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[期刊] 渔业科学进展
[作者]
赵庆 吴彪 刘志鸿 孙秀俊 周丽青 杨爱国 张高伟
血红蛋白是红细胞的主要组成成分,在高等动物中分布广泛,具有运载氧气等多种重要功能。然而,软体动物血红蛋白的相关研究较少。魁蚶(Scapharca broughtonii)作为重要的大型经济蚶类,其血淋巴因含有红细胞而不同于其他多数双壳贝类。为明确魁蚶血红蛋白基因的结构特征、组织分布以及发生、免疫活性等特点,本研究以从魁蚶转录组数据库中获得的部分序列为基础,通过cDNA末端快速扩增(rapid amplication of cDNA ends,RACE)技术克隆获得了一种魁蚶血红蛋白基因cDNA全长序列(命
关键词：
魁蚶 血红蛋白 基因克隆 表达特征
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
刘天红 于晓清 刘广斌 王颖 吴莹莹 刘恩孚 邱兆星
为研究无机镉对不同规格魁蚶的毒性,采用急性毒性试验方法和定性定量研究Cd2+对不同规格魁蚶(Scapharca broughtonii)24、48、72、96 h的半致死浓度(LC50)和安全养殖浓度(SC50)。结果显示,Cd2+对小规格魁蚶24、48、72、96 h的LC50和SC50分别为131.11、41.40、3.57、3.37、1.24 mg/L;Cd2+对中规格魁蚶24、48、72、96 h的LC50和SC50分别为54.10、9.46、2.54、0.50、0.09 mg/L;Cd2+对大规格魁蚶24、48、72、96 h的LC50和SC50分别为157.36、38.13、8.9...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
刘天红 于晓清 刘广斌 王颖 吴莹莹 刘恩孚 邱兆星
为研究无机镉对不同规格魁蚶的毒性，采用急性毒性试验方法和定性定量研究Ｃｄ～（２＋）对不同规格魁蚶（ＳＣａｐｈａｒＣａ ｂｒｏｕｇｈｔｏｎｉｉ）２４、４８、７２、９６ ｈ的半致死浓度（ＬＣ＿（５０））和安全养殖浓度（ＳＣ＿（５０））。结果显示，Ｃｄ～（２＋）对小规格魁蚶２４、４８、７２、９６ ｈ的ＬＣ＿（５０）和ＳＣ＿（５０）分别为１３１．１１、４１．４０、３．５７、３．３７、１．２４ ｍｇ／Ｌ；Ｃｄ～（２＋）对中规格魁蚶２４、４８、７２、９６ ｈ的ＬＣ＿（５０）和ＳＣ＿（５０）分别为５４．１０、９．４６、２．５４、０．５０、０．０９ ｍｇ／Ｌ；Ｃｄ～（２＋）对大规格魁蚶２４、４８、７２、９６ ．．．
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
郭晓亮 毛玉泽 李阳 李加琦 陈琼琳 薛素燕 高振锟
2015年4月6日—10月26日,在桑沟湾海区现场研究了牡蛎壳粉缓释剂(Careshell)对魁蚶(Scapharca broughtonii)生长和存活的影响。按照缓释剂的重量比设置4个处理组,其中,魁蚶的初始体重均为160 g/组,缓释剂的重量分别为0(对照组C0)、80 g(C1组)、160 g(C2组)和320 g(C3组)。实验共进行200 d,每40 d测量各实验组魁蚶的生长参数(壳长、壳宽、壳高、湿重),计录死亡个体数,计算不同阶段(40 d间隔)魁蚶的特定生长率(SGR)及死亡率。结果显示
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
刘寒苗 吴彪 刘志鸿 杨爱国 周丽青 孙秀俊
采用PCR技术扩增了中国山东胶南、长岛、蓬莱、荣成和韩国统营5个地理群体魁蚶(Scapharca broughtonii)样本的COⅠ、12S rRNA、18S rRNA和28S rRNA基因部分序列,分析了魁蚶5个地理群体的遗传多样性和系统进化关系。经测序拼接、剪接后,分别获得67条776 bp的COⅠ序列、72条443 bp的12S rRNA序列、75条909 bp的18S rRNA序列和75条894 bp的28S rRNA序列。序列分析结果显示,5个群体75个个体的COⅠ序列中共检测到466个多态位
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
蔡忠强 郑言鑫 任利群 赵春暖 吴彪 王肖君 于涛 杨爱国 林建国
以魁蚶（Ｓｃａｐｈａｒｃａ ｂｒｏｕｇｈｔｏｎｉｉ）中国群体（ｃ）和韩国群体（Ｋ）为材料，进行了４个组合的杂交和自交实验，分析了各实验组的受精率、孵化率、幼虫和稚贝的生长、存活以及杂交子一代的杂种优势。结果显示，４个组的受精率和孵化率均较高（８０％以上）；自交组的受精率略高于杂交组，但孵化率无显著差异。在幼虫期，ＫＫ组和Ｋｃ组的壳长平均值大于ｃＫ组和ｃｃ组，但存活率和变态率无显著差异；在稚贝期，ＫＫ组和Ｋｃ组的壳长平均值也均大于ｃＫ组和ｃｃ组，但ｃｃ组和ｃＫ组的保苗率比Ｋｃ组和ＫＫ组高。综合分析比较表明，杂交Ｋｃ组的杂种优势率在幼虫期和稚贝期的壳长生长上均表现为正值，在稚贝期的存活率方面也表现．．．
关键词：
魁蚶 杂交 生长 存活 杂种优势
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
沈淑芳 朱玲 李加琦 薛素燕 李阳 陈琼琳 毛玉泽 庄志猛 方建光
通过cDNA末端快速扩增(Rapid amplification of c DNA ends,RACE)技术克隆得到魁蚶(Scapharca broughtonii)C型凝集素(C-type lectin,Sb-Lec1)基因,该基因全长为700 bp,其中,5′-UTR为29 bp,3′-UTR为167 bp,开放阅读框长度为504 bp,编码167个氨基酸,包括长度为23个氨基酸的信号肽序列、129个氨基酸的糖识别结构域(CRD)以及参与二硫键形成的6个半胱氨酸。预测蛋白分子量为19.11 k Da,
[期刊] 水产学报
[作者]
李佩芬 林志华 包永波
通过已构建的泥蚶转录组文库EST,利用SMART RACE技术扩增得到泥蚶Tg-TIMP-3基因全长c DNA序列,并对其进行生物信息学和组织表达相关分析。结果显示,泥蚶Tg-TIMP-3 c DNA全长为804 bp,其中开放阅读框为570 bp,编码189个氨基酸;氨基酸序列比对发现其氨基酸序列与其他动物的相似性并不高,与长牡蛎的相似性仅为35.8%,但TIMP基因的两个功能域(N端和C端)相对保守。qRT-PCR检测结果显示:Tg-TIMP-3 mRNA在鳃中表达最高,外套膜和肝胰腺次之,表达量最低的是血液。在不同浓度重金属镉(Cd)攻毒后,泥蚶鳃中的Tg-TIMP-3 mRNA表达量先...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
魏智薪 辛鲁生 白昌明 李亚楠 张淑敏 李成华 王崇明
Ets蛋白是宿主MAPK信号通路下游的一类可参与调控病毒基因转录复制的重要转录因子。本研究通过基因克隆成功获得魁蚶(Scapharca broughtonii) Ets家族9条基因(分别命名为ETS-1～ETS-9),开放阅读框(ORF)大小分别为1065、1290、1569、912、1344、1404、1521、1968和1191 bp,并分别编码354、429、522、303、447、468、506、655和396个氨基酸。系统进化树分类表明,本研究所获得的基因均属Ets家族。对ETS-1和ETS-3的氨基酸序列和三维结构分析表明,其均含有高度保守的ETS结构域。在不同水温条件下,通过人工注射牡蛎疱疹病毒(OsHV-1)对魁蚶进行感染,并对病毒拷贝数和Ets的相对表达量进行定量分析。结果显示,ETS-1和ETS-3只在高温阳性组中相对表达量显著上调,与病毒拷贝数在高温条件下增长趋势呈正相关;ETS-4和ETS-8只在低温阳性组中相对表达量显著上调,但在高温阳性组中ETS-4和ETS-8的相对表达量与病毒拷贝数呈负相关;初步研究结果显示,从魁蚶Ets基因中筛选出2条Ets基因(ETS-1和ETS-3),在高温条件下(16±2)℃,其可能参与正向调控病毒Os HV-1的复制过程。本研究为进一步探索魁蚶在夏季因感染牡蛎疱疹病毒(OsHV-1)而导致的大量死亡提供了科学数据。
[期刊] 水产学报
[作者]
黄永欢 刘志鸿 吴彪 周丽青 孙秀俊 杨爱国 李东明
采用ＲＴ－ＰＣＲ和Ｃ ＤＮＡ末端快速扩增技术（ＲＡＰｉＤ ＡｍＰｌｉｆｉＣＡＴｉｏＮ ｏｆ Ｃ ＤＮＡ ｅＮＤｓ，ＲＡＣｅ）克隆出魁蚶过氧化氢酶（ｓｂ ＣＡＴ）基因Ｃ ＤＮＡ全长序列，该基因全长为２１８１ ｂＰ，包括１４３１ ｂＰ的开放阅读框（ｏＰｅＮ ＲｅＡＤｉＮｇ ｆＲＡｍｅ，ｏＲｆ），９６ ｂＰ的５＇端非翻译区（ＵＴＲ）和６５４ ｂＰ的３＇－ＵＴＲ。其中ｏＲｆ编码４７７个氨基酸，预测分子量为５４ ｋＵ，理论等电点为８．０３。ｓｂ ＣＡＴ氨基酸序列与其他所选动物的氨基酸序列具有较高的相似性，其相似度为６８％～９６％，ｓｂ ＣＡＴ氨基酸具有ＣＡＴ基因家族的特征性序列，包括ＣＡＴ活性位点，１个．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
姚韩韩 董迎辉 姚彬彬 包永波 林志华
为探索贝类乙二醛酶Ⅰ基因的结构及功能特征,实验利用RACE技术首次克隆获得泥蚶乙二醛Ⅰ基因(Tg-GLOI)的cDNA全长序列,并对其氨基酸序列特征及时空表达特征进行了研究。结果发现,Tg-GLOI基因的cDNA全长序列为1 807 bp,开放阅读框为540 bp,编码180个氨基酸,在27~169 aa处具有典型的乙二醛酶系保守序列;成熟的乙二醛酶Ⅰ由2个相同的亚基组成,每个亚基由乙二醛Ⅰ基因编码,其二级结构由18个α-螺旋、20个β-折叠片和36个转角组成,每个亚基各含1个Zn2+;氨基酸序列比对发现,Tg-GLOI氨基酸序列与太平洋牡蛎的同源性达到86.1%,与其他脊椎动物的同源性也都在...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
张高伟 吴彪 刘志鸿 周丽青 孙秀俊 赵庆 杨爱国
低氧诱导因子(hypoxia-induciblefactor,HIF)是低氧信号传导途径中的关键因子,在动物低氧应答反应中发挥重要作用。为探讨魁蚶(Scapharca broughtonii) HIF-1α基因结构特征及在低氧胁迫下的应答规律,本研究以魁蚶转录组数据库中的部分序列为基础,通过cDNA末端快速扩增(rapid amplication of cDNA ends, RACE)技术克隆获得了魁蚶HIF-1α基因cDNA全长序列(命名为SbHIF-1α),并检测了其mRNA的组织分布和低氧胁迫下的表达规律。序列和结构分析显示, SbHIF-1α基因cDNA全长为2741 bp,其中包括2136 bp的ORF,编码711个氨基酸,含有HIF保守的HLH、PAS-A、PAS-B和PAC结构域,预测蛋白分子量为80.8kDa,理论等电点为5.57;SbHIF-1α与所选其他物种HIF-1α的序列相似度为56%～95%;系统进化分析显示SbHIF-1α与软体动物的遗传距离最近。qRT-PCR结果显示,在魁蚶的血淋巴、鳃、外套膜、斧足、闭壳肌和肝胰腺6个组织内均能检测到SbHIF-1α基因,在血淋巴中表达量最高,鳃次之,与其他4个组织都存在显著差异(P
[期刊] 淡水渔业
[作者]
王文静 吴彪 刘志鸿 孙秀俊 周丽青 徐万栋
为探究性类固醇激素合成相关基因17β-羟类固醇脱氢酶14(17β-hydroxysteroid dehydrogenase 14,17β-HSD14)在魁蚶(Scapharca broughtonii)性腺发育过程中的作用，本研究从魁蚶转录组中筛选并验证了17β-HSD14基因序列，通过原位杂交和实时荧光定量PCR检测了该基因在魁蚶中的组织定位及性腺发育过程中表达变化规律。结果显示：17β-HSD14基因的编码区序列长度为822 bp,编码273个氨基酸；原位杂交实验在魁蚶卵巢的成熟卵细胞、滤泡壁和精巢中的精原细胞、精子以及其他组织的细胞中都检测到了17β-HSD14基因的阳性杂交信号；qRT-PCR结果表明，17β-HSD14基因的表达随其性腺发育而产生变化，在形成期(Ⅰ期)到增殖期(Ⅱ期)的过程中呈上升趋势，成熟期(Ⅲ期)至耗尽期(Ⅴ期)呈下降趋势，且在卵巢组织中的表达量显著高于精巢组织。综上，17β-HSD14基因与魁蚶的性腺发育密切相关，可能对其性腺发育、功能维持和成熟具有重要的作用。
[期刊] 水产学报
[作者]
钱雪骏 董迎辉 姚韩韩 林志华
为了研究Ｓｍａｄ１／５基因在泥蚶生长、发育过程中的调控作用，本研究利用ＳｍａＲＴ ＲａＣＥ方法克隆得到泥蚶Ｓｍａｄ１／５基因（Ｔｇ－Ｓｍａｄ１／５）的Ｃ ｄＮａ全长序列，该序列全长２ ４２４ｂｐ，开放阅读框１ ３８６ ｂｐ，编码４６２个氨基酸。Ｔｇ－Ｓｍａｄ１／５蛋白与合浦珠母贝Ｓｍａｄ５、太平洋牡蛎Ｓｍａｄ５和大西洋舟螺Ｓｍａｄ１的同源性分别达到了９２．３％、９１．２％和８０．４％，与脊椎动物的同源性都在７０％以上；该蛋白包含ｍＨ１和ｍＨ２区２个较为保守的结构域，此结构与高等动物Ｓｍａｄ１和Ｓｍａｄ５蛋白极为相似，表明该基因在物种进化过程中比较保守。利用ｑＲＴｐＣＲ技术，研究了Ｓｍａｄ１／５．．．
关键词：
泥蚶 Smad1/5 基因克隆 时空表达
[期刊] 水产学报
[作者]
钱雪骏 董迎辉 姚韩韩 林志华
为了研究Smad1/5基因在泥蚶生长、发育过程中的调控作用,本研究利用SMART RACE方法克隆得到泥蚶Smad1/5基因(Tg-Smad1/5)的c DNA全长序列,该序列全长2 424bp,开放阅读框1 386 bp,编码462个氨基酸。Tg-Smad1/5蛋白与合浦珠母贝Smad5、太平洋牡蛎Smad5和大西洋舟螺Smad1的同源性分别达到了92.3%、91.2%和80.4%,与脊椎动物的同源性都在70%以上;该蛋白包含MH1和MH2区2个较为保守的结构域,此结构与高等动物Smad1和Smad5蛋白极为相似,表明该基因在物种进化过程中比较保守。利用qRTPCR技术,研究了Smad1/5...
关键词：
泥蚶 Smad1/5 基因克隆 时空表达
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