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[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
吴兰 葛刚 龚世杰 万金保
通过提取鄱阳湖老爷庙水域水体细菌总DNA,构建细菌16SrRNA基因文库和序列测定等手段,以期揭示鄱阳湖老爷庙水域的细菌群落组成并探讨细菌多样性与湖泊水体理化参数之间的关系。研究结果认为:来自老爷庙水域的2006年10月(PN06-10)和2007年5月(PN07-5)的细菌文库中的180个阳性克隆产生了66个细菌分类操作单位(OTUs),这些细菌主要分属于:变形菌Alpha-纲,Beta-纲,Gamma-纲,Epsilon-纲,拟杆菌门,放线菌门,浮霉菌门,酸杆菌门和OP10等9大类型。2006年10月老爷庙水域的优势菌群为Beta-变形菌;2007年5月优势菌群为Gamma-变形菌和拟杆菌...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
索朗桑姆 何萍 简阅 刘盼盼 徐雨婷 陈诚欣 禄亚洲 兰小中 张二豪
【目的】探究甘青青兰不同组织和根际土壤细菌群落结构组成及多样性。【方法】采用高通量测序技术对甘青青兰根、茎、叶和根际土壤细菌16S rRNA基因V5～V7区进行测序，并对甘青青兰不同组织和根际土壤细菌群落结构组成及多样性进行生物信息学分析。【结果】在甘青青兰不同组织和根际土壤中共获得2351个OTUs，归属29门、76纲、191目、319科和570属，且茎部（DtS）中内生细菌多样性指数最高，根部（DtR）中最低；青青兰不同组织和根际土壤中的优势菌门均是放线菌门和变形菌门；DtL和DtS中的优势细菌属均为芽孢杆菌和土壤红杆菌属，土壤红杆菌属和游动放线菌是DtR中的优势菌属，DtRS中的优势菌属为土壤红杆菌属和Gaiella属；从整体结果来看，茎部（DtS）和叶部（DtL）内生细菌群落结构组成相似，而根部（DtR）和根际土壤（DtRS）中细菌群落结构组成相似。PICRUSt功能预测结果表明，甘青青兰不同组织和根际土壤细菌中富含与黄酮类、黄酮苷类和萜类等物质合成相关的功能基因。【结论】甘青青兰不同组织和根际土壤细菌具有丰富的群落和功能多样性，且部分优势细菌属具有潜在功能价值，为开发利用甘青青兰中有益微生物资源提供了理论参考。
[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
邓志民 张翔 张华 潘国艳 秦学全
近年来，鄱阳湖水位持续走低，极端干旱事件频繁发生，湿地生态系统结构与功能遭受破坏。为此，于２０１４年鄱阳湖湿地保护区两个断面分层采集０～１００ ｃｍ土壤，并采集优势种植物和河湖水以及地下水数据，运用稳定同位素技术，分析了土壤－植物－河湖水－地下水稳定同位素变化特征，并探寻它们之间的补给关系。结果表明，两断面土壤水氧同位素变化范围分别为–１０．４８‰～–５．２３‰和–１２．３９‰～–６．５５‰，算术平均值分别为–８．３６‰和–８．６３‰。断面一表层（０～３０ ｃｍ）土壤水氧重同位素较富集，且随深度增加而减小；断面二表层（０～４０ ｃｍ）土壤水中氧同位素组成基本无变化。断面一的地下水主要是受降水补．．．
关键词：
稳定氧同位素 水分补给 鄱阳湖湿地
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
么宗利 周凯 罗璋 来琦芳 王慧 徐赟霞 应成琦 冯守明
对天津地区盐碱地凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)养殖池塘的细菌种类和垂直变化规律进行了研究。结果表明:池塘中细菌总数维持在2.4×103~8.5×105cfu/mL之间,弧菌总数维持在1.75×102~2.3×105cfu/mL之间,细菌总数和弧菌总数分别在8月份和9月份达到高峰。反硝化细菌总数维持在3.4×104~2.8×105cfu/mL之间,硫酸盐还原菌总数维持在2.9×102~7.5×104cfu/mL之间,氨化细菌总数维持在1.2×102~7.0×104cfu/mL之间。养殖水体中共检测到13种细菌,养殖前期弧菌属、产碱菌属、棒杆菌属为优势菌群;养殖中期产碱菌属...
关键词：
盐碱地 养虾池塘 细菌组成 变化
[期刊] 农业现代化研究
[作者]
圣平 于一尊 田晓娟 黄江丽 张志红 丁建南
本文对鄱阳湖７个河口（赣江、抚河、信江、乐安河、昌江、饶河和修河）水体的理化特性进行了分析，并采用细菌１６Ｓ ｒ ｒＮＡ基因Ｍｉ Ｓｅｑ测序的方法对其多样性和组成进行了研究。结果表明，乐安河水体总氮含量最高，信江水体总磷含量最高。乐安河、修河和饶河水体细菌丰度高于其它河口，而修河、昌江和饶河水体细菌多样性则相对较高。水体细菌群落组成分析结果表明，在７个河口水体中变形菌门细菌均占优势，其次为放线菌门和拟杆菌门细菌。而在纲水平，在７个河口水体中β－变形菌纲细菌占优势，其次为α－变形菌纲细菌和放线菌纲细菌。相关性分析结果表明，水体ｐ Ｈ和细菌群落多样性呈显著负相关关系，而总氮和氨态氮含量和细菌群落多．．．
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
张盛静 赵小金 宋晓玲 张晓静 万晓媛 黄倢
为深入了解人工养殖条件下养殖对虾肠道内菌群结构和携带病毒情况,应用常规细菌分离、培养与纯化,细菌16S rD NA序列分析的方法分析了我国山东、江苏、韩国不同养殖场的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)和中国明对虾(Fenneorpenaeus chinensis)肠道内可培养细菌的总数、优势菌组成和数量,并用巢式聚合酶链式反应(Nested polymerase chain reaction,Nested PCR)方法检测对虾携带病毒情况。结果显示各批次凡纳滨对虾和中国明对虾样品肠道内的可培养细菌总数在105~109cfu/g之间,并对分离出的优势菌进行属(种)鉴定,结果表...
关键词：
对虾 肠道 可培养细菌 优势菌 WSSV
[期刊] 上海水产大学学报
[作者]
杨桂梅 鲍宝龙 李会荣 唐文乔 任大明
采用16S rDNA特征序列PCR-DGGE法,分析了不同饵料饲养的暗纹东方鲀的表皮、肠道和河鲀毒素累积组织(肝和卵巢)中可培养细菌的群落组成。根据分子系统发育分析,共鉴定出45种可培养细菌,在这些细菌中,以变形细菌的gamm a亚群占多数,其它分别隶属于低GC含量革兰氏阳性菌和高GC含量革兰氏阳性菌。摄食不同饵料的暗纹东方鲀,其肠道、表皮或河鲀毒素累积组织中的细菌菌落组成是不同的,但不管是摄食人工配合饲料或天然饵料,在暗纹东方鲀的肠道、表皮或河鲀毒素累积组织中,均发现已有报道的可产河鲀毒素的细菌类群,表明饵料来源对暗纹东方鲀的河鲀毒素产生不是必需的。
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
张晓静 宋晓玲 万晓媛 杨冰 黄倢
采用常规细菌分离、培养与纯化，结合细菌１６ＳｒＤＮＡ序列分析等方法，调查分析了山东、天津、浙江部分苗种场凡纳滨对虾（ＬｉｔｏｐｅＮＡｅｕＳ ｖＡＮＮＡｍｅｉ）和中国明对虾（ＦｅＮＮｅｏｒｐｅＮＡｅｕＳ ｃｈｉＮｅＮＳｉＳ）苗种体内的可培养细菌总数以及优势菌的种类和数量，并用ｐｃｒ的方法检测对虾苗种携带病毒情况。结果显示，凡纳滨对虾和中国明对虾苗种体内的可培养细菌总数均在１０～５–１０～７ ｃＦｕ／ｇ之间，分离出的细菌分属于弧菌属（ｖｉｂｒｉｏ）、发光杆菌属（ｐｈｏｔｏｂＡｃｔｅｒｉｕｍ）、芽孢杆菌属（ｂＡｃｉＬＬｕＳ）、盐单胞菌属（ｈＡＬｏｍｏＮＡＳ）等８个属，其中，弧菌属在对虾苗种体内占绝对．．．
[期刊] 林业科学研究
[作者]
王祥福 郭泉水 刘正宇 任明波 巴哈尔古丽 罗正均
通过样地调查法对崖柏群落的植物组成进行调查,在此基础上对崖柏群落的种子植物区系组成及其特征进行分析,结果表明:以崖柏为优势的群落共出现种子植物73科150属242种,表征科有桦木科、漆树科和荚蒾科,单种科和单种属所占比例较大;植物区系地理成分多样,以温带成分为主,说明以崖柏为优势的群落区系亚热带向暖温带过渡性质明显。区系指数分析表明:世界广布、北温带广布、东亚和北美间断分布对崖柏群落种子植物区系性质影响极大。
关键词：
崖柏群落 种子植物 区系 区系指数
[期刊] 林业科学
[作者]
陈辉 唐明 朱长俊 胡景江
对华山松大小蠹消化道和共生真菌胞外蛋白和酶类组成分析的结果表明 ,华山松大小蠹消化道和共生真菌胞外均可分泌多种酶类 ,其中华山松大小蠹消化道具自身分泌纤维素酶、酯酶、蛋白酶和淀粉酶的能力 ,但不具分泌漆酶等木质素分解酶的能力 ,因此 ,其虽然可以直接利用寄主华山松韧皮部和木质部边材组织内的纤维素、淀粉、多糖、酯类和蛋白等营养物质 ,但不能分解利用木质素类营养。而共生真菌除具有胞外分泌纤维素酶、酯酶、蛋白酶和淀粉酶的能力外 ,还能够在寄主华山松组织内木质素的诱导下分泌漆酶 ,以充分利用华山松韧皮部和木质部内纤维素、木质素、淀粉和脂类物质。此外 ,华山松大小蠹消化道和共生真菌胞外分泌的纤维素酶、酯...
关键词：
华山松大小蠹 共生真菌 消化道 胞外酶
[期刊] 浙江林学院学报
[作者]
支建江 刘勇 张明娟
研究调查了江苏省南京市主城区具有代表性的24个星级广场乔、灌木的物种组成,观赏习性(观花、观果、观叶、观形),应用频率及重要值等。研究结果表明:南京城市广场木本植物种类较丰富,共有53科91属124种(包括种以下单位),其中:乔木类62种,灌木类52种,藤本类6种,竹类4种,但乡土树种应用偏少,骨干树种较单调,观赏植物配植不尽如人意。建议增加观花观果植物、芳香植物及南京市市树市花在南京城市广场的应用。表4参11
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
刘志鸿 牟海津
利用不同血清型的克雷伯氏菌Klebsiella菌株液体发酵,制备胞外多糖,并采用气相色谱和化学分析方法分析胞外多糖的化学组成。结果表明,菌株K26产胞外多糖的能力最高,培养48h和72h的产量分别为3.11mg/ml和3.89mg/ml;各实验菌株的胞外多糖的单糖组成包括甘露糖、葡萄糖和半乳糖。
关键词：
克雷伯氏菌 血清型 胞外多糖 组成分析
[期刊] 淡水渔业
[作者]
阮瑞 吴金平 李营 岳华梅 李创举 乔新美 熊伟 陈细华
为了解达氏鳇肠道微生物组成特征,采集6尾喂养人工配制饲料4周的达氏鳇后肠内容物分别提取DNA,并利用16S r RNA V3-V4变异区扩增子高通量测序的方法分析达氏鳇幼鱼肠道微生物组成与多样性。结果显示:6个样本共获得541575条有效序列,73个操作分类单元(OTUs)。73个OTUs隶属于7个门,其绝对优势菌群在门、目、科、属分类水平上分别为厚壁菌门(98.253%)、梭菌目(98.216%)、梭菌科(98.137%)、狭义梭菌属(92.892%)。序列注释发现,梭菌属中绝大部分为具有降解糖类为短链脂肪酸功能的Clostridium colicanis。此外,还分布有少量的分节丝状菌(3.99%)、鲸杆菌属(1.22%)等菌群。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘尧 李力 李俊 关大伟 姜昕 沈德龙 杜秉海
【目的】选育在常温(22℃)下对玉米秸秆具有高效稳定腐解功能的微生物复合菌系,明确其菌群组成,以促进选育的复合菌系在中国北方原位还田玉米秸秆中的应用。【方法】采用限制性培养与温度梯度诱导相结合的方法,以山西、山东、北京等省(市)玉米秸秆连续多年还田的土壤样品为菌源,以秸秆失重率、C/N及CMC酶活为筛选指标,获得高效稳定的玉米秸秆腐解复合菌系CSS-1;比较复合菌系不同继代腐解秸秆的失重率、CMC酶活、木聚糖酶活和PCR-DGGE的菌群监测动态变化,评价CSS-1的功能及其组成稳定性;采用克隆文库法,解析复合菌系CSS-1的主要菌群组成。【结果】CSS-1处理玉米秸秆的CMC平均酶活和最高酶活...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
高菲 孙慧玲 许强 谭杰 燕敬平 王清印
利用PCR-DGGE技术研究刺参(Apostichopus japonicus)前肠、中肠和后肠内含物的细菌群落组成。通过软件Bio-rad Quantity one分析DGGE指纹图谱,发现刺参后肠内含物的条带数目显著高于前肠和中肠(P=0.003,P=0.016),表明刺参后肠内含物的细菌多样性最高,其次是中肠;前肠内含物的细菌多样性最低。UPGMA聚类分析发现,不同刺参个体其后肠的细菌群落组成差异最小,前肠的细菌群落差异最大。经DGGE分离、条带切割和序列测定,共获得了13条序列,系统发育分析表明,刺参消化道内含物的细菌群落可主要归属于5大类群,即α-变形菌纲(α-proteobacte...
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