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[期刊] 海洋水产研究
[作者]
刘萍 李健 何玉英 王清印
中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)是我国海水养殖业中最具代表性的一项产业,优良种质和抗病力已成为对虾养殖业中迫切需要解决的问题。在遗传育种中若能筛选到与抗病、生长等数量性状紧密连锁的遗传标记,将为开展标记辅助育种工作和实现良种化奠定基础。对虾种质资源以及种群遗传学已成为研究热点,种群保护也已提到议事日程。这些研究工作的开展将为对虾良种选育提供理论依据,相信随着研究工作的继续深入,人们会更好、更有效地利用对虾资源。本文对目前已经在对虾遗传多样性和系统进化研究中进行应用的DNA标记技术方法进行分析总结,拟对今后其他物种开展相关工作提供借鉴。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
裴颖芳 刘延琳
本文介绍了RAPD、mtDNA-RFLP、微卫星DNA(microsatellite)、Interdelta指纹图谱以及线粒体DNACOX1基因指纹图谱等5种DNA分子标记技术的方法和原理及其优缺点,同时探讨了DNA分子标记技术在国内外酿酒酵母菌株区分中的应用状况与前景。
[期刊] 水产学报
[作者]
崔文涛 邹宇凡 白志毅 王志炎 李典中
为了解安徽地区克氏原螯虾养殖群体的遗传多样性，实验以芜湖（WH）、宣城（XC）、合肥（HF）3个安徽地区克氏原螯虾人工养殖群体为研究对象，分别以铜陵（TL）、马鞍山（MAS）2个安徽野生群体和监利（JL）、建湖（JH）、滆湖（GH）、兴化（XH）4个人工养殖群体作为对照，选用10对克氏原螯虾微卫星引物对其进行微卫星遗传多样性和遗传结构研究。结果显示，安徽地区人工养殖克氏原螯虾群体的平均遗传多样性均高于2个野生群体和江苏、湖北4个地区的人工养殖群体，其中XC群体的遗传多样性最高。9个群体全部10个位点经Bonferroni法校正后均显著偏离Hardy-Weinberg平衡且绝大多数位点显示杂合不足。AMOVA分析表明遗传变异是由群体内部决定的；大多数组的F_(st)表现出中度分化（0.05 < F_(st )< 0.15）。基因流表明不同群体之间存在着广泛的基因交换，尤其是GH和JH群体之间。基于群体间Nei's遗传距离及UPGMA聚类树结果显示，WU群体、GH群体、MAS群体和JH群体聚为一组，XC群体和HF群体同属于一组，而JL群体、TL群体、XH群体分别自成一组。STRUCTUR结果显示，XC群体和HF群体的大多数个体被分配到相同的遗传群中，说明上述群体起源相同。研究表明安徽地区克氏原螯虾人工养殖群体具有较高的遗传多样性，结果为安徽地区克氏原螯虾种质资源的保护和改良，提供了参考资料。
关键词：
克氏原螯虾 遗传多样性 遗传结构 微卫星
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
王豪杰 蔡生力 叶斐菲 刘红
利用AFLP(amplified fragment length polymorphism)技术对4个不同世代的凡纳滨对虾(Litopenaeusvannamei)群体进行遗传分析,探讨亲本、F1、F2和Fn4个世代群体间的遗传差异。选取10对AFLP引物组合对4个世代凡纳滨对虾群体共80尾个体进行比较分析,共扩增出483个位点,其中348个为多态位点;4个群体的多态位点比例为:61.90%、49.28%、50.52%、46.38%;4个群体的Shannon多样性指数分别为:0.3134、0.2621、0.2594、0.2262;结果表明亲本与F1,F2与Fn相互间遗传距离更为紧密。通过对4个...
关键词：
凡纳滨对虾 AFLP 遗传多样性 世代
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
陈华增 李健 何玉英 李吉涛 王清印
利用正交设计L16(45)对影响中国对虾SRAP分子标记分析的5个因素(Taq酶,Mg2+,模板DNA,dNTP和引物浓度)在4个水平上进行了优化,筛选出各反应因素的最佳水平为:20μl反应体系中包含1.0UTaq酶,2.0mmol/L的Mg2+,40.0ng的模板DNA,0.125mmol/L的dNTP以及0.4μmol/L的引物,退火温度为53.5℃。研究表明,各因素的不同水平对扩增结果有显著影响,其中Mg2+影响最大,影响大小顺序依次为Mg2+,Taq酶,引物,dNTP和模板DNA。利用优化的SRAP分子标记体系对中国对虾"黄海1号"第12世代选育群体进行了遗传多样性分析,实验结果表明,...
关键词：
中国对虾 正交设计 SRAP 遗传多样性
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
王军 王清印 孔杰 孟宪红 曹家旺 王明珠 冯亚萍 吕丁
利用微卫星标记技术分析了中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)野生群体(Wild Population,WP)和‘黄海2号’第10代选育群体(Breeding Population,BP)的遗传多样性,以检测累代人工选育对中国对虾群体遗传结构的影响。结果显示,15个微卫星位点共检测到462个等位基因,微卫星位点等位基因数(Na)和有效等位基因数(Ne)分别为344个和229个,多态信息含量(PIC)为0.5180.964。野生群体和选育群体的平均观测杂合度分别为0.852和0.810
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
王军 王清印 孔杰 孟宪红 曹家旺 王明珠 冯亚萍 吕丁
利用微卫星标记技术分析了中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)野生群体(Wild Population,WP)和“黄海2号”第10代选育群体(Breeding Population,BP)的遗传多样性,以检测累代人工选育对中国明对虾群体遗传结构的影响。结果显示,15个微卫星位点共检测到462个等位基因,微卫星位点等位基因数(N_a)和有效等位基因数(N_e)分别为344个和229个,多态信息含量(PIC)为0.5180.964。野生群体和选育群体的平均观测杂合度分别为0.852和0
[期刊] 水产学报
[作者]
张天时 刘萍 李健 孔杰 王清印
利用微卫星技术对中国对虾人工选育群体第1代和第6代群体的遗传多样性进行了分析。对10个微卫星位点进行了扩增,共产生74个等位基因,每个位点产生的等位基因数从3到13不等。在两个群体中,所观察到的等位基因数都比有效等位基因数多。多态信息含量PIC值0.5567～0.8877,说明这10个微卫星位点在中国对虾中具有较高的信息含量。两个群体的平均杂合度分别为0.6400(CP1)、0.6300(CP6),并通过计算基因型的P值,确定了对Hardy Weinberg平衡的偏离情况。对Fis值的计算表明两个群体内共有5个微卫星位点存在杂合度观察值过剩的现象。两个群体的Shannon多样性指数分别为1.6...
关键词：
中国对虾 微卫星 遗传变异 杂合度
[期刊] 水产学报
[作者]
刘连为 许强华 陈新军 闫杰 余为 王从军
为合理开发利用东太平洋茎柔鱼资源,需要准确掌握其种群结构。基于线粒体细胞色素b(Cytb)与细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)2个分子标记对茎柔鱼赤道海域与秘鲁外海2个地理群体的遗传多样性现状进行比较分析。分析认为,基于Cytb基因所有序列得到2个群体总的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为7、(0.397±0.079)、(0.001 09±0.000 96)和0.600,秘鲁外海群体单倍型多样性指数仅为(0.282±0.101),明显低于赤道海域群体。基于COⅠ基因所有序列得到2个群体总的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为17、(0....
[期刊] 水产学报
[作者]
王佳佳 王琼 秦桢 陈耀辉 李健 李吉涛
基于SSR标记研究凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体遗传结构，为凡纳滨对虾种质资源的遗传改良提供基础信息。本研究利用MISA软件对凡纳滨对虾全基因组SSR位点进行搜索，通过聚丙烯酰胺凝胶电泳获得多态性高的SSR标记，基于POPGENE 1.32、PIC-CALC和Mega 6.0软件分析6个不同来源的凡纳滨对虾养殖群体的遗传多样性和群体结构特征。在凡纳滨对虾全基因组数据中共鉴定出10 453 975个微卫星，约占基因组序列总长度的18.56%，其中，二碱基微卫星最丰富，占总数的82.15%。利用具有多态性的14个SSR标记分析3个国内群体桂海1号（CG）、海兴农2号（CH）和山东养殖群体（CT），及3个国外群体厄瓜多尔1号（FO）、厄瓜多尔2号（FT）和墨西哥群体（FM）的遗传特征，结果表明，14个SSR标记在6个群体中共检测到208个等位基因变异，等位基因数、观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量的范围分别为6～25、0.112～0.994、0.234～0.925和0.226～0.918；遗传多样性丰富程度从高到低分别为CH > FO > FM > CT > FT > CG。桂海1号与山东养殖群体、3个国外群体间属于中等程度的遗传分化；聚类分析显示，国内群体桂海1号和海兴农2号聚为一大类，山东养殖群体与国外群体厄瓜多尔1号、厄瓜多尔2号和墨西哥群体聚为一大类。本研究结果表明，筛选的14个SSR标记可用于凡纳滨对虾群体遗传多样性的评估；3个国外群体的遗传多样性相对较高，且与国内群体桂海1号和海兴农2号的亲缘关系较远。本研究对凡纳滨对虾种质资源的开发利用与新品种选育具有十分重要的意义。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
马朝芝 傅廷栋 Stine Tuevesson Bo Gertsson
利用ISSR(inter simplesequencerepeats)技术比较了 2 4份中国半冬性、瑞典冬性和瑞典春性油菜的遗传多样性。 2 0个引物扩增出了 12 5条多态性带。UPGMA聚类分析将 2 4份材料分为 3组。第一组为 6份瑞典冬性和 8份中国半冬性材料 ,第二组为 2个中国半冬性材料湘油 15号和保 81,第三组为 8份瑞典春性材料。主成分分析结果与聚类分析结果相似 ,表明研究所用中国半冬性、瑞典冬性和瑞典春性 3类材料彼此间区分明显 ,中国半冬性油菜与瑞典冬性油菜的遗传关系比与瑞典春性油菜的关系近。结果显示 ,ISSR技术是估计油菜种质资源遗传多样性的有效手段
关键词：
甘蓝型油菜 遗传多样性 ISSR
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
谭云飞 蓬国辉 熊礼静 彭波 吴毅博 宋朝伟 白旭峰
用8个SSR(simple sequence repeats)分子标记分别对我国长江中下游流域的13个克氏原螯虾野生群体的等位基因数(Na)、期望杂合度(He)、观测杂合度(Ho)、多态性信息含量(PIC)、Hardy-Weinberg平衡指数与遗传距离等进行研究。结果显示:各群体不同标记位点的等位基因数为3～5个,平均期望杂合度、平均观测杂合度与多态性信息含量分别分布在0.37～0.57、0.23～0.48与0.40～0.56,表明在这些群体中存在较丰富的遗传多样性。群体遗传距离聚类分析得出:13个克氏原螯虾群体初步分化为3个类群,分别为以太湖(TH)与鄱阳湖(PYH)为代表的类群,以重庆与巢湖为代表的类群和以洪湖、洞庭湖与洪泽湖等为代表的类群。以上结果表明我国具有遗传多样的克氏原螯虾种质资源。
[期刊] 中国水产科学
[作者]
魏鸿擎 张凤英 蒋科技 姜亚洲 孟永永 宋炜 马春艳 程家骅 马凌波
为评估增殖放流对日本囊对虾（Ｍａｒｓｕｐｅｎａｅｕｓ ｊａｐｏｎｉｃｕｓ）群体遗传多样性的影响，本研究分析了放流前捕捞渔获群体（ＦＬＱ）、放流后捕捞渔获群体（ＦＬＨ）以及放流虾苗群体（ＦＬＸＸ）的遗传多样性水平。３个群体共测定了１３５尾日本囊对虾的线粒体Ｄ－Ｌｏｏｐ序列，经比对分析确定测得的序列长度为９３８ ｂｐ，检测到２３７个变异位点，１７７个简约信息位点，定义了１００种单倍型。经分析，核苷酸多样性指数由大到小依次为ＦＬＱ、ＦＬＨ、ＦＬＸＸ，单倍型多样性指数大小为ＦＬＱ＝ＦＬＨ＞ＦＬＸＸ。ａＭｏＶａ分析表明ＦＬＱ和ＦＬＨ群体的遗传分化系数（Ｆ＿（ｓｔ））值为０．００６２９，其小于０．０５，表．．．
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
邢智珺 姜虎成 陆伟 钱照君 于宏伟 李家乐
利用8个微卫星标记分析了江苏省8个地区(大浦、平望、漆塘、官滩、西顺河、太平、固城、洋河滩)克氏原螯虾的遗传多样性。研究表明:8个群体全部64个位点经Bonferroni法校正后均显著偏离Hardy-Weinberg平衡且绝大多数位点显示杂合不足。8个群体中大浦群体遗传多样性水平最高,平望群体遗传多样性水平最低。群体间遗传分化指数FST及AMOVA分析表明,8个群体遗传分化指数为0.126,存在中等程度的分化(0.05
关键词：
克氏原螯虾 遗传多样性 江苏 微卫星
[期刊] 西南农业学报
[作者]
张露 周剑 柯红雨 黄志鹏 赵仲孟 赵瀚 段元亮 牟成艳 李华东 李强
【目的】四川省河流众多，野生日本沼虾资源丰富，为深入了解四川省日本沼虾种质资源现状，开展不同流域日本沼虾遗传多样性评估具有重要意义。【方法】基于线粒体Cytb序列，对四川省巴河（BH）、涪江（FJ）、嘉陵江（JLJ）、岷江（MJ）和思蒙河（SMH）5个日本沼虾野生群体的遗传多样性进行分析。【结果】所有群体的201尾日本沼虾中共检测出36种单倍型，单倍型多样性（H_(d)）值在0.345～0.959之间，H_(d)均值为0.802，其中JLJ群体的H_(d)值最高（0.959），而MJ、SMH和BH群体的H_(d)值相对较低，H_(d)值均小于0.5。所有群体的核苷酸多样性（P_(i)）值在0.002 25～0.015 47之间，P_(i)均值为0.015 83，其中JLJ群体的P_(i)值最高（0.015 47），BH群体的P_(i)值最低（0.002 25）。日本沼虾的遗传变异主要来自群体间（68.20%），群体间存在显著的遗传分化，系统发育树分析显示所有群体呈现3个较明显分支。单倍型MJ网络图显示所有单倍型也呈现3个明显谱系，其中谱系A包含优势单倍型Hap 14，谱系B包含优势单倍型Hap 16，谱系C包含优势单倍型Hap 1。【结论】日本沼虾群体遗传多样性总体上处于较高水平，但不同流域的群体间遗传多样性水平差异较大，其中MJ、BH和SMH群体的遗传多样性相对较低，对这些流域内日本沼虾种质资源的保护有待进一步加强。本研究为四川省日本沼虾种质资源的保护与合理开发利用提供了参考依据，有利于促进四川省日本沼虾产业的可持续发展。
关键词：
素ｂ 基因 遗传多样性
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