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[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 程云清  刘剑锋  刘强  王占武  王淑范  
利用PE-1730傅里叶变换红外光谱仪对8种来源的高山红景天块根粉末进行分析,以红外指纹图谱的共有峰率、变异峰率为计算指标,分析样品相对原生境野生植株样品的共有峰率和变异峰率,建立共有峰率和变异峰率双指标序列分析方法。结果表明:产地相近的H1与H4之间具有较高的共有峰率(88.89%)和较低的变异峰率(12.50%);种质来源地不同、倍性相同的H5与H3通过相同的生境栽培,共有峰率仅为22.22%;种质来源地相同、倍性不同的H5与H6共有峰率达到71.43%;不同种源、不同倍性、相同生境的H6与H8红外图谱的相似度为57.14%。
[期刊] 西南农业学报  [作者] 杨新周  
【目的】对2个以上中草药样品进行定性评价,以阐明不同产区间的相似程度,为中药材真伪鉴定和品质评价奠定基础。【方法】利用共有峰率和变异峰率2个指标,以不同臭灵丹样品的红外指纹图谱为标准,计算出所测样品相对于标准品的共有峰率和变异峰率。按照共有峰率的大小,建立了不同的共有峰率和变异峰率双指标序列方法。【结果】文中指纹图谱显示,臭灵丹不同产区样品间最大共有峰率为93.33%,最小共有峰率为38.89%,变异峰率最大为114.29%,最小为0.00%。【结论】红外指纹图谱中的共有峰率和变异峰率在一定程度上能反映出
[期刊] 西南农业学报  [作者] 杨新周  董毅  党菱婧  田孟华  田先娇  马艳粉  
【目的】建立云南不同产区白花蛇舌草的紫外指纹图谱,阐明不同产区间白花蛇舌草的相似程度和差异,为白花蛇舌草的真伪鉴定和品质鉴定评价奠定基础。【方法】采用紫外分光光度法测定云南23个不同产区白花蛇舌草紫外图谱,考察白花蛇舌草乙酸乙酯、甲醇、水三种极性溶剂的提取物各波段的稳定性及重现性,对紫外图谱进行平均值、平滑和二次微分处理,计算白花蛇舌草不同提取物的共有峰率和变异峰率。【结果】建立的白花蛇舌草指纹图谱:最佳称样量为0.5000 g,乙酸乙酯、甲醇和水3种溶剂最佳提取时间分别为30、40、30 min,3种溶剂提取液在48 h内稳定。白花蛇舌草紫外指纹图谱显示,不同产区样品间最大共有峰率为92.3%,最小共有峰率为22.2%。【结论】利用紫外光谱结合共有峰率和变异峰率双指标序列分析法能阐明不同产区间白花蛇舌草的的相似程度,为白花蛇舌草药材真伪鉴定和品质评价奠定基础。
[期刊] 水产学报  [作者] 王燕  王斌  徐焕志  郑斌  杨会成  徐银峰  
利用傅里叶变换红外光谱仪采集6个不同地区的24个淡菜样品的醇提物红外光谱,原始光谱经过多点基线校正、聚类分析,采用平均值法建立淡菜的红外指纹图谱共有模式。相似度分析表明,各样品红外光谱与所建立的指纹图谱共有模式比较相似度良好,所选用建立共有模式的21批样品相似度均大于0.9,符合指纹图谱要求;而聚类分析中剔除的3个样品(S7、S10和S21)相似度均低于0.9,不符合指纹图谱研究要求,相似度分析和聚类分析结果相吻合。主成分分析建模结果表明,前两个主成分能代表原始数据96%的信息,相同产地的样品在主成分散点图上聚集为同一的类群,基本实现不同产地淡菜的鉴别。载荷因子分析结果表明,不同产地淡菜醇提物...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)  [作者] 林文津  魏道智  
利用傅里叶变换红外光谱法(FTIR)对不同部位、不同产地的马蓝药材进行红外指纹图谱鉴别研究,找出根、茎、叶的指纹特征及其差异.结果表明:根、茎在1260 cm-1处存在共吸收峰,而叶在此处不存在吸收峰(或者不明显);经一阶、二阶导数光谱,傅里叶去卷积分析后发现有更多的差异峰.不同产地马蓝茎、叶的指纹图谱很相似,但茎与叶平均图谱的相似度有较大差异,10批产地马蓝茎的红外光图谱与茎平均图谱的相似度为94.29-98.72,与叶平均图谱的相似度为85.74-90.90;10批产地马蓝叶的红外光图谱与叶平均图谱的相似度为93.30-97.46,与茎平均图谱的相似度为82.16-89.03.FTIR法具...
[期刊] 林业科学  [作者] 刘剑锋  阎秀峰  程云清  李霞  
高山红景天叶片在附加6-BA2mg·L-1和NAA0.5mg·L-1的改良MS培养基中诱导出愈伤组织,将愈伤组织放入10%DMSO+0.5mol·L-1山梨醇的冰冻保护剂中,4℃冰箱中放置8h,然后以1℃.min-1的降温速度降至-40℃,停留2h后投入液氮保存,在40℃水浴中化冻。冻存后的愈伤组织用液体培养基MS+6-BA2mg·L-1+NAA0.5mg·L-1反复冲洗后,转入固体培养基中进行暗培养,2周后转入光照(2000lx)培养。5周后观察到高山红景天愈伤组织呈鲜绿色,长势较为旺盛,愈伤组织存活率达到75.64%。冻存后的愈伤组织可诱导成苗。
[期刊] 林业科学  [作者] 毛秀红  郑勇奇  孙百友  张元帅  韩丛聪  位晓  荀守华  
【目的】对山东省刺槐无性系进行遗传多样性分析和指纹图谱构建,为刺槐新品种选育、遗传改良和品种鉴定提供可靠的依据,为中国其他省市刺槐遗传资源保存、评价与利用提供参考。【方法】采用荧光SSR引物进行PCR扩增,产物经毛细管电泳仪进行检测;利用所得结果分析49个无性系遗传多样性并构建其指纹图谱;采用非加权组平均法(UPGMA)进行基于亲缘关系的无性系聚类分析。【结果】8对SSR引物共检测到51个等位基因,每个位点的等位基因为215个,平均每对引物扩增出6.375个多态性等位基因。不同位点的PIC值变化范围很大,
[期刊] 北京林业大学学报  [作者] 刘剑锋  阎秀峰  程云清  周晓梅  
采用玻璃化法对高山红景天的愈伤组织进行了超低温保存研究.高山红景天愈伤组织在8%蔗糖中暗培养5 d后,先用25℃的60%玻璃化保护剂PVS2预处理20 min,转至100%PVS2于-20℃乙醇浴中处理2 h后,投入液氮进行保存,48 h后使用40℃水浴快速化冻.冻存后的愈伤组织用液体培养基MS+6-BA 2 mg/L+NAA 0.5 mg/L+40%蔗糖洗涤3次,再转入MS+6-BA 2mg/L+NAA 0.5 mg/L固体培养基中在22℃条件下进行暗培养,2周后转入光照培养(光照强度800 lx).6周后观察到高山红景天愈伤组织呈鲜绿色,长势较为旺盛,存活率可达到78.24%.冻存后的愈伤...
[期刊] 图书情报工作  [作者] 陈几香  李秋惠  关晓明  
为了解中药指纹图谱的发展规律与未来研究趋势,基于CNKI的"中国期刊全文数据库"中关于"中药"和"指纹图谱"的研究论文(截至2013年),从论文的年代、期刊分布、作者、研究机构以及关键词等方面进行计量学分析。发现:1987年开始有中药指纹图谱方面的论文刊载,从2000年开始,数量呈快速增长趋势;高效液相色谱是中药指纹图谱方面的研究热点,中药注射剂指纹图谱研究还是薄弱环节。
[期刊] 林业科学研究  [作者] 何旭东  郑纪伟  田雪瑶  教忠意  窦全琴  
[目的 ]基于荧光SSR标记结合高通量毛细管电泳技术,建立一种快速、高效、稳定、准确的薄壳山核桃基因分型体系,用以分析各品种间亲缘关系并构建指纹图谱,旨在为薄壳山核桃品种鉴定与新品种保护提供理论依据,也为薄壳山核桃种质资源评价、品种选育与推广提供有益参考。[方法 ]选取薄壳山核桃及其近缘种54对SSR引物进行初筛,最终确定10对标记合成荧光引物用于后续分析。基于毛细管电泳技术对25个薄壳山核桃品种进行基因分型,利用软件统计位点数据并计算各个位点的等位基因数(A)和多态信息含量(PIC)。利用SSR标记间的相互组合构建薄壳山核桃不同品种的指纹图谱。通过等位片段的转化对薄壳山核桃品种进行聚类,并分析其亲缘关系。[结果 ]10对荧光SSR标记共扩增出68条等位片段,平均为6.8个;位点Cc19最多,有12个等位基因,位点BFU-Jr19最少,有3个等位基因。多态信息含量(PIC)变化范围为0.291 0~0.843 5(平均为0.588 3)。优选的4对核心引物Cc19、PM-GA31、PM-CIN4和PM-GA41组合能完全区分25个薄壳山核桃品种。25个品种遗传相似系数在0.62~0.99之间,并聚类成2个大的类群,部分亲缘关系较近的品种聚类在一起,部分品种聚类不能与遗传背景完全对应。[结论 ]与传统的显性标记及聚丙烯酰胺凝胶电泳分型技术相比,荧光SSR标记结合毛细管电泳技术构建薄壳山核桃品种指纹图谱切实可行,通量大且速度快,结果稳定可靠,通过标记组合可有效的对不同品种进行区分。在品种亲缘关系分析中,建议增加杂交亲本数量,并在全基因组范围内选取一定数量效率更高的标记,以便最大程度地揭示薄壳山核桃品种间亲缘关系的真实水平。
[期刊] 华北农学报  [作者] 姜伟  李雪源  何觉民  陆建农  
利用ISSR对8个新疆品种(系)进行指纹图谱构建。通过基因组多态性分析,从60条引物中筛选到11条扩增效果好的引物,用其中2条引物UBC809,UBC841建立8个品种的指纹图谱,统计品种鉴定的置信概率达到1/8388608。结果显示,ISSR分子标记技术对棉花品种的指纹图谱构建具有高效性和准确性。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 毕宁宁   侯立娜   王天琪   阮坤非   张静菊   刘忠华  
[目的]分析玫瑰及其近缘种之间的遗传多样性并构建指纹图谱,为玫瑰种质资源鉴定与开发利用奠定基础。[方法]在玫瑰的传统品种、杂交繁育品种和国内外引进品种中各选择1种,取其鲜嫩叶片进行转录组测序;基于测序得到的玫瑰转录组数据,使用MISA在reads覆盖的基因组数据中查找玫瑰的SSR位点,并根据SSR位点两端的保守序列使用Primer 3.0设计引物。选取10种玫瑰的DNA作为试验材料,筛选设计、合成后的引物。以48份玫瑰及其近缘种的DNA作为试验材料,利用筛选出的峰值较好的引物进行TP-M13-SSR PCR,并对其扩增产物进行毛细管电泳检测,应用GeneMarker 2.2.0 (SoftGenetics,USA)读取毛细管电泳数据并用Excel进行整理;使用POPGEN VERSION 1.32计算筛选引物的观测杂合度、期望杂合度、Nei's遗传多样性指数、观测等位基因数、有效等位基因数、Shannon信息指数,并用CERVUS version 3.0计算多态性信息含量。利用Powermarker计算玫瑰及其近缘种各种质之间的遗传距离;采用NTSYSpc 2.10e计算每2个种质之间的遗传相似性系数,并绘制UPGMA聚类树状图。最后采用引物与基因型组合的方式构建玫瑰及其近缘种的指纹图谱。[结果]基于玫瑰样品转录组测序数据,使用MISA共检测出48796个SSR位点,分布于139712条Unigene中,碱基重复类型数量最多的为二核苷酸重复和三核苷酸重复,分别为20628和12828个。使用Primer 3.0以SSR位点两端的保守序列为依据初步设计并合成了144对引物;以10个玫瑰品种的DNA作为模板筛选引物,共筛选出峰值较好的28对引物。以48份玫瑰及其近缘种的DNA为试验材料,28对引物在48份试验材料中均能扩增出峰型良好、多态性高的DNA片段;28对引物的观测杂合度、期望杂合度、Nei's遗传多样性指数、观测等位基因数、有效等位基因数、Shannon信息指数和多态性信息含量的平均值分别为0.4101,0.7505,0.7011,5个,3.5116个,1.3442和0.6526。大多数供试样品间的遗传距离为0.6000~0.8000;聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.571时,48份玫瑰及其近缘种被分为两类。运用核心引物法筛选出的4对核心引物可将48份试验材料全部区分开,并构建了其指纹图谱。[结论]开发并筛选出28对多态性较好的SSR引物,可用于后续玫瑰的遗传多样性分析、遗传图谱构建、遗传稳定性鉴定等方面。
[期刊] 西南农业学报  [作者] 孙佩  赵春艳  童文  周海玉  杨晓  叶霄  胡尚钦  张超  
关键词:
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 樊蓉  樊军锋  李周岐  
【目的】对外观相近、较难区分的4个白杨新品种及其父母本和3个近缘种进行遗传分析并构建指纹图谱,为这些品种在生产应用中的分子鉴定提供技术依据。【方法】采用SRAP分子标记技术,对03-4-9、03-4-22、03-5-17和03-6-11 4个白杨新品种及I-101杨、截叶毛白杨、84K、毛白杨30号、银毛杨共9个白杨品种开展遗传分析及指纹图谱构建。【结果】14对多态性高的SRAP引物对9个白杨品种共扩增出167条条带,平均每对引物扩增条带为11.93条。其中多态性条带143条,多态性比率为85.63%,多态性高。聚类分析表明,9个白杨品种之间的遗传相似系数为0.40~0.76,其中4个白杨新品...
[期刊] 华北农学报  [作者] 王笑一  于拴仓  张凤兰  余阳俊  赵岫云  张德双  
为研制我国小白菜品种的DUS测试标准,搜集和筛选了形态差异大、不同生态类型的地方品种和目前生产上栽培面积大的杂交一代品种80份,在植物学性状调查的基础上,利用SSR标记对80份小白菜品种进行了遗传特异性分析,构建了SSR指纹图谱。从131对SSR引物中筛选了20对多态引物组合,对80个品种进行了分析,共检测出56个多态性条带,多态性比率73.68%,平均每对引物组合产生2.8个多态性条带。用5对引物Na12E02、Na12A08、Ni4D09、BRMS-269和BRMS-296的组合获得了每个品种的SSR特征带,可以将80个品种区分开来,从而建立80份小白菜品种的SSR指纹图谱。基于SSR标记...
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