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[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
于潇玮 王创 王可 李欣艳 董雷 崔中利 曹慧
[目的]探究黏细菌Myxococcus sp. BS对烟稻轮作土壤真菌多样性和群落组装过程的调控，为烟稻轮作模式下通过施用黏细菌进行生防提供理论指导。[方法]以未处理（CK）、施用黏细菌菌剂（BS）和施用黏细菌+有机肥（BF）3个处理的烟稻轮作土壤为研究对象，采用高通量测序技术对烟稻轮作土壤真菌的群落多样性、组成、组装过程进行分析。[结果]黏细菌添加后，Chao1指数降低，且Shannon指数升高。BS和BF群落相似度较高，CK与BS、BF群落相似度较低。添加黏细菌后，在门水平上，被孢霉门（Mortierellomycota）、壶菌门（Chytridiomycota）和球囊菌门（Glomeromycota）的相对丰度降低；在属水平上，绿核菌属（Ustilaginoidea）和枝孢霉属（Cladosporium）的相对丰度增加，链格孢属（Alternaria）、腐质霉属（Humicola）和被孢霉属（Mortierella）的相对丰度逐渐降低。通过LEfSe分析可以得到不同处理间真菌丰度有显著差异的物种，即生物标记物种（biomarker），在CK中发生显著变化的真菌差异物种有7个，BS有5个，而BF有8个。3种土壤真菌群落组装过程均以随机性过程为主导，其中扩散限制贡献最大，且随机性过程贡献量在添加黏细菌后增加。[结论]向烟稻轮作土壤加入黏细菌后，改变土壤真菌群落组成和组装过程，并且使导致烟草赤星病和水稻褐变病的植物病原菌链格孢属（Alternaria）的相对丰度明显降低；与单独施用菌剂相比，以黏细菌配施有机肥效果更佳。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
缪伏荣 董志岩 刘景
【目的】研究从腐烂紫菜中分离的Stenotrophomonas sp.Z705菌株产琼胶酶的最佳发酵条件和培养基组成。【方法】采用单因素试验,分析装液量、摇床转速、发酵时间、初始pH、发酵温度、盐度等因素对Stenotrophomonas sp.Z705菌株发酵产琼胶酶活力的影响,从中筛选出该菌株的最佳发酵条件。在此基础上,采用单因素试验和L9(33)正交试验,分析不同氮源和碳源对Stenotrophomonas sp.Z705菌株发酵产琼胶酶活力的影响,从中筛选出该菌株最佳培养基的组成。【结果】Stenotrophomonas sp.Z705菌株发酵产琼胶酶的最佳条件为:装液量25mL、摇床...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
郭坚华 刘庆都 任欣正
小麦细菌性苗枯病菌Ta菌株细胞壁的特征性双碱基氨基酸为二氨基丁酸,菌体脂类中不含枝菌酸,磷酸类脂主要为双磷脂酰甘油,符合Claribacter属的特征;菌体细胞水溶性蛋白SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱不同于Clacribucter属的已知各种及亚种,甲基萘醌分析结果与对照菌Cl.tritici 2626菌株亦不尽相同;菌株的DNA G+C mol%含量为66.12%～68.78%,与Cl.michiganense subsp.michiganense菌株2550的 DNA DNA同源值为40.2%,与Cl.tritici菌株2626的同源值为46.0%。确认Ta菌是Claibter属中的一个新...
关键词：
小麦 细菌性病害 棒形杆菌 鉴定 分类
[期刊] 华中师范大学学报(自然科学版)
[作者]
张宏岐 柳蔚 高星星 郑倩倩 罗菲
从药用植物宜昌蛇菰(Balanophora henryi Hesml.)中分离得到一株内生真菌Aspergillus sp.SHG-7,通过固体发酵,乙酸乙酯萃取得浸膏,其浸膏经硅胶柱层析、Sephadex LH-20、半制备型HPLC等分离手段分离得到6个化合物,经核磁共振、质谱等手段鉴定其结构分别为灰黄霉素(1),麦角甾醇(2),麦角甾-7,22-二烯-3,6-二酮(3),麦角甾-7,22-二烯-3,5,6-三醇(4),软脂酸-1-甘油酯(5),肉豆蔻酸(6).化合物1对MCF-7、A549及Hela
关键词：
蛇菰 内生真菌 次级代谢产物 细胞毒活性
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
姚倩倩 顾向阳
[目的]从含盐环境中富集分离中度嗜盐菌,并进行菌种鉴定,分析确定与耐盐特性相关的主要相容性溶质,探索利用分离菌株合成四氢嘧啶的可行性。[方法]从盐池土中富集分离耐盐或嗜盐的乙酸降解菌,通过生理生化特性测定和16S rDNA序列的分析,将所得菌株鉴定至相应的属或种。通过摇瓶试验研究分离菌株耐盐生长的特征,从所得的菌株中提取、分析相容性溶质并测量其含量,初步分析分离菌株耐盐生长的机制。在高盐培养基中诱导嗜盐菌胞内相容性溶质的合成,然后在低渗盐溶液中测定相容性溶质的释放率,之后再将菌体转移至高渗培养基中研究相容
[期刊] 西南农业学报
[作者]
柯野 杨家臣 屈奇奇 袁小枚 黄镜如
【目的】解析Streptomyces sp. DJ菌株编码的3种角蛋白酶的氨基酸序列、二级结构、三级结构及其功能的关系。【方法】基于DJ菌株全基因组测序结果,利用Bio-edit、DNAMAN、Discovery Studio2.5等软件、https://swissmodel.expasy.org/等网站对其3种角蛋白酶的序列和结构进行了分析和预测。【结果】DJ菌株胞外分泌3种角蛋白酶(K1、K2和K3)均属于S8家族的丝氨酸蛋白酶,信号肽、前导肽和成熟肽在氨基酸残基的组成、极性和长度等方面较一致。3种酶均能以5WSL.1.A为模板进行同源建模,每种酶的3-D结构中均含有6个α螺旋、2个3_(10 )α螺旋和15个β折叠的二级结构;其中K1酶含有2个二硫键,1Ca和2Ca位点,K2和K3各有1个二硫键,1Ca位点;3种酶的Pro270残基位于loop环,而仅有K2的Pro242残基位于loop环中。3种酶底物结合区域主要由疏水性残基构成,偏向于疏水性强的底物。3种酶的底物结合区域比较而言,S1和S2对底物特异性起关键作用;由于3种酶的S1和S2中重要位点残基的不保守性,使其底物特异性具有差异。【结论】DJ菌株中3种角蛋白酶在氨基酸、二硫键、脯氨酸和钙结合等的不同致使酶稳定性的不同;并且由于其表面电荷分布、底物结合区域的差异构成对羽毛水解位点的互补性,这可能是DJ菌株高效降解羽毛的重要原因。
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
杨雪 岳胜天 武志海 付丽 于人杰 杨美英
为明确溶磷菌wj1的无机磷酸盐(Pi)的转运机制,对溶磷菌wj1磷酸盐特异性转运系统(Pst)进行生物信息学分析并与土壤中常见细菌的Pst系统进行比较,通过亚克隆构建溶磷菌wj1pstS蛋白的原核表达系统,利用钼酸铵分光光度法测定诱导表达的pstS蛋白对磷酸盐的结合率。结果表明:溶磷菌wj1的Pst系统是由pstS、pstC、pstA、pstB和phoU 5个基因组成,且依次分布于染色体上,这种结构与土壤中常见细菌的大多数菌属相似。溶磷菌wj1的pstS蛋白位于细胞质外,是一种具有信号肽的可溶性蛋白,其空间结构是由2个球状结构域组成。与绿脓假单胞菌的pstS蛋白结构相比,溶磷菌wj1pstS蛋白的活性中心位于两个球状结构域的裂缝中,其中有9个氨基酸参与Pi特异性结合,1个氨基酸通过疏水作用维持蛋白与Pi的结合。溶磷菌wj1pstS蛋白在大肠杆菌中过量表达后,使得重组大肠杆菌的无机磷酸盐吸收率显著提高,表明溶磷菌wj1pstS蛋白具有结合Pi的能力,但菌浓度不变时Pi浓度的增加会抑制溶磷菌wj1pstS蛋白对Pi的结合。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
李莎莎 曹煜成 李卓佳 胡晓娟 徐煜 徐武杰 杨铿 苏浩昌 文国樑
芽孢杆菌(Bacillus sp.)A4是一株具有溶甲藻能力的菌株,为探究营养条件与培养条件对A4生长的影响,明确在多因素共同作用下菌株的生长特性,先以单因素方法比较不同碳、氮营养因子对其生长的影响,再以Plackett-Burman方法综合比较碳源、氮源、pH、接种菌量、温度、转速、装液量等因子对其生长的协同影响效应。结果显示,A4菌对有机碳源玉米浆和有机氮源大豆蛋白利用效果最好,培养24 h后菌量分别达到3.58×108、3.19×108 CFU/ml。各因子的重要性排序依次为大豆蛋白、温度、玉米浆、
关键词：
芽孢杆菌 碳源 氮源 培养条件
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
李志琳 解宇峰 吴杰 徐佳迎 王珏 蒋静艳
[目的]本文旨在筛选出不同种类和特性的高效降解柴油菌株,研究降解菌株对不同环境下柴油污染的降解机制。[方法]从南京扬子石化厂区的油泥沉积物中分离出1株高效柴油降解菌J-3,通过细菌形态学、生理生化及16S rRNA基因序列分析比对初步鉴定菌株J-3为沙雷氏菌属(Serratia sp.)。通过水培及土壤培养并结合气质联用(GC-MS)和全基因组比对技术研究其降解率和降解机制。[结果]该菌能利用柴油为唯一碳源生长,产生表面活性物质,具有稳定的乳化性能。在温度20～40℃、初始pH5～9条件下生长良好,能耐受15 g·L~(-1) NaCl和5 g·L~(-1)柴油。在最适生长条件(pH7,25℃,1 g·L~(-1) NaCl,0.5 g·L~(-1)柴油)下对柴油降解率为62.0%,GC-MS图谱分析确定菌株J-3对柴油中各组分均有降解能力,对部分中长直链烷烃降解率超过99%。通过菌株J-3的全基因组比对分析,发现2个烷烃氧化相关的基因,烷烃羟化酶基因alkB和长链烷烃羟化酶基因almA,推断菌株J-3能降解柴油可能是这2个氧化酶基因产生作用。将菌株J-3应用于柴油污染土壤修复试验,对土壤中各柴油组分均有降解能力。不同处理下菌株J-3降解率可达33.8%～49.0%,可有效降解土壤中的柴油。[结论]Serratia sp. J-3是一株高效降解柴油的菌株,在水体和土壤中均能很好利用柴油进行生长代谢,可应用于柴油污染实际生物修复工程。
[期刊] 海洋渔业
[作者]
代影 卢静容 周美宏 杨帆 林厚文
南极极端生境中蕴含着发掘特殊生物活性天然产物的巨大潜力。本研究对采自南极海域水深6000 m海区钩虾(Gammarus sp.)的肠道共附生微生物进行分离，并对一株有价值菌株的代谢产物进行研究。采用稀释涂布法进行菌株分离，利用形态学观察及16S rRNA测序进行菌株种属鉴定；综合运用薄层色谱，正相硅胶柱色谱，凝胶柱色谱，反相ODS柱色谱和半制备高效液相(HPLC)等色谱手段分离纯化得到单体化合物，采用波谱学和质谱技术鉴定其化学结构。从钩虾中分离得到17株菌，并将其分类学地位归属于9个属，其中细菌11株，放线菌6株。从放线菌Streptomyces xiamenensis YF008的发酵产物中分离得到8个单体化合物，分别鉴定为：1(10)E，5E-germacradiene-2，11-diol (1)，N-[2-(4-hydroxyphenyl)] ethylacetamide (2)，环(L-苯丙氨酸-甘氨酸) (3)，环(L-苯丙氨酸-L-丙氨酸) (4)，环(D-苯丙氨酸-L-异亮氨酸) (5)，环(L-羟脯氨酸-L-苯丙氨酸) (6)，环(D-亮氨酸-L-脯氨酸) (7)，环(L-苯丙氨酸-L-脯氨酸) (8)。化合物1，3-6系首次从该菌中分离得到，且化合物1为特殊的十元环germacrane型倍半萜类化合物。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
刘文韬 朱雪竹 陈雪梅 孙彦伟 吕百韬 王丹琴 王雪
[目的]本文旨在筛选适配的农作物-功能内生菌定殖系统,防治多环芳烃(PAHs)污染。[方法]以芘作为多环芳烃代表,选择空心菜、小麦、不结球白菜、菠菜、茼蒿5种常见农作物,通过在芘降解培养基中添加不同农作物匀浆液,探究目标农作物体内物质和体内原有内生菌群对菌株Enterobacter sp. PRd5定殖效率及芘去除的影响,筛选合适的目标农作物-功能内生菌定殖体系。利用定殖培养试验,验证筛选获得的目标农作物-功能菌体系的促生长与降低芘污染的效能。[结果]筛选试验表明,菌株Enterobacter sp. PRd5可产生铁载体和吲哚乙酸(IAA)等促生长因子,促进作物生长。各农作物匀浆液与菌株Enterobacter sp. PRd5的混合液芘去除率从大到小依次为空心菜、小麦、不结球白菜、菠菜、茼蒿,芘去除率分别为83.7%、75.3%、72.6%、70.1%和61.4%。定殖试验显示,菌株Enterobacter sp. PRd5能高效定殖在小麦和空心菜体内,通过提高芘代谢酶活力,降低作物中芘污染。[结论]芘无机盐培养基中添加2%植物匀浆液的细菌培养试验可用于筛选适配的农作物-功能内生菌定殖系统,防治农产品多环芳烃污染。
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
宋立超 钮旭光 李培军 刘宛
Ｐａｎｔｏｅａ ｓＰ．ｔＪＢ５是一株具有菲降解能力的耐盐碱菌株。为将其更好地应用到环境中去，研究了其粗酶液对菲的降解特性及降解途径关键酶基因的性质。结果表明：处理１２ｈ胞内酶对５０ｍｇ·Ｌ－１菲的降解率达到７０．１％。菲胞内酶降解的酶促反应最适温度是３０℃，最适Ｐ ｈ值为６．０～８．０，最适盐浓度为０～３．０％。进一步克隆降解功能酶邻苯二酚－２，３－双加氧酶（Ｃ２３０）基因，获得序列９２４ＢＰ，建树分析其与ｓＰｈｉｎｇｏＢｉｕｍ ｓＰ．４０７－１ Ｃ２３０的基因同源性为９７％，初步判定该菌株对菲降解过程中产生的邻苯二酚是通过Ｃ２３０进行降解催化的。
关键词：
成团泛菌 胞内酶 菲 邻苯二酚双加氧酶
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
关怡 尹娣 杜茜 沙艺琛 赖姗姗 赵超
为寻找新纤维素酶和纤维素酶基因资源,以羧甲基纤维素钠作为唯一碳源,从湿润木屑中分离和筛选获得1株高产纤维素酶目的菌株LYW-1。对该菌保守序列ITS进行扩增和测序后,提交NCBI并与相近物种ITS序列进行比对和分析,基于亲缘关系构建系统发育树。将ITS rDNA保守序列比较分析结果与形态学观察结果相结合,初步鉴定该菌株属于栓菌属(Trametes)。以羧甲基纤维素钠溶液为底物,采用3’5’-二硝基水杨酸(DNS)法测定纤维素酶活力,分析pH、温度及培养基中同碳源、氮源对该菌产纤维素酶活力的影响。结果表明,菌株LYW-1在pH 7.0、37℃、淀粉为碳源和乙酸铵为氮源时为最适培养条件,总酶活力达到最大。
关键词：
栓菌属 纤维素酶 酶活力 产酶条件
[期刊] 海洋渔业
[作者]
梅东海 田晓清 樊成奇 赵树明 杨桥 马丽艳 黄洪亮 陆亚男
海鞘共附生微生物是尚待关注的海洋微生物资源重要来源之一。本文研究了大洋纵列海鞘(Symplegma oceania)的一株共附生链霉菌Streptomyces sp. FDZ35-2的代谢产物,以探讨其主要代谢产物的结构类型和菌株的潜在药用价值。运用多种柱层析和HPLC等分离技术,从菌株甲醇提取物中分离鉴定2个主要的单体化合物;经LC-MS、1H-和13C-NMR等波谱学方法和文献数据对照,鉴定化合物结构分别为:9-甲基-β-咔啉-3-羧酸甲酯(1)和放线菌素D(2)。考虑放线菌素D生物合成可能利用培养基氮源中的氨基酸,本文还利用磷虾蛋白水解产物代替商品蛋白胨作为培养基氮源,对Streptom...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
吴志明 鹿承建 章帅文 祁增兴 朱曼宁 李昆太
【目的】为明确新型广谱拮抗链霉菌N2的抗菌谱,开发安全高效的生物防腐剂。【方法】采用菌丝生长速率法和杯碟法,初步评价了N2粗提物对酵母菌、13种植物病原真菌、3种G+和3种G-细菌的抑菌效果。【结果】N2粗提物具有广谱、高效的拮抗特性,尤以对葡萄座腔菌、意大利青霉、烟草黑胫病菌、枯草芽孢杆菌(G+)和水稻黄单胞菌(G-)的抑制作用最为明显。通过建立毒力回归方程发现N2粗提物对辣椒疫病菌、葡萄座腔菌、西瓜枯萎病菌、棉花枯萎病菌、烟草黑胫病菌、水稻纹枯病菌、莴苣菌核病菌和稻瘟病菌的EC50分别为0.45、1.02、3.39、1.70、1.49、1.18、1.12和0.68μg·m L~(-1)。同时,离体水果的生物防效与保鲜试验的结果表明,N2粗提物中的有效抗菌物质能显著提高猕猴桃的相对防效,抑制水果表面有害病菌的生长,减缓水果的水分散失,提高水果的贮藏品质。【结论】综上可知,链霉菌N2拥有广谱拮抗特性,有望在食品保鲜领域发挥重要作用。
关键词：
链霉菌N2 抑菌活性 广谱拮抗 水果保鲜
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