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[期刊] 中国水产科学
[作者]
仲伟鹏 罗坤 孟宪红 陈宝龙 隋娟 孔杰 曹宝祥 邢群 栾生
为研究竞争性环境下中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)体重性状的间接遗传效应,设计多家系多分组方案,对来源于中国对虾G11代育种群体的103个测试家系限制配合饲料投喂量(正常投喂量50%),利用经典动物模型和包含间接遗传效应的扩展动物模型估算收获体重的遗传参数。基于2种模型估计出的经典遗传力分别为0.581±0.071和0.616±0.074。似然比率检验表明,体重的间接遗传效应显著,对总遗传方差的贡献度高达75.03%。由于存在一个较大的负直接遗传效应与间接遗传效应协方差(-2.1982),导致总遗传方差与表型方差的比值仅为0.524±0.212,小于经典的遗传力估计值。基于协方差获得的直接遗传效应与间接遗传效应的遗传相关系数为-0.495±0.184,暗示测试个体间存在较强的竞争交互。本研究表明,在饲料投喂量受限制的竞争性环境下,对虾个体间较强的竞争交互行为,对中国对虾收获体重间接产生了可遗传的效应,减少了可利用的总遗传变异。今后在设计中国对虾育种方案时,应避免在资源受限的强竞争环境下开展性状测试和遗传评估。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
马爱军 王新安
采用条件数量性状加性-显性遗传模型和统计分析方法,对大菱鲆(Scophthalmus maximus)体重性状不同生长期进行遗传分析;基于von Bertalanffy模型,对大菱鲆6种交配组合的生长曲线划分为缓慢生长期、快速生长前期、快速生长后期和渐进期,并与各生长期所对应的遗传分析结果进行比对。结果表明,6种交配组合的缓慢生长期、快速生长前期和快速生长后期基本上是一致的。在缓慢生长期,检测到新的条件加性方差和条件显性方差,其相应的条件加性方差分量比率均未达到显著水平,相应的条件显性方差分量比率均达到显著(P<0.05)或极显著水平(P<0.01);在快速生长前期,交互检测到达到极其显著水平...
关键词：
大菱鲆 体重性状 快速生长期 遗传分析
[期刊] 水产学报
[作者]
李波波 栾生 柴展 隋娟 罗坤 孟宪红 陈宝龙 曹宝祥 刘宁 孔杰
本研究针对低密度养殖模式下中国明对虾收获体质量和眼球磨损性状的直接遗传效应（DGE）和间接遗传效应（IGE）进行了估计。间接遗传效应是指个体自身的基因表达对同一组内其他个体表型性状的影响程度。为了准确地估计中国明对虾收获体质量及眼球磨损性状的遗传参数，将来自G8、G9代的178个被标记的家系（G8代88个家系，G9代90个家系），共计6 408尾中国明对虾，每个家系分成3组（每组12尾），随机放入3个不同的圆缸（半径100 cm），其中，G8代88个圆缸，G9代90个圆缸。每个圆缸包含3个不同的家系，1个家系共与其他6个家系进行组合，生长测试80 d后对体质量及眼球磨损性状进行测量和评估。结果显示，使用传统的动物模型获得收获体质量的遗传力为0.11±0.05，属低遗传力水平。似然比检验结果表明，需要将IGE效应包含在模型中（LRT=5.26）。利用包含IGE的扩展动物模型估计得到的总遗传方差由DGE方差（43%）、DGE-IGE协方差（24%）和IGE方差（33%）组成，占表型方差的24%，是传统动物模型获得的遗传力的2倍多（11%）。由DGE-IGE协方差估计出收获体质量的DGE-IGE相关系数为0.32±0.45，属中度正相关，表明由于养殖密度较低，组内个体间社会交互形式为非竞争行为。利用不包含IGE的logit模型获得眼球磨损性状的遗传力估计值为0.05±0.03，属低遗传力水平。包含IGE的总遗传方差占表型方差的比值为2.75（T~(2)），显著大于1，是不包含IGE的logit模型获得的遗传力的58倍多(0.05)。上述结果显示，社会交互行为对中国明对虾收获体质量产生了更多可利用的遗传变异。与收获体质量相比，眼球磨损性状更易受个体间社会交互行为的影响，可将眼球是否磨损作为代表个体间社会交互行为结果的一个性状。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
王军 王清印 孔杰 孟宪红 曹家旺 王明珠 冯亚萍 吕丁
利用微卫星标记技术分析了中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)野生群体(Wild Population,WP)和‘黄海2号’第10代选育群体(Breeding Population,BP)的遗传多样性,以检测累代人工选育对中国对虾群体遗传结构的影响。结果显示,15个微卫星位点共检测到462个等位基因,微卫星位点等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)分别为344个和229个,多态信息含量(PIC)为0.5180.964。野生群体和选育群体的平均观测杂合度分别为0.852和0.810
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
王军 王清印 孔杰 孟宪红 曹家旺 王明珠 冯亚萍 吕丁
利用微卫星标记技术分析了中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)野生群体(Wild Population,WP)和“黄海2号”第10代选育群体(Breeding Population,BP)的遗传多样性,以检测累代人工选育对中国明对虾群体遗传结构的影响。结果显示,15个微卫星位点共检测到462个等位基因,微卫星位点等位基因数(N_a)和有效等位基因数(N_e)分别为344个和229个,多态信息含量(PIC)为0.5180.964。野生群体和选育群体的平均观测杂合度分别为0.852和0
[期刊] 水产学报
[作者]
岳志芹 王伟继 孔杰 戴继勋
利用AFLP技术对连续4年选育的中国对虾抗白斑病毒群体进行了遗传分析,并比较了不同的数据处理方法对遗传学参数的影响。7个EcoRⅠ/MseⅠ引物组合共产生350个位点,其中202个为多态位点。4代群体的多态位点比例分别为:39.4286%,41.4286%,33.4286%,39.1429%,Nei基因多样性指数分别为:0.1197,0.1259,0.1133,0.1249;4代群体的Shannon多样性指数分别为0.1831,0.1917,0.1702,0.1896。遗传多样性水平除了第3代群体标本明显较低外,其它3代甚为接近,维持在一个恒定的水平。比较了Nei分析、Shannon信息指数分...
关键词：
中国对虾 AFLP 遗传变异 抗病群体
[期刊] 水产学报
[作者]
杨翠华 孔杰 王清印 田燚 罗坤 张天时
过量的捕捞和不合理的人工育种措施,使中国对虾野生和养殖群体的遗传多样性均遭到不同程度的降低。本试验在相似的环境条件下养殖了40个野生对虾产生的家系和3个兄妹交产生的家系,定量测定了平均体重(1.43-1.58)g1 460尾中国对虾早期体重和感染白斑综合征病毒(WSSV)后存活时间的近交衰退系数。结果显示,野生对虾家系组的平均体重和平均存活时间分别为(1.58±0.01)g和(100.43±0.68)h,而兄妹交家系组平均体重和平均存活时间分别是(1.43±0.04)g和(85.84±1.70)h,平均体重和平均存活时间在两组间均存在极显著差异(P<0.01)。野生对虾家系组体重和存活时间的表...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
强光峰 杨国梁 陈雪峰 孔杰 夏正龙 高强 罗坤 栾生
精确地估计加性和显性遗传效应,可以提高选择准确度和加速遗传进展。本研究构建了343个罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)G7G9育种群体全同胞家系(半同胞家系244个),测定了29523尾个体的收获体重。基于单性状动物模型,利用平均信息约束最大似然法(average information restricted maximum likelihood method,AIREML)估计了G7、G8、G9和G8+G9 4个数据集收获体重的方差组分。分析时采用了两种模型:(1)加性遗传效
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
孔杰 栾生 张天时 罗坤 王清印
设计了3种育种模式,精细育种模式(A)、全同胞育种模式(B)和群组育种模式(C),分别利用不同的系谱信息(所有系谱、全同胞、群组),考虑不同的遗传力水平,在家系和个体水平上进行选择效果的对比分析。采用单性状动物模型,考虑各家系标记时的平均体重为协变量,通过BLUP法估计个体体重育种值。家系选择水平上的结果表明,利用全同胞育种模式选取的家系(50%的淘汰率)与精细育种模式相比,一致率在90%以上,估计的家系育种值与精细育种模式间的相关系数在0.9以上,相关程度高。在个体选择水平上,全同胞育种模式与精细育种模式间存在着较大差距。以10%的留种率为标准,前者留取的个体与后者的一致率在68.61%～8...
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
孟鹏 刘晓敏 王伟继 孔杰 李晓静 王清印
采用扩增片段长度多态性分子标记技术对中国对虾的40个家系共200个样品进行了家系水平的遗传多样性分析。利用10对引物共产生307个表达清晰可用于分析的标记,其中189个标记表现为多态性,占总标记数的61.56%;中国对虾各个家系多态位点百分率在12.7%～34.2%之间;各个家系基因多样性指数在0.0494～0.122之间,Shannon指数的范围在0.0725～0.182之间(家系水平为0.1975)。对40个家系的AMOVA分析结果显示,家系间的基因分化系数Gst=0.4713,即总的遗传变异中有47.13%的变异存在于家系间,家系内的遗传变异占总遗传变异的52.87%。采用UPGMA法对...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
佟丽佳 冯小芳 王苏皖 李亚博 王瑜 封元 蒋秋斐 徐军 顾亚玲 张娟
为分析不同动物模型对宁夏地区安格斯牛18月龄生长性状遗传参数估计的影响，筛选出估计生长性状遗传参数的最佳动物模型，本研究使用包含或剔除母体遗传效应、母体永久环境效应及母体与直接遗传效应之间是否存在协方差来区分6种动物模型，借助DMU软件的DMU＿AI模块，利用约束最大似然法（AI-REML）估计安格斯牛18月龄生长性状的遗传参数。利用赤池信息准则（AIC）和似然比检验（LRT）确定遗传参数估计的最佳动物模型。结果表明：1）模型4是估计安格斯牛18月龄体重（Body weight, BW）、十字部高（Crucifixion height, CH）和管围（Shin circumference, SC）的最佳模型，该模型估计的以上3个性状的直接遗传力分别为0.42、0.29和0.22，母体遗传力分别为0.11、0.14和0.05，总遗传力分别为0.23、0.12和0.11。2）模型6是估计安格斯牛18月龄体高（Body height, BH）、体斜长（Body length, BL）和胸围（Chest circumference, CC）的最佳模型，该模型估计的这些性状的直接遗传力分别为0.48、0.48和0.64，母体遗传力分别为0.02、0.12和0.08，总遗传力分别0.33、0.18和0.34。综上，考虑直接遗传效应和母体遗传效应之间的协方差、母体效应可对目的性状更加准确的进行无偏预测。本研究为加快安格斯牛的遗传进展提供理论依据。
关键词：
安格斯牛 遗传参数 体尺体重 模型比较
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
张天时 栾生 孔杰 罗坤 田燚 王清印
育种值是选种和配种计划制定的基础,其准确性与选择效果密切相关。利用中国对虾2005年21个父系半同胞组共1387个个体体重数据,将家系标记时的平均体重、全同胞组效应等因子组合,建立了4种不同的动物模型,应用BLUP法估计体重育种值。4种模型的估计结果分析表明,家系标记时的平均体重和全同胞家系效应是两个重要影响因子,建立的AFB动物模型比其他模型所估计的结果更准确。AFB动物模型估计中国对虾145d的体重遗传力为0.14±0.076,据此计算育种值并进行模拟留种分析。结果显示,在根据表型值或育种值选种的情况下,育种值选种的留种家系或个体的育种值比表型值选种分别提高50%和80.59%,育种值选择...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
李雪 洪巍 刘桂芬 魏晨 何军敏 张文静 龙丽 杨存明 田可川 黄锡霞
为进一步提高天目多胎羊的生长性能和育种效率，收集2013—2022年天目多胎羊18 534条断奶前体重数据，分析影响天目多胎羊羔羊期体重性状的非遗传因素，利用DMU软件估计遗传参数和育种值，分析其遗传趋势和表型趋势。结果表明：1）性别、出生年份和出生季节对天目多胎羊羔羊期体重性状均影响极显著（P<0.01）；出生类型对断奶前克莱伯比率具有显著（P<0.05）影响，对其他性状具有极显著影响。2）初生重为中等遗传力性状，直接遗传力为0.18±0.03，母体遗传力为0.13±0.02；断奶重、断奶前平均日增重和断奶前克莱伯比率属于低遗传力性状，直接遗传力分别为0.06±0.02、0.06±0.02和0.02±0.01，母体遗传力估计值分别为0.07±0.01、0.07±0.01和0.09±0.01。3）除初生重与断奶前克莱伯比率之间为负的遗传相关与表型相关外，其余各性状间均为正遗传与表型相关。4）初生重的平均育种值整体呈现下降趋势，平均表型值呈先上升后下降的趋势；断奶重的平均育种值与平均表型值均先下降后上升；断奶前平均日增重和断奶前克莱伯比率的平均育种值先下降后上升又下降终上升，平均表型值先下降后上升。5）初生重、断奶重、断奶前日增重和断奶前克莱伯比率的遗传进展分别为-0.013 kg/a、-0.005 kg/a、-0.001 g/（d·a）和0.005；表型进展分别为0.066 kg/a、0.218 kg/a、3.388 g/天/a和0.092。综上，本研究可对天目多胎羊当前育种方案进行优化调整，进一步稳定其优良遗传性能，提高育种效率，节约饲养成本，为天目多胎羊的科学早期选育、提高生长性能和群体遗传稳定性提供理论依据。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
陈华增 李健 何玉英 李吉涛 王清印
利用正交设计L16(45)对影响中国对虾SRAP分子标记分析的5个因素(Taq酶,Mg2+,模板DNA,dNTP和引物浓度)在4个水平上进行了优化,筛选出各反应因素的最佳水平为:20μl反应体系中包含1.0UTaq酶,2.0mmol/L的Mg2+,40.0ng的模板DNA,0.125mmol/L的dNTP以及0.4μmol/L的引物,退火温度为53.5℃。研究表明,各因素的不同水平对扩增结果有显著影响,其中Mg2+影响最大,影响大小顺序依次为Mg2+,Taq酶,引物,dNTP和模板DNA。利用优化的SRAP分子标记体系对中国对虾"黄海1号"第12世代选育群体进行了遗传多样性分析,实验结果表明,...
关键词：
中国对虾 正交设计 SRAP 遗传多样性
[期刊] 中国水产科学
[作者]
何玉英 刘萍 李健 孔杰 王清印
采用RAPD技术对中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)第一代和第六代人工选育群体的遗传结构及其分化进行了分析。在20个10bp随机引物中筛选出16个引物,共扩增出89条DNA片段,其中多态性片段分别为34和30条,多态位点比例分别为38.2％和33.71％。对2群体的遗传学参数计算结果表明:2群体间遗传分化指数为0.1408,属中等程度分化;群体间的遗传变异平均为0.197,由此可见,80％的遗传变异来自于群体内,而近20％的变异则是来自于群体间;第六代群体的多态位点比例和遗传多态度均低于第一代群体,这可能与人工定向选育过程中注重经济性状有关。
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