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[期刊] 淡水渔业
[作者]
徐树英 张燕 汪登强 李志华 陈大庆
选用实验室克隆的23个圆口铜鱼(Coreius guichenoti Sauvageet Dabry)微卫星标记分析了长江宜宾江段的圆口铜鱼群体遗传多样性,统计分析了有效等位基因数、观测杂合度Ho、期望杂合度He、多态信息含量(PIC)等遗传学指标。结果表明:23个位点有14个微卫星位点呈单态,9个位点出现多态,在这9个位点中共检测到48个等位基因,其平均有效等位基因数为5.3,多态信息含量在0.440～0.839之间变动,平均为0.670,除YT17和YT22位点属于中度多态外,其余7个位点均属于高度多态。平均观测杂合度为0.753,平均期望杂合度为0.728,表明该群体的遗传多样性较为丰富...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
王伟 周琼 张沙龙 王龙涛 李博 张家波
选用10对微卫星引物,对金沙江观音岩江段圆口铜鱼(Coreius guichenoti)群体的遗传多样性进行研究。统计分析了有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量等遗传学指标,结果显示所选用的10对微卫星引物均表现为高度多态性,共检测到等位基因数84个,平均有效等位基因数为5.4296;观测杂合度0.8000~0.9333、期望杂合度0.7747~0.8414;多态信息含量为0.649~0.753;Shannon’s指数为1.5237~2.2602;Hardy-Weinberg平衡偏离指数为0.0326~0.1277。结果表明该江段圆口铜鱼群体遗传多样性较丰富。
[期刊] 淡水渔业
[作者]
王伟 周琼 张沙龙 王龙涛 李博 张家波
选用１０对微卫星引物，对金沙江观音岩江段圆口铜鱼（Ｃｏｒｅｉｕｓ ｇｕｉＣｈｅｎｏｔｉ）群体的遗传多样性进行研究。统计分析了有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量等遗传学指标，结果显示所选用的１０对微卫星引物均表现为高度多态性，共检测到等位基因数８４个，平均有效等位基因数５．４２９ ６；观测杂合度０．８００ ０～０．９３３ ３、期望杂合度０．７７４ ７～０．８４１ ４；多态信息含量为０．６４９～０．７５３；ｓｈａｎｎｏｎ’ｓ指数为１．５２３ ７～２．２６０ ２；ｈａｒｄｙ－Ｗｅｉｎｂｅｒｇ平衡偏离指数为０．０３２ ６～０．１２７ ７。结果表明该江段圆口铜鱼群体遗传多样性较丰富。
[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
陈建武 汪登强 张燕 段辛斌 刘绍平 陈大庆
采用6对圆口铜鱼(Coreius guichenoti)微卫星引物对长江重庆、沙市、湖口和常熟4个江段的铜鱼(Coreius heterodon(Bleeker))的遗传多样性进行分析。PCR分析结果表明:6对引物均能成功扩增出DNA片段并具有一定的多态性,等位基因数在2～7个。每个群体的平均等位基因数为3.0～3.7,平均观测杂合度(Ho)在0.4844～0.6301,平均期望杂合度(He)在0.4695～0.5622,多态信息含量(PIC)范围在0.1638～0.7392。有部分微卫星座位在一些群体中偏离哈代-温伯格平衡。遗传距离分析表明沙市群体与常熟群体遗传距离最远,而重庆群体与湖口群体...
关键词：
微卫星 遗传多样性 铜鱼 长江
[期刊] 水产学报
[作者]
姬长虹 谷晶晶 毛瑞鑫 朱新平 孙效文
采用34个微卫星分子标记,对长江(湘江、监利、枞阳)、珠江、黑龙江(抚远)鲢共5个群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ne)等进行了遗传检测,根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离,以卡方检验估计Hardy-Weinberg平衡,以近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化。同时,基于Nei氏标准遗传距离获得NJ聚类图。共检测出154个等位基因,其中有80个共有基因。位点等位基因1~9个不等,平均等位基因4.666 7,平均有效等位基因2.948 9。5群体平均观测杂合度为0.329 5~0.461 9,平均期望杂合度为0...
关键词：
鲢 微卫星 遗传多样性
[期刊] 淡水渔业
[作者]
范玉顶 张燕 汪登强 孟彦 徐进 曾令兵
本研究采用磁珠富集法分离了10对具有多态性的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)微卫星位点,并对140条长江野生草鱼组成的后备亲鱼群体的遗传结构进行了分析。结果显示:本试验得到的草鱼微卫星序列主要是以2个碱基为重复单位、重复次数在5～22之间的多重复单元,重复次数在10次以上的微卫星序列较易得到多态性;77个微卫星座位中,完美型、非完美型和混合型微卫星标记所占的比例分别为87.01%、2.60%和10.39%;群体遗传分析显示,10个多态性微卫星座位中,除了GC39座位外,其它座位都符合哈迪-温伯格平衡,适用于草鱼群体的遗传结构分析;每个座位检测到3～8个等位基因,平均有效...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
周盼 张研 徐鹏 鲁翠云 孙效文
选取26个微卫星标记对来自长江(监利、邗江)、黑龙江、珠江3个水系的4个野生草鱼(Ctenopharyngodon idellus)群体的遗传多样性进行了检测。结果表明,26个微卫星位点均为高度多态位点,草鱼4个地理群体的多态信息含量(PIC)平均值为0.581 3~0.638 6;共检测出141个等位基因,其中有102个为共有等位基因;每个位点有等位基因2~11个,平均等位基因5.46,平均有效等位基因3.455 6。4个地理群体野生草鱼的平均杂合度在0.711 4~0.804 5之间。群体间遗传固定指数(FST)及AMOVA分析表明,群体间遗传分化并不显著(FST=0.031 73)。基于...
关键词：
草鱼 微卫星 野生群体 遗传多样性
[期刊] 水产学报
[作者]
梁利群 常玉梅 董崇智 孙效文
从网上查询获得鳟微卫星标记30对,并对乌苏里江哲罗鱼的基因组进行遗传多样性分析,结果筛选出10对具多态性的微卫星标记。并用其中6对微卫星引物对17尾乌苏里江哲罗鱼进行基因组DNA扫描检测。用2%的琼脂糖凝胶电泳检测微卫星标记的PCR扩增产物,并对扩增结果进行了统计分析,计算了6个基因座的等位基因频率、杂合度等。结果表明,乌苏里江哲罗鱼等位基因频率为0.0455～0.7857,多态信息含量(PIC)为0.2801～0.6351,杂合度(H)为0.3368～0.6563。统计结果初步表明乌苏里江哲罗鱼的遗传多样性程度处于中等偏下水平。同时,结合资源量下降的事实,建议在保护遗传多样性的前提下对其采取...
关键词：
哲罗鱼 微卫星标记 遗传多样性 乌苏里江
[期刊] 中国水产科学
[作者]
袁希平 严莉 徐树英 汪登强 张燕 陈大庆
利用线粒体DNA控制区序列多态性分析了长江流域铜鱼(Coreius heterodon)和圆口铜鱼(Coreius guichenoti)各4个群体的遗传结构;同时利用9对自行开发的多态性微卫星标记分析圆口铜鱼4个群体的遗传结构。结果显示,铜鱼线粒体DNA(mtDNA)D-loop序列共检出22个多态位点,28种单倍型,平均单倍型多样性指数(h)和核苷酸多样性指数(π)分别为0.849和0.00257。圆口铜鱼线粒体DNA(mtDNA)D-loop序列共检出18个多态位点,28种单倍型,平均单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0.902和0.00424。分子变异分析(AMOVA)结果提示,...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
李燕平 覃川杰 吕云云 龚全 王均 颉江 文正勇
为研究14个不同养殖群体的黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)遗传多样性及遗传结构，采用8对多态性微卫星引物对14个群体的209尾个体进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示：14个群体的平均等位基因数在8～10之间，平均有效等位基因在5.160～6.882之间，平均观测杂合度在0.633～0.717之间，平均期望杂合度在0.358～0.749之间，平均多态信息含量在0.594～0.681之间，均大于0.5。分子方差分析结果表明：3.69%的遗传变异来自群体间，3.93%来自群体内个体间，92.38%来自所有个体间，变异来源主要来自个体间，其中RB群体和WH群体的遗传分化最大(F_(st)=0.116),ZL群体和XB群体的遗传分化最小(F_(st)=-0.009)。基于遗传距离构建了UPGMA系统树，发现14个群体共分为5个聚类支，HJ、YZ、YH、YB 4个群体聚为一支，HQ和LG单独各自聚为一支，LZ和RB 2个群体聚为一支，DB、ZJ、WH、XH、XB和ZL 6个群体聚为一支。基于贝叶斯的Structure聚类分析同样支持14个黄颡鱼群体可分为5个聚类支，与聚类树的结果吻合。14个黄颡鱼群体的遗传多样性均处于高度多态水平，遗传分化处于低等分化水平。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
郑义 鲁翠云 郑先虎 那荣滨 唐富江
为研究移植大银鱼(Protosalanx chinensis)群体的遗传多样性和遗传结构,本研究从大银鱼基因组中筛选了18对多态微卫星引物,对2016—2020年采集的4个水系(8个水体)大银鱼共计281个样本进行群体遗传学分析。共得到172个等位基因,其中等位基因数(N_a)为3～24,平均值为9.600;有效等位基因数(N_e)为1.039～4.595,平均值为2.384;期望杂合数(H_e)为0.035～0.804,平均值为0.507;多态信息含量(PIC)为0.034～0.775,平均值为0.469,其中10个位点属于高度多态位点(PIC>0.5)。群体平均等位基因数(N_a)为3.389～5.389,多态信息含量(PIC)为0.373～0.479,8个水体的群体均处于中度多态水平(0.250.15)。为防止群体遗传衰退,建议将南方和北方作为不同群体进行保护,连环湖作为大银鱼的主要产地,应当进行重点保护。
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
邢智珺 姜虎成 陆伟 钱照君 于宏伟 李家乐
利用8个微卫星标记分析了江苏省8个地区(大浦、平望、漆塘、官滩、西顺河、太平、固城、洋河滩)克氏原螯虾的遗传多样性。研究表明:8个群体全部64个位点经Bonferroni法校正后均显著偏离Hardy-Weinberg平衡且绝大多数位点显示杂合不足。8个群体中大浦群体遗传多样性水平最高,平望群体遗传多样性水平最低。群体间遗传分化指数FST及AMOVA分析表明,8个群体遗传分化指数为0.126,存在中等程度的分化(0.05
关键词：
克氏原螯虾 遗传多样性 江苏 微卫星
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
郑嫩珠 董晓宁 郑丽祯 陈晖 李慧芳 朱志明 宋卫涛 缪中纬 孙世坤
利用筛选出的6个微卫星标记对福建德化黑鸡、白绒乌鸡、金湖乌鸡、河田鸡以及江西泰和乌鸡等优良地方鸡种进行遗传多样性分析.结果表明,所选的6个微卫星标记均呈高度多态(平均多态信息含量即PIC均大于0.5).5个地方鸡种的平均杂合度为0.716-0.729,均具有较高的杂合度,表现出丰富的遗传多样性.采用邻结法(NJ)对Ne i氏遗传距离(DA)进行聚类分析,结果表明,5个鸡种被聚为2类,泰和乌鸡与河田鸡先聚为一小类(DA=0.0957),然后再与金湖乌鸡聚为一类(DA=0.1553);德化黑鸡与白绒乌鸡则聚为另一类(DA=0.1980).聚类结果基本反映了各鸡群的地理分布和选育现状.
关键词：
地方鸡种 微卫星 遗传多样性
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
毛守康 马爱军 丁福红 闫喜武 罗海忠 李伟业 徐宝荣 王怀忠 王宝义 王广宁
利用１４对微卫星引物，对采捕于辽宁葫芦岛、山东青岛、江苏连云港以及浙江舟山附近海域的梭鱼（Ｌｉｚａ ｈａｅｍａｔｏｃｈｅｉＬａ）４个野生地理群体进行群体遗传多样性分析。结果显示，１４对微卫星引物均能扩增出清晰的条带且具有一定的多态性，４个野生群体的多态性百分率分别为９２．８６％、９２．８７％、１００．００％和８５．７１％。４个群体共扩增出６１个等位基因，４个群体的等位基因数为３．７８６－４．０００，有效等位基因数为２．６７３－２．８９９，观测杂合度为０．３５９－０．３８９，期望杂合度为０．５０３－０．５６１，多态信息含量为０．４６５－０．５１３，说明４个群体遗传多样性处于中等多态水平。运用ＳＰ．．．
关键词：
梭鱼 地理群体 微卫星 遗传多样性
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