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[期刊] 中国农业大学学报  [作者] 李永洙  
研究依莎褐蛋鸡和艾维茵肉鸡发育正常及迟缓鸡群的盲肠细菌种群结构和多样性变化。使用基于16S rDNA的PCR-DGGE技术,结合割胶回收DNA进行克隆和测序,分别对4、6、10、16、20和40周龄蛋鸡及1、2、4、6、7和8周龄肉鸡发育正常、迟缓鸡群盲肠内容物的细菌群落进行特异性引物图谱指纹和聚类分析,鉴定特异性和共性群落。结果表明,Lactobacillus属在两品种发育正常鸡群盲肠内容物细菌的相似性均高于迟缓鸡群,两品种各周龄和发育正常、迟缓鸡群间指纹图谱平均条带数差异显著(P<0.05)。而Bacteroides属在发育正常鸡群盲肠内容物细菌的相似性与迟缓鸡群较为相近;发育正常、迟缓鸡...
[期刊] 中国农业大学学报  [作者] 李永洙  
研究在低蛋白饲粮中添加不同氨基酸水平对改善蛋鸡生产性能及盲肠微生物菌群的影响。选用225羽20周龄海兰褐蛋鸡,随机分为5组,每组3个重复,每个重复15羽。对照组饲粮为粗蛋白质13%(Ⅰ组)的无氨基酸添加玉米-豆粕型基础饲粮;试验组饲粮为在基础饲粮中按氨基酸需要量的100%(Ⅱ组)、110%(Ⅲ组)、120%(Ⅳ组)和130%(Ⅴ组)添加必需氨基酸(蛋氨酸、赖氨酸和苏氨酸),试验期为40周。结果表明:试验期内氨基酸添加Ⅲ组产蛋率最高,平均达到83.6%,分别比试验Ⅱ、Ⅳ、Ⅴ组及其对照组平均高出7.2%(P<0.05)、3.4%、4.2%(P<0.05)和12.4%(P<0.05);不同周龄段中Ⅲ...
[期刊] 西南农业学报  [作者] 何嘉  马婷慧  白小军  李清清  高立原  郝万亮  赵阳阳  
【目的】本文针对近年来枸杞生产中过量施用化肥农药及长期连作的栽培模式导致果实产量品质下降的问题,研究不同微生物菌剂处理对枸杞树体生长发育和果实产量品质的影响。【方法】以"宁杞7号"为研究对象,通过施用培元(T1)、哈茨木霉菌(T2)、根无忧(T3)3种微生物菌剂,以不施微生物菌剂为对照,进行田间试验。【结果】微生物菌剂能显著提高一龄枸杞幼苗的成活率,发根量和枝条生长量较对照分别提高9.06%~57.84%、4.76%~54.9%;四龄枸杞植株发枝量和枝条生长量较对照分别提高29.9%~87.09%和7.5%~18.3%,成花率、坐果率、百粒重、产量分别提高2.07%~18.87%、3.19%~13.63%、0.57%~4.92%、29.7%~52.7%,哈茨木霉菌(T2)提高作用尤为显著,其发枝量、成花率、产量较其他处理提高30.05%、12.23%、4.45%;可显著改善果实品质,使各处理枸杞果实内含物多糖、甜菜碱、总黄酮含量分别较CK显著提高4.55%~25%、25.5%~43.67%、12.5%~58%,胡萝卜素含量提高达2.8~3.6倍,尤以培元(T1)效果最佳,较其他处理枸杞多糖、甜菜碱、胡萝卜素含量显著增加5.77%、8.52%、23.78%。【结论】综合评价得出,微生物菌剂对枸杞的生长均有一定的积极作用,其中哈茨木霉菌对树体生长发育、产量及经济效益最为显著,培元对果实品质的提升效果最佳,在生产实践中可据生产需求借鉴推广,可将培元和哈茨木霉菌配合施用,以期达到提质增产效果。
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 罗丹  李蛟龙  邢通  张林  高峰  
[目的]本试验旨在研究低聚木糖(XOS)和包膜丁酸钠(CSB)对肉鸡肠道发育、黏膜免疫和盲肠微生物的影响。[方法]采用2×2因子试验设计,在基础日粮设2个XOS添加水平(0和150 mg·kg~(-1))和2个CSB添加水平(0和400 mg·kg~(-1))。试验选用1日龄、健康的罗斯308肉鸡192只,随机分成4组,分别为对照组(Control)、XOS组(150mg·kg~(-1)XOS)、CSB组(400mg·kg~(-1)CSB)及XOS+CSB组(150mg·kg~(-1)XOS和400mg·kg~(-1)CSB),每组6重复,每个重复8只鸡,试验期为42 d。[结果]添加CSB可显著降低十二指肠、回肠的相对长度,增加十二指肠、空肠、回肠的单位长度重量,XOS和CSB对回肠的单位长度重量存在互作效应( P
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 于洁  冯炘  解玉红  刘淑琮  
变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术目前已被广泛应用于环境微生物领域。介绍了DGGE的基本原理和技术步骤,分析了该方法的主要影响因素及其优点和存在的问题;概述了PCR-DGGE技术在环境微生物领域,包括在微生物处理技术、微生物生态多样性研究和功能菌种优化筛选中的应用现状,并展望了其应用前景。
[期刊] 中国农业科学  [作者] 倪学勤  Joshua Gong  Hai Yu  Shayan Sharif  曾东  
【目的】研究蛋鸡MHC(Major Histocompatibility Complex,主要组织相容性复合物)基因对不同周龄和不同部位肠道细菌种群结构的影响。【方法】使用基于16S rDNA的PCR-DGGE技术,结合特异性和共性条带割胶回收DNA进行克隆和测序,对2,4,6和8周龄商品蛋鸡和15I5系蛋鸡嗉囊、十二指肠、空肠、回肠和盲肠内含物细菌群落的结构和多样性进行比较,鉴定8周龄蛋鸡部分特异性和共性群落成员。【结果】商品蛋鸡和15I5系蛋鸡盲肠细菌的多样性最高,其次是回肠和空肠,嗉囊和十二指肠的细菌多样性比较低,且随着蛋鸡周龄增加,各肠段细菌多样性呈上升趋势,MHC基因对细菌多样性无显...
[期刊] 农业现代化研究  [作者] 同小娟  李维炯  李俊  倪永珍  
采用田间小区试验方法研究了有效微生物堆肥对冬小麦生长的影响。结果表明:与等量传统堆肥、化肥相比,有效微生物堆肥能明显提高土壤的有机质、全氮和碱解氮含量,刺激冬小麦根系生长,增加群体密度,提高叶面积指数和叶片的总叶绿素含量,促进植株生长和干物质的积累,从而显著提高了冬小麦产量。与等量传统堆肥、化肥相比,有效微物生堆肥增产幅度为5.3%~25.8%,且随施肥量增加效果更为显著。
[期刊] 中国农业大学学报  [作者] 林奕岑  徐帅  倪学勤  曾东  周梦佳  曾燕  
为对肉鸡盲肠微生物的多样性进行探索,选取15只饲养在相同条件下的科宝-500肉鸡,利用IllumIna mISeq测序平台与qIIme等16Srrna序列分析工具在22日龄时采集盲肠内容物进行研究。结果显示:1)测序共获得359 158条有效序列与3 210个OTu,并且由稀释曲线可以证明此次测序结果比较全面的覆盖了肉鸡盲肠微生物群落。2)各样品菌群之间存在差异,得到序列的数量以及菌群多样性差别较大。3)通过核心菌群分析可知,4个共享菌群在门水平上分别为:拟杆菌门BacTerOIdeTeS(70.0%±12.1%)、厚壁菌门FIrmIcuTeS(25.4%±11.2%)、变形菌门PrOTeOB...
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 梅文晴  冯宇妍  姚志浩  倪迎冬  赵茹茜  
[目的] 本试验旨在研究早期饲喂复合益生菌对肉仔鸡盲肠微生物组成、小肠上皮组织结构及紧密连接相关基因表达的影响。[方法] 将144只1日龄健康青脚麻鸡随机分为3组,分别为对照组(Control, CON),低剂量(50 mg·d~(-1))益生菌组(low-dose probiotic, LP)和高剂量(100 mg·d~(-1))益生菌组(high-dose probiotic, HP),每组6个重复,每个重复8只鸡,从1日龄开始饮水中添加益生菌,试验期为2周。试验期间记录采食量和体质量,于第14日龄采集小肠上皮组织检测其形态结构及紧密连接相关基因表达,16S rRNA测序分析盲肠内容物微生物组成。[结果] 试验期间HP组肉鸡体质量高于对照组,但差异不显著(P>0.05)。与对照组相比,HP组肉鸡1-7日龄平均日采食量显著降低(P<0.05),但7-14日龄平均日采食量有升高的趋势(0.05
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 朱赫   王亚梅   胡恒   姚文   郑卫江  
[目的]本试验旨在研究饮用富氢水对肉鸡生长性能、抗氧化能力、肉品质和盲肠微生物群影响。[方法]选取120只一日龄雄性AA肉鸡,随机分成两组(每组6个重复,每个重复10只鸡),对照组饮用自来水,富氢水组饮用富氢纳米气泡自来水,试验为期42 d。[结果]虽然富氢水对肉鸡生长性能无显著影响,但可提高血清总抗氧化能力、超氧化物歧化酶活性和肝脏过氧化氢酶活性(P<0.05);降低肝脏活性氧和丙二醛含量(P<0.05)。在鸡胸肉的肉品质方面,富氢水组剪切力显著低于对照组(P<0.05);此外,富氢水组鸡胸肉中亮氨酸、赖氨酸及必需氨基酸占比显著高于对照组(P<0.05);十一烷酸占比显著低于对照组(P<0.05),棕榈油酸、油酸、芥酸、γ-亚麻油酸、α-亚麻油酸及单不饱和脂肪酸占比显著高于对照组(P<0.05)。与对照组相比,富氢水可提高盲肠食糜中产丁酸盐菌(Mediterraneibacter、Kineothrix、Roseburia)和寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)相对丰度(P<0.05),而降低Massilimaliae和共生小杆菌属(Symbiobacterium)相对丰度(P<0.05)。[结论]富氢水对肉鸡生长性能无显著影响,但对血清和肝脏的部分抗氧化指标起到积极作用;此外,富氢水还可提高盲肠食糜中部分产丁酸盐菌群的丰度,并通过改善氨基酸与脂肪酸组成调节肉鸡鸡胸肉品质。
[期刊] 浙江林学院学报  [作者] 何沙娥  张智俊  
为了获得完整、高纯度的竹林土壤微生物总DNA,采用改良的十二烷基硫酸钠-高盐抽提法对5种竹林土壤进行DNA提取,通过DNA凝胶回收试剂盒纯化粗提的DNA,利用细菌16 S rDNA基因的V3区引物对纯化的DNA进行了聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)验证。结果表明,该方法所需土壤样品少,抽提的DNA片段均在23kb以上,完整性好;采用DNA凝胶回收试剂盒纯化能够有效去除粗提DNA中大部分杂质,获得高质量的DNA;以此DNA为模板进行DGGE检测所反映的微生物信息量丰富。
[期刊] 水产学报  [作者] 夏耘  郁二蒙  谢骏  余德光  王广军  李志斐  王海英  龚望宝  
在草鱼养殖过程中添加碳源(葡萄糖)维持水体C∶N为20∶1以培养生物絮团,通过对生物絮团细菌群落构成进行种类鉴定来评价生物絮团中功能微生物的组成。采用PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)技术分析生物絮团形成第5、10和15天的细菌群落结构。DGGE指纹图谱结果分析表明:第5天和第10天的相似性最高,达67.4%;第5天和第15天相似性系数最低仅为40.5%。第10天时微生物多样性最高,第15天时多样性最低。对DGGE指纹图谱特征条带进行回收、克隆测序,结果表明,生物絮团培养过程主要微生物类群隶属于以下6个纲:α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、γ-变形菌纲(Gammapro...
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 陈添晔  许晨远  敖蕊  朱崇淼  姚文  郑卫江  
[目的]本试验研究发酵豆粕对蛋雏鸡生长性能、养分表观代谢率、血清生化指标、抗氧化性能和盲肠微生物的影响。[方法]选取320只33日龄海兰褐蛋雏鸡,随机分成5组(每组8个重复,每重复8只鸡),对照组饲喂基础饲粮,试验组分别饲喂2.5%、5.0%、7.5%和10%发酵豆粕等能等蛋白替代基础饲粮中普通豆粕的试验饲粮,试验为期28天。[结果]1)不同比例发酵豆粕对蛋雏鸡各阶段生长性能均无显著影响(P>0.05)。2)不同比例发酵豆粕对总能、干物质和钙的表观代谢率无影响(P>0.05);但2.5%发酵豆粕组粗蛋白、粗灰分和总磷的表观代谢率显著高于对照组(P<0.05)。3)2.5%和7.5%发酵豆粕组血清谷丙转氨酶活性显著低于10%发酵豆粕组(P<0.05);5%发酵豆粕组血清谷丙转氨酶活性显著低于对照组和10%发酵豆粕组(P<0.05)。4)2.5%发酵豆粕组血清总抗氧化能力和谷胱甘肽过氧化物酶活性显著高于对照组(P<0.05)。5)与对照组相比,2.5%发酵豆粕组盲肠食糜中普氏菌属9(Prevotella_9)和Mucispirillum相对丰度显著升高(P<0.05);螺杆菌属(Helicobacter)和副萨特氏菌属(Parasutterella)相对丰度显著降低(P<0.05)。[结论]2.5%发酵豆粕对部分养分表观代谢率和血清抗氧化指标具有积极作用;但随着发酵豆粕水平的增加,蛋雏鸡养分表观代谢率和血清抗氧化性能呈线性或二次曲线降低。此外,与对照组相比,2.5%发酵豆粕提高了盲肠食糜有益菌(普氏菌属9、布劳特氏菌和颤螺菌科UCG-005属)的相对丰度,抑制了病原菌(螺杆菌属和副萨特氏菌属)的定殖。
[期刊] 水产学报  [作者] 聂志娟  徐钢春  程起群  张勇  杜富宽  顾若波  
为了分析养殖刀鲚体内与生长环境菌群结构,利用PCR-DGGE技术,对养殖刀鲚鳃、胃、肠壁及肠内容物和养殖水体菌群结构进行了初步分析。PCR-DGGE指纹图谱分离显示,42条清晰条带,其中养殖水体(27)、鳃(9)、胃(13)、肠道壁(19)、肠道内容物(18)的香农指数分别为3.037、1.883、2.193、2.825、2.683;养殖水体与刀鲚鳃、胃、肠道壁及肠道内容物分别具有6、9、11、8共有带。UPGMA聚类分析显示,样品3个重复相似度都在95%以上,差异不明显;不同样品之间,养殖刀鲚鳃和胃聚为一支,具有较高的相似度(76%),同时与养殖水体相似度达29%;养殖刀鲚肠道壁和肠道内容物...
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 胡萍  周光宏  徐幸莲  韩衍青  徐宝财  刘军昌  
应用16S rDNA变性梯度凝胶电泳(DGGE)指纹图谱和系统发育分析方法,揭示了火腿切片在真空包装、4℃贮藏条件下主要微生物的动态变化。直接从火腿中提取总的细菌DNA,用巢式PCR和降落PCR扩增16S rDNA V3可变区序列,再通过DGGE得到动态变化指纹图谱。DGGE图谱表明,产品在贮藏初期具有丰富的微生物群落,说明污染微生物的多样性,但经过一段时间后,只有少数种类细菌存活并最终成为主导菌群。DGGE优势条带经DNA序列分析表明,代表最相似菌为清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)和弯曲乳杆菌(Lactobacillus curvatus),其次是长膜明串珠菌(Leuco...
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