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[期刊] 淡水渔业  [作者] 赵凯  
本文利用随机扩增多态DNA (RAPD)技术对 4种鲤科鱼类 ,即裂腹鱼亚科的青海湖裸鲤、鲤亚科的鲤和鲫鱼、雅罗鱼亚科的草鱼基因组DNA进行了分析 ,目的是探讨青海湖裸鲤的系统分类位置。遗传距离指数计算结果显示 ,鲤亚科 2个鱼种间的相似性显著高于青海湖裸鲤和草鱼间的相似性 ,而裂腹鱼亚科的青海湖裸鲤与另两个鲤亚科三种鱼类之间的差异 (0 876 9、 0 7145、 0 6 930 )明显高于雅罗鱼亚科草鱼与鲤亚科鲤、鲫鱼之间的差异 (0 4718、 0 5 2 18)。在此基础上讨论了RAPD技术适用性的一些问题
[期刊] 长江流域资源与环境  [作者] 胡茂林  吴志强  常剑波  
利用RAPD(随机扩增多态)标记分析湖内鲤、鲫群体遗传多样性,从40个随机引物中各筛选出8个引物适合鲤、鲫群体RAPD扩增。在鲤群体中,共检测出60条带,其中多态性带42条,多态位点比率为70.00%;而在鲫群体中,共检测出61条带,其中多态性带40条,多态位点比率为65.57%。用POPGENE软件分析实验数据,结果显示:湖内鲤群体的遗传多样性水平(He=0.230 1,H0=0.391 0)和鲫群体的遗传多样性水平(He=0.218 6,H0=0.375 8)都较高,都有较大的遗传变异。而在鲤、鲫群体内,雌性群体与雄性群体相比较,其各自的遗传多样性很接近。
[期刊] 淡水渔业  [作者] 史建全  祁洪芳  杨建新  陈大庆  段辛斌  刘绍平  王亚民  
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 郝家胜  周开亚  
用 40个 10 寡核苷酸随机引物对中国鹅的 5个品种———狮头鹅、皖西白鹅、太湖鹅、浙东白鹅和四川白鹅进行了随机扩增多态DNA (RAPD)分析。结果表明 ,用筛选出的 14个引物共扩增出 174个DNA片段 ,其中的 48个 (占2 8 2 % )在 5个品种间表现为多态性。根据扩增DNA片段的异同 ,计算了各品种和个体间的遗传多样性指数和遗传距离指数。同时 ,用分子进化遗传分析软件 (MEGA)以UPGMA法和NJ法对遗传距离指数进行了聚类分析。结果显示 ,中国鹅 5品种间的遗传分化可能与人工选择密切相关 ,而和地理分布没有明显的关联。
[期刊] 水产学报  [作者] 张锡元  张德春  杨代淑  邓凤姣  余来宁  方耀林  
运用40个10碱基随机引物对长江中游鲢的遗传多样性进行了随机扩增多态DNA (RAPD)分析。所用引物中,能在鲢不同个体基因组中扩增出多态DNA带的有10个,占总引物数 的 25%.据RAPD带型分析,所取长江鲢自然群体的 18条样品中,每两个体相比较的遗 传相似度在0.9285至0.9788之间,平均值为0.9543;遗传变异度则在0.0212至0.0715之 间,平均值为0.04725;群体Shannon表型多样性指数(Ho)为8.8615,Shannon多样性值(H)为0.0624。 讨论了这些数据所反映的长江鲢遗传多样性和鱼类种质资源评价问题。
[期刊] 渔业科学进展  [作者] 李新丹  肖新平  周卫国  罗江  周杨浩  荣义峰  祁洪芳  史建全  杜浩  
本研究采用递增流速法对青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)野生洄游群体和人工养殖 1龄、2龄群体的临界游泳速度进行测试,采用固定流速法和人工模拟鱼梯对野生群体的克流能力进行评估。结果显示,(1)野生洄游组的绝对临界游泳速度(U_(crit))(35.73±6.56) cm·s~(–1)与养殖1龄组(31.66±9.97) cm·s~(–1)相比差异不显著(P>0.05),但显著低于养殖2龄组(57.77±10.25) cm·s~(–1) (P0.05)。(4)青海湖裸鲤野生群体在高流速100 cm·s~(–1)下的持续游泳时间极短(27.67±5.67) s,持续游泳时间与水流速度呈显著负相关(P<0.01)。(5)野生洄游群体在3级不同鱼梯的通过率差异显著(P<0.01),最低通过率仅为36%。本研究表明,青海湖裸鲤作为高海拔、高盐碱环境的典型冷水性鱼类,其游泳能力相对较弱,在洄游过程中更容易受到水坝等障碍的影响,本研究结果可为今后鱼梯设计和优化,青海湖裸鲤洄游群体保护提供基础数据。
[期刊] 华北农学报  [作者] 保长虹  李昭楠  关却多杰  李长忠  尹格玛  贺彩霞  金文杰  周叶吉  陈艳霞  
为正确区分青海湖裸鲤和花斑裸鲤,向科学研究及偷捕鱼货物的司法鉴定提供相应的数据支撑。对青海湖裸鲤和花斑裸鲤的线粒体基因组进行测序和生物信息学分析。此外,基于36种鲤科鱼类的线粒体全基因组序列用最大似然法(ML)构建鲤科鱼类系统发育树。结果表明,青海湖裸鲤线粒体基因组全序列全长为16 720 bp,包括13个蛋白编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因和1个D-Loop控制区,整个青海湖裸鲤线粒体基因组的核苷酸组成为28.68%A、27.29%T、18.16%G及25.87%C,AT偏向性显著(55.97%)。花斑裸鲤线粒体基因组全序列全长为16 760 bp,包括13个蛋白编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因和1个D-Loop控制区,整个花斑裸鲤线粒体基因组的核苷酸组成为28.63%A、27.22%T、18.26%G及25.88%C,同样具有明显的AT偏向性(55.85%)。青海湖裸鲤和花斑裸鲤线粒体基因组所有蛋白编码基因以ATG作为起始密码子,绝大多数蛋白编码基因以TAG或TAA作为终止密码子,少数以不完全密码子(T--)作为终止密码子,所有的tRNA基因均能形成典型的三叶草结构。系统发育分析结果显示,裸鲤属所有物种都聚为一个类群,并与光倒刺鲃、大理裂腹鱼和扁吻鱼的亲缘关系较近。该研究基于线粒体基因组的系统发育分析未将青海湖裸鲤和花斑裸鲤准确区分,但为重新建立更清晰的鲤科鱼类分类体系奠定了基础。
[期刊] 林业科学  [作者] 魏令波  唐谦  郑先武  顾万春  李小兵  
马尾松随机扩增多态性DNA标记的分离研究魏令波,唐谦,郑先武,顾万春(中国林业科学研究院林业研究所北京100091)李小兵(中国科学院遗传研究所植物生物技术开放实验室北京100012)关键词马尾松,RAPD,Mendelian分离随机扩增多态性DNA...
[期刊] 西南农业学报  [作者] 霍金龙  苗永旺  霍海龙  陈涛  伍革民  刘丽仙  
采用随机扩增多态性DNA标记技术对澳洲鸵鸟20个个体进行了遗传变异分析,从60个随机引物中筛选出17个多态性丰富的引物,并对其所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增,结果17条引物共产生103种扩增片段,其中共有片段13条,多态片段90条,平均每条引物的扩增带数为6.06,各引物多态性片段范围在2~9,多态频率在40%~100%。表明澳洲鸵鸟的遗传多样性较丰富。
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 陈世林  赵书红  李永军  李孟华  余梅  熊统安  李奎  
利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对辽宁绒山羊的遗传变异进行了分析。用 37个随机引物和 5 5个两两组合的随机引物组合进行筛选 ,筛选出了 5个多态性较为丰富的随机引物 (组合 )。用这 5个随机引物(组合 )对 35个个体进行扩增 ,据它们的RAPD指纹图计算了遗传变异度 (0 .2 475 )。
[期刊] 华北农学报  [作者] 蒋建平  杨懋勋  黄永芳  
本研究选择了中国广东省7个有代表性的山区作为野百合(Lilium brownii F.E.Brown ex Miellez)天然居群的采样点,对采集到的199份样品进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析,以建立野百合天然居群RAPD分析方法体系以便后续研究,并了解广东省野百合天然居群多态性情况和居群内外个体及野百合及变种百合样品的聚类情况。以新鲜叶片、硅胶干燥叶片及鳞片为材料分别提取DNA,从273条10聚寡核苷酸随机引物中筛选出20条随机引物,对7个居群共199个野百合及百合样品进行RAPD扩增。共检测到433条RAPD谱带,其中多态性条带为430条,所有个体的多态性条带百分率(PPB)...
[期刊] 西南农业学报  [作者] 伍玲  李平  刘熔山  
以小麦、玉米、小米、高粱、狼尾草五个不同属的材料为外源DNA供体,经减压渗透转导受体紫稻,从获得的变异材料中各选一份进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)分析。共用20个随机引物,其中6个引物扩增出了有差异的多态性DNA片段,1个引物可以区分受体材料与变异材料及变异材料间的差异。在以材料两两间的相似率进行的聚类分析中,发现聚类结果与材料变异性状一致,变异材料与受体材料间相似率高达90.7%,认为变异材料为受体材料在“减压渗透”处理后的真实变异;RAPDs是检测材料间差异的有效方法。
[期刊] 海洋水产研究  [作者] 马春艳  刘敏  马凌波  张凤英  陈亚瞿  
用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对长江口刀鲚 (Coiliaectenes) 30个个体的遗传多样性进行了检测 ,从 4 0个随机引物中筛选出 17个对每个刀鲚的DNA进行扩增 ,结果表明 ,17个引物共检测到 14 8条清晰且重复性好的条带 ,分子量在 2 0 0~ 2 0 0 0bp之间 ,其中多态位点为 86个 ,占5 8 11% ;群体的Shannon多样性指数为 0 190 5 ,Nei基因多样性指数为 0 2 2 80 ;个体间最大遗传距离为 0 2 12 ,最小遗传距离为 0 0 92。通过与其他鱼类的遗传多样性的研究结果比较可初步判断 ,刀鲚群体的遗传多样性比较丰富...
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