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[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
武莹 李威 祝传书 王永宏 张兴
【目的】克隆雷公藤萜类生物合成途径限速酶HMGR的编码基因,并分析雷公藤叶悬浮细胞中该基因在不同质量浓度壳寡糖诱导下的表达水平,为雷公藤萜类生物碱的生物合成提供理论依据。【方法】根据GenBank中报道的限速酶HMGR的编码基因序列合成简并引物,采用RT-PCR、5′-RACE和3′-RACE方法从雷公藤叶片中获得hmgr基因的cDNA全长序列;用生物信息学方法对限速酶HMGR进行蛋白结构及功能分析;用半定量RT-PCR方法比较hmgr基因在不同质量浓度壳寡糖诱导下的表达差异;用HPLC分析不同质量浓度壳寡糖诱导下雷公藤叶悬浮细胞中3种萜类次生代谢物(内酯醇、吉碱和次碱)的含量。【结果】获得了...
关键词:
雷公藤 HMGR RACE 壳寡糖
[期刊] 中国农业科学
[作者]
戴建军 常缨 张美萍 李彩凤 马凤鸣
以代表性差异分析cDNA-RDA(representationaldifferenceanalysisofcDNA)方法获得在低温和长日照诱导甜菜(BetavulgarisL)幼苗茎尖中差异表达的基因片段DP3,并进行了cDNA的末端快速扩增(rapidamplificationofcDNAends),经RT-PCR扩增和基因组DNA中PCR扩增,克隆测序后获得1个全长609bp的cDNA和855bp的DNA序列,分别命名为Ty7Br600和Ty7Br900,并在GenBank注册,登录号分别为AY324115和AY324114。在GenBank中比较未发现同源序列,可能为新基因。序列分析发现...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
王京京 魏麟 陈斌
克隆猪胰岛素诱导1(INSIG1)基因,并对其蛋白质序列进行分析。根据人INSIG1基因的保守序列设计1对引物,以猪总RNA为模板,经RT–PCR获得INSIG1基因序列,通过相对荧光定量PCR分析该基因在不同组织中的表达量;将INSIG1基因序列连接到PMD19–T SIMPle载体上,用PCR检测阳性克隆后测序,并对克隆得到的基因进行生物信息学分析。结果表明,INSIG1基因在肺中的表达量最高,其次是在肝脏,再次是在脾脏,在心脏中的表达量最低;通过克隆,获得了一段999 bP的序列,其中831 bP的开放阅读框编码276个氨基酸;该蛋白不含信号肽序列,与其他动物INSIG1基因氨基酸序列的...
关键词:
猪 胰岛素诱导1基因 基因克隆 序列分析
[期刊] 华北农学报
[作者]
吴梅花 张丽 牛一丁 方天祺 哈斯阿古拉
以拟南芥基因组DNA为模板,通过PCR扩增得到逆境胁迫诱导表达基因rd29A的启动子片段,将其克隆到pUC19质粒中进行序列分析。结果表明,获得的启动子片段大小为937bp,与已报道的该启动子序列比较,其核苷酸序列同源性为99.8%。
关键词:
拟南芥 rd29A 启动子 抗逆基因
[期刊] 林业科学研究
[作者]
梁立雄 常英英 高亚南 王颜波 张伟溪 苏晓华 张冰玉
DNA甲基化是植物基因组中普遍存在的一种的重要表观遗传学机制,对植物生长发育及进化起着重要的调节作用[1-2]。植物体DNA甲基化的建立和维持受多个基因的协同调控,其中MET1(DN-MT1-likE METHYlTRANSFERASE 1 gENE)是在植物中最早分离出来的甲基化相关基因,编码DNA甲基化转移酶1(MET1,METHYTRANSFERASE1),该酶主要负责保持Cg位点的甲基化,通过DNA甲基化作用影
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
李琰 冯俊涛 王永宏 郭小虎 祁新帅 张兴
【目的】建立雷公藤愈伤组织诱导培养体系,为雷公藤通过组织培养生产次生代谢产物奠定基础。【方法】以雷公藤枝条扦插苗的根、幼茎、叶为外植体,研究基本培养基、激素、外植体类型对愈伤组织诱导的影响,并检测了不同外植体愈伤组织乙酸乙酯提取物的杀虫活性。【结果】MS培养基有利于雷公藤愈伤组织的诱导;雷公藤的根、茎、叶3种外植体均可用来诱导愈伤组织;供试激素中,2,4-D的诱导效果较NAA好,KT的效果优于6-BA,低质量浓度的KT与2,4-D组合能促进愈伤组织的诱导和生长;根、茎、叶3种愈伤组织提取物对粘虫幼虫均有明显的拒食活性,对粘虫幼虫的生长发育有明显的抑制作用,48 h拒食中质量浓度(AFC50)分...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
姜维 薛鹏 何永新 陈玉林
【目的】克隆山羊Eda基因CDS区全序列,并对其进行序列分析,研究Eda基因在毛囊生长周期不同阶段皮肤组织中的表达规律。【方法】以太行黑山羊为研究对象,采集其毛囊生长休止期、生长期和退行期背部皮肤组织,采用RT-PCR技术克隆山羊Eda基因,通过在线软件Blastn进行基因cDNA序列分析,用SMART进行氨基酸序列分析,利用SWISS-MODEL软件进行蛋白质结构分析;以β-actin为看家基因,采用实时荧光定量PCR技术对Eda mRNA在毛囊生长不同时期皮肤组织中的表达规律进行分析。【结果】太行黑山羊Eda-A1基因CDS区全长1 176bp,编码391个氨基酸;Eda-A2比Eda-A...
[期刊] 水产学报
[作者]
杨国坤 徐双阳 梁晓敏 秦超彬 张艳敏 孟晓林 聂国兴
为研究GIP(葡萄糖依赖性肠促胰岛素,glucose-dependent insulinotropic polypeptide)在鲤体内的生理功能,实验利用RT-PCR(reverse transcription-polymerase chain reaction)技术从鲤前肠克隆得到gip,对其进行生物信息学分析,并对其mRNA的表达进行检测。结果显示,鲤gip的开放阅读框(open reading frame,ORF)为324 bp,编码107个氨基酸。经过结构预测鲤Gip前体蛋白包括信号肽、N端结构域、Gip成熟肽和C端结构域。氨基酸序列比对及系统进化树分析结果显示,鲤Gip蛋白与斑马鱼Gip蛋白的亲缘关系最近。Real-time PCR结果显示,gip在鲤各个组织中均有表达,但在前肠和垂体组织表达量最高。葡萄糖灌喂实验结果表明,鲤的脑和前肠中gip的表达量在灌喂葡萄糖1和2 h后显著增加。在饥饿再投喂实验中,鲤前肠中gip的表达量在饥饿后显著降低,而再投喂后表达量显著升高。在饲养实验中,高糖和高脂均能显著增加鲤前肠中gip基因的表达量。本研究克隆了鲤gip,并且不同的营养状态可以调节其表达水平。研究结果可初步阐明Gip的生理功能,为探究Gip调节鱼类糖脂代谢的机制提供理论依据。
关键词:
鲤 Gip 鉴定 表达分析
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
王晓丽 杨莉莉 何泽东 陈蒙蒙 马志卿 张斌 祝传书
【目的】探究不同诱导子对雷公藤发状根生长及主要次生代谢产物(吉碱和次碱)含量的影响,为雷公藤次生代谢产物的开发利用及其生物合成途径解析提供理论依据。【方法】分别配制1/4 MS,1/2 MS,3/4 MS和MS 4种培养基,恒温避光培养雷公藤发状根35 d,测定雷公藤发状根干质量及雷公藤吉碱和次碱含量,筛选雷公藤发状根培养的最适培养基;以最适培养基培养雷公藤发状根,每7 d取样1次,共取样7次,测定发状根干质量,以培养时间为横坐标,发状根干质量为纵坐标绘制发状根生长曲线并确定添加诱导子的时间;提取和分离不同处理发状根及培养基中的雷公藤吉碱和次碱,并进行HPLC分析,探究不同诱导子对雷公藤发状根生长及吉碱、次碱含量变化的影响。【结果】培养35 d时,1/2 MS和MS培养基中雷公藤发状根干质量分别为0.86和0.81 g/瓶,且MS培养基中发状根的根系长势更好;MS培养基中发状根吉碱和次碱的含量均达到最高,分别为1 070.57和331.72μg/g,因此确定MS培养基为雷公藤发状根培养的最适培养基。雷公藤发状根的干质量以及吉碱和次碱含量在培养21~28 d内迅速增长,28~35 d处于稳定阶段,35 d后生长速率出现下降的趋势,因此确定雷公藤发状根培养28 d添加诱导子。诱导试验结果表明,低浓度水杨酸(SA)促进雷公藤发状根的生长,100μmol/L SA处理吉碱和次碱的总产量分别达到(1 777.09±70.02)和(592.16±85.61)μg/瓶;高浓度硝酸银(AgNO3)抑制了雷公藤发状根的生长,但显著提高了发状根中吉碱和次碱的产量, AgNO3质量浓度为50 mg/L时,吉碱和次碱的总产量分别达到(3 926.82±273.59)和(669.31±33.23)μg/瓶;5和10 g/L山梨醇对雷公藤发状根生长及吉碱和次碱含量均有促进作用,其中10 g/L山梨醇处理时吉碱总产量为(1 567.84±135.78)μg/瓶,5 g/L山梨醇处理时次碱总产量为(388.68±30.11)μg/瓶;壳聚糖对雷公藤发状根生长有抑制作用,100 mg/L壳聚糖处理的吉碱和次碱总产量分别为(1 661.62±189.33)和(361.39±33.45)μg/瓶。【结论】低浓度AgNO3、SA以及山梨醇对雷公藤发状根生长具有一定促进作用,壳聚糖对雷公藤发状根生长有抑制作用;对吉碱和次碱诱导效果最好的是50 mg/L AgNO3。
关键词:
雷公藤 发状根 诱导子 吉碱 次碱
[期刊] 华北农学报
[作者]
孟想想 闫佳萍 刘晓梦 廖咏玲 常杰 许锋
3-羟基-3-甲基戊二酰-CoA还原酶(3-hydroxy-3-methyl glutAryl Coenzyme A reduCtAse,hmgr)是植物萜类化合物甲羟戊酸合成途径中的关键限速酶。为研究hmgr基因在洋甘菊萜类化合物合成代谢中的功能,根据前期罗马洋甘菊转录组注释hmgr的unigene序列设计引物,以罗马洋甘菊C dnA为模板,采用rt-PCr方法,从罗马洋甘菊中克隆得到一个长为1 856 bP的hmgr基因,命名为Cnhmgr(gen bAnk登录号为ku589282)。Cnhmgr基因序列包含1个1 746 bP长的开放阅读框,编码582个氨基酸,生物信息学软件预测蛋白质分...
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
王丽华 李杰勤 詹秋文 樊飞飞
以高粱品系早亨加利为材料,通过RT–PCR扩增,克隆高粱Sb CAD4基因。测序结果表明,克隆的Sb CAD4基因与NCBI基因库中高粱IS11861品系只在编码序列第548位有1个碱基的差异,而二者的氨基酸序列完全一致。进化树分析结果表明,Sb CAD4与拟南介、水稻、玉米的木质素合成CAD基因位于同/L1个群中。比对分析结果表明,Sb CAD4与木质素合成基因具有相同的结构域。将构建正确的重组质粒(p MAL–Sb CAD4)转化入大肠杆菌菌种BL21中进行诱导表达的结果表明,IPTG的最佳诱导浓度为0.5 mmol/L。经Amylose Resin亲和层析柱纯化后,Sb CAD4融合蛋白...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
贾成霞 张照斌 张清靖 刘盼 朱华
克隆了虹鳟(Oncorhynchus mykiss)过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated receptor,PPAR)αmRNA全序列。对其序列分析发现,虹鳟PPARα与其他脊椎动物PPARα有较高的同源性,其中mRNA序列有66.4%~97.5%相同,氨基酸序列有69.2%~98.9%相同。DNA结合结构域和配体结合结构域从鱼类到人类高度保守,其中DNA结合结构域有88.0%~98.8%的氨基酸序列相同;配体结合结构域有74.6%~99.6%的氨基酸序列相同。系统发生树分析表明,虹鳟的PPARα基因与同属鲑科鱼类的大西洋鲑(Salmo...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
李世鹏 刘富洋 张丛 邰付菊
利用同源克隆的方法分离了6个玉米ERF(EthylEnE-REsponsivE ElEmEnt binding FactoR)基因,分别命名为ZmERF4、ZmERF26、ZmERF28、ZmERF64、ZmERF89和ZmERF202。基因结构分析显示,ZmERF与拟南芥的atERF可能存在差异。系统发育分析显示,ZmERFs与osERFs的亲缘关系更加亲近,而与atERFs的关系则稍远。Rt-pcR表达分析表明,在乙烯利(Et)处理之后,这6个ZmERFs的mRnas水平在叶中都是先积累后下降的,但其中4个基因(ZmERF4、ZmERF28、ZmERF64和ZmERF89)在玉米根中都是呈...
[期刊] 水产学报
[作者]
田志环 焦传珍 成永旭 吴旭干
为研究Akt基因在中华绒螯蟹蜕壳前后肌肉生长过程中的功能,应用RACE技术克隆得到编码中华绒螯蟹Akt(命名为Es Akt)的全长为2 200 bp的c DNA序列,包括159 bp的5′非翻译区(5′-UTR)、496 bp的3′非翻译区(3′-UTR)和长度为1545 bp编码514个氨基酸的编码序列。蛋白质结构域分析显示Es Akt含有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族的3个特征性保守结构域。多序列比对和系统发育分析显示,Es Akt与中国明对虾、凡纳滨对虾的Akt序列一致性都为0.889,在系统发育树中节
[期刊] 中国水产科学
[作者]
蒋菁菁 李英文 陈大庆 刘绍平 段辛斌 李小芳 范振华 汪登强
补体系统经活化形成末端补体复合物,C7是将此复合物与目的细胞的细胞膜结合的重要分子。本研究从已有的cDNA文库中克隆鲢(Hypophthalmichthys molitrix)补体C7的cDNA,其全长2 625 bp,编码821个氨基酸。同源性分析表明,鲢补体C7与草鲤鱼的氨基酸序列相同率最高(为93%)。与已报道的硬骨鱼类补体C7相同,鲢补体C7具有一些保守的结构,如TSP1、LDLRa、MACPF、EGF、TSP1、CCP。对12尾鲢补体C7进行遗传多样性分析发现有6个突变位点,其中5个是同义突变,另外一个是非同义突变,确定6个等位基因。在鲢正常组织和嗜水气单胞菌感染的免疫器官组织中,对...
关键词:
鲢 C7 遗传多样性 克隆 表达
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