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[期刊] 西南农业学报
[作者]
李丽 黄先群 何天久 雷尊国 李其义 彭义 黄贵民
为弄清贵州马铃薯审定品种和2012年区试材料间的亲缘关系和遗传背景,利用10对SSR引物构建了38份参试材料的指纹图谱,并进行遗传多样性分析。结果表明:共检测到113个等位位点,其中64个为多态性位点,多态性比率为57%。每对SSR引物扩增的多态性位点数为4～12个,平均6.4个,多态性信息量变化为0.1445～0.9370,平均0.5098;经聚类分析,在遗传相似系数0.61处,所有参试材料可明显分为3个类群。贵州马铃薯不同品种间的遗传基础较狭窄,同一单位提供的品种遗传关系相近。
关键词：
马铃薯 SSR标记 遗传多样性 贵州
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘建霞 雷海英 温日宇 郭耀东 王润梅 周凤
利用SSR标记技术对山西省12份马铃薯主栽品种进行了遗传多样性分析。从60对SSR引物中筛选出11对多态性高、谱带清晰的引物,共检测到79个等位位点,其中,77个多态性位点,多态性比率达97.5%;S189、S151和STM001这3个引物扩增的DNA指纹图谱差异明显,可作为12份马铃薯品种间鉴别的分子依据;12份材料的遗传距离介于0.209 2～0.626 9之间,平均值为0.421 7。在遗传相似系数为0.632处,将12份材料划分为4类,第Ⅰ类有3个品种(费乌瑞它、大西洋和冀张薯8号),同薯24和紫花白分别归为第Ⅲ类和第Ⅳ类,其余7个品种归为第Ⅱ类(其中全部为山西省选育的马铃薯品种,亲缘...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
黄先群 冉江 黄团 李丽
为了鉴定马铃薯引进品种和变异材料的遗传背景和亲缘关系,利用9对SSR引物对12个引进品种、12个费乌瑞它自然和辐射变异材料进行遗传多样性分析。结果表明:对24份马铃薯参试材料的DNA进行PCR扩增共获得178条扩增条带,其中167个为多态性条带,多态性比率为93.8%,平均每对引物扩增条带数为18.6条。多态性条带中有84.4%的条带大小为120~950bp。24份参试材料的遗传相似性系数在0.479~1.000。聚类分析显示,在遗传相似系数为0.65处,参试材料可明显分为4个类群,全部变异材料均聚在1个类群,品种间的多态性和遗传距离大于变异材料。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
李芳弟 王鹏 窦俊焕 郭天顺 齐小东 王利立
【目的】对四倍体马铃薯F1群体杂种的真伪性进行SSR分子标记鉴定，并对群体与其亲本的遗传多样性进行分析，为加工型马铃薯新品种的选育、种质创新和遗传改良提供理论依据。【方法】将淀粉加工型马铃薯品种天薯10号与炸条加工型品种克新17号进行杂交，获得227份F1群体基因型（KT1KT227）。采用轮筛法从70对马铃薯SSR引物中筛选扩增条带清晰、差异性较强、具有双亲特异条带的引物，利用筛选出的引物分析227份马铃薯杂交后代单株的杂种真伪性和遗传多样性，利用NTSYSpc 2.1软件分析群体和亲本的遗传关系。【结
[期刊] 西南农业学报
[作者]
殷丽琴 彭云强 付绍红 杨进 陈涛 黄敏 余勤 韦献雅 牛应泽
本试验从７０条ＩＳＳＲ引物中筛选出１５条多态性好的ＩＳＳＲ引物，对１０份原产自云南的彩色马铃薯材料进行遗传多样性分析和ＩＳＳＲ指纹图谱构建。结果表明，１５条引物共扩增到１０１条清晰条带，８９个多态性条带，多态性条带百分率为８９．２４％，引物平均多态性位点５．９３，平均多态性信息量０．８２３。聚类分析可将１０份彩色马铃薯划分为４类，其中Ｓ０３－２６７７和Ｓ０３－２６８５的遗传相似系数最大，而紫云１号和Ｓ０６－２７７的遗传相似系数最小。同时筛选到１条核心引物ＡＷ６７７７６，绘制了１０份彩色马铃薯品种的指纹图谱。结果表明ＩＳＳＲ标记能够较准确地按亲缘关系划分彩色马铃薯品种，可为我国彩色马铃薯的品种选．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
唐铭霞 何卫 胡建军 王克秀 陈萍萍 牟文平 杨麟
简单重复序列(SSR)是进行遗传多样性研究的一种有效分子标记。选用四川省现有及引进的马铃薯品系(种)42份,利用已发表的马铃薯SSR引物进行扩增,采用聚类分析方法对供试材料进行了遗传多样性分析。从110对SSR引物中筛选出16对多态性高、扩增稳定、重复性好的引物,16对SSR引物共扩增出130个位点,其中多态性位点116,占总扩增位点的89.2%。利用NTSYS软件进行聚类分析,结果显示四川省栽培的马铃薯品种遗传多样性水平较低,品种间的遗传差异较小。
关键词：
马铃薯 SSR 遗传多样性 聚类分析
[期刊] 中国农业科学
[作者]
张怀山 鄢秀芹 鲁敏 王道平 安华明
【目的】通过分析评价贵州野生刺梨(Rosa roxburghii Tratt)资源居群遗传多样性和遗传结构,为刺梨资源的保护和发掘利用提供科学依据。【方法】从刺梨EST-SSR引物中筛选扩增效果好、多态性较高的10对引物,对收集的12个野生刺梨自然居群(共255份资源)的遗传多样性及遗传结构应用POPGENE 1.31软件进行分析,并根据Nei’s标准遗传距离,利用NTSYS-pc2.10e软件对各居群进行聚类分析,同时进行Nei’s遗传距离与地理距离的Mantel相关性检验。【结果】居群内Shannon
关键词：
刺梨 SSR 遗传多样性 居群遗传结构
[期刊] 华北农学报
[作者]
张德双 张娜 于拴仓 张凤兰 隋光磊 余阳俊 赵岫云 汪维红 苏同兵 卢桂香
芥蓝的研究多集中在分类、常规种资源遗传多样性等方面。随着芥蓝杂交种的问世,杂交种的优势越来越突出,市场效果明显,因此,对芥蓝自交系的遗传多样性等研究尤为重要。选取分布在甘蓝9条染色体上的55对SSR引物,从中筛选出多态性好、分布均匀的15条SSR引物对98份芥蓝自交系进行分析,共得到65个多态性带型。采用UPGMA方法构建了一张聚类图,在相似系数为0.71时,将98份芥蓝自交系初步分为1,2,3,4,5组。研究结果为芥蓝育种中的亲本选配、杂交种鉴定和资源保护等提供了依据。在试配芥蓝新组合时,应选择遗传距离较远的自交系作为重点材料,后代的杂种优势会更显著。
关键词：
芥蓝 SSR 多样性
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘警 李扬 刘金利 张馨方 白仲奎 于秋香
为研究核桃种质资源涩味的遗传多样性,以4个不同核桃涩味群体共118份种质资源为材料,利用SSR毛细管电泳荧光标记技术进行遗传多样性研究,并构建树状聚类图。结果表明:12对引物共检测到93个等位变异位点,变异范围为2～18,平均每对SSR引物可检测到7.75个等位位点;多态性信息量(PIC)为0.357 9～0.785 2,平均0.541 1。4个群体的多态位点数Np为91、多态位点百分率PPB为97.85%、观测等位基因数Na为1.978 5、有效等位基因数Ne为1.198 5、Shannon′s信息指数I为0.209 7、Nei′s多样性指数H为0.126 3、总遗传多样性指数Ht为0.126 7、群体内遗传多样性指数Hs为0.122 2,说明4个核桃群体的遗传多样性和变异度不高。群体间遗传分化系数Gst为0.035 5,说明群体内遗传变异占总变异的96.45%。其中稍涩群体多态性位点百分率最大,为72.04%,说明稍涩群体在4个群体中遗传多样性最丰富。UPGMA聚类分析表明,4个群体的遗传相似系数在0.989 8～0.997 1,群体的整体相似系数高,说明这4个群体的遗传距离很近。当相似系数为0.993 4时,可将4个群体分成2组。其中,第1组包括不涩、稍涩和较涩3个群体,剩余涩群体单独为一组。通过计算不同群体93个位点的基因频率,发现12对引物的41个位点可将不同涩味等级的资源区分开。利用SSR分子标记技术对4个核桃群体进行与涩味相关的遗传多样性分析,根据转录组测序结果筛选出12对引物用于SSR分析,共扩增出93个SSR位点,多态位点百分率为97.85%,说明引物的多态性高,适用于核桃的遗传多样性分析,为培育轻涩味的优良品种提供技术指导,可用于后续核桃涩味的遗传多样性及育种研究。
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
关萍 马丹炜 王贵侠 石建明 陈放
该文利用ISSR分子标记技术,对分布于贵州的药用植物天麻的9个种群的遗传多样性水平和遗传结构进行分析,为传统的中药材天麻的遗传、育种及种质资源的保护和合理利用提供依据.该研究用12条ISSR引物共扩增出120条大小在200~1 600 bp清晰的谱带,其中97条具有多态性,总的多态位点百分率为80.83%,表明在物种水平上有较高的遗传变异;种群水平的多态性相对较低,多态百分率在17.5%~40.83%,平均25.56%.用POPGENE软件计算各种群间和种群内的遗传参数,结果表明:物种水平上的Nei’s遗传多样性(He)为0.042~0.153,平均0.073;Shannon信息指数为0.33...
关键词：
天麻 ISSR 遗传多样性 遗传结构
[期刊] 西南农业学报
[作者]
郭燕 刘声传 曹雨 赵华富 魏杰 鄢东海 周富裕
为了贵州古茶树资源的有效保护和充分利用提供理论依据，采用ＥＳＴ－ＳＳＲ标记对４０份贵州古茶树资源进行了遗传多样性分析和分子指纹鉴定。结果表明：２０个ＳＳＲ标记在４０份资源中共检测到７６个等位基因，平均每个标记３．８个，ＰＩＣ和Ｓｈａｎｎｏｎ信息指数平均值分别为０．４６２和０．９３６，多态性适中。７６个等位基因在参试古茶树资源中的出现频率差异较大，变异范围为１．３２％～８９．７４％。参试材料的ｎＥＩ＇Ｓ遗传距离（Ｄ）为０．０７５～０．８７５，当Ｄ≈０．１６０时，４０份古茶树资源可聚为６类，包括３个单独聚类和３个复合聚类。利用４个核心标记即可鉴定４０份古茶树资源，并根据等位基因带型，获得１８位数的．．．
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
孙海悦 郭瑞雪 王佳卉 盖钰卓 刘禹姗 董梅 李亚东
【目的】探讨越橘ＥＳＴ序列中ＳＳＲ位点的分布规律，开发越橘ＥＳＴ－ＳＳＲ引物，并分析其在越橘品种遗传多样性研究中的作用。【方法】以９１份越橘种质为材料，利用越橘果实转录组（ＲＮＡ－ＳＥｑ）的测序结果，通过ＳＳＲＩＴ在线搜索，利用ＰＲＩｍＥＲ ＰＲＥｍＩＥＲ ５．０软件设计３０对引物，并筛选扩增效果理想的引物，用筛选出的引物分析９１份种质的多态性，构建９１份种质的系统发育树。【结果】３４ ４６４条越橘ｕＮＩｇＥＮＥ序列中含有ＳＳＲ位点的序列有８２９条，ＳＳＲ位点有９１３个，其中二核苷酸、三核苷酸重复是主要的ＳＳＲ类型，分别占全部ＳＳＲ位点的１３．６９％和８１．２７％。不同核苷酸数目重复基元的重复．．．
关键词：
越橘 EST SSR 遗传多样性
[期刊] 西南农业学报
[作者]
林开勤 李悦欣 魏杰 汪安然 喻云春 段长流 王枫 鄢东海
【目的】探明石阡茶树种质资源的遗传多样性和亲缘关系，为开发和保护石阡茶树资源提供理论依据。【方法】利用SSR分子标记技术，对贵州石阡7个茶树群体122份资源进行SSR位点多态性、遗传多样性及亲缘关系分析，并对不同地域来源的石阡茶树资源进行遗传距离分析。【结果】21对SSR引物共扩增出72个多态性位点，每对引物平均扩增3.43个位点，多态信息含量（PIC）为0.19～0.76，平均为0.51，等位基因在群体中分布均匀且多态性较高。7个茶树群体的Nei’s基因多样性指数（He）均值为0.22，Shannon信息指数（I）均值为0.33，多态位点百分率（PPB）均值为75%，遗传距离为0.017 7～0.103 6。122份石阡茶树资源的遗传距离为0.10～0.67，当遗传距离为0.21时，分为3个大类群：第I类群包含113份资源，第Ⅱ类群仅有1份茶树资源(SWXD009)，第Ⅲ类群包含8份茶树资源，分别是SWXD-B、SWXD-F、SWXD-H、SWXD-M、SQT3、SQT4、SWX005和SWX006；在3个大类群中均有五德镇长兴村的茶树资源。【结论】贵州石阡茶树群体间的遗传差异较小，但群体内个体单株之间具有一定的遗传差异，尤其是五德长兴茶树群体内的遗传背景较丰富，筛选优异资源的基础较好。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
王兵伟 覃嘉明 黄安霞 覃永嫒 郑加兴 秦洪波 时成俏
利用SSR分子标记技术对60个玉米自交系进行遗传多样性研究及杂种优势群划分。结果表明:42对引物标记60个玉米自交系共扩增出144个清晰的多态性条带,每对引物可产生2~7个清晰可辨的条带,平均为3.43个,遗传相似系数变幅为0.518~0.978。60个自交系可分为9个类群,分析结果与这些自交系综合性状的差异性表现基本一致。"温带种质×热带种质"是研究中杂种优势利用的主要模式。
关键词：
SSR 玉米自交系 遗传多样性
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