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[期刊] 林业科学  [作者] 魏令波  唐谦  郑先武  顾万春  李小兵  
马尾松随机扩增多态性DNA标记的分离研究魏令波,唐谦,郑先武,顾万春(中国林业科学研究院林业研究所北京100091)李小兵(中国科学院遗传研究所植物生物技术开放实验室北京100012)关键词马尾松,RAPD,Mendelian分离随机扩增多态性DNA...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 杜晓华  王得元  巩振辉  
为了避开基于限制性酶切位点分子标记技术的DNA酶切环节,简化其复杂的程序,试验以辣椒为材料,建立了一种新型DNA标记技术——限制性位点扩增多态性(RSAP),并对其反应体系进行了优化,对RSAP适用性、重复性进行了检验。结果显示,RSAP技术的引物为2条长度均为18 bp的引物,引物的3′端为4~6个碱基的限制性酶切位点序列,接着是12~14个碱基的随机序列,2条引物的限制性位点和随机序列不同;PCR扩增的前5个循环采用35℃的退火温度,随后的35个循环采用48℃的退火温度;在25μL反应体系中,模板DNA用量为20 ng,M g2+浓度为2.5 mm o l/L,dNTP s浓度为0.2 m...
[期刊] 西南农业学报  [作者] 霍金龙  苗永旺  霍海龙  陈涛  伍革民  刘丽仙  
采用随机扩增多态性DNA标记技术对澳洲鸵鸟20个个体进行了遗传变异分析,从60个随机引物中筛选出17个多态性丰富的引物,并对其所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增,结果17条引物共产生103种扩增片段,其中共有片段13条,多态片段90条,平均每条引物的扩增带数为6.06,各引物多态性片段范围在2~9,多态频率在40%~100%。表明澳洲鸵鸟的遗传多样性较丰富。
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 陈世林  赵书红  李永军  李孟华  余梅  熊统安  李奎  
利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对辽宁绒山羊的遗传变异进行了分析。用 37个随机引物和 5 5个两两组合的随机引物组合进行筛选 ,筛选出了 5个多态性较为丰富的随机引物 (组合 )。用这 5个随机引物(组合 )对 35个个体进行扩增 ,据它们的RAPD指纹图计算了遗传变异度 (0 .2 475 )。
[期刊] 华北农学报  [作者] 蒋建平  杨懋勋  黄永芳  
本研究选择了中国广东省7个有代表性的山区作为野百合(Lilium brownii F.E.Brown ex Miellez)天然居群的采样点,对采集到的199份样品进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,以建立野百合天然居群RAPD分析方法体系以便后续研究,并了解广东省野百合天然居群多态性情况和居群内外个体及野百合及变种百合样品的聚类情况。以新鲜叶片、硅胶干燥叶片及鳞片为材料分别提取DNA,从273条10聚寡核苷酸随机引物中筛选出20条随机引物,对7个居群共199个野百合及百合样品进行RAPD扩增。共检测到433条RAPD谱带,其中多态性条带为430条,所有个体的多态性条带百分率(PPB)...
[期刊] 西南农业学报  [作者] 伍玲  李平  刘熔山  
以小麦、玉米、小米、高粱、狼尾草五个不同属的材料为外源DNA供体,经减压渗透转导受体紫稻,从获得的变异材料中各选一份进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析。共用20个随机引物,其中6个引物扩增出了有差异的多态性DNA片段,1个引物可以区分受体材料与变异材料及变异材料间的差异。在以材料两两间的相似率进行的聚类分析中,发现聚类结果与材料变异性状一致,变异材料与受体材料间相似率高达90.7%,认为变异材料为受体材料在“减压渗透”处理后的真实变异;RAPDs是检测材料间差异的有效方法。
[期刊] 水产学报  [作者] 李晓静  孔杰  王伟继  孟宪红  田燚  孟鹏  毛连菊  
为评估DNA随机扩增多态性标记在中国对虾遗传连锁图谱构建中的应用前景,利用中国对虾单对交配亲本及其子二代材料,对RAPD标记及其遗传规律进行了研究。22条RAPD随机引物扩增结果的统计分析表明,标记在中国对虾F2的遗传规律可归为不分离标记和分离标记:不分离标记,指在亲本和后代中均不分离的标记,占总位点的54.1%;分离标记占总位点的45.9%。其中,分离标记又包括符合孟德尔遗传分离的标记、偏离孟德尔遗传分离标记和异常分离标记。符合孟德尔分离的标记中,分离比例为3∶1的标记占分离标记的14.7%;总的1∶1标记占分离标记的64.7%;偏离孟德尔分离和异常分离的标记分别占分离标记的11.7%和8....
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 曹少先  杨利国  赵文魁  张兆柏  姜勋平  茆达干  
应用 19个波尔山羊个体间多态性较强、重复性好的随机引物对 2 0只 5~ 6月龄波尔山羊公羊组织样DNA进行扩增 ,共得到 15 6个标记 ,其中可变标记 47个。t检验表明 ,OPE 15 .1阳性组腰角宽显著高于阴性组 ,OPH 15 .8、OPE 15 .4阳性组臀端宽显著高于阴性组 ;而OPH 13 .6、OPH 13.8等标记阴性组多个体尺、体重性状显著高于阳性组。这说明这些标记与特定性状可能存在相关 ,其遗传基础可能是该标记与控制性状的QTL或主基因连锁。
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 郝家胜  周开亚  
用 40个 10 寡核苷酸随机引物对中国鹅的 5个品种———狮头鹅、皖西白鹅、太湖鹅、浙东白鹅和四川白鹅进行了随机扩增多态DNA (RAPD)分析。结果表明 ,用筛选出的 14个引物共扩增出 174个DNA片段 ,其中的 48个 (占2 8 2 % )在 5个品种间表现为多态性。根据扩增DNA片段的异同 ,计算了各品种和个体间的遗传多样性指数和遗传距离指数。同时 ,用分子进化遗传分析软件 (MEGA)以UPGMA法和NJ法对遗传距离指数进行了聚类分析。结果显示 ,中国鹅 5品种间的遗传分化可能与人工选择密切相关 ,而和地理分布没有明显的关联。
[期刊] 水产学报  [作者] 张锡元  张德春  杨代淑  邓凤姣  余来宁  方耀林  
运用40个10碱基随机引物对长江中游鲢的遗传多样性进行了随机扩增多态DNA (RAPD)分析。所用引物中,能在鲢不同个体基因组中扩增出多态DNA带的有10个,占总引物数 的 25%.据RAPD带型分析,所取长江鲢自然群体的 18条样品中,每两个体相比较的遗 传相似度在0.9285至0.9788之间,平均值为0.9543;遗传变异度则在0.0212至0.0715之 间,平均值为0.04725;群体Shannon表型多样性指数(Ho)为8.8615,Shannon多样性值(H)为0.0624。 讨论了这些数据所反映的长江鲢遗传多样性和鱼类种质资源评价问题。
[期刊] 林业科学  [作者] 程东升  梁惠燕  薛煜  潘学仁  李武汉  
用RAPD手段分析了我国3种松干锈菌Cronartiumribicola、C.flaccidum及C.quercuum在DNA水平上的遗传分化。用5个随机引物从10个菌株(含1个不同属参照菌株)中检测出51个多态DNA片段进行聚类分析,3种锈菌清晰地显示为不同类群,此结果为传统分类的成立提供了分子遗传学证据。3种锈菌中C.ribicola和C.flacidum的亲缘关系较近,这同由症状和冬孢子寄主反映出的相似关系一致。种内菌株间存在遗传差异,但其程度小于种间差异。锈孢子及冬孢子寄主都不同的C.flacidum菌株间差异明显,可能反映着专化型分化的遗传学基础。不同松树寄主的C.quercuum菌...
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 曹少先  杨利国  姜勋平  茆达干  赵文魁  张兆伯  
用 10个随机引物对 11个波尔山羊精液样本DNA进行随机扩增 ,得到 113个标记 ,其中多态标记 31个。分析DNA多态标记与公羊总采精量、平均每次射精量、冻前活力、冻后活力、稀释倍数等的关系 ,发现OPK0 9 4标记阳性组山羊总采精量和平均每次射精量显著高于阴性组山羊 (P
[期刊] 海洋水产研究  [作者] 马春艳  刘敏  马凌波  张凤英  陈亚瞿  
用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对长江口刀鲚 (Coiliaectenes) 30个个体的遗传多样性进行了检测 ,从 4 0个随机引物中筛选出 17个对每个刀鲚的DNA进行扩增 ,结果表明 ,17个引物共检测到 14 8条清晰且重复性好的条带 ,分子量在 2 0 0~ 2 0 0 0bp之间 ,其中多态位点为 86个 ,占5 8 11% ;群体的Shannon多样性指数为 0 190 5 ,Nei基因多样性指数为 0 2 2 80 ;个体间最大遗传距离为 0 2 12 ,最小遗传距离为 0 0 92。通过与其他鱼类的遗传多样性的研究结果比较可初步判断 ,刀鲚群体的遗传多样性比较丰富...
[期刊] 淡水渔业  [作者] 赵凯  
本文利用随机扩增多态DNA (RAPD)技术对 4种鲤科鱼类 ,即裂腹鱼亚科的青海湖裸鲤、鲤亚科的鲤和鲫鱼、雅罗鱼亚科的草鱼基因组DNA进行了分析 ,目的是探讨青海湖裸鲤的系统分类位置。遗传距离指数计算结果显示 ,鲤亚科 2个鱼种间的相似性显著高于青海湖裸鲤和草鱼间的相似性 ,而裂腹鱼亚科的青海湖裸鲤与另两个鲤亚科三种鱼类之间的差异 (0 876 9、 0 7145、 0 6 930 )明显高于雅罗鱼亚科草鱼与鲤亚科鲤、鲫鱼之间的差异 (0 4718、 0 5 2 18)。在此基础上讨论了RAPD技术适用性的一些问题
[期刊] 华北农学报  [作者] 胡秀荣  方良俊  陈晓  朱志凯  张鑫  詹聘芳  
在盐胁迫下,经不同药物处理的水稻R6幼苗,提取RNA并反转录为cDNA后,对水稻P450基因cDNA序列扩增多态性进行分析。结果表明,不同药物处理的水稻R6幼苗形态特征明显;药物环孢素(CsA)处理的水稻细胞色素P450基因CYP709(NM-001066006)缺失430 bp条带,可能是NM-001066006基因与NM-001066009基因的外显子选择性剪接所致,从而表现出功能基因扩增多态性。
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