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[期刊] 图书馆论坛
[作者]
戚筠 何琳
深化对国内外领域数据库FAIR原则实践研究，奠定进一步开展科学数据的管理工作布局与实践基础，为不同学科领域的数据开放路径提供支持。采用文本分析法对国内外11个生物信息学领域数据库的介绍文献内容进行编码，探索其FAIR原则实践进展。通过分析生物信息学领域数据库的可发现、可访问、可互操作和可重用的FAIR原则实践，发现FAIR原则在生物信息学领域的数据实践研究中存在管理与应用两方面的不足。建议在后续FAIR原则实践中，生物信息学领域数据库在设计和管理上规范标准并不断创新，丰富领域数据相关描述，遵循通用且符合FAIR原则的数据库规定，实现领域中各数据库平台的互联互通，提高数据开放共享。
[期刊] 情报学报
[作者]
万跃华 何立民
大量的蛋白质和核酸数据的积累与理性地分析这些数据中所蕴涵的生物学意义的双重需要 ,产生了综合生物学研究与计算技术研究等领域最新成果的交叉性学科生物信息学。本文分别从生物信息学的基因组数据库 ,核酸和蛋白质一级结构序列数据库 ,生物大分子 (主要是蛋白质 )三维空间结构数据库 ,以及以这 3类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库 (包括基因组二次数据库、蛋白质序列二次数据库、蛋白质结构二次数据库 )和生物信息学数据库的集成系统等几个方面 ,概述了发展中的生物信息学数据库的最近动态和有关信息 ,同时对主要的热门生物信息学数据库站点和资源进行了评价。此外 ,就国内生物信息学数据库存在的问题与前景进...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
萧浪涛
综合分析了生物信息学这一现代新兴学科的定义和内涵 ,据此提出现代生物信息学是采用计算机技术和信息论方法研究生命科学中各种生物信息的表述、采集、储存、传递、检索、分析和解读的科学 ,是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学、化学等学科相互渗透和高度交叉形成的学科 .介绍了近年来国内外对于现代生物信息学的认识及其主要研究领域
关键词：
生物信息学 基因组 蛋白组 数据库
[期刊] 情报学报
[作者]
黄科 曹家树 吴秋云 温庆放
生物信息学是生物技术的核心 ,是一门由生物、数学、物理、化学、计算机科学、信息科学等多学科交叉产生的新兴学科。本文介绍了生物信息学的概念 ,分析了发展生物信息学对现今科学发展的重大意义。根据生物信息学的发展特点 ,具体分析了生物信息学研究的内容 :基因组序列的分析 ;基因进化 ;药物设计 ;基因区域预测 ;基因功能预测 ;蛋白质结构预测。评述了生物信息学发展的现状 ,指出我国生物信息学发展中存在的问题 ,并对我国发展生物信息学提出了一些建议。最后分析了生物信息学发展的方向 ,展望了生物信息学的发展前景
关键词：
生物信息学 生命科学 新兴学科
[期刊] 图书情报知识
[作者]
韩涛
科学数据的高速增长和科研工作者对信息获取日益提升的需求,要求科学数据库与科学文献库能实现集成信息服务,达到跨异构库知识发现的目的。本文以生物信息学为例,重点研究了生物信息学科学数据库与文献库的两种相关关系:外部关联和内部关联。前者主要是基于两者的外部相似性建立的交叉引用关系,后者则在内容层面直至知识层面实现两者的聚合和知识关联。
[期刊] 图书馆杂志
[作者]
许丹 杨颖 韩爽 徐爽
梳理国际上生物信息学领域发展至今的脉络态势及热点研究,为行业领域内科研人员提供文献信息支撑依据,也为我国未来生物信息学科的发展提供建议和指导。以SCIE11种国际生物信息学期刊1998-2019年发表的文献为信息源,结合文献计量学方法对发文国家、机构等情况进行阐述。利用Histcite、Pajek对1998-2014年文献进行脉络梳理及可视化分析并筛选出主要路径。运用BICOMB、gCluto对2015-2019年文献进行关键词聚类分析来探析研究热点。根据引文编年图和主要路径中的文献信息总结出1998-2014年生物信息学领域9个方面的研究热点并筛选出3条主要路径;获得2015-2019年生物信息学领域的6类研究热点。
[期刊] 图书馆杂志
[作者]
徐维
本研究揭示了对本体理解的两个层面。第一个层面的本体主要指特定领域里公认的事实所构成的有关过程或实体的知识。第二层面的本体主要指对信息实体的表达,是对信息模型中容纳事物实例的信息实体概念以及概念特征和相互关系的表达。以生物医学信息学领域为例,分析了生物医学信息学领域的顶层本体、本体建立原则和Bio Portal本体平台。提出今后中国生物医学信息学领域对本体的研究重点。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
彭佳红 张铭
数据挖掘是一个崭新的计算机应用领域,而生物信息学是生物学与计算机科学以及应用数学等学科相互交叉而形成的一门新兴学科.综述了数据挖掘技术的内容、过程、方法和模式,介绍了生物信息学的内涵和新的应用技术,同时探索了数据挖掘技术对生物信息挖掘应用的途径.
[期刊] 情报理论与实践
[作者]
杨文 韩涛 孙志茹
在分析生物信息学领域已有数据库、整合平台的基础上,归结了目前生物学数据库融合的两种模式:交叉引用模式和集成模式,并总结了目前系统的不足及数据库融合面临的困难,为进一步研究序列库与文献库的整合打下基础。
关键词：
生物信息学 数据库 整合
[期刊] 情报理论与实践
[作者]
朱庆华 李亮
本文重点介绍了国内外生物信息学的研究现状,分析了情报学与生物信息学的联系,并提出了情报学在生物信息学研究中的切入点。
关键词：
情报学 生物信息学 理论研究
[期刊] 图书馆论坛
[作者]
阙本旭
以CALIS“十五”期间专题特色数据子项目“潮汕文献数据库”的建库实践为例,对建库的基本原则要求、步骤与方法进行探讨。
[期刊] 草业科学
[作者]
宋辉
生物学家亟需应用生物信息学方法解决生命科学的问题。目前,草业科学专业尚未普及生物信息学课程。但是,部分草类植物已完成全基因组测序,需精通生物信息学知识的人才解决相关科学问题。基于以上考虑,青岛农业大学草业科学专业开设了生物信息学课程。通过对教学过程遇到问题的思考,对授课内容进行了优化,已收到良好教学反馈。通过对草业科学专业生物信息学课程的教学探索发现,在授课过程同时兼顾理论知识的讲授和软件工具的操作,具有良好的教学反馈;尤为重要的是,学生通过掌握生物信息学软件的操作,能够深刻理解理论知识。本文通过对青岛农业大学草业科学专业生物信息学授课的探索,为其他院校草业科学专业开设该门课程提供参考。
[期刊] 职业技术教育
[作者]
胡大威
高职软件技术专业基于工作过程的学习领域课程开发,应把握学习情境的设计原则,遵循行动导向教学法的教育理念和特征,严格按照"六步法"进行教学设计和课业文本设计。学习领域课程开发与实施要求教师转变教学观念,改革现有教学管理方式,并为学习情境营造提供物质保证。
[期刊] 大学图书馆学报
[作者]
黄婧 吴英梅
主要围绕北师大图书馆京师文库全文数据库的建设实践展开。首先简要阐明文库建设背景,在调研国内其他高校文库数据库建设实践基础上,明确京师文库全文库建设力图实现的功能。重点针对全文库建设实践的难点与特色功能进行了介绍。最后提出了关于全文库建设的下一步发展设想。
关键词：
高校文库 特色数据库 京师文库
[期刊] 图书情报工作
[作者]
孙海霞 李军莲 李丹亚 夏光辉 吴英杰 冀玉静 张宁
基于知识构建相关理论研究,设计面向知识服务的文献数据库知识构建体系,主要包括情景库、知识库、人际网络库、基础保障库,并以中国生物医学文献服务系统SinoMed为例,总结文献数据库基于该构建体系架构进行的主要知识服务实践:支撑技术研究和知识组织系统研制、知识元标引与知识元网络构建、基于用户体验的知识服务情景设计。
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