗传多样性(共检测到94个等位位点,每个引物2～4个,平均2.85个;引物多态性信息含量为0.20～0.79,平均值为0.56;可观测等位位点数最多9个,最少3个,平均4.79个;杂合度观测值为0.08～0.97,平均值为0.53;杂合度期望值为0.14～0.86,平均值为0.62;群体内的Shannon指数平均值为1.17);聚类分析结果显示,阿萨姆茶等6个品种各自形成了单独的分支,其余78个品种聚成1个大类群,在相似系数0.54处...
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
陈圣林 王会娜 孙颖 陈显 李建安
以湖北省秭归县三峡库区的14个李品种为研究材料,根据优化的ISSR-PCR反应体系,从24条引物中筛选出10条扩增条带特异性好、条带数目适中、条带清晰、重复性好的引物,总共扩增出101条清晰可重复的DNA条带,其中83条为多态性条带,多态带百分率为82.18%,每个引物扩增的条带大小在300～3 000 bp之间,数目在8～12条之间,平均为10.1条。应用软件POPGENE 1.31和NTSYS-pc对所得数据进行分析处理,从而得出14个李品种的遗传相似系数和遗传遗传距离,并绘制出品种相似性的UPGMA聚类图和主坐标分析的二维、三维散点图,结果表明:遗传一致度的变化范围在0.602 2～0....
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