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[期刊] 中国水产科学
[作者]
邢新梅 张研 徐鹏 周盼 刘伟 孙婷 张保勇 蒋丽 孙效文
应用荧光标记的通用引物法,利用100对微卫星标记对高背镜鲤(Cyprinus carpio L.)和低背镜鲤杂交所得F1190个个体的基因组DNA进行分型。利用SPSS软件对100个微卫星标记与鲤的体长、体高、体厚、头长、尾柄长及尾柄高等体形性状进行相关性分析,结果显示有22个微卫星座位与体长、体高、体厚等体形性状显著性相关(P<0.05)。其中CAFS110、CAFS159、CAFS624、CAFS907、CAFS2320、CAFS2321、HLJE319与体长,CAFS254、CAFS1119、HLJE310与体高,CAFS159、CAFS907、CAFS1119、CAFS1737、CAF...
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
赵海燕 李池陶 贾智英 石连玉 胡雪松
利用微卫星标记技术对形态差异较大的2个德国镜鲤(Cyprinus carpio L. mirror)群体的189尾个体进行研究。利用一般线性模型(general linear model,GLM)对15个微卫星位点与德国镜鲤的体重、体长、体高、尾柄长、尾柄高、头长和头高的关系进行方差分析和多重比较,结果表明微卫星引物MFW1与体重和体长显著相关,与体高极显著相关;引物MFW9与头长显著相关;引物MFW11与尾柄长和头高显著相关;引物MFW29与体长、体高和头高极显著相关,与尾柄高显著相关。利用引物MFW1检出10尾含有座位208/208的个体;利用引物MFW9检出25尾含有座位90/90的个体...
关键词：
德国镜鲤 微卫星标记 相关分析
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
马磊 张晓峰 张天奇 孙效文
利用41个SSRs标记对德国镜鲤抗寒品系F1代的68个个体基因组DNA进行检测,共检测到100个等位基因,各座位等位基因2～4个,片段长度91～376bp,有效等位基因1.4287～3.9454个,观察杂合度0.3676～1.0000,期望杂合度0.3023～0.7521,平均位点多态信息含量0.4059.利用统计软件SPSS的GLM程序,对41个微卫星标记与镜鲤体重、体高、头长和吻长的相关性进行分析.结果表明,标记hlj354与体重、体高、头长显著相关;标记hlj855与体重、体高和吻长显著相关;标记hlj919、hlj585与头长显著相关,标记hlj895、hlj704与吻长显著相关.
关键词：
微卫星标记 镜鲤 生长性状
[期刊] 中国水产科学
[作者]
李建林 唐永凯 陈文华 俞菊华 董在杰 徐跑
根据罗非鱼微卫星遗传图谱,在不同的连锁群上随机选择30个微卫星位点,研究它们在192尾不同家系吉富罗非鱼(Genetically Improved Farmed Tilapia,GIFT)中的遗传多样性及这些位点与体质量、体形性状的相关性。结果表明,30个位点共检测出126个等位基因,片段长度124～310bp。各位点等位基因数为1～7个,平均等位基因数4.2个;多态信息含量(PIC)为0.2594～0.7167,平均0.5808;杂合度(H)为0.3064～0.7531,平均0.6322,表明该吉富罗非鱼群体遗传多样性比较丰富。最小二乘方差分析结果显示,位点GM041、GM542和GM304...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
鲁翠云 徐浩 张明昭 顾颖 李超 程磊 邱高峰 孙效文
利用镜鲤(Cyprinus carpio L.)全同胞家系68个个体,分析其眼径(ED)和眼间距(EC)与164个细菌人工染色体文库(bacterial artificial chromosome,BAC)末端序列来源的微卫星标记的相关性。结果164个微卫星标记共检测到401个等位基因,463种基因型,利用GLM模型对每个标记与对应的性状做回归分析,Permutation 10 000次检验结果显示,共22个微卫星标记分别与眼径和眼间距具有显著相关性(P<0.05),其中CAFS1526等6个标记仅与眼径具有显著相关性(P<0.05),CAFS0882等11个标记仅与眼间距显著相关(P<0.0...
关键词：
镜鲤 眼径 眼间距 微卫星标记
[期刊] 淡水渔业
[作者]
顾颖 鲁翠云 张芹 李超 屈长义 王兆平 程磊 孙效文 冯建新
用３５个镜鲤微卫星ＱＴＬ标记评估了豫选黄河鲤（Ｃｙｐｒｉｎｕｓ Ｃａｒｐｉｏ ｖａｒ．ｈａｅｍａＴｏｐＴｅｒｕｓ）群体的遗传结构，并评估了不同基因型与生长性状（体重、体长、体高和体厚）的相关性，筛选了在群体中具有性状优势的基因型。３５个微卫星标记在２８８个豫选黄河鲤个体中的扩增结果显示，各标记等位基因数为３～１３，平均每个标记６．８２８ ６个；平均有效等位基因数为４．５２０ ８；平均观测杂合度为０．６０３ ０；平均期望杂合度为０．７０１ ９；平均多态信息含量为０．６６５ ６，群体整体处于高度多态水平（ｐｉＣ＞０．５）。利用ｓｐｓｓ１９．０的ＧＬｍ模型分析标记与性状的相关性，共１７个微卫星标记与．．．
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
池喜峰 贾智英 李池陶 石连玉
用30对微卫星引物对易捕性状人工选育鲤(Cyprinus carpio)的4个连续世代共计154个个体进行了遗传分析。4个世代(F1-F4)的平均等位基因数分别为7.7619、6.9189、5.0889、4.6667;平均多态信息含量分别为0.6215、0.7512、0.7314、0.7431;平均观测杂合度分别为0.7730、0.7135、0.7593、0.7196,人工定向选育已对群体的多样性造成了影响。Hardy-Weinberg平衡的卡方检验及F-检验数据显示人工累代选育已经使群体的遗传结构发生了变化,并开始趋于稳定,表现为偏离平衡的位点逐代增加,相邻世代之间遗传分化系数逐代减小。FS...
关键词：
鲤 选育群体 微卫星 遗传变异
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
孙桂荣 田亚东 康相涛 邓雪娟 李明 李国喜 韩瑞丽 王彦彬 黄艳群 石建周
利用最小二乘法拟合线性模型,探索了与鸡体型参数和屠体性状紧密相关的10个微卫星座位与商品代固始鸡体型参数和屠体性状的关系。用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳法,分析了这10个微卫星位点在100只商品代固始鸡中的遗传变异,计算了微卫星位点的等位基因频率、杂合度、多态信息含量和有效等位基因数。结果表明,其中8对微卫星引物表现出多态,平均每个座位检测到3.625个等位基因(3~4个),平均多态信息含量为0.520 3,平均杂合度为0.626 0。通过最小二乘分析,检测到MCW0295、MCW0006、MCW0185、ADL0192位点与体型参数中的5种性状间存在不同程度的关联性;MCW0006、MCW0185...
[期刊] 水产学报
[作者]
孙国华 杨建敏 孙孝德 宋志乐 王卫军 刘小静
运用单标记分析法分析了10个微卫星位点与控制体重、体长数量性状的QTL的连锁关系。10对微卫星引物在8月龄具有生长性状差异的60个刺参个体基因组DNA中扩增得到50个等位基因,每个微卫星位点等位基因数3～7个,平均有效等位基因个数5.0。10个微卫星位点的多态信息含量为0.268 0～0.825 6不等,观测杂合度为0.083 3～0.666 7。采用SPSS软件对刺参的体重、体长生长性状和微卫星位点相关性进行分析,结果显示,微卫星位点AjSSR02基因型AB、AD、CD与体重和体长相关,AjSSR04标记中等位基因A对生长性状有正面影响,位点AjSSR06基因型FF个体仅平均体重与其他基因型...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
佟广香 匡友谊 张超 尹家胜 孙效文
利用22个微卫星标记对野生哲罗鱼(Hucho taimen)F1代4个家系、176个个体的基因组进行分析。首先利用SPSS软件对体长、叉长、头长、吻长、口裂长、口裂宽和眼径等7个性状进行正态分布检验,7个性状都显示出连续变异的特点,属典型的数量性状或者多基因遗传,符合正态分布;其次用GLM程序对22个微卫星标记与性状进行相关性分析,并将与性状显著相关的标记进行基因型之间的多重比较,结果显示22个微卫星座位中,有10个标记至少与一种性状显著相关,其中与口裂长和眼径相关的标记最多的为7个;多重比较可知每个标记中同一性状均有部分基因型差异达到显著水平。这些标记为哲罗鱼进一步的分子标记辅助育种提供了基...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
肖同乾 鲁翠云 李超 曹顶臣 程磊 孙效文
选用来源于鲤基因组中的鳞被相关基因(ant、eda、edar、fgfr)及其上下游序列中的155个微卫星标记,对德国镜鲤(Cyprinus carpio L.)与黑龙江野鲤(Cyprinus carpio haematopterus)杂交的F2 116尾个体的遗传多样性进行检测,以卡方检验估计群体Hardy-Weinberg平衡。结果表明,36个微卫星标记表现为多态,各标记的等位基因数在2~4个浮动,共检测到86个等位基因,平均每个标记2.388 9个;平均有效等位基因数为2.209 4;平均观测杂合度为0.624 5;平均期望杂合度为0.529 2;平均多态信息含量为0.432 1,其中23...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
鲁翠云 曹顶臣 孙效文 梁利群
用微卫星标记辅助进行镜鲤(Cyprinus carpio L.)家系的建立及选育,通过对亲本遗传结构及遗传差异的分析,预测产生优良家系的最佳配组。用28个微卫星分子标记评估松浦镜鲤亲本群体的遗传潜力,结果显示,群体的多态信息含量(PIC)达到0.5627,处于高度的遗传多样性水平,具备进一步繁育筛选优良群体的潜质。用x2检验和遗传偏离指数(d)估计Hardy-Weinberg平衡,结果表明群体处于平衡状态,但在16个位点表现出杂合子缺失,这可能跟长期的人工选择有关。依据个体间的遗传距离,连续2年共建立1对1亲本的繁育家系70个,用网箱分别养殖,2月龄家系体长均值为7.24～10.60cm,体质...
关键词：
微卫星 镜鲤 家系选育
[期刊] 中国农业科学
[作者]
梁杜 王金富 李岩 赵洁 张成先 赵燕 廖和荣
【目的】构建具有冠型性状记录的鸡F2资源群的2号染色体连锁图谱,并结合表型分析对调控鸡冠型性状的基因进行初步定位。【方法】通过测交选择豆冠冠型基因型纯合的吐鲁番斗公鸡2只和玫瑰冠冠型基因型纯合的玫瑰冠母鸡6只为亲本,采用F2代试验设计建立F2代资源群436只,参考EL(East Lansing)家系的遗传连锁图谱,在鸡2号染色体上筛选14对微卫星标记,运用MapMaker/EXP3.0软件初步构建此家系2号染色体遗传连锁图谱,同时运用LOD记分法进行鸡的冠型基因连锁分析。【结果】经χ2检验,F2资源群冠型分化比例符合经典孟德尔遗传学的独立分离规律。在连锁分析中除MCW0157外,其余13个微卫...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李成渤 王桂芝 纪志宾 戈新 李培培 王建华 王建民
【目的】探讨微卫星DNA作为崂山奶山羊泌乳性状遗传标记的可行性。【方法】根据比较基因组遗传图谱,选择奶牛6、14、15号染色体上与泌乳性状相关联的微卫星座位(BM1329、BM143、BM302、CSSM66和BMS0812),对175只崂山奶山羊泌乳母羊进行多态性检测,采用最小二乘方法分析微卫星座位与泌乳性状之间的关联效应。【结果】所选微卫星座位在崂山奶山羊群体中均表现出丰富的遗传多态性,有效等位基因、观察杂合度、多态信息含量和近交系数的平均值分别为3.9924、0.4667、0.6748和0.347。基因座CSSM66对乳脂率和300d泌乳量均有显著效应(P<0.05),最有利的基因型分别...
[期刊] 水产学报
[作者]
刘福平 白俊杰 宋红梅 叶星 李胜杰 于凌云
为了筛选到与尼罗罗非鱼生长相关的分子标记,并对这些标记进行准确性鉴定,运用65个微卫星标记对鹭业和番禺2个尼罗罗非鱼群体进行了PCR扩增,再利用SPSS软件一般线性模型(GLM)对这些微卫星位点与尼罗罗非鱼体重等主要生长性状进行了标记性状连锁关联分析。结果表明,鹭业群体中有8个微卫星标记(UNH130,UNH183,UNH911,GM558,UNH211,UNH176,UNH914和UNH974)与主要生长性状显著或极显著相关(P<0.05或P<0.01),其中有2个微卫星标记(UNH914和UNH974)与番禺群体的主要生长性状显著或极显著相关(P<0.05或P<0.01),1个微卫星标记(...
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