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[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
冯陈晨 王文龙 红梅 刘宁 呼和巴特尔
为探明骆驼斯氏副柔线虫雌虫和雄虫的转录组差异,挖掘出与性别决定相关的功能基因,采用Illumina HiSeqTM2000分别对其雌虫和雄虫样本进行转录组测序,构建cDNA文库,通过建库质量评估和组装效率评估后对其进行功能注释及相关生物信息学分析。结果显示,比较雌虫和雄虫的转录本,获得6 430个差异表达基因,其中2 131个基因上调;4 299个基因下调。对差异表达基因进行GO功能分类,有341 328和714个Unigenes分别注释到生物学过程、细胞组成和分子功能三大类41个分支中。KEGG数据库分
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
赵学亮 王姝懿 呼和巴特尔 冯陈晨 孙柯 王文龙
为探讨斯氏副柔线虫免疫相关SHR基因作为疫苗候选抗原及早期诊断抗原的可能性,提取斯氏副柔线虫的总RNA,用RT-PCR技术扩增SHR基因,并将PCR产物克隆到pMD19-T载体,构建原核表达载体pET-30a(+)-SHR,利用在线软件对该基因编码蛋白序列进行生物信息学分析。结果表明:克隆获得SHR基因全长1 083 bp,编码360个氨基酸,理论等电点为6.09,无信号肽和跨膜区;磷酸化预测含有29个磷酸化位点;结构分析发现,α-螺旋构成二级结构的主要成分,亲水性氨基酸比例超过60%;抗原表位预测表明,SHR蛋白是一种抗原性较高的亲水性蛋白。推测SHR有望用作斯氏副柔线虫的免疫诊断抗原和疫苗候选抗原。
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
于志超 罗晓平 张伟 李军燕 王瑞 杨莲茹 杨晓野
为更有效地对骆驼盘尾丝虫病进行防治,利用流行病学调查和常规病理学观察的方法,对骆驼盘尾丝虫病进行研究。结果表明:内蒙古阿拉善左旗骆驼盘尾丝虫病平均感染率为85.4%,感染强度为115峰-1,虫体形成的结节分布在骆驼的颈项韧带处;共收集到209个结节,它们的形态和质地各不相同,软的结节内形成纤维组织囊腔,硬的结节内形成钙化灶;骆驼年龄段不同,结节的分布呈不同变化;病理组织学观察显示,囊腔周围有各种炎性细胞侵润,囊腔内有不同状态的雌虫虫体,骆驼盘尾丝虫病表现为骆驼的寄生虫性肉芽肿。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
刘伟 杨宝君
松材线虫和拟松材线虫雄虫交合伞形状的比较刘伟，杨宝君关键词松材线虫，拟松材线虫，雄虫交合伞松材线虫病是松树的一种毁灭性病害。病原松材线虫ＢｕｒｓａｐｈｅｌｅｎｃｈｕｓｘｙｌｏｐｈｉｌｕｓＮｉｃｋｌｅ（简作Ｂｘ）的形态与非病原拟松材线虫Ｂ．ｍｕｃｒｏｎ...
关键词：
松材线虫,拟松材线虫,雄虫交合伞
[期刊] 林业科学研究
[作者]
于淑惠 亓倩 孙涛 王雪庆 杨璞 冯颖
［目的］蛹期对于白蜡虫雄虫发育和交配具有重要意义，但目前缺乏对于白蜡虫真蛹基因转录情况的分析，本研究旨在获得白蜡虫真蛹转录组数据，了解其转录组特征。［方法］采用ＩｌｌｕｍＩｎａ ＨＩ Ｓｅｑ ２０００进行高通量测序，并进行生物信息学分析；采用荧光定量ＰＣＲ（ｑＲＴ－ＰＣＲ）检测３个热激蛋白基因（ＨＳＰ）在不同虫态中的表达动态。［结果］共获得６３ ９５７条ｕｎＩｇｅｎｅ、６３ ２７２个开放阅读框（ＯＲＦ）、９ ５６１个ＳＳＲ分子标记，ｕｎＩｇｅｎｅ平均长度６７４ ｂＰ，共有１４ ３２７条ｕｎＩｇｅｎｅ获得了注释，ｇｅｎｅ ＯｎＴＯｌＯｇｙ（ｇＯ）注释和ＫｙＯＴＯ ｅｎＣｙＣｌＯＰｅｄＩａ ＯＦ ．．．
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
李午佼 颜瑾 王运生
通过SignalP 3.0、TargetP 1.1、KohGPI、TMHMM 2.0等系列软件对南方和北方根结线虫分泌蛋白组进行预测。结果表明,南方和北方根结线虫预测分泌蛋白数为2 622和1 696个,分别占总基因数的13.65%和12.95%。经BlastP(E
关键词：
根结线虫 分泌蛋白 模体
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
俞虹 付达英 徐进 叶辉 李永和
为明确楚雄腮扁叶蜂雌虫头部交配响应相关基因表达情况，取交配后1、6和24 h（交配后24 h开始产卵）以及未交配的雌虫头部进行转录组分析，通过基因功能注释和富集分析明确头部交配响应基因表达情况，并预测可能涉及的生物学过程。结果表明，与未交配组相比，交配组在交配后1、6和24 h分别有621（448个上调、173个下调）、918（389个上调、529个下调）和172个（124个上调、48个下调）差异表达基因（DEGs）。交配后1 h上调DEGs共富集到115条GO（基因本体分析）术语/ KEGG（代谢斜径分析）通路，多涉及物质和能量代谢，如氨基酸和脂类的合成与分解等；交配后6和24 h上调DEGs共富集到35条GO术语/KEGG通路，所涉及范围较广，包括环境信号、细胞凋亡、生长发育及消化系统等。交配后1、6和24 h下调DEGs共富集到89条GO术语/KEGG通路，所涉及的范围更广，如疾病、循环系统、寿命、免疫和环境信号等。此外还找到31个神经肽/神经肽受体编码基因[包括1个DH-PBAN（与滞育和性信息素合成有关）同源序列]、78个OBPs（气味接合蛋白）以及1个SPR（性肽受体），但其中除了2个OBPs相关基因在交配后6 h显著下调表达外，其余基因的表达并未受到交配的影响。采用荧光定量PCR方法对15个DEGs的表达进行验证，结果与RNAseq分析的结果相一致。由此可见，交配引起了楚雄腮扁叶蜂雌虫头部基因表达的快速响应。
[期刊] 中国林业科学研究院
[作者]
王瑞珍
由松材线虫(Pine Wood Nematode,PWN)引起的松树枯萎病在亚洲造成毁灭性的生态危害和经济损失。食线虫真菌能够捕杀线虫,是自然生态系统中重要的生态组成部分。伊氏杀线真菌(Esteya vermicola,Ev)是1995年发现的内寄生PWN的食线虫真菌,Ev能够在短时间内侵染并杀死PWN,其对PWN的高感染性和致死性使得Ev成为高潜力的生防菌株,但其进化历史和寄生适应机制尚不清楚,对食线虫真菌生活方式的分子基础知之甚少,不同食线虫真菌间的相似性和差异也是未知的。本研究中首次发现生防菌株Ev
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
李金梅 木魁 姜双林 李登坤 李文雍 马同富 李永民
【目的】研究骆驼蓬总碱对草地贪夜蛾幼虫的杀虫作用机理,为此类生物碱作为新型植物杀虫剂的开发应用提供理论依据。【方法】从骆驼蓬成熟种子中提取骆驼蓬总碱,采用MTT法测定0,1,5,10和20μg/mL骆驼蓬总碱对草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)卵巢细胞系(Sf9)的毒性;测定5μg/mL骆驼蓬总碱在处理10,30,50,70和90min时对Sf9细胞Na+和K+吸收的影响,并测定5μg/mL骆驼蓬总碱在处理1,2,3,4,5d后对葡萄糖吸收的影响;最后采用叶碟法(叶碟在20μg/mL
[期刊] 林业科学
[作者]
王璇 理永霞 张星耀
【目的】研究松材线虫不同环境条件下繁殖策略,为该病种群扩张繁殖生物学的深入研究和防控策略的制定提供理论基础。【方法】通过显微观察检测在营养和蒎烯胁迫条件下松材线虫雌雄比变化规律。【结果】在营养富足条件下,松材线虫雌虫比例增加,反之松材线虫雄虫比例增高;低浓度α-蒎烯和β-蒎烯胁迫条件下,松材线虫雌雄比降低,而高浓度α-蒎烯处理后,松材线虫雌雄比升高,雌性后代比例增大;在低浓度α-蒎烯和低浓度β-蒎烯混合处理条件下,松材线虫雌雄比最低,且一直稳定在较低水平。【结论】松材线虫在适宜环境条件下有利于雌性后代的发
[期刊] 中国农业科学
[作者]
邹勇 钟晓武 张利平 赵萍 夏庆友
【目的】深入了解家蚕幼虫期与蛹期马氏管蛋白质组的变化,为马氏管在不同发育时期的功能研究提供蛋白质水平上的依据。【方法】利用蛋白质双向电泳技术对家蚕5龄第5天及化蛹第1天的马氏管组织进行比较,并采用基质辅助激光解析飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对表达量差异较大的蛋白点进行肽指纹图谱鉴定,应用GPMAW 8.00软件对NCBI蛋白质数据库中所有来自于P50/Dazao的蛋白质与家蚕9倍基因组预测蛋白质库共同构建本地数据库,对试验采集到的肽指纹图谱进行分析。【结果】共检测到360—430个蛋白点,主要分布在分子质量15—80 kD、等电点4.0—9.5。2个时期共成功鉴定17个表达量有显著...
[期刊] 林业科学研究
[作者]
赵文霞 杨宝君
Terminal mucro of adult female was the distinct character between Bursaphelenchus xylophilus (Bx) and its allied species Bursaphelenchus mucronatus(Bb). In general, Bx had no mucro. But it could have mucro in some situations. In the test, Bx without mucro was inoculated on Chineses pine (Pinus tabul...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李月 王云龙 欧阳珑玲
浮游虫黄藻可与共生虫黄藻一起维持珊瑚群落的健康。前期研究表明1株营浮游生活的虫黄藻(Symbiodinium sp.ECSFRI081109)在不同磷酸盐浓度培养下的生长速率和碱性磷酸酶活性有所差异。为了解其对不同磷酸盐浓度的响应机制,本研究利用RNA-Seq技术对高磷酸盐初始浓度(35μmol/L)和低磷酸盐初始浓度(0.15μmol/L)下不同培养时间(第0天、第5天和第10天)的虫黄藻进行转录组测序并做比较分析。结果显示:测序组装后获得80955个Unigenes,其中在NR、GO、KEGG、eggNOG、SwissProt以及Pfam数据库中共同注释的有4407个。对5个实验组的转录组数据进行比较分析,得到23个与磷利用相关的差异表达基因,主要有磷脂酶A2、磷脂酶B、磷脂酶C、磷脂酶D、碱性磷酸酶、酸性磷酸酶、无机磷酸盐转运体、Na~+依赖型磷酸盐转运体、线粒体磷酸盐转运蛋白基因。根据不同磷酸盐初始浓度培养下上述基因的表达量变化,推测在低磷环境下,虫黄藻可通过增强对无机磷酸盐的转运能力及利用磷酸酶分解有机磷以缓解磷胁迫,从而维持细胞生长。本研究旨为深入了解浮游虫黄藻响应不同磷酸盐浓度的分子调控机制提供基础数据。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
张路平 孔繁瑶 杨宝君
对松材线虫 7个株系和拟松材线虫 2个株系的线粒体DNA随机扩增多态性分析结果显示 ,松材线虫和拟松材线虫种间和种内都表现出很大的变异性 ,但种间变异明显大于种内变异 ,因而支持将松材线虫和拟松材线虫划分为两个不同的种。两个拟松材线虫株系 (法国株系和日本株系 )之间的相似值和松材线虫各株系间的相似值极为接近 ,由此看来 ,这两个株系的变异为种内变异 ,应同属于一个种。聚类分析的结果表明 ,松材线虫和拟松材线虫系两个明显不同的类群 ,即松材线虫类群和拟松材线虫类群。松材线虫类群又分为两个亚组 ,一个是以日本株系为代表 ,另一个是以北美洲 (美国和加拿大 )株系为代表
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