【目的】陆均松和青梅是海南岛热带雨林中珍稀濒危树种。研究陆均松和青梅叶际真菌群落多样性和结构组成及其环境驱动因子，为未来利用微生物群落提供的有益功能来提高珍稀濒危植物生长适应性提供理论依据。【方法】通过对陆均松和青梅叶际真菌样品进行高通量测序，分析叶际真菌群落α、β多样性和群落组成，并阐明其主要环境驱动因子。【结果】1)本研究共分析检测到10 489个OTU，其中包括真菌10门40纲。陆均松和青梅的叶表共有OTU为523（4.99%），叶内共有OTU仅为9（0.09%）。2)优势菌纲包括：座囊菌纲（Dothideomycetes）、散囊菌纲（Eurotionmycetes）、银耳纲（Tremellomycetes）。其中青梅叶内的座囊菌纲相对丰度显著大于其他物种和隔室（P<0.01）。3)叶表真菌α多样性均高于叶内，但在不同物种上叶际真菌多样性差异不显著，物种变化解释了叶际真菌群落组成差异的13.57%（P<0.001）；4)叶际真菌α多样性与叶片pH值、温度呈显著正相关（pH：R²=0.16，P<0.001；Tem：R²=0.16，P<0.001），同时与降水量呈显著负相关（Rain：R²=0.35，P<0.001）。CCA分析结果显示，Mg、降水量对叶表真菌群落组成的解释度分别为：71.29%、69.33%；pH值、Mg对叶内真菌群落组成的解释度分别为：62.48%、61.51%。5)置换多元方差分析（PERMANOVA）结果说明全氮（TN：R²=0.13，P=0.001）、全磷（TP：R²=0.12，P=0.001）、Mg（Mg：R²=0.14，P=0.001）、降水量（Rain：R²=0.13，P=0.002）是陆均松和青梅叶际真菌组成差异的主要驱动因子。【结论】物种变化显著影响了叶际真菌群落，全氮（TN）、全磷（TP）、Mg是驱动陆均松和青梅叶际真菌群落组成差异的主要影响因子。

【目的】探究热带雨林2种典型植物（陆均松和青梅）根际真菌群落多样性与组成差异，为保护热带雨林生态系统中珍稀濒危物种的生物多样性提供科学依据。【方法】通过Illumina Miseq 高通量测序法对海南热带雨林陆均松和青梅根际真菌群落组成、多样性及功能进行分析。【结果】担子菌门（Basidiomycota）和子囊菌门（Ascomycota）是根际不同生态位间的优势菌门。PCoA结果表明，与生态位相比，物种更能影响陆均松和青梅真菌群落结构，且对根际不同生态位的影响程度不同（根际: R = 0.1983， P = 0.007; 根表: R = 0.2622， P = 0.004; 根内: R = 0.7342， P = 0.001）。在OTU水平上陆均松和青梅真菌群落α多样性差异不显著，但同一树种的根表与根内真菌群落α多样性差异显著（P < 0.05），且与其它生态位相比，根内真菌群落α多样性最低。CCA分析结果表明，环境因子中pH、铵态氮（AN）是影响2个树种根际真菌群落结构的重要环境因子。FUNGuild功能预测结果显示，外生菌根真菌-未定义腐生菌、外生菌根、未定义的腐生菌及寄生真菌-未定义的腐生菌为主要功能类群，且在不同树种中存在差异。【结论】植物种类显著影响根际真菌群落组成，但生态位是在小尺度区域上影响真菌群落多样性的重要因素。pH、AN是驱动陆均松和青梅根际真菌群落组成差异的重要环境因子。

【目的】陕西小叶杨主要分布在生态环境差异显著的陕北和秦岭北麓地区。研究小叶杨叶内生真菌群体特征，明确影响小叶杨生态分布的生态因素。【方法】通过对２种生境下小叶杨林分代表植株叶片定点、定时采集，在严格的表面消毒下，进行ＰＤＡ和纸培养，结合形态学和分子系统学技术对分离真菌进行鉴别，并用ＳＡＳＳ软件对内生真菌群体进行统计分析。【结果】宝鸡和榆林的小叶杨内生真菌相似系数较高（０．４４４ ５），优势种群相似。交链孢属、单隔孢属、茎点霉属真菌相对分离率分别为２３．１％，２２．５％，２８．４４％，皆为优势菌群，呈现明显的暗色有隔菌群特点，这可能与小叶杨树种旱生发育型相关。地区内的内生真菌群体相似系数大于地区．．．

利用Ion S5~(TM) XL测序平台,通过未施肥(R1)、常规施肥(R2)和化肥减量(R4)等不同施肥方式对木薯华南205种植地土壤进行16S rRNA高通量测序分析,结果表明,在相似水平为97%下聚类分析得到的R1、R2、R4的OTUs数分别为1 003、989、864个;不同施肥方式下木薯根际土壤中优势菌门为酸杆菌门、绿弯菌门、变形菌门、放线菌门、厚壁菌门和拟杆菌门.化肥施用增加了绿弯菌门、变形菌门、放线菌门、厚壁菌门等的相对丰度,降低了酸杆菌门和拟杆菌门的相对丰度.施肥方式改变土壤细菌的多样性和丰度,其物种多样性表现为R1>R2>R4.基于土壤细菌群落的PCoA和聚类分析,R1和R2群落组成多样性较为相似,与R4不同.表明施肥方式不仅改变木薯根际土壤细菌的多样性与相对丰度,也在一定程度上改变了木薯根际土壤群落结构,尤其增加了木薯根际土壤有益细菌的数量,提高了木薯产量.

【目的】通过对胡杨林根围土壤和背景土壤的理化因子测定及数据分析，对其根围土壤中丛枝菌根真菌（ａｒｂｕｓｃｕｌａｒ ｍｙｃｏｒｒｈｉｚａｌ ｆｕｎｇｉ，简称ａｍ真菌）孢子分离与鉴定以及对其根系共生ａｍ真菌进行群落构成进行分子鉴定，分析荒漠生态系统中胡杨幼苗ａｍ真菌共生状况和群落结构特点，以探讨荒漠生态系统中胡杨根际共生ａｍ真菌生态学功能及其对地上植物群落结构的影响。【方法】在新疆艾比湖国家自然湿地保护区，分别采集胡杨保护林中７株胡杨幼苗根围土壤及根组织。对土样理化因子进行测试并采用ｓａｓ软件对数据进行统计分析。采用湿筛法对胡杨根围土壤中ａｍ真菌孢子进行分离，压片法进行孢子鉴定，并计算ａｍ真菌孢子．．．

【目的】探究寒温带落叶松林建群种差异对土壤真菌多样性的影响，以期为落叶松林群落构建和土壤真菌多样性的维持机制研究提供依据。【方法】在大兴安岭落叶松林监测样地内进行植被调查，计算落叶松的重要值并以此为实验处理，采用Illumina MiSeq高通量测序技术对土壤进行测序，解析建群种差异下土壤真菌的群落组成和多样性的变化特征，并探讨影响其变化的土壤环境因素。【结果】落叶松林的土壤理化性质具有显著差异（P <0.05），其中土壤AP含量随落叶松重要值升高而显著升高，SOC、MBC、pH值和C/N为显著下降。测序获得土壤真菌14门47纲96目176科298属463种，其中担子菌门和子囊菌门为优势真菌门，除毛霉门外，其余菌门的相对丰度具有显著差异（P <0.05）。各落叶松林的优势属存在不同，并且各菌属的相对丰度差异显著（P<0.05）。Chao1、Shannon和Simpson指数结果表明落叶松林土壤真菌的Alpha多样性无显著差异（P>0.05）,NMDS分析表明落叶松林土壤真菌Beta多样性具有极显著差异（P=0.001），土壤pH值、AN、MBC、C/N、SOC、TN、AP和WC是土壤真菌群落结构差异显著的影响因子。功能预测结果表明，土壤真菌以共生型、腐生型和腐生-共生型为主要营养方式，外生菌根真菌为最主要的功能群，其相对丰度随叶松重要值的升高而显著降低（P <0.05）。【结论】建群种重要值差异的落叶松林土壤真菌群落组成、多样性和潜在功能具有显著差异，土壤理化性质的差异是其主要的影响因素。

在前期研究发现,韭菜处理可以减轻香蕉枯萎病和根结线虫病害的发生,推测韭菜中含有能抑制病原菌及致死根结线虫的生防菌。对韭菜根际真菌和内生(叶片和根系)真菌的种群结构及多样性进行比较分析,以期为分离鉴定韭菜中抑菌和杀根结线虫的生防真菌提供理论依据。通过Illumina平台对韭菜根际真菌和内生(叶片和根系)真菌样品中的18S rRNA序列进行测序,并进行生物信息学分析。结果表明:从韭菜根际土壤、根系、叶片中获得348 484高质量序列和123个操作分类单元(OTU)。根际真菌的Chao、ACE、Shannon指数显著高于内生真菌(叶片和根系),而Simpson指数则显著小于内生真菌。根际真菌群落主要由子囊菌门(Ascomycota)(67. 20%)和担子菌门(Basidiomycota)(24.44%) 2个菌门组成;而内生真菌主要由子囊菌门组成,在叶片和根系中含量分别为91. 39%和96. 60%。在检测到的5个菌门中,内生真菌中子囊菌门显著高于根际土壤,其他菌门则显著低于根际土壤。叶片和根系中内生真菌稍有不同,但是差异并不显著。该研究表明,韭菜根际真菌和内生真菌的种群结构存在显著差异,根际真菌的多样性及丰富性显著高于内生真菌。该研究为分离鉴定韭菜中抑制植物病原菌及致死根结线虫的生防真菌提供参考。

【目的】通过研究根结线虫病患病烟株与健康烟株根际土壤真菌群落结构及多样性，明确烟草根结线虫病发生的微生态机制。【方法】利用Illumina MiSeq高通量测序技术分析根结线虫病患病烟株与健康烟株根际土壤真菌群落结构和土壤养分变化特征。【结果】根际土壤真菌OUTs数健康烟株与病株分别为2120个和1170个，健康烟株土壤真菌OUTs数是病株的1.81倍，特有OTUs数是病株的3.31倍；病株根际土壤的Shannon、ACE和Chao1等指数分别较健康烟株降低了12.16%、52.96%、50.40%。病株根际土壤中桑尼被孢霉（Mortierellasarnyensis）、未分类被孢霉菌属（unclassified＿g＿＿Mortierella）、未分类真菌界（unclassified＿k＿＿Fungi）和未分类青霉菌属（unclassified＿g＿＿Penicillium）的相对丰度较健康烟株分别增加了139.01%、134.83%、203.27%和361.94%，且差异均达到显著水平（P＜0.05）；根际土壤真菌群落组成的PCoA分析结果表明，健康烟株与病株根际土壤真菌物种组成存在明显差异。烤烟根际土壤真菌群落结构与土壤养分变化存在一定相关性，其中土壤pH与土壤常见病原菌镰刀菌属（Fusarium）呈显著负相关，水解氮、有效磷和速效钾等土壤养分与土壤有益微生物被孢霉属（Mortierella）呈极显著正相关。【结论】烟草根结线虫病发生明显降低了真菌OUT丰度，影响烟株根际土壤真菌群落的分布和相对丰度。根际土壤真菌群落与土壤养分互作，共同影响根结线虫病的发生。

【目的】分析手参[Gymnadeniaconopsea(L.)R.Br.]根际土壤真菌群落多样性及与土壤环境因子的相关性，为探究手参人工栽培、生态种植等资源保护及可持续利用提供参考。【方法】采用Illumina MiSeq 高通量测序技术对内蒙古阿鲁科尔沁旗、东乌株穆沁旗和翁牛特旗手参根际土壤真菌群落的多样性进行高通量测序和分析，并对植株根际土壤理化性质与相关性进行分析。【结果】手参根际土壤呈酸性，富含有机质和速效钾，但少氮低磷，且不同分布区土壤理化性质差异显著。从3个分布区土壤样品中共获得 5125个OTUs，隶属于11门、31纲、65目、161科、158属。在门水平，3个分布区手参根际土壤真菌的优势菌门均为子囊菌门（Ascomycota）和担子菌门（Basidiomycota）。在属水平，毛舌菌属（Trichoglossum）、湿伞属（Hygrocybe）、被孢霉属（Mortierella）为手参根际土壤真菌的优势类群。Alpha多样性指数表明，3个分布区手参根际土壤真菌群落多样性和丰富度总体趋势表现为阿鲁科尔沁旗（A1）>东乌珠穆沁旗（D3）>翁牛特旗（W2）；Beta多样性指数表明，3个分布区手参的根际土壤真群落组成存在一定差异。土壤全钾、全磷、全氮和水分含量可能是影响内蒙古地区的手参根际土壤真菌群落组成的关键因子。湿伞属（Hygrocybe）和锁瑚菌属（Clavulinopsis）与土壤环境关键因子呈显著正相关；而具有致病特性的肉座菌属（Hypocrea）和镰刀菌属（Fusarium）与土壤环境关键因子呈显著负相关。【结论】明确了内蒙古地区分布的手参生长的土壤条件及根际土壤真菌群落特征，在3个分布区中，阿鲁科尔沁旗手参根际土壤真菌群落多样性和丰富度最高。土壤理化性质对手参根际土壤真菌多样性影响较大，其他影响因素需进一步研究。

以长白山不同恢复时期红松阔叶林群落为研究对象,采用空间序列代替时间序列的方法,探讨了不同恢复时期(恢复20年、30年、70年和原始林)红松阔叶林群落的结构与多样性特征。结果表明:恢复70年的群落中乔木科、属、种特征与原始林相同,而恢复20年和30年的群落则与原始林存在显著差异,物种多度分布曲线也显示了相同的特征。恢复70年的群落与原始林中的物种丰富度及多度随径级和高度级的分布形式相同,但恢复20年和30年的群落则与原始林不同,并且缺少大径级和较高的树木。恢复30年的群落中乔木和灌木的物种丰富度最高,而恢复70年的群落则与原始林无显著差异,草本物种丰富度在原始林中最高。乔木Shannon-Wie...

【目的】研究不同林龄红豆树土壤真菌群落结构及多样性，为红豆树人工林土壤质量动态变化和土壤微生物生态学机制的理解提供基础数据，为红豆树人工林的可持续经营提供依据。【方法】以红豆树幼龄林、中龄林和成熟林为研究对象，采用Illumina Miseq测序平台，分析了土壤真菌群落的Alpha多样性、真菌群落结构组成，群落多样性与环境因子的相关关系，并对土壤理化性质与真菌群落相关性进行分析。【结果】1）α多样性指数表明，幼龄林和中龄林、成熟林土壤真菌多样性差异显著，红豆树幼龄林土壤中真菌多样性高且分布均匀；成熟林土壤真菌的数量和丰度最大；2)3个林龄的土壤样品中共检测到真菌26个门，67个纲，101个目，127个科，145个属。子囊菌门和担子菌门丰度占真菌总量的74.2%～90.2%。中龄林和成熟林土壤真菌群落结构相似度较高。3个林龄土壤中前3位优势菌纲为：银耳纲、粪壳菌纲和散囊菌纲。RDA分析表明土壤速效钾、有效磷、全钾和pH是影响真菌群落的主要因子。【结论】土壤真菌群落结构和多样性指数在不同林龄间有一定差异，幼龄林和中龄林、成熟林的群落结构差异显著，中龄林和成熟林的真菌群落结构多样性差异较小。随着林龄的增大真菌多样性增加，本研究结果为不同林龄红豆树土壤肥力和土壤微生物群落结构研究提供理论支撑。

【目的】对半红树药用植物杨叶肖槿（Thespesia populnea）内生真菌的多样性及其抑菌活性进行研究，为开发生态友好型抗菌剂提供参考依据。【方法】采用形态学和分子生物学相结合的方法，对广西北部湾沿海杨叶肖槿茎、叶和树皮组织中的内生真菌进行分离鉴定。选用从柿树、核桃、荔枝中分离的炭疽菌（Colletotrichum）、香蕉枯萎病菌尖孢镰刀菌古巴专化型FOC1(Fusarium oxysporum f. sp. cubense 1）和FOC4（Fusarium oxysporum f. sp. cubense 4)、黄瓜瓜链格孢菌（Alternaria cucumerina）6种植物病原真菌、白骨壤内生真菌链格孢菌（Alternaria alternata）和罗非鱼海豚链球菌（Streptococcus iniae）为指示菌，通过平板对峙法和滤纸片法对杨叶肖槿内生真菌提取物进行抗真菌和抗细菌活性筛选。【结果】从杨叶肖槿中共分离纯化出60株内真生菌，分属于5个属25个种。其中，炭疽菌属（Colletotrichum）和间座壳属（Diaporthe）为优势菌属，分离率为48.33%和26.67%；其余菌属分别是葡萄座腔霉属(Botryosphaeria)、亚隔孢壳属(Didymella)和小隐孢壳属(Cryptosporella)，对应的分离率为15.00%、6.70%和3.33%。从杨叶肖槿树皮组织分离到的菌株最多，共分离到4个属23株菌，占总分离量的38.33%；其次为叶片组织（31.67%）和茎组织（30.00%）。发现12株内生真菌与NCBI数据库已公布ITS rDNA序列相似性低于95.00%，为潜在新种。抑菌结果表明，炭疽菌J1-20对8种指示菌均有较强的抑菌活性，对柿树炭疽菌、核桃炭疽菌、荔枝炭疽菌、香蕉枯萎病菌FOC1和FOC4、黄瓜瓜链格孢菌、白骨壤链格孢菌的抑菌率分别为39.39%、25.00%、19.10%、32.43%、28.20%、89.00%和74.19%，对罗非鱼海豚链球菌的抑菌圈为21.00 mm。【结论】杨叶肖槿内生真菌多样性丰富，分布较均匀。其中J1-20菌株对8种指示菌具有广谱抑菌性，有较好的开发潜力。

【目的】探明落叶松针叶和梢的内生真菌多样性和群落结构的差异与落叶松枯梢病发病的关系，为落叶松枯梢病的防控提供参考。【方法】基于高通量测序技术，通过OTU数量、鉴定类群、多样性指数及FUNGuild营养型预测等方法，分析无病斑和染病的针叶和松梢的内生真菌群落结构、多样性和功能营养型的差异。【结果】针叶样品中共计1 091个OTU，梢样品中共计1 083个OTU；针叶样本间差异显著（P＜0.05），全无病斑的针叶内生真菌多样性显著高于染病最重的针叶，无病斑梢与感病梢内生真菌多样性无显著差异；针叶和梢中的优势菌门为子囊菌门（Ascomycota），无病斑的针叶内生真菌优势菌目和属为刺盾炱目Chaetothyriales和Arthrocatena，染病后针叶优势真菌为葡萄座腔菌目（Botryosphaeriales）和新壳梭孢属（Neofusicoccum），梢中优势真菌目和属为煤炱目（Capnodiales）和小叠孢属（Microcyclosporella）；LefSe分析表明在针叶和梢中真菌群落中共54个显著性差异类群；PCoA分析进一步证实无病斑与染病针叶的内生真菌群落差异显著（anosim R=0.695，P＜0.05）；针叶真菌营养型以病理-腐生营养型真菌为主，染病后病理营养型真菌占优势，梢中真菌营养型以病理-腐生营养型真菌为主。【结论】相较于落叶松梢，针叶内生真菌群落结构变化更显著，病原菌在针叶中富集，进而促进落叶松枯梢病的发展。

【目的】为探究寒温带落叶松倒木分解过程中的理化性质变化特征以及不同分解阶段的真菌组成和多样性的差异,明确真菌在兴安落叶松分解过程中的作用和影响因素。【方法】采用空间代替时间的方法,以不同分解等级的落叶松倒木为研究对象,测定其含水率、总碳、总氮、纤维素、半纤维素和木质素含量,应用ITS rRNA基因Illumina MiSeq高通量测序技术分析真菌组成、相对丰度和生态功能群组;通过冗余分析探讨不同分解等级倒木上的真菌组成和多样性差异以及影响因素。【结果】研究发现:从Ⅰ级到Ⅴ级分解等级,倒木的含水率、总氮、木质素含量显著升高,碳氮比、总碳、纤维素、半纤维素含量显著降低。真菌测序共获得825个可操作分类单元(OTU),分属于9门31纲90目178科291属425种;其中子囊菌门Ascomycota、担子菌门Basidiomycota、被孢霉门Mortierellomycota为各级倒木上真菌群落的优势菌门,并且真菌的相对丰度存在显著性差异。Ace、Shannon和Simpsoneven等Alpha多样性指数在各分解等级间存在不同程度的差异。Beta多样性和冗余分析结果表明:5个分解等级倒木上的真菌被分为3组,子囊菌门与总碳含量和半纤维素含量正相关,担子菌门和被孢霉门与含水率、纤维素、木质素、总氮含量正相关,与总碳含量和半纤维素含量负相关。倒木上的真菌主要被划分为植物病原菌、腐生菌、动植物病原菌、内生菌和外生菌等主要生态功能群组,共包含19个科,各分解等级倒木上的真菌生态功能群组各不相同。【结论】各分解等级倒木上的真菌组成、相对丰度、生态功能群组的不同与其腐烂程度有关;随着倒木分解的进行,腐烂的加剧,其分解基质发生了改变,真菌的组成和多样性也随之发生了变化,出现了真菌群落的演替。综上所述,倒木的理化性质是影响真菌组成和多样性的重要因素。

以湖南省壶瓶山国家级自然保护区生长的9株(3组)不同树龄银杏为研究对象,应用IlluminaHiSeq高通量测序技术,分析银杏叶片组织内生真菌的多样性及群落结构。结果表明:银杏叶片内生真菌群落的多样性、群落结构与组成均存在显著性差异,且随着树龄的增加,叶片内生真菌群落结构差异增大;子囊菌门(Ascomycota)为绝对优势菌门;曲霉属(Aspergillus)、假丝酵母属(Candida)、球腔菌属(Mycosphaerella)等真菌为银杏叶内生真菌群落优势菌属;通过对银杏叶黄酮含量进行检测,发现不同树龄银杏叶的黄酮含量存在显著差异,且随着树龄的增加,3种黄酮醇苷(槲皮素、山奈酚和异鼠李素)含量均呈递减趋势;进一步分析表明,黄酮类化合物作为重要环境因子,可能通过影响优势菌门子囊菌中优势菌属的定殖与生长对内生真菌群落的形成与变化产生显著影响。