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[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
王宣朋 孙效文 李文升 张天奇 李超
利用JoinMap 4.0软件包,以德国镜鲤选育系为祖父母所培育的自交F2群体的68个个体为作图群体,首次以新型分子标记单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)为主要作图标记,以微卫星(Simple Sequence Repeats,SSR)和表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)为辅助标记,采用CP(CrossPollinators)模型构建鲤的遗传连锁图谱。构建的遗传连锁图谱含有560个标记(174个SSR标记、41个EST-SSR标记和345个SNP标记),分布在50个连锁群上,最大连锁群由60个标记组成,最小连...
[期刊] 水产学报
[作者]
高国强 常玉梅 匡友谊 梁利群
首次使用R环境中的OneMap软件包,以荷包红鲤抗寒品系(♂)和云南大头鲤(♀)为祖父母本所培育的110个F2个体为作图群体,以荧光扩增片段长度多态性(fluorescent amplification fragment length polymorphism,fAFLP)为主要分子标记,采用远交全同胞家系模型构建鲤的遗传连锁图谱。结果显示,110个F2个体中共产生1513个清晰的fAFLP标记,其中多态性标记911个;另开发多态性的EST标记12个,最后总计923个标记用于构建遗传连锁图谱;采用OneMap软件包构建的遗传图谱含有238个fAFLP标记和8个EST标记分布在50个连锁群上,总...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
孙效文 梁利群
建立了鲤鱼的遗传连锁图谱。图谱有RAPD分子标记 56个 ,鲤鱼的SSLP标记 2 6个 ,鲫鱼SSLP标记19个 ,斑马鱼的SSLP分子标记 70个 ,鲤鱼基因标记 91个 ,共有标记 2 6 2个 ;图谱有 50个连锁组 ,连锁图给出鲤鱼的基因组大小在 5789CM左右
关键词：
鲤鱼 遗传连锁图谱 分子标记
[期刊] 中国农业科学
[作者]
骆晚侠 张李 杨凯 李奕松 赵波 李明 万平
【目的】以小豆SSR为锚定标记,将公开发表的豇豆SSR、普通菜豆SSR和EST-SSR标记定位整合到小豆遗传连锁群中,构建中国小豆遗传图谱,为小豆基因定位、图位克隆和分子标记辅助选择育种提供更多可用的分子标记。【方法】用1 473对SSR和EST-SSR引物进行PCR扩增,包括906对豇豆SSR、123对普通菜豆和196对小豆SSR引物及248对普通菜豆EST-SSR引物,筛选亲本间多态性标记,验证栽培小豆HB801×AG109及GM892×AG110的F2分离群体。【结果】整合和构建了含有145个SSR和EST-SSR标记小豆遗传连锁图谱,包括59个小豆SSR标记,新增63个豇豆SSR、9个...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
石悦 于肖夏 于卓 杨东升 姜超 张明飞
【目的】对高丹草低氢氰酸含量及产量等重要性状进行QTL定位,构建其AFLP分子遗传连锁图谱,为分子标记辅助育种等研究奠定基础。【方法】以散穗高粱×红壳苏丹草杂种F2代305个分离单株为作图群体,利用AFLP分子标记技术先从供试AFLP引物中筛选适宜引物对,再用这些引物对对其供测群体进行PCR扩增;根据扩增原始数据,利用Join Map 3.0作图软件进行高丹草分子遗传连锁图谱构建。【结果】从113对AFLP引物组合中筛选出了25对多态性丰富、重复性好、条带清晰的适宜引物,对高丹草F2分离群体305个单株的
关键词：
高丹草 AFLP分子标记 遗传连锁图谱
[期刊] 中国水产科学
[作者]
喻达辉 王小玉 黄桂菊 郭奕惠 龚世园 王爱民
用AFLP标记构建了印度合浦珠母贝(Pinctada fucata)全同胞家系的遗传图谱。用经过筛选的36对引物组合对父母本和62个子代个体进行遗传分析,共得到1 547个标记,包括581个1∶1分离标记。母本分离标记294个,其中178个符合1∶1孟德尔分离规律;父本分离标记287个,其中182个符合1∶1孟德尔分离规律。雌性框架图包括33个遗传标记,分布在14个连锁群中,标记间平均间隔24.3 cM,有2个3联体,11个连锁对,图谱总长度为488.5 cM。雄性框架图包括53个遗传标记,分布在19个连锁群中,标记间平均间隔30.5 cM,有4个3联体,10个连锁对,图谱总长度为1 035....
关键词：
合浦珠母贝 遗传连锁图谱 AFLP标记
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
罗云 高保全 刘萍 李健 戴芳钰
利用AFLP和SSR标记技术结合"拟测交"策略,以三疣梭子蟹莱州湾、舟山野生群体杂交(1♂×3♀)产生的F2代家系为作图群体,初步构建了三疣梭子蟹雌、雄性遗传连锁图谱。用经过筛选的60对AFLP引物和3对SSR引物对亲本及108个F2代个体进行遗传分析,共得到母本分离标记214个,其中155个标记(AFLP标记153个,SSR标记2个)符合1∶1孟德尔分离规律;父本分离标记195个,139个标记(AFLP标记138个,SSR标记1个)符合1∶1孟德尔分离规律。雌性图谱包括100个遗传标记,分布在9个连锁群,6个三联体,15个连锁对,图谱总长度为1544cM,标记平均间隔22.0cM,总覆盖率为...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
乔慧 吴滟 傅洪拓 龚永生 蒋速飞 熊贻伟
采用SSR和SRAP标记结合拟测交策略构建青虾(Macrobrachium nipponense)遗传连锁图谱。共有175个标记(含27个SSR、148个SRAP标记)分布在53个连锁群上。每个连锁群含2~8个标记,其中不少于3个标记的连锁群有35个,连锁对18个,平均每个连锁群的标记数为3.3个;连锁群长度在6.7~91.2 cM之间,相邻标记间最大间隔为49.0 cM,最小为1.4 cM,平均间隔为13.1 cM。青虾框架图谱长度为997.2 cM,图谱观察总长度为2 270.5cM,根据估算,青虾遗传连锁图谱预期长度为4 380.6 cM,图谱的覆盖率为51.83%。本研究构建了青虾遗传...
[期刊] 水产学报
[作者]
李健 刘萍 王清印 李朝霞 孙昭宁 何玉英
利用RAPD、SSR和AFLP三种标记技术结合"拟测交"策略,以中国对虾"黄海1号"雌虾与野生雄虾作为亲本进行单对杂交产生的F1家系为作图群体,初步构建了中国对虾雌、雄性遗传连锁图谱。对460个RAPD引物和44对SSR引物进行筛选,共选出61个RAPD和20对SSR引物,结合88对AFLP引物组合对父母本和82个F1个体进行了遗传分析。共得到783个分离标记(RAPD标记237个,微卫星标记45个,AFLP标记501个),761个标记用于连锁分析。雌性图谱包括40个连锁群和15个三联体,20个连锁对,标记间平均间隔为12.5cM,图谱共覆盖2835.5cM,覆盖率为73.5%;雄性图谱包括4...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
王磊 王龙 薛华柏 李秀根 李疆
【目的】利用已公开发表的梨和苹果的ＳＳＲ（Ｓｉｍｐｌｅ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｒｅｐｅａｔ）引物以及从梨转录组开发的ＳＳＲ引物构建本研究作图群体的遗传连锁图谱，为后期梨重要性状ｑｔｌ定位和分子标记辅助选择等奠定基础。【方法】以西洋梨品种‘红茄’（Ｒｅｄ ｃｌａｐｐ ＦａｖｏＲｉｔｅ）为母本，东方梨品种‘晚秀’（ｍａｎＳｏｏ）为父本，构建Ｆ１代作图群体。将所选用的ＳＳＲ引物在亲本和４个子代个体进行ｐｃＲ扩增，初步筛选出扩增结果符合Ｊｏｉｎ ｍａｐ ４．０软件中＂ｃｐ＂作图模式要求的引物，随后在Ｆ１群体中检测，选用Ｊｏｉｎ ｍａｐ ４．０软件对分离数据进行连锁分析，分别构建亲本的连锁图谱。以双亲图谱在．．．
关键词：
梨 SSR 连锁图谱 整合图谱
[期刊] 水产学报
[作者]
徐燕 谢潮添 陈昌生 纪德华 高亚辉
以野生型坛紫菜纯系(♀)和红色型坛紫菜纯系(♂)作为杂交亲本,结合四分子分析法及单个体细胞克隆的丝状体途径,创建了由157个株系组成的坛紫菜DH作图群体,并用经过筛选的24对SRAP引物和16对SSR引物对父母本及作图群体各株系进行双标记分析,获得了224个多态性标记,其中157个标记符合孟德尔分离规律。根据标记间的连锁规律,首次构建了坛紫菜的分子遗传连锁图谱,所构建的遗传图谱由包含124个标记(含SRAP标记104个,SSR标记20个)的5个连锁群组成,总长度为879.2cM,平均标记间隔为7.09cM,各个连锁群长度为134.2～213.6cM,包含标记18～31个。最后采用3种不同方法计...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
庞仁谊 宋文涛 高峰涛 廖小林 赵永伟 牛余泽 王磊 赵文 田永胜 陈松林
利用基因组测序得到的大量微卫星序列,以681383B为父本、6812E36为母本杂交获得的F1为作图群体,构建了牙鲆(Paralichthys olivaceus)微卫星标记(SSR)遗传连锁图谱。雌雄图谱共定位SSR标记529个,其中雄性连锁图谱包括418个标记,分布在24个连锁群上,总长度1 418.1 cM,标记平均间隔3.62 cM,图谱覆盖率为88.7%;雌性连锁图谱包括437个标记,分布在24个连锁群上,总长度1 298.1 cM,标记平均间隔为3.16 cM,图谱覆盖率为89.1%。牙鲆中密度遗传图谱的构建为QTL分析以及分子标记辅助育种进一步奠定基础,并可以有效推动牙鲆的遗传改...
关键词：
牙鲆 SSR分子标记 遗传连锁图谱
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
屈彦纯 邓昌彦 熊远著 苏玉虹 郑嵘 刘桂兰
筛选了以 2 0cM左右均匀分布于 6号染色体的 9个多态性微卫星位点 ,构建了猪 6号染色体的遗传连锁图谱 ,并进一步进行了重要经济性状位点的定位。试验结果表明 :9个微卫星位点均为中、高度多态性位点 ,所有位点平均杂合度为 0 .5 81 71,多态信息含量为 0 .30 8 98～ 0 .74 7 5 8,平均多态信息含量为 0 .5 0 9 94。构建的资源家系遗传连锁图谱总长 198.6cM ,与USDA图谱位点顺序一致 ,图谱总长和多数区间距离长于USDA图谱。并进一步进行了猪数量性状位点定位的研究 ,在 6号染色体发现了显著影响肌内脂肪、肌肉大理石纹等肉质性状和板油重的数量性状位...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
赵永伟 宋文涛 廖小林 牛余泽 庞仁谊 高峰涛 沙珍霞 陈松林
利用全基因组测序方法筛选出微卫星标记,以渤海近海野生个体和人工养殖的半滑舌鳎(Cynoglossus semi-laevis)为亲本交配产生的F1全同胞家系为作图群体,构建了半滑舌鳎雌、雄微卫星标记遗传连锁图谱。用320对引物对父母本和92个F1个体进行遗传分析,共得到288个分离标记,其中包含112个偏分离标记(P
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