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[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
陈建武 汪登强 张燕 段辛斌 刘绍平 陈大庆
采用6对圆口铜鱼(Coreius guichenoti)微卫星引物对长江重庆、沙市、湖口和常熟4个江段的铜鱼(Coreius heterodon(Bleeker))的遗传多样性进行分析。PCR分析结果表明:6对引物均能成功扩增出DNA片段并具有一定的多态性,等位基因数在2～7个。每个群体的平均等位基因数为3.0～3.7,平均观测杂合度(Ho)在0.4844～0.6301,平均期望杂合度(He)在0.4695～0.5622,多态信息含量(PIC)范围在0.1638～0.7392。有部分微卫星座位在一些群体中偏离哈代-温伯格平衡。遗传距离分析表明沙市群体与常熟群体遗传距离最远,而重庆群体与湖口群体...
关键词：
微卫星 遗传多样性 铜鱼 长江
[期刊] 中国水产科学
[作者]
马波 姜作发 霍堂斌
下游黑龙江茴鱼(Thymallus tugarinae)为黑龙江水系中国境内茴鱼属(Thymallus)新纪录种,也是黑龙江水系特有的珍稀濒危冷水性鱼类。本研究利用7对微卫星引物,对乌苏里江(WS)、黑龙江上游的呼玛河(HM)和额木尔河(EM)3个下游黑龙江茴鱼地理种群的遗传多样性进行了比较研究,以探讨其种群遗传结构及地理分化水平,并为制定保护管理策略提供遗传学依据。结果显示,WS、HM和EM种群的平均等位基因数(Na)分别为18.1、14.4和11.7,平均杂合度(H)分别为0.8165、0.8072和0.8184,多态信息含量(PIC)分别为0.8913、0.8053和0.7577,种群中...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
徐树英 张燕 汪登强 李志华 陈大庆
选用实验室克隆的23个圆口铜鱼(Coreius guichenoti Sauvageet Dabry)微卫星标记分析了长江宜宾江段的圆口铜鱼群体遗传多样性,统计分析了有效等位基因数、观测杂合度Ho、期望杂合度He、多态信息含量(PIC)等遗传学指标。结果表明:23个位点有14个微卫星位点呈单态,9个位点出现多态,在这9个位点中共检测到48个等位基因,其平均有效等位基因数为5.3,多态信息含量在0.440～0.839之间变动,平均为0.670,除YT17和YT22位点属于中度多态外,其余7个位点均属于高度多态。平均观测杂合度为0.753,平均期望杂合度为0.728,表明该群体的遗传多样性较为丰富...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
于悦 庞美霞 俞小牧 童金苟 沈建忠
利用１０个高度多态的微卫星标记对采自长江、赣江、鄱阳湖湖口和都昌水域的４个鲢野生群体遗传结构进行分析。检测到１４８个等位基因，每个微卫星位点的等位基因数５～２４，有效等位基因数６．４～７．１，平均观测杂合度Ｈｏ为０．８０２～０．８２１，平均期望杂合度Ｈｅ为０．８１７～０．８３９，表明这４个鲢群体遗传多样性较高。鲢群体间的遗传相似系数为０．９２２ ２～０．９４４ １，遗传距离为０．０５７ ６～０．０８１ ０，固定系数Ｆｓｔ值为－０．０１２ ３５～０．００５ ２８，表明这４个鲢群体间遗传一致性高，遗传距离小，群体遗传分化不显著。ＡＭｏＶＡ结果显示遗传变异主要来自群体内，基因流分析认为长江、赣江、鄱．．．
关键词：
鲢 遗传结构 微卫星 长江 赣江 鄱阳湖
[期刊] 水产学报
[作者]
谭杰 孙慧玲 刘萍 杨爱国 燕敬平 刘志鸿 周丽青
运用微卫星DNA技术对仿刺参烟台群体、威海群体、大连群体的3个野生群各20个个体进行了遗传分析。对9个基因位点进行了扩增,共获得了59个等位基因。评估了9对微卫星引物的多态信息含量(PIC),范围在0.5129~0.8794之间。结果表明:3个野生群体的平均杂合度观测值分别为0.6416、0.6595、0.5824,平均杂合度期望值分别为0.7641、0.7161、0.7364;在Hardy-Weinberg平衡条件下,进行了P检验,发现3个群体均有位点发生了显著偏离;对3个群体进行了配对Fst值计算,发现3个群体之间遗传分化较弱。从变异贡献率来看,95.68%的变异来自个体之间,4.32%的...
关键词：
仿刺参 地理群体 遗传变异 微卫星DNA
[期刊] 淡水渔业
[作者]
王伟 周琼 张沙龙 王龙涛 李博 张家波
选用10对微卫星引物,对金沙江观音岩江段圆口铜鱼(Coreius guichenoti)群体的遗传多样性进行研究。统计分析了有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量等遗传学指标,结果显示所选用的10对微卫星引物均表现为高度多态性,共检测到等位基因数84个,平均有效等位基因数为5.4296;观测杂合度0.8000~0.9333、期望杂合度0.7747~0.8414;多态信息含量为0.649~0.753;Shannon’s指数为1.5237~2.2602;Hardy-Weinberg平衡偏离指数为0.0326~0.1277。结果表明该江段圆口铜鱼群体遗传多样性较丰富。
[期刊] 淡水渔业
[作者]
王伟 周琼 张沙龙 王龙涛 李博 张家波
选用１０对微卫星引物，对金沙江观音岩江段圆口铜鱼（Ｃｏｒｅｉｕｓ ｇｕｉＣｈｅｎｏｔｉ）群体的遗传多样性进行研究。统计分析了有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量等遗传学指标，结果显示所选用的１０对微卫星引物均表现为高度多态性，共检测到等位基因数８４个，平均有效等位基因数５．４２９ ６；观测杂合度０．８００ ０～０．９３３ ３、期望杂合度０．７７４ ７～０．８４１ ４；多态信息含量为０．６４９～０．７５３；ｓｈａｎｎｏｎ’ｓ指数为１．５２３ ７～２．２６０ ２；ｈａｒｄｙ－Ｗｅｉｎｂｅｒｇ平衡偏离指数为０．０３２ ６～０．１２７ ７。结果表明该江段圆口铜鱼群体遗传多样性较丰富。
[期刊] 水产学报
[作者]
姬长虹 谷晶晶 毛瑞鑫 朱新平 孙效文
采用34个微卫星分子标记,对长江(湘江、监利、枞阳)、珠江、黑龙江(抚远)鲢共5个群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne)等进行了遗传检测,根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离,以卡方检验估计Hardy-Weinberg平衡,以近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化。同时,基于Nei氏标准遗传距离获得NJ聚类图。共检测出154个等位基因,其中有80个共有基因。位点等位基因1~9个不等,平均等位基因4.666 7,平均有效等位基因2.948 9。5群体平均观测杂合度为0.329 5~0.461 9,平均期望杂合度为0...
关键词：
鲢 微卫星 遗传多样性
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
马骞 林琳 柳淑芳 钟声平 庄志猛 苏永全 唐启升
利用在生长激素(GH)、生长激素释放激素(GHRH)和垂体腺苷酸环化酶激活多肽(PACAP)基因中发现的7个微卫星位点,分析了半滑舌鳎两个野生群体(渤海群体和黄海群体)和1个养殖群体间以及各群体内雌雄个体间的遗传多态性差异。结果表明,7个位点中有4个位点表现出多态性,在3个群体中的等位基因数的分布范围为2～37,平均为9.5;有效等位基因数分布范围为2～28.9,平均为8.4。各位点的平均观测杂合度、平均期望杂合度和平均多态信息含量分布范围分别为0.5145～0.7738、0.5690～0.8671和0.4829～0.8314。群体间的成对FST值及个体分配分析的结果表明,半滑舌鳎野生群体和养...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
潘传燕 臧云鹏 廖梅杰 王印庚 荣小军 张正 李彬 陈贵平
采用FIASCO(Fast Isolation by AFLP Sequences Containing Repeats)方法构建了仿刺参基因组富集CA微卫星序列的基因组短片段文库,筛选得到118条微卫星DNA序列。根据重复单元的排列特点,完美型共83个,占70.4%;非完美型共30个;占25.4%;复合型标记5个,占4.2%。选取其中20条微卫星序列设计引物进行多态性检测,并利用这20对引物对采自中国、韩国(西海岸及东海岸)、俄罗斯和日本沿海的野生仿刺参以及美国沿海的具疣拟刺参进行遗传多样性水平和遗传结构分析。结果表明,所设计的20对引物的扩增产物均具有多态性,其中16个位点为高度多态(PI...
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
邵长伟 廖小林 田永胜 陈松林
采用微卫星标记分析技术,用5个多态性的微卫星标记对来自3个不同国家(中国、日本和韩国)的牙鲆养殖群体进行了遗传多样性研究。研究结果表明,3个牙鲆群体平均等位基因在4.8～5.6之间,平均观测杂合度(H0)在0.3917～0.5643之间,平均期望杂合度(HE)在0.5981～0.6264之间。有多个位点在不同的群体中偏离哈代-温伯格平衡。遗传距离分析表明,中国群体与日本群体遗传距离最近,韩国群体与日本群体遗传距离最远。分子方差分析(AMOVA)表明,群体内遗传变异与群体间遗传变异分别占总遗传变异的92.44%和7.56%,固定系数(Fst)为0.0752(P<0.001),表明牙鲆3个养殖群体...
关键词：
牙鲆 养殖群体 微卫星标记 遗传多样性
[期刊] 水产学报
[作者]
赵广泰 刘贤德 王志勇 蔡明夷 姚翠鸾
利用13个多态性微卫星位点分析了大黄鱼"官井洋优快01"品系F1到F44个选育世代的遗传结构与遗传多样性变化情况。结果显示,随着选育的进行,4个世代群体遗传多样性指标值渐次下降,F1到F413个微卫星位点的平均多态信息含量从0.638下降到0.524,平均等位基因数从5.462下降到4.308,平均观测杂合度从0.779下降到0.532,平均Shannon多样性指数从1.356下降为1.092。F1与其后各代遗传相似系数逐渐减小(从0.7194到0.5813),遗传距离逐渐增加,而相邻世代间的遗传相似性逐步升高,遗传分化指数(FST)渐次变小(F1～F2为0.0619,F2～F3为0.0511...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
李燕平 覃川杰 吕云云 龚全 王均 颉江 文正勇
为研究14个不同养殖群体的黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)遗传多样性及遗传结构，采用8对多态性微卫星引物对14个群体的209尾个体进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示：14个群体的平均等位基因数在8～10之间，平均有效等位基因在5.160～6.882之间，平均观测杂合度在0.633～0.717之间，平均期望杂合度在0.358～0.749之间，平均多态信息含量在0.594～0.681之间，均大于0.5。分子方差分析结果表明：3.69%的遗传变异来自群体间，3.93%来自群体内个体间，92.38%来自所有个体间，变异来源主要来自个体间，其中RB群体和WH群体的遗传分化最大(F_(st)=0.116),ZL群体和XB群体的遗传分化最小(F_(st)=-0.009)。基于遗传距离构建了UPGMA系统树，发现14个群体共分为5个聚类支，HJ、YZ、YH、YB 4个群体聚为一支，HQ和LG单独各自聚为一支，LZ和RB 2个群体聚为一支，DB、ZJ、WH、XH、XB和ZL 6个群体聚为一支。基于贝叶斯的Structure聚类分析同样支持14个黄颡鱼群体可分为5个聚类支，与聚类树的结果吻合。14个黄颡鱼群体的遗传多样性均处于高度多态水平，遗传分化处于低等分化水平。
[期刊] 水产学报
[作者]
梁业松 张维炜 宋飞彪 张娴 刘伊凡 刘晓春 林浩然 骆剑
遗传多样性下降被认为是水产生物经济性状降低的常见原因。虎龙杂交斑作为养殖规模最大的石斑鱼品种，近年来病害增多。为了探究是否由于群体遗传多样性的改变而影响虎龙杂交斑的养殖性状，本研究选用27个EST-SSRs标记，对苗种主产区6个虎龙杂交斑群体进行了遗传多样性和群体遗传结构分析。结果显示，6个群体其平均等位基因数(N_(a))为6.666 7～8.555 6，平均有效等位基因数(N_(e))为 3.511 6～3.959 0，平均观测杂合度0.764 6～0.794 3，平均期望杂合度（H_(e)）0.709 1～ 0.750 4，平均多态性信息含量（PIC）0.662 2～0.706 4。分子方差分析（AMOVA）结果显示，5.70%的遗传变异来自群体间，0.00%来自群体内个体间，94.3%来自所有个体间。主坐标分析（PCoA）也显示差异主要来源于个体。群体间F_(ST)(遗传分化指数)、遗传距离及聚类分析显示，HB和XC群体先聚为一支，再与WT群体聚为一支，GC和QT群体聚成一支，FP群体为独立一支。遗传结构分析显示，所有样本被分为5（K=5）个理论群体，HB群体由FP、WT、XC、GC群体集合而成。研究表明，杂交石斑鱼群体仍具有较高的遗传多样性，具有清晰的分群，杂交品种受亲本近交影响而出现衰退的可能性不高；病原生物的变异和养殖管理不规范可能是导致病害频发的原因。本研究为石斑鱼种质管理和病害防控提供理论依据。
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
李可 马徐发 谢鹏 高萌 郭焱 谢从新 侯杰
利用16对多态性微卫星标记对新疆额尔齐斯河干流北湾河段、支流哈巴河以及乌伦古湖拟鲤(Rutilus rutilus)3个地理群体的遗传多样性及遗传结构进行了分析。结果显示,16个微卫星位点的平均多态信息含量PIC、期望杂合度He和等位基因数AN分别为0.902 9、0.916 8和18.937 5,遗传参数均反映出3个群体较高的遗传多样性水平。乌伦古湖群体的遗传多样性水平略低于哈巴河和北湾群体。主成分分析表明,影响乌伦古湖群体与哈巴河和北湾群体间遗传多样性差异的主要因素可能为盐度。遗传分化指数和UPGMA聚类分析显示3个群体间均未发生种群遗传分化。分子变异分析(AMOVA)显示个体间的变异贡献率为88.47%,仅少部分变异来源于群体间(1.83%),表明拟鲤3个群体间的遗传变异水平较低。
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