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[期刊] 华北农学报
[作者]
李伟 智慧 王永芳 李海权 刁现民
利用公共数据库已有的ISSR序列信息,检验了29条ISSR引物在谷子等狗尾草属植物基因组的扩增性,其中14条在狗尾草属中有良好扩增,其余15条在狗尾草属中无任何扩增。能稳定扩增的14条引物全为3'-锚定引物,6条5'-锚定引物在狗尾草属中得不到扩增。研究发现AG,GA和CA重复的引物在狗尾草属植物有较好扩增,且多态性强。利用正交试验设计,从Mg2+、dNTP、引物、Taq酶4种因素、4个水平对狗尾草属谷子ISSR反应体系进行优化,确定了适合谷子的ISSR反应体系,在20μL体系中,含1×PCR buffer、Mg2+浓度2.0 mmol/L,dNTP浓度0.25 mmol/L,Taq酶0.4μ...
关键词：
谷子 ISSR标记 狗尾草属
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
赵秀香 苏燕妮 伏颖 赵艳琴 孙宏伟 孙剑萍 吴元华
以烟草靶斑病菌（Ｒｈｉｚｏｃｔｏｎｉａ ｓｏｌａｎｉ）基因组Ｄｎａ为模板，采用单因素和正交设计ｌ＿（１６）（４～５）相结合的方法对影响ｉｓｓＲ－ＰｃＲ反应的主要因子进行优化，并对采自东北三省烟区的２０个烟草靶斑病菌菌株进行ｉｓｓＲ分析，建立了适宜于病菌的ｉｓｓＲ分子标记的最佳反应体系，即２０μｌ的反应体系中含有模板Ｄｎａ ３０ｎｇ，Ｍｇ～（２＋）浓度２．０ＭＭｏｌ·ｌ～（－１），Ｄ ｎｔＰ浓度０．２０ ＭＭｏｌ·ｌ～（－１），ｔａｑ酶１．０Ｕ，引物浓度０．４μＭｏｌ·ｌ～（－１）。利用优化的反应体系从２０个ｉｓｓＲ引物中筛选出１３个多态性和重复性好的引物，对２０个烟草靶斑病菌菌株进行ｉｓｓＲ分．．．
[期刊] 林业科学
[作者]
赵亚琦 成铁龙 施季森 王新民 徐阳 刘伟东 陈金慧
采用L16(45)正交设计,对鹅掌楸属SRAP-PCR反应的5个因素(Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶和模板DNA浓度)在4个水平上进行优化试验,同时对SRAP反应影响较大的Mg2+、Taq酶、模板DNA浓度进行单因素分析。建立鹅掌楸属植物SRAP-PCR最适反应体系(20μL),反应条件为:Mg2+3.0 mmol·L-1,dNTPs0.3 mmol·L-1,引物浓度0.9μmol·L-1,Taq酶2.0μmol·min-1,模板DNA 90 ng,10×PCR buffer 2μL,不足部分以ddH2O补足。利用优化的SRAP体系对鹅掌楸属10个不同地理种源进行遗传多样性分析。筛选出1...
关键词：
鹅掌楸属 SRAP 体系优化 遗传多样性
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
彭木 王秋玉 闫绍鹏
桦剥管菌Piptoporus betulinus作为一种褐腐真菌,是白桦木材的专性腐朽菌,在工业污染物降解和医药领域中起着重要作用。以桦剥管菌为材料,在SRAP-PCR体系优化的基础上,对来自东北主要林区(带岭、塔河、帽儿山以及敦化)不同种群的桦剥管菌进行遗传多样性分析,为桦剥管菌多态性鉴定以及进一步利用提供理论依据。结果表明:用单因素法及均匀设计法优化后的SRAP-PCR体系为10×Buffer 2.0μL、Primer各8μmol/L、dNTP 16 mmol/L、Taq polymerase 2.5
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
张耀元 任彦鑫 禾璐 张雁明 张彬 王兴春 李红英 韩渊怀
利用表型性状和ＳＳＲ标记对山西省４１份青狗尾草资源进行遗传多样性分析。在表型水平，通过分析每份资源的株型、穗型、叶型等１４个表型性状指标的测定结果，发现山西青狗尾草资源具有较为丰富的表型多样性，其中叶片绿色的深浅即叶绿素含量遗传多样性指数最高，为２．７６，其余性状遗传多样性指数也大多保持在２．０左右；大多数青狗尾草的穗型为纺锤形，籽粒颜色和形状分别是青色和纺锤形。通过表型聚类可将山西青狗尾草资源划分为３个类群：第１类主要表现为株高、穗数等整体指标居中；第２类主要表现为植株小，穗数少，单株干重低等；第３类主要表现为植株高大，穗数多，穗重等。聚类分析发现表型多样性与山西特定生态地理区划有一定相关性．．．
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李蕊倩 何瑞 张跃兵 徐玉梅 王建明
【目的】建立镰刀菌ISSR反应体系和进行镰刀菌的ISSR遗传多样性分析。【方法】利用ISSR-PCR技术,对影响PCR扩增效果的一些因素和ISSR引物进行筛选和优化,通过聚类分析图对镰刀菌遗传多态性进行研究。【结果】镰刀菌ISSR-PCR分析最适宜的反应条件是以UBC885为引物,在20μl反应体系中,2.0mmol·L-1Mg2+,0.5UTaqDNA聚合酶,0.2mmol·L-1dNTPs,0.4μmol·L-1引物,30ng的DNA模板,退火温度为52℃。通过对27株镰刀菌进行了ISSR的遗传多样性分析,选用的11个引物共扩增出79个DNA片段,其中多态性位点为65个,占总扩增片段的82...
关键词：
镰刀菌 ISSR-PCR 遗传多样性
[期刊] 华北农学报
[作者]
肖海峻 徐柱 李临航 马玉宝 曹授俊
为进一步了解鹅观草属种质资源的遗传背景和拓宽牧草育种的遗传基础,科学指导鹅观草属种质资源的收集、评价和利用,利用ISSR(Inter simple sequence repeat marker)标记对鹅观草属20个种,6个变种,共60份材料进行了遗传多样性检测。结果发现,被测材料间ISSR标记的多态性较高,在20个引物中,有16个引物可扩增出清晰且重复性好的DNA片段,共产生125条DNA片段,其中104条具有多态性,多态性比率为83.20%;每个引物可扩增出6～10条DNA片段,平均7.81条,材料间遗传相似系数GS变幅为0.188～0.879,平均值为0.375;聚类分析表明,在遗传相似系...
[期刊] 华北农学报
[作者]
闫伟红 徐柱 李临杭 马玉宝
利用ISSR分子标记技术,对采自内蒙古、河北、山西、宁夏、甘肃和吉林6省区,经引种栽培筛选出的5种12个冰草属植物居群,进行DNA分子水平的遗传结构分析和评价。构建了国内冰草属ISSR-PCR扩增反应体系。研究结果表明:供试材料共检测出88条谱带,其中多态性谱带83条,多态性条带的比例为94.32%,表明供试材料遗传多态性丰富。不同物种居群间遗传多样性丰富程度不同,蒙古冰草遗传多样性最大,其次为冰草,光穗冰草最小。种间遗传分化占冰草属物种遗传多样性的56.35%,冰草物种地区间遗传多样性高于地区内遗传多样性。UPGMA聚类结果显示,同种不同材料基本能够聚在一起,但有交叉现象,部分材料表现出地域...
关键词：
冰草属 ISSR 遗传分析 居群
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
令狐斌 侯思宇 孙朝霞 黄可盛 路阳 韩渊怀 许冬梅
通过正交试验设计,比较苦荞序列相关多态性-聚合酶链式反应(Sequence related amplified polymorphism-polymerase chain reaction,SRAP-PCR)扩增反应体系的组合,选出最佳扩增体系用于苦荞SRAP分子标记进行遗传多样性分析。其中最佳SRAP-PCR反应扩增体系为Taq DNA聚合酶2 U、Mg2+1.5 mmol/L、DNA模板75ng、引物0.5μmol/L。从238对SRAP引物组合中筛选出20对多态性较高的引物组合,并对15个苦荞品种进行遗传多样性分析。结果表明:20对引物组合共扩增出128个位点,其多态性信息量(Polym...
[期刊] 财经研究
[作者]
朱象贤
近一个时期,全国正实施中央关于加强和改善宏观调控的一系列政策措施。建立适合于市场经济的宏观调控体系已到了一个关键时刻,绝不能再延误时机了。党的十四大提出建立社会主义市场经济以来,市场建设步子在加大,市场调节功能
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
黄树军 黄婷 肖永太 荣俊冬 杨阳 何天友 陈凌艳 郑郁善
采用单因素试验方法,建立了适合大明竹属25个竹种的ISSR-PCR反应体系,优化了各影响因子的用量,筛选出18条有效引物,并确定它们的退火温度,最后对体系进行了检验.优化后大明竹属植物ISSR-PCR的20μL反应体系含2.0μL10×PCR Buffer、2.5 mmol·L-1Mg2+、0.15 mmol·L-1dNTPs、0.5μmol·L-1引物、1.0 U Tap DNA聚合酶、50 ng模板DNA、10.6μL灭菌ddH2O.扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性60 s,55℃复性45 s,72℃延伸90 s,循环40次;72℃延伸7 min,4℃保存.该ISSR-PCR...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李永祥 李斯深 李立会 杨欣明 李秀全
为了比较ISSR和SSR标记在披碱草属(ElymusL.)植物研究中的可应用性,用33个ISSR引物和137对小麦SSR引物对该属12个物种进行了分析。筛选出18个ISSR引物和14对小麦SSR引物可用于遗传多样性分析。12个物种的PCR分析表明,18个ISSR引物和14对SSR引物的多态性位点百分率分别为84%和91%,均表现出较高多态性,基于两种标记的种间聚类状况与物种的倍性水平和形态学相似程度存在较高一致性。在12个种间,ISSR的标记指数MI值(10.2)为SSR(4.3)的2.4倍,表明ISSR具有更大的标记效率;但在亲缘关系较近的肥披碱草、圆柱披碱草、麦宾草和披碱草等4个种间,SS...
关键词：
披碱草 ISSR SSR 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
肖炳光 杨本超
【目的】分析烟草种质的遗传多样性水平,揭示不同烟草类型间的遗传关系,为充分发掘、利用种质提供依据。【方法】对包括不同烟草类型的119份种质进行了ISSR分析,估算其遗传相似系数,利用UPGMA法作聚类图。【结果】利用21个ISSR引物共扩增出672条带,全部为多态性带,其中116条为普通烟草特有带。普通烟草种质间的遗传相似系数变化范围为0.779～0.945,其中烤烟种质间遗传相似系数变化范围在0.812～0.933之间;不同烟草类型基本可聚为相应的亚类或小类,引进烤烟品种与国内品种并未聚为各自类别。普通烟草与其它烟草种间遗传相似系数较小;普通烟草与其假定祖先种N.sylvestris聚为一类...
关键词：
烟草 ISSR 遗传多样性 聚类分析
[期刊] 西南农业学报
[作者]
聂琼 刘仁祥
利用SSR和ISSR标记分析23份烟草种质遗传多样性。结果表明:8个SSR引物和8个ISSR引物分别检测到66个和113个多态性位点。不同烟草种质之间的遗传相异系数在0.3259~0.8588(SSR)或0.1369~0.8161(ISSR)。以SSR、ISSR标记分别聚类以及两种标记混合聚类均在0.63处将23个材料分为4类:2个类群和2个独立个类Coker147、Val16或G140,一类群以红花大金元为基础聚类,另一类群以NC82为基础聚类。两种标记的结果相似,均可用来进行烟草种质资源的遗传多样性分析。
关键词：
烟草 SSR ISSR 聚类分析
[期刊] 西南农业学报
[作者]
胡中会 赵立华 孔宝华 陈海如 范静华 刘飞 李小鹏 蔡红 杨根华 秦西云 方敦煌
采用ISSR和RAPD 2种分子标记方法对来自不同地区的28份烟草赤星病菌进行遗传多样性分析,筛选后选用10个ISSR引物和10个RAPD引物,ISSR扩增出多态性条带112条,多态性条带百分率为86.82%,菌株间相似性系数为0.53～0.97;RAPD引物扩增出多态性条带70条,多态性条带百分率为81.39%,菌株间相似性系数为0.57～0.94;用SPSS17.0软件对2种标记遗传距离进行相关性分析,发现2种分子标记结果呈显著正相关,表明2种分子标记方法都适合于烟草赤星病菌遗传多样性研究,ISSR是一种多态性优于RAPD的标记技术。根据2种标记的结果,利用NTSYS软件按UPGMA方法进...
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