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[期刊] 渔业科学进展
[作者]
梁超 杨爱国 刘志鸿 周丽青 吴彪
应用RAPD标记技术对魁蚶Scapharca broughtonii1个韩国群体与3个中国群体的遗传多样性进行RAPD分析。对4个群体的133个个体进行扩增,共检测到171个位点。其中,多态性位点为167个,4个群体的多态性位点比例:韩国群体为86.55%、黄岛群体为90.06%、蓬莱群体为85.96%和前三岛群体为89.47%;4个群体的Shannon’s多样性指数为(0.460±0.232)~(0.491±0.214),Nei’s多样性指数为(0.308±0.171)~(0.331±0.199),表明4个群体遗传多态性较高;4个群体遗传分化指数在0.006~0.121之间。其中,韩国与中国...
关键词：
魁蚶 遗传多样性 RAPD
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
田吉腾 刘志鸿 杨爱国 吴彪 周丽青
利用多态性好的20对微卫星引物,对中国日照、黄岛、蓬莱和韩国的4个魁蚶地理群体进行了遗传多样性分析。结果显示,20个位点在4个群体中的等位基因数为3~17,平均等位基因数为8.35,平均有效等位基因数为6.230 6;观测杂合度(Ho)为0.466 7~0.966 7;期望杂合度(He)为0.619 8~0.931 8;多态信息含量(PIC)为0.530 1~0.909 3,表现出高的遗传多样性水平。4个群体间的遗传分化指数(Fst)在0.013 2~0.031 4之间,呈现出较低的遗传分化。群体间的遗传距离在0.125 5~0.245 8之间;通过构建UPGMA聚类树,显示日照群体和黄岛群体...
关键词：
魁蚶 微卫星 地理群体 遗传多样性
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
刘寒苗 吴彪 刘志鸿 杨爱国 周丽青 孙秀俊
采用PCR技术扩增了中国山东胶南、长岛、蓬莱、荣成和韩国统营5个地理群体魁蚶(Scapharca broughtonii)样本的COⅠ、12S rRNA、18S rRNA和28S rRNA基因部分序列,分析了魁蚶5个地理群体的遗传多样性和系统进化关系。经测序拼接、剪接后,分别获得67条776 bp的COⅠ序列、72条443 bp的12S rRNA序列、75条909 bp的18S rRNA序列和75条894 bp的28S rRNA序列。序列分析结果显示,5个群体75个个体的COⅠ序列中共检测到466个多态位
[期刊] 中国水产科学
[作者]
杨慧荣 江世贵 周发林 龚世园
利用RAPD技术对取自胶州湾(青岛)、台湾海峡(厦门)和北部湾(海南)3个天然群体的24尾黑鲷(Sparusmacro cephalus)进行群体内与群体间的遗传变异分析。在事先优化的反应条件下,所使用的60个随机引物中,有28个引物扩增出清晰稳定的片段,共计200条,大小在200～2500bp,其中多态性片段135条(多态性片段的比例为67.50%)。青岛、厦门和海南黑鲷群体内的遗传距离分别是0.1068、0.0939和0.1206,相似系数为0.8932、0.9061和0.8794;群体间的遗传距离分别是0.1550、0.1318和0.1228,其中青岛和海南黑鲷群体间的遗传距离最大,青岛...
关键词：
黑鲷 遗传变异 RAPD
[期刊] 水产学报
[作者]
江世贵 杨慧荣 苏天凤 龚世园
Random amplified polymorphic DNA( RAPD) technique was applied to assess the genetic variations among inter- and intra-population of three wild stocks(24 individuals) in Red Sea Bream from Jiaozhou Gulf(Qingdao), Taiwan Strait(Xiamen)and Beibu Gulf(Hainan). Under predetermined optimal reaction condit...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
周丽青 杨爱国 王清印 吴彪 于涛
为充分了解我国魁蚶种质资源状况,准确定位魁蚶的养殖育种模式,本研究采用聚合酶链式反应(PCR)对采自山东蓬莱(PL)、山东黄岛(HD)、江苏前三岛(QSD)及韩国统营(KTY)4个地理群体魁蚶样本的核糖体RNA两个内转录间隔区域(ITS-1和ITS-2)进行扩增,经测序比对后分别获得长度为468bp和541bp(包含引物、插入/缺失位点)的序列。序列比对结果表明,ITS区序列变异相对较高,但4个群体的碱基组成基本一致;4个群体的ITS区序列均表现出丰富的遗传多样性,HD群体最为丰富,该群体在ITS区序列上的变异位点数也最多,HD和QSD群体共同变异位点多且集中。对不同个体间的遗传距离和分子系统...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
丁金强 刘萍 李健 王清印 高保全 陈萍
采用聚丙烯酰胺不连续凝胶垂直电泳技术对中国沿海的大连黑石礁、山东莱州湾、江苏海州湾和浙江象山4个日本蟳地理群体的10种同工酶进行检测,并分析了群体间的生化遗传差异。实验共记录了28个座位,其中m-Mdh-1、Sod-3、Cat-3、Est-1、α-Amy-1、α-Amy-4、Ldh-2、Alp-1和Alp-3共9个座位表现为多态,4个群体的多态座位百分数(P0.99)均为32.14%,平均每个座位等位基因有效值Ae为1.2830～1.2979,平均预期杂合度He为0.1462～0.1556,平均观察杂合度Ho为0.2738～0.2783,遗传距离D为0.0004～0.0018。4个群体的聚类分...
关键词：
日本蟳 地理群体 同工酶 遗传差异
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
侯仕营 马爱军 王新安 黄智慧 薛宝贵 杨志 曲江波
利用12对微卫星分子标记对大菱鲆Scophthalmus maximus 4个引进地理群体进行遗传多样性分析。结果表明,等位基因数(A)为2~10个,平均等位基因数为4.3,有效等位基因数(Ne)为1.6~6.1,平均有效等位基因数为2.7,各位点的杂合度观测值(Ho)为0.0000~0.5625,杂合度期望值(He)为0.3823~0.8416。各群体之间无偏倚杂合度期望值由小到大依次为丹麦群体、英国群体、法国群体、挪威群体,运用SPSS软件对无偏倚杂合度期望值进行Kruskal-Wallis检验,其结果(H=4.438,df=3,P=0.218)表明,4个群体的遗传多样性差异不显著。群体间...
关键词：
大菱鲆 地理群体 微卫星 遗传多样性
[期刊] 林业科学
[作者]
苏晓华 张绮纹 郑先武 张香华 归复
本文利用ＲＡＰＤ分子标记技术从ＤＮＡ分子水平上探测了大青场（ｐｌｐｕｌｕｓｕｓｓｕｒｉｅｎｓｉｓＫｏｍ．）天然群体的遗传结构和分化程度。结果得出：用１４个随机寡核苷酸引物共产生１８０个扩增片段，扩增片断在２１１ｂｐ至１６３６ｂｐ之间。Ｓｈａｎｎｏｎ表型多样度（ＨＯ）估测值在群体间变动范围为０．２７１至０．３９２，平均为０．３１０。对分子水平变异分为群体间和群体内两部分进行分析，群体间分量占总变异的６２．３％，群体内只占３７．７％。不同引物在群体内探测能力也各不相同，ＣＨｌ－ｌ引物探测多样度（ＨＯ）最高（０．５４０），而２１１６引物最低（０．１５１）。
关键词：
大青杨,天然群体,RAPD,遗传结构
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
郭传友 黄坚钦 王正加 方炎明
利用随机扩增多态性DNA(RAPD)分子标记技术,分析了山核桃5个天然居群150个个体的遗传多样性和遗传结构,20条10 bp的随机引物共扩增出252个位点,其中,多态性位点168个,多态位点百分率(PPB)为66.7%。居群水平Shannon′s多态性信息指数(I)在0.199 2~0.280 0间变化,物种水平I为0.410 2;居群水平Ne′is基因多样性指数(H)介于0.129 7~0.205 1之间,物种水平H为0.267 1。遗传变异计算显示,山核桃居群间基因分化系数(Gst)为0.384 5。分子方差分析(AMOVA)表明,居群间基因分化系数为0.341 3,大部分变异存在于居群...
关键词：
山核桃 居群 遗传结构 RAPD
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
罗福广 苏翔驹 区小玲 李斌 潘英 郑惠芳 覃志彪
利用RAPD技术对管角螺(Hemifusus tuba Gmelin)4个自然群体(广西北海、广东湛江、浙江温州、江苏连云港)的遗传多样性进行了分析。所选择的19条有效引物在4个自然群体200个个体中总共产生182个扩增片段,片段数量为19 983个,片段大小在250～2 500 bp之间。其中每条引物可产生4～17条带,平均5.28个位点。4个自然群体共检测到149个多态位点,多态位点比例为81.87%,其中北海群体的多态位点比例最高,占66.48%,其次是湛江群体为47.25%,温州群体为44.51%,连云港群体为36.81%。4个群体中均未检测到各群体特有的扩增带。4个自然群体管角螺的N...
关键词：
管角螺 遗传多样性 遗传距离 RAPD
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
何燕林 肖克宇 唐湘北 刘晓燕 江辉 戴振炎
为进一步开发和利用圆尾斗鱼,并为保护圆尾斗鱼种质资源提供分子水平上的依据,以湘江、益阳和沅江三个地理种群圆尾斗鱼的基因组DNA为材料,进行遗传多样性的RAPD分析.试验从选用的60个随机引物中筛选出28个有效引物,对3个种群的圆尾斗鱼基因组DNA进行RAPD-PCR扩增,共扩增出1994个DNA片段.3个地理群体的多态位点比例为0.309～0.329,杂合度为0.194～0.213,群体内遗传相似性指数分别为0.892,0.837和0.868,其中益阳圆尾斗鱼与湘江圆尾斗鱼种群间的遗传距离最大,其值为0.219,益阳圆尾斗鱼与沅江圆尾斗鱼种群间的遗传距离最小,其值为0.151.分析表明,3个地...
关键词：
圆尾斗鱼 地理群体 遗传多样性 RAPD
[期刊] 水产学报
[作者]
姚韩韩 董迎辉 林志华 朱东丽
利用AFLP分子标记技术对泥蚶4个快速生长家系(J5♂×Z19♀、Z7♂×J26♀、S1♂×Z3♀、S6♂×Z22♀)的遗传结构及遗传差异进行了分析。用筛选出的9对引物组合在4个家系共124个个体中扩增出506个位点,多态位点比例72.53%。遗传结构分析表明,4个家系的多态位点比例为51.14%～60.75%。从Nei基因多样性指数和Shannon’s信息指数反映的遗传多样性来看,4个家系的遗传多样性由大到小依次为J5♂×Z19♀>S6♂×Z22♀>S1♂×Z3♀>Z7♂×J26♀。基因分化系数GST和AMOVA分子方差分析表明,遗传变异主要来源于家系内个体间。4家系间总遗传分化指数FST=...
关键词：
泥蚶 家系 遗传变异 扩增片段长度多态性
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
程长洪 张敏莹 徐东坡 刘凯 段金荣 周彦锋 施炜纲
采用10对暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)和16对红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)微卫星引物对4个暗纹东方鲀群体(1个长江常熟江段捕捞群体,1个江苏扬中放流群体和2个养殖群体)的遗传多样性进行分析。结果显示,20个微卫星位点能成功扩增出片段并且具有一定的多态性,在4个群体中共检测到113个等位基因。每个群体的平均等位基因数为4.95～5.50,平均观测杂合度为0.686 7～0.761 7,平均期望杂合度为0.653 0～0.700 0,平均多态信息含量为0.601 3～0.638 4。各个群体都有一些微卫星位点偏离Hardy-Wein-berg平衡(P<0.0...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
秦溱 王晓清 曾志南 朱丹丽 熊钢 巫旗生 宁岳
利用AFLP分子标记方法对4个群体(福建连江野生、连江养殖、长乐养殖、广西野生)的泥东风螺进行遗传多样性分析。结果:用11对引物共扩增出908条有效片段,其中684条(75.33%)为多态性片段,224条片段(24.67%)为4个群体所共有;遗传多样性指数分析显示,4个群体的有效等位基因数、平均等位基因数、Shannon’s多样性指数和平均杂合度依次为1.500 6、1.974 0、0.464 7、0.303 4,Nei’s遗传距离为0.128 4~0.180 6,遗传相似系数为0.834 8~0.879 5,表明4个泥东风螺群体具有较为丰富的遗传多样性,且群体间具有较高的遗传相似性;分子方差...
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