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[期刊] 渔业科学进展
[作者]
张文静 徐永江 崔爱君 王滨 姜燕 王开杰 周鹤庭
胰岛素样生长因子结合蛋白(insulin-like growth factor binding proteins, IGFBPs)在调节胰岛素样生长因子的生物学活性和生长调控中起着至关重要的生理作用。本研究克隆了黄条(鱼师)(Seriola aureovittata)igfbp-1、igfbp-2a和igfbp-2b等3个基因cDNA编码的开放阅读框(ORF)序列，分析了其组织分布特征，并检测了工厂化不同养殖密度下黄条(鱼师)肝脏中5个基因igfbp-1、igfbp-2a、igfbp-2b、igf-1和igf-2对生长的调控作用。结果显示，igfbp-1的ORF长为741 bp，共编码246个氨基酸；igfbp-2a的ORF长度为882 bp，共编码293个氨基酸；igfbp-2b的ORF长度为810 bp，共编码269个氨基酸。它们均具有广泛的组织表达特性，其中在肝脏中显著高表达，且具有性别二态性表达特性。工厂化养殖条件下，低密度组实验鱼生长速度最快且igfbp-1、igfbp-2a、igfbp-2b、igf-1和igf-2表达量均最高，与中、高密度组有显著性差异(P<0.05)，且与血清IGF-1、GH表达趋势相同，与皮质醇含量及葡萄糖浓度的趋势相反；而中、高密度组实验鱼的生长及igfbp-1、igfbp-2a、igfbp-2b、igf-1和igf-2表达量均无显著差异。本研究表明，igfbp-1、igfbp-2a和igfbp-2b参与了不同养殖密度下黄条(鱼师)生长的调控过程，且与igf-1、igf-2对生长的表达调控存在正向协同效应。研究结果为阐释黄条(鱼师)生长的分子机制以及工厂化条件下适宜养殖密度的调控提供了理论依据。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
张文静 徐永江 崔爱君 王滨 姜燕 王开杰 周鹤庭
胰岛素样生长因子结合蛋白(insulin-like growth factor binding proteins, IGFBPs)在调节胰岛素样生长因子的生物学活性和生长调控中起着至关重要的生理作用。本研究克隆了黄条(Seriola aureovittata) igfbp-1、igfbp-2a和igfbp-2b等3个基因cDNA编码的开放阅读框(ORF)序列，分析了其组织分布特征，并检测了工厂化不同养殖密度下黄条肝脏中5个基因igfbp-1、igfbp-2a、igfbp-2b、igf-1和igf-2对生长的调控作用。结果显示，igfbp-1的ORF长为741 bp，共编码246个氨基酸；igfbp-2a的ORF长度为882 bp，共编码293个氨基酸；igfbp-2b的ORF长度为810 bp，共编码269个氨基酸。它们均具有广泛的组织表达特性，其中在肝脏中显著高表达，且具有性别二态性表达特性。工厂化养殖条件下，低密度组实验鱼生长速度最快且igfbp-1、igfbp-2a、igfbp-2b、igf-1和igf-2表达量均最高，与中、高密度组有显著性差异(P<0.05)，且与血清IGF-1、GH表达趋势相同，与皮质醇含量及葡萄糖浓度的趋势相反；而中、高密度组实验鱼的生长及igfbp-1、igfbp-2a、igfbp-2b、igf-1和igf-2表达量均无显著差异。本研究表明，igfbp-1、igfbp-2a和igfbp-2b参与了不同养殖密度下黄条生长的调控过程，且与igf-1、igf-2对生长的表达调控存在正向协同效应。研究结果为阐释黄条生长的分子机制以及工厂化条件下适宜养殖密度的调控提供了理论依据。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
丁为群 梁宏伟 邹桂伟 王晓阳 曹磊 刘迪秋 李忠
【目的】克隆鲢胰岛素样生长因子结合蛋白1(IGFBP-1)基因,分析其编码蛋白的结构与功能,并分析低氧胁迫下该基因在鲢肝脏中的表达情况。【方法】采用cDNA末端快速扩增技术(Rapid amplification of cDNAends,RACE)扩增鲢IGFBP-1基因的全长cDNA,通过半定量RT-PCR法对鲢肌肉、心脏、脑、肾脏、肝脏、腮和脾等组织器官IGFBP-1mRNA的表达水平进行检测,利用Real-time PCR法检测急性低氧胁迫0,2,4,6,8,10和12h后鲢肝脏组织中IGFBP-1表达量的变化。【结果】鲢IGFBP-1全长cDNA为1 081bp,具有73bp的5′非编...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
占思远 董尧 李利 仲涛 王林杰 张红平
【目的】克隆获得南江黄羊ＩＧＦＢＰ－２（ＩｎｓｕｌＩｎ－ｌＩｋｅ Ｇｒｏｗｔｈ Ｆａｃｔｏｒ ＢＩｎｄＩｎＧ ＰｒｏｔｅＩｎ－２）基因的ｃｄｓ区全序列，对其进行生物信息学分析，并分析ＩＧＦＢＰ－２的ｍｒｎａ和蛋白组织表达特征，为深入研究该基因在出生后山羊生长和发育过程中的作用以及表达调控提供基础资料。【方法】下载ｎｃＢＩ的Ｇｅｎ Ｂａｎｋ数据库中公布的绵羊（ｏｖＩｓ ａｒＩｅｓ，ｎｍ＿００１００９４３６）和牛（Ｂｏｓ ｔａｕｒｕｓ，ｎｍ＿１７４５５５）的ＩＧＦＢＰ－２基因的ｍｒｎａ序列，经序列比对后采用保守区域序列并利用ＰｒＩｍｅｒ ＰｒｅｍＩｅｒ ６．０软件设计克隆引物，经Ｐｃｒ扩增后采用ｔ．．．
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
陶洋 邹曙明
克隆了草鱼(Ctenopharyngodon idellus)胰岛素样生长因子结合蛋白1(IGFBP-1)基因的全长cDNA,并对草鱼不同时期的胚胎和成鱼不同组织进行了RT-PCR分析,以探索草鱼IGFBP-1基因的生物学功能。结果显示:(1)草鱼IGFBP-1基因cDNA全长为1 135bp,包含一个789 bp阅读框,编码262个氨基酸残基;草鱼与鲤、斑马鱼、沟鲶、大鳞大麻哈鱼、虹鳟、五条、小鼠和人的IGFBP-1氨基酸序列相似度分别为94%、93%、69%、60%、58%、56%、40%和38%;草鱼IGFBP-1蛋白的N端和C端序列负责与胰岛素样生长因子(IGF)结合,其保守性较高。...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
方璐 徐永江 崔爱君 姜燕 王滨 周鹤庭 柳学周
热休克蛋白(heat shock proteins， HSPs)在鱼类的应激与免疫反应中发挥重要的生理调控作用，HSP70是该家族的重要成员。为探讨热休克蛋白在大洋性经济鱼类黄条（鱼师） (Seriola lalandi)生长发育中的生理作用，本研究克隆获得了黄条（鱼师） hsp70基因的全长cDNA序列，并采用定量PCR技术测定了其组织分布及在早期生长发育过程中的表达特征。结果显示，黄条（鱼师） hsp70基因的cDNA序列全长为2332 bp，其中，5′-UTR长度为187 bp，ORF长度为1920 bp，3′-UTR长度为225 bp，编码639个氨基酸，蛋白质分子量为70.1 kDa，等电点为5.16。黄条（鱼师） hsp70 mRNA的组织表达具有性别二态性差异，其中，在雌性鳃、心、脾脏和卵巢组织中显著高表达(P<0.05)，且以卵巢中表达量最高；雄性垂体、鳃、头肾和精巢组织显著高表达(P
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
姜燕 刘欣 徐永江 崔爱君 王滨 刘新富 柳学周 薛致勇
为了研究黄条(鱼师) (Seriolaaureovittata)视觉和听觉等器官关键调控基因在早期发育过程的表达特性，本研究克隆了黄条(鱼师) otx2和eya1的开放阅读框(ORF)序列，解析了其序列及系统进化的特性和时空表达特征。结果显示，otx2的ORF长度为876 bp，编码291个氨基酸；eya1的ORF长度为1 962 bp，编码653个氨基酸。otx2和eya1均具有广泛的组织分布特性，其中，otx2在眼组织中表达量最高，脑次之，均显著高于其余组织(P<0.05)；eya1在垂体中表达量最高，其次为卵巢，均显著高于其余组织(P<0.05)。在胚胎发育过程中均可检测到otx2和eya1的表达，且均在胚胎发育后期表达上调；其中，otx2在孵化期达到峰值，eya1在胚体包卵黄4/5期达峰值。在仔稚幼鱼时期均可追踪到otx2和eya1的表达，且在前期相对表达量较高；其中，otx2的表达呈先上调后下调的趋势，在20 dph (days post-hatching)时显著最高(P<0.05)，eya1的表达量呈下调趋势，在1 dph时表达量显著最高(P<0.05)。该研究为认识otx2和eya1在黄条(鱼师)感知器官发育过程中可能的生理功能和研究感知器官的发育调控机制提供了分子认知基础。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
姜燕 刘欣 徐永江 崔爱君 王滨 刘新富 柳学周 薛致勇
为了研究黄条(鱼师) (Seriolaaureovittata)视觉和听觉等器官关键调控基因在早期发育过程的表达特性，本研究克隆了黄条(鱼师) otx2和eya1的开放阅读框(ORF)序列，解析了其序列及系统进化的特性和时空表达特征。结果显示，otx2的ORF长度为876 bp，编码291个氨基酸；eya1的ORF长度为1 962 bp，编码653个氨基酸。otx2和eya1均具有广泛的组织分布特性，其中，otx2在眼组织中表达量最高，脑次之，均显著高于其余组织(P<0.05)；eya1在垂体中表达量最高，其次为卵巢，均显著高于其余组织(P<0.05)。在胚胎发育过程中均可检测到otx2和eya1的表达，且均在胚胎发育后期表达上调；其中，otx2在孵化期达到峰值，eya1在胚体包卵黄4/5期达峰值。在仔稚幼鱼时期均可追踪到otx2和eya1的表达，且在前期相对表达量较高；其中，otx2的表达呈先上调后下调的趋势，在20 dph (days post-hatching)时显著最高(P<0.05)，eya1的表达量呈下调趋势，在1 dph时表达量显著最高(P<0.05)。该研究为认识otx2和eya1在黄条(鱼师)感知器官发育过程中可能的生理功能和研究感知器官的发育调控机制提供了分子认知基础。
[期刊] 水产学报
[作者]
翟万营 张俊玲 施志仪 李巍
利用RACE-PCR技术,从牙鲆肝脏组织总RNA中克隆得到胰岛素样生长因子结合蛋白-1(insulin-like growth factor binding protein 1,IGFBP-1)基因的全长cDNA序列,该cDNA全长为1 070 bp,开放阅读框为729 bp,编码242个氨基酸。通过系统进化树分析,牙鲆IGFBP-1与鱼类IGFBP-1基因紧密聚为一支;通过同源性比对,牙鲆IGFBP-1基因的核苷酸序列与大菱鲆同源性最高,为95%,而其推导的氨基酸序列与其它鱼类如大菱鲆、五条、黄金鲈、红点鲑、鲤和斑马鱼的同源性分别为89%、89%、84%、79%、67%和67%。半定量RT-...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
张曼曼 高泽霞 冯兵 罗双双 曹文怡 周小云
为探讨胰岛素样生长因子结合蛋白-1(IGFBP-1)基因在二倍体和四倍体泥鳅之间的表达差异及其与DNA甲基化的相关性,克隆二倍体、四倍体泥鳅的CDS序列和启动子序列,并分别采用qRT-PCR和亚硫酸氢盐测序技术(BSP)分析IGFBP-1在二倍体、四倍体泥鳅中的表达水平及启动子区和第一外显子区的甲基化水平。结果显示,泥鳅的IGFBP-1基因CDS序列长789bp,编码262个氨基酸,二倍体、四倍体泥鳅间有5bp的差异,但氨基酸序列完全相同。在二倍体、四倍体中分别克隆得到2 341bp和2 331bp的启动子序列,倍性间的序列相似度达99%,启动子序列中包含典型元件TATA-box,以及SP1、CREB、C/EBP、POU2F2、GATA-2/3/4和SRY等转录因子结合位点。泥鳅的IGFBP-1基因主要在肝脏中表达,且四倍体泥鳅肝脏中IGFBP-1的表达水平显著高于二倍体(P<0.01)。四倍体泥鳅IGFBP-1基因启动子及第一外显子区的甲基化水平均比二倍体低,其中四倍体肝脏中的甲基化水平显著低于二倍体(P<0.01)。综合分析研究结果表明,在IGFBP-1基因主要表达的肝脏组织中,其mRNA表达水平与DNA甲基化水平呈负相关,启动子区较高的甲基化可能抑制了二倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
李林 梁宏伟 李忠 罗相忠 张志伟 朱媛媛 邹桂伟
利用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)克隆了黄颡鱼DMRT1基因cDNA全长序列,并利用实时荧光定量RT-PCR技术对该基因在黄颡鱼成体不同组织及不同发育阶段的表达情况进行研究。结果表明,黄颡鱼DMRT1基因cDNA序列全长1 381bp,其中5′端非翻译区30bp,3′端非翻译区454bp[不包括poly(A)],开放阅读框885bp,编码295个氨基酸。氨基酸序列同源性分析表明,黄颡鱼DMRT1基因与革胡子鲶同源性最高(为81%),与黑鲷、虹鳟、斑马鱼、青鳉的同源性分别为60%、59%、64%和52%,与小鼠...
[期刊] 华北农学报
[作者]
关荧 刘楠 苍晶 魏铁锁 吴晶晶 齐越 郭富烨 李沅珊
东农冬麦1号(Dn1)是首例能够在黑龙江地区安全过冬的强抗寒冬小麦品种,目前其体内很多相关抗寒基因已被研究。为了探索外源ABA对冬小麦TabZIP2基因在低温胁迫下的影响,以强抗寒冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)为试验材料,克隆了TabZIP2基因的CDS序列全长,并且利用生物信息学手段对其进行了预测分析。之后又以弱抗寒冬小麦品种济麦22(JM22)为对比材料,应用RT-PCR技术对TabZIP2基因进行逆境下不同冬小麦品种的组织表达分析,并且探讨不同温度下外源ABA对Dn1分蘖节和叶片中TabZIP2相对表达量的影响。生物信息学分析结果表明:TabZIP2基因包含759 bp的完整开放阅读框,其编码的蛋白由252个氨基酸组成,是一个分子量为26.595 6 ku的不稳定蛋白;二级结构预测α-螺旋(H)和无规则卷曲(C)占大部分;该蛋白无跨膜区和信号肽,亚细胞定位表示该蛋白在细胞核中,亲水能力较强,并且与二穗短柄草以及水稻亲缘关系较近,而且该蛋白有保守的碱性亮氨酸拉链结构域。表达分析结果显示:寒胁迫下,Dn1叶片要比分蘖节提前应答低温胁迫;Dn1分蘖节和叶片中的TabZIP2表达量明显高于JM22;经过ABA处理后,-10,-25℃下Dn1分蘖节和叶片中TabZIP2的表达增加,即ABA正向调节TabZIP2的表达,初步判断ABA可以提高冬小麦抗寒性。本研究初步探究了TabZIP2在Dn1抗寒方面发挥的功能,也为低温下ABA信号调控机制提供了支持。
[期刊] 水产学报
[作者]
杨峰 秦超彬 卢荣华 孙君君 杨丽萍 聂国兴
为探讨Ａｄｉｐｏ Ｒ１－Ｂ在鱼类糖类和脂质代谢中的作用，本实验采用ＲＡＣＥ方法获得了草鱼Ａｄｉｐｏ Ｒ１－Ｂ的全长Ｃ ｄＮＡ序列（登录号：Ｋｐ７３３８４６），利用生物信息学技术对该基因及其所编码蛋白的结构特征进行了分析；采用实时定量ｐＣＲ技术，检测了Ａｄｉｐｏ Ｒ１－Ｂ在１９个不同组织中的表达特性以及高糖（４５％）、高脂（８％）和高糖高脂饲喂对草鱼肝脏中该基因表达的影响。结果显示，草鱼Ａｄｉｐｏ Ｒ１－Ｂ Ｃ ｄＮＡ全长２１８６ Ｂｐ，其中开放读码框为１１２２ Ｂｐ，编码３７３个氨基酸；跨膜结构分析表明草鱼Ａｄｉｐｏ Ｒ１－Ｂ为典型的７次跨膜蛋白；同源性分析结果显示，草鱼Ａｄｉｐｏ Ｒ１－Ｂ与．．．
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
陈海旺 侯喜林 李英 王枫 杨学东 张硕
采用RT-PCR方法首次获得不结球白菜BcSLAC1基因,该基因核甘酸序列全长1 668 bp,其开放阅读框编码555个氨基酸。与已公布的拟南芥SLAC1基因有较高的同源性。系统进化树分析表明:与SLAHs基因家族其他基因相比,BcSLAC1基因与拟南芥SLAC1基因有更近的遗传距离。在冷胁迫条件下利用气孔开张度测量和荧光显微技术分析表明:冷胁迫下H2O2可能作为下游信号分子参与了保卫细胞中ABA信号转导。实时定量RT-PCR检测表明,冷胁迫下BcSLAC1基因表达量升高,同时用ABA处理后,BcSLAC1基因表达量比抗坏血酸处理后明显上升,说明ABA对BcSLAC1基因的诱导作用和ABA诱导...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
王琳 王滨 徐永江 关长涛
白介素-1β是一种典型的促炎细胞因子，参与调控免疫细胞增殖、分化和凋亡等过程。本研究从黄条(鱼师)(Seriola lalandi)中鉴定到2个白介素-1β分子(分别命名为Sdil-1β1和Sdil-1β2)。Sdil-1β1全长cDNA序列为1292 bp，开放阅读框长度为828 bp，编码275个氨基酸；Sdil-1β2 cDNA序列为1337 bp，开放阅读框长度为960 bp，编码319个氨基酸。Sdil-1β1和Sdil-1β2编码的蛋白均含有IL-1保守的结构域和12个β折叠，具有结构上的保守性。组织表达分布显示，Sdil-1β1在头肾中表达量最高，脾脏和肝脏次之；而Sdil-1β2在鳃中表达量最高，头肾、脾脏次之。脂多糖(LPS)刺激后，Sdil-1β1和Sdil-1β2在头肾和脾脏中的表达量均显著增加。在头肾中，LPS刺激后6 h，Sdil-1β1急剧上升至对照组的10.03倍(P<0.05)，随后逐渐回落；Sdil-1β2转录水平表达模式与Sdil-1β2相似。综上，本研究在黄条(鱼师)中鉴定了2种白介素-1β分子，并探讨了其在黄条(鱼师)免疫应答中的表达规律，为今后研究白介素-1β分子在黄条(鱼师)抗细菌免疫防御中的作用提供了基础。
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