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[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘宏祥 徐文娟 朱春红 陶志云 宋卫涛 章双杰 李慧芳
【目的】选择两个中国地方品种高邮鸭和金定鸭,对鸭胚胎发育中后期胸肌进行转录组分析研究,旨在探明胸肌发育阻滞的分子变化机制,为鸭骨骼肌调控机理研究打下基础。【方法】在21胚龄和27胚龄两个时间点,分别解剖高邮鸭、金定鸭各3只,采集胸大肌,提取总RNA构建文库,利用Illumina的HiseqTM2000进行高通量测序,并利用生物信息学方法进行差异表达基因挖掘、基因功能注释等分析,探讨21胚龄和27胚龄两个时间点之间胸肌发育阻滞的分子机制。【结果】高邮鸭、金定鸭21胚龄和27胚龄胸大肌组织RNA-seq质量Q20均在94%以上,Q30均在89%以上,测序得到的结果可靠,可用于后续分析。RNA水平相关性检查和基因mRNA表达量聚类图结果都表明,21胚龄(27胚龄)高邮鸭和金定鸭之间表达模式的相关性高于高邮鸭(金定鸭)21胚龄和27胚龄之间的表达模式。不同品种内时间点之间的差异基因数量(高邮鸭6 128个,金定鸭6 452个)远多于同一时间点不同品种间的差异基因数量(21胚龄522个,27胚龄299个)。qRT-PCR验证试验结果与RNA-seq分析结果相关性较强。通过GO和KEGG富集分析发现,高邮鸭、金定鸭胸肌在21胚龄到27胚龄阶段,能量代谢相关基因(主要为辅酶Q相关基因、ATP酶合成相关基因和细胞色素C相关基因)均显著上调,DNA复制和细胞周期相关基因(主要为微型染色体维持蛋白(MCM)相关基因、复制因子C(RFC)相关基因)均显著下调。相关基因表达的变化可能与此阶段成肌细胞增殖速度减慢,逐渐退出细胞周期开始准备下一阶段融合成多核肌管并形成肌纤维有关。对肌肉生长发育相关的关键基因分析发现,促进肌肉生长的IGF1和诱导成肌细胞末端分化的MyoG显著下调,促进肌纤维分化融合的MUSTN1基因、诱导肌祖细胞向成肌细胞转化的MyoD1基因显著上调。【结论】鸭胚胎中后期胸肌发育过程中大量基因差异表达。其中能量代谢相关基因的上调和DNA复制、细胞周期相关基因的下调,以及肌肉发育相关基因MUSTN1显著上调,IGF1、MyoG等显著下调,可能与鸭胚胎中后期胸肌发育阻滞现象密切相关。
关键词：
鸭 胸肌发育 转录组测序 差异表达基因
[期刊] 中国农业科学
[作者]
字向东 罗斌 夏威 郑玉才 熊显荣 李键 钟金城 朱江江 张正帆
【目的】探明不同发育阶段牦牛体外受精(IVF)胚胎的转录组差异,了解差异表达基因(DEG)在功能、分类和代谢通路的差异,为揭示牦牛早期胚胎发育调控机制,促进牦牛胚胎体外生产技术的发展提供理论基础。【方法】以IVF技术生产的牦牛2-细胞、4-细胞、8-细胞、桑椹胚和囊胚5个发育阶段的胚胎为样本分别提取总RNA,采用Smart-Seq2扩增技术构建5个测序文库,应用Hi SeqTM 2500高通量测序技术进行转录组测序,对获得的有效序列进行功能注释及相关生物信息学分析。【结果】牦牛IVF后的卵裂率和囊胚率分别为69.3%和26.2%。2-细胞、4-细胞、8-细胞、桑椹胚和囊胚5个发育阶段的牦牛胚胎Clean reads为47 355 570—50 855 888条,其中有85.65%—90.02%的reads能比对到牦牛参考基因组序列上;8-细胞的胚胎比对上的转录本最多(14 893),而囊胚比对上的转录本最少(9 827)。牦牛胚胎转录本主要有5种可变剪接类型,转录起始区域可变剪接(TSS)和转录结束区域可变剪接(TTS)所占比例最大;牦牛2-细胞、4-细胞、8-细胞、桑椹胚和囊胚基因组分别有116601、234 131、196 420、70 841和94 840个位点存在单核苷酸多态性(SNP)。在4-细胞、8-细胞、桑椹胚、囊胚期开始表达的基因分别有1 221、1 116、142和564个;随着胚胎发育的进行,BMP15、KIT、GDF9、STAT3、ZP3和ZP4等母源基因的表达量逐渐减少,而SARS、IL18、ACO2、TXN2、ATP5B、PCGF4、UBE3A、MAPK13、SNURF和JUP等胚胎基因的表达量则逐渐增加。以|log2ratio|≥1且Q-value
[期刊] 华北农学报
[作者]
朱春红 陶志云 宋卫涛 徐文娟 章双杰 刘宏祥 李慧芳
为筛选重要地方鸭品种——高邮鸭早期肌肉生长标记，利用连接酶检测反应，以高邮鸭群体为研究对象，筛选肌分化因子基因Ｍｙｏ Ｄ１第一内含子区域的ＳＮＰ位点，以期获得高邮鸭早期生长分子标记。筛选获得Ｍｙｏ Ｄ１基因第一内含子区的位点突变Ｔ→Ａ，检测到ＡＡ，ＴＡ和ＴＴ ３种基因型，其中ＡＡ和ＴＡ是优势基因型，处于ＨＡｒＤｙ－ＷｅｉＮｂｅｒｇ平衡状态。关联分析结果表明ＴＡ基因型群体在４９日龄的体重、胸肌重、胸肌横截面积、胸肌纤维直径以及胸肌纤维密度均显著高于ＡＡ、ＴＴ基因型群体（Ｐ０．０５）。相较于传统育种，分子标记辅助育种具有快速、精准的优点。结果预示ＴＡ．．．
关键词：
高邮鸭 Myo D1基因 多态性 胸肌
[期刊] 水产学报
[作者]
崔文耀 周丽青 杨继辉 熊加奉 李伟明 任建峰
四带无须魮是一种具有较高经济价值的小型热带观赏鲤科鱼类。本实验利用光学显微镜观察了其胚胎发育全过程，采用小鱼游泳法和流式细胞术检测了其染色体数目及DNA含量，最后利用线粒体基因组序列对其在鲃亚科中的系统进化地位进行了分析。结果显示，水温28℃条件下，四带无须魮的胚胎发育经历了卵裂期、囊胚期、原肠期、神经胚期、器官形成期和出膜期6个时期，24 h孵化出膜。与斑马鱼出膜时开始形成色素不同，四带无须魮出膜时色素未形成，有利于早期器官形成和发育的观察。以公鸡血细胞DNA含量2.30 pg/2c为标准，四带无须魮DNA含量为1.50 pg/2c。四带无须魮染色体为2n=50，系统进化树显示，四带无须魮在鲃亚科鱼类进化史上属于较早出现的鱼类，染色体数为原始的数目类型，鲃亚科其他属的鱼类独立发生多倍化。上述结果为四带无须魮的繁殖和遗传改良研究提供了基础资料。
[期刊] 淡水渔业
[作者]
陈玉琳
白鲫胚胎发育的研究陈玉琳（上海市水产研究所，上海２０００８２）白鲫是一种优良的养殖种类。近年来我们对白鲫胚胎发育及仔鱼的习性作了观察研究，其结果叙述如下。１材料与方法１．且实验材料取自本所养殖实验场２－３龄的人工授精卵。用毛笔将受精卵撒在干净的培养皿...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
何斌 陈先均 温涛 龙治海 李孟均
为了研究中华沙鳅胚胎的各发育期形态特征及发育特点,采用莱卡体视显微镜对中华沙鳅胚胎发育进行连续观察、描述和拍照记录。结果表明:成熟卵直径为0.9~1.3 mm。受精卵吸水膨胀之后卵膜外径为4.21~4.98 mm,漂流性。在水温23℃±0.5℃时,中华沙鳅胚胎需要33 h 15 min发育后出膜。胚胎发育过程可划分为7个阶段26个发育期。初孵仔鱼身体透明,全长约4.8~5.1 mm,肌节数为24+14。
关键词：
中华沙鳅 胚胎发育 受精卵
[期刊] 淡水渔业
[作者]
胡振禧 黄洪贵 吴妹英 赖铭勇 黄柳婷
研究不同温度对斑鳜(Siniperca scherzeri)胚胎发育的影响。结果表明:在18~28℃温度范围内,斑鳜胚胎均能孵化出膜;随温度升高,胚胎发育达囊胚期、原肠期和出膜期的时间均相对缩短,温度对囊胚期前的发育进程影响较小,胚胎发育至囊胚期后,温度升高胚胎发育进程明显加快;孵化时间随温度的升高而缩短,孵化时间T与温度x呈极显著的负相关关系,T=306 738x-2.463,R2=0.996 6(P<0.01);在18~26℃温度范围内,胚胎发育到原肠中期的死亡率较低,孵化率较高,且组间差异不显著(P<0.05),温度达28℃时,胚胎发育到原肠中期的死亡率极显著上升,孵化率下降极显著(P<...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
陈国柱 方展强 马广智
唐鱼(Tanichthys albonubes)是一种小型鲤科鱼类,是华南地区的特有种。本研究报道对唐鱼胚胎发育过程的观察结果。唐鱼的受精卵近卵圆型,其卵径为(1.017±0.001)mm。根据其胚胎发育过程的形态特征,胚胎发育全程可划分为7个阶段:受精卵胚盘形成阶段、卵裂阶段、囊胚阶段、原肠胚阶段、神经胚形成阶段、器官形成阶段和孵化出膜阶段。观察结果表明,在不同的水温条件下发育历程不同:当水温分别在14.0-16.8℃、22.5-25.0℃和28-30℃条件下,受精卵分别经过147 h、50 h和28 h发育而孵出。文中讨论了唐鱼胚胎形态及胚细胞的分化特点,以及水温对胚胎发育的影响。
关键词：
唐鱼 胚胎发育 水温
[期刊] 水产学报
[作者]
田永胜 陈松林 严安生 季相山
在牙鲆胚胎玻璃化冷冻中,为了准确选择胚胎的冷冻时期,掌握胚胎发育进程,同时为牙鲆苗种培育提供一定的依据,对海水工厂化养殖牙鲆的胚胎发育进行了研究。牙鲆受精卵培养在14～16℃、盐度29.9的海水中,利用Olympus显微镜对牙鲆胚胎发育过程连续观察,对各个胚胎时期的发育时间进行了记录,并对每一时期的特征用Olympus照像机进行了拍摄。实验记录了从受精卵到出膜后5d的29个具体发育时期的特征和发育时间,拍摄了30张具有代表性的胚胎和鱼苗图片,将牙鲆胚胎发育划分为卵裂期、囊胚期、原肠期、神经胚期、肌节期、尾芽期、心跳期、胚体转动期、出膜前期、出膜期10个连续的典型时期。在此培养条件下牙鲆胚胎历时...
关键词：
牙鲆 胚胎发育
[期刊] 水产学报
[作者]
沈和定 陈贤龙 陈汉春 冉福 李家乐 王飞 熊柳平
通过实验室研究,对石磺(Onchidiumsp.)胚胎发育过程进行了详细观察,比较了不同水温下石磺胚胎发育的速度,探讨了膜内面盘幼虫孵化出膜的主要条件。结果表明:石磺的胚胎发育过程类似于肺螺亚纲其他贝类,行体内受精,刚产出的卵为受精卵,细胞未进行分裂,卵裂从卵产出体外开始,分别经过卵裂期,囊胚期,原肠期,膜内担轮幼虫期,膜内面盘幼虫期,经过孵化期孵化出膜为自由生活的面盘幼虫期。对各阶段幼体的大小、形状、内部器官等特征以及发育变态过程进行了详细的显微观察和描述。26℃,28℃,30℃3个水温组中,从受精卵到膜内面盘幼虫孵化出膜分别需要300h,290h,288h;发现影响幼虫孵化出膜的主要因素是...
关键词：
石磺 水温 胚胎发育 孵化出膜 停止发育
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
夏连军 施兆鸿 王建钢 陆建学 赵荣兴 黄宁宇 来琦芳 么宗利 楼宝 辛俭
研究了孵化水温对黄鲷胚胎发育的影响。结果表明:在16~26℃范围内,黄鲷胚胎都能孵出仔鱼,孵化速度随水温上升而加快。其中18~22℃是黄鲷胚胎孵化的最适温度,孵化率最高,20℃时达89%,畸形率最低;受精卵42 min细胞开始分裂,3 h 30 min为多细胞期,7 h为囊胚期,22 h胚孔关闭,37 h仔鱼开始孵出,孵出仔鱼健壮活泼。当水温高于26℃或低于16℃时,黄鲷胚胎不能孵出仔鱼;水温低于14℃时胚胎发育停止于高囊胚,12 h后受精卵开始变浊死亡;水温高于28℃时,胚胎发育至多细胞期,胚盘聚合死亡。黄鲷胚胎发育的有效积温为422.2~483.6(h.℃)。黄鲷发育的阈温度为7.88℃
关键词：
黄鲷 胚胎 发育 仔鱼 温度
[期刊] 中国水产科学
[作者]
易祖盛 陈湘粦 王春 林小涛
2001～2002年,采用连续观察法对倒刺(SpinibarbusdenticulatusdenticulatusOshima)人工授精的受精卵的发育进行观察,倒刺胚胎发育分为22个时期,成熟卵直径2.87～3.12mm,金黄色,沉性,具弱粘性。卵膜遇水后30～50s膨胀达最大,外膜径达3.35～3.55mm。在水温(25±0.5)℃条件下,受精卵历时43h45min孵化,积温1093.75℃·h。初孵仔鱼全长(8.93±0.35)mm,肌节数为12+16+14;具心跳、血液循环,无色素,活动能力弱,沉于水底。与本亚科其他鱼类的发育比较,倒刺具有下列3个特点:第二极体明显;发育过程中没有...
关键词：
倒刺鲃 胚胎发育
[期刊] 淡水渔业
[作者]
杨广 刘金兰 袁凤霞
鄂西棘腹蛙的胚胎发育杨广，刘金兰，袁凤霞（湖北农学院水产系）（华中农业大学水产学院）蛙类的胚胎发育在过去有过一些研究，然而有关武陵山区棘腹蛙（Ｒａｎａｂｏｕｌｅｎｇｅｒｉ）的尚未见报道。为对棘腹蛙人工养殖提供可行性技术，研究其胚胎发育的规律是必要的。...
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