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[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
冷宇鑫 闵义 付阳云 周奎 何颖 文晓鹏
为精准鉴定贵州荞麦种质资源，采用SSR分子标记对60份荞麦种质进行遗传多样性分析，构建DNA分子身份证数据库。结果显示，从100对SSR引物中筛选出16对稳定性好、多态性丰富的引物，在60份供试种质中共扩增出174个多态性条带；Shannon’s信息指数、Nei’s多样性指数、多态信息指数均值分别为0.337、0.206、0.693，引物的多态性较好，能有效揭示60份荞麦种质的遗传多样性；在Dice遗传相似系数为0.374时，所有供试材料可聚为A、B、C三组；当Dice遗传相似系数为0.484时，将苦荞组（A组）更细分为A1、A2两个小组。采用毛细管电泳及8%的聚丙烯酰胺凝胶（PAGE）电泳对SSR标记扩增产物进行双验证，2种方法的聚类结果一致。结果表明，本研究开发的高效性SSR分子标记能够有效地鉴定贵州荞麦重要种质的遗传多样性且用于构建分子身份证。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
何文 蔡兆琴 陈会鲜 张秀芬 黄珍玲 郭素云 阮丽霞 莫周美
【目的】对葛根种质资源进行遗传多样性分析，并构建分子身份证，为葛根种质鉴定提供参考依据。【方法】以收集自不同地区的 21 份葛根种质为试验材料，采用变异系数、Shannon-Weaver多样性指数、聚类分析、ISSR引物多态性研究葛根种质资源遗传多样性，并构建分子身份证。【结果】21份葛根种质资源各遗传性状表现出丰富的多样性，其Shannon-Weaver多样性指数为0.381～1.844，平均值为1.166，其中主茎粗Shannon-Weaver多样性指数最大（1.844）。葛根种质遗传性状变异系数范围为16.330% ～55.714%，平均值为35.157%，其中，成熟叶片花纹变异系数最大（55.714%），其他遗传性状变异系数均大于15.000%。从48条ISSR引物中筛选出10条条带清晰，多态性较好的引物，其多态性比率为40.00%～100.00%；多态性信息含量值（PIC）、等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Nei’s基因多样性（H'）和Shannon’s信息指数（I）分别为0.7043～0.8468、1.4000～2.0000、1.1135～1.4741、0.0776～0.2999、0.1276～0.4720，其平均值分别为0.7800、1.7830、1.3514、0.2160、0.3353。说明所筛选的10条ISSR引物多态性检测效率较高，适合用于葛根种质资源的遗传多样性分析。聚类分析可将供试葛根种质分成3类，部分种质与地理来源存在一定关联性，存在不同地域种质互相引进或交流。按照ISSR引物中PIC值由大到小的顺序，筛选P6、P17和P42作为核心引物，构建葛根种质资源DNA分子身份证。【结论】21份葛根种质资源具有丰富的遗传多样性和较高杂合度，可作为今后葛根育种选育基础材料。筛选出的P6、P17和P42可作为核心引物，能有效区分21份葛根种质资源，并构建分子身份证。本研究为葛根种质资源区分和精准鉴定及葛根种质资源DNA分子身份证的构建提供了理论参考。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
唐源江 曹雯静 吴坤林
【目的】探究国兰种质资源遗传多样性水平,并构建分子指纹图谱及分子身份证,为在分子水平上鉴定国兰种质提供技术支撑,也为国兰种质资源开发、保存利用及种质创新奠定基础。【方法】以收集于华南及邻近地区的139份国兰栽培品种和野生种质为材料,采用改良的CTAB法提取基因组DNA,由13条正向引物和16条反向引物随机组成208对SRAP引物,每对引物用品种‘宋梅’和‘大勋’扩增产物进行筛选;PCR扩增产物应用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,电泳胶图进行人工读带,并计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率。按照Botstein公式计算多态信息含量;用POPGENE32软件计算观测等位基因数、...
[期刊] 华中农业大学学报
[作者]
刘昔辉 张荣华 张革民 周会 宋焕忠 方位宽 区惠平 杨丽涛 李杨瑞
以广西地区的１５份河八王无性系为材料，采用ＡＦＬＰ标记结合毛细管电泳进行分析，计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率。进行遗传相似系数和ＵＰＧＭＡ聚类分析，并建立分子身份证。２５对ＡＦＬＰ引物组合在１５份河八王种质资源中共扩增出２ ２０８个位点，其中多态性位点１ ９１４个，多态性比率（ＰＰＢ）为８７．１１％。ＵＰＧＭＡ聚类分析表明，供试的１５份河八王种质资源其遗传相似系数变化范围在０．６５６～０．８７８，在相似系数为０．７０６时，可划分为３个类群。结合特征带和不同引物组合方法可有效建立河八王种质资源特异分子身份证，置信概率达到９９．９９％。所供试河八王种质具有较丰富的遗传多．．．
[期刊] 中国林业科学研究院
[作者]
李洪果
杜仲(Eucommia ulmoides Oliv.)是我国十分重要的国家战略资源,分布区域广,用途广泛。我国杜仲种质资源丰富,全世界99%的杜仲资源分布在我国。我国杜仲栽培利用历史悠久,由于各地种质资源的频繁交换,杜仲在种质资源收集、保存、评价和鉴定上长期处于低效状态。已收集保存的种质资源存在种质不清和种质混杂等问题,严重制约了长期杜仲育种工作的进程。随着杜仲的引种栽培逐步向良种化方向发展,一些栽培表现普通的种质及群体面临淘汰和分布区进一步缩减甚至消失的压力,而其中的遗传多样性可能随之消失。本研究以中国
[期刊] 中国农业科学
[作者]
侯雅君 张宗文 吴斌 李艳琴
【目的】从分子水平研究苦荞种质资源的遗传多样性,为综合评价苦荞种质资源提供依据。【方法】用筛选出的20对AFLP引物,对14个不同地理来源的165份苦荞种质进行遗传多样性分析。【结果】共扩增出938条清晰的条带,其中314(33.48%)条呈多态性,平均每对引物组合的条带数和多态性带数分别为46.9个和15.7个。不同地理来源苦荞种质的Shannon-Weaver多样性指数为0.1093～0.2661,四川资源群最高,青海、云南和甘肃/宁夏等资源群次之,湖南资源群最低。利用Popgen Ver.1.32软件,依不同地理来源苦荞资源群间Nei′s遗传一致度可聚类成5个组,聚类结果与苦荞地理分布相...
关键词：
苦荞 AFLP 种质资源 遗传多样性
[期刊] 中国农业科学
[作者]
屈洋 周瑜 王钊 王鹏科 高金锋 高小丽 冯佰利
【目的】了解苦荞产区种质资源遗传多样性和遗传结构，为苦荞资源的有效利用提供参考。【方法】采用相关性分析、主成分分析方法对苦荞８个植株性状进行分析；温室内培养苦荞资源，于３叶期，每个资源选取１０株新鲜叶片，采用ＣＴＡＢ方法提取苦荞基因组ＤＮＡ，结合ＳＳＲ分子标记方法进行ＰＣＲ扩增，然后对扩增产物进行电泳检测并照相保存，根据ＳＳＲ检测位点构建［０，１］矩阵，最后利用ＰｏｗｅＲ ＭＡＲｋｅＲ３．２５和ＳＴＲｕＣＴｕＲｅ２．３．４软件对８３份苦荞种质资源进行遗传多样性和群体遗传结构分析。【结果】８个植株性状分布较分散，大部分植株性状间呈现显著相关，植株性状的前４个主成分累计贡献率达到８５．２２％，基本．．．
[期刊] 西南农业学报
[作者]
王春梅 任洪 沈建华 赵晓燕 曹绍书 王竹
利用覆盖玉米基因组的１８对ＳＳＲ引物，对２７０份贵州玉米地方种质资源及六大种质类群代表系进行多样性评价。结果显示：１８对引物供检测１０２个等位基因，平均等位基因数５．７，变幅在２～１０，平均多样性指数为０．５３。根据ＳＳＲ分子标记遗传相似系数矩阵，经中心化变换后，按类平均法（ＵＰＭＧＡ）聚类分析，分为６大类，其中第Ⅱ大类和第Ⅳ大类又分为２个亚群，与贵州玉米地方种质资源的地理来源和系谱一致，六大种质类群代表系各自单独成类。根据聚类分析结果，以２０％抽样比例，最大遗传距离方法构建的核心种质库能最大限度保存原种质库的遗传多样性。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
殷冬梅 王允 尚明照 崔党群
【目的】通过对花生遗传多样性的研究,为花生育种提供理论依据。【方法】运用ISSR和SRAP2种标记对24份重要花生种质资源的遗传多样性进行分析。【结果】32条ISSR引物中的13条引物共扩增出390条条带,其中多态性条带有293条,75.13%的条带可以揭示材料之间的遗传差异;252对SRAP引物中有229对引物为有效引物,共扩增出5827条可读的条带,其中多态性条带为3966条,平均每对引物可扩增17.32条条带。利用2种分子标记计算的相似系数的变化范围为0.60—0.80,将24份种质按系统聚类分析可以分为7组,按主坐标分析可以分为8组,从分子水平上解释了这些种质资源的遗传多样性水平和亲缘...
关键词：
花生 遗传多样性 分子标记 聚类分析
[期刊] 林业科学
[作者]
廖柏勇 王芳 陈丽君 刘明骞 欧阳昆唏 阙青敏 惠文凯 李培 陈晓阳
【目的】利用相关序列扩增多态性（ＳＲＡＰ）分子标记对来自１７个省（区）的３１个苦楝种源进行遗传多样性分析，为苦楝种质资源的保存和育种计划的制订提供依据。【方法】通过ＳＲＡＰ分子标记获得１／０数据矩阵，计算ＳＲＡＰ分子标记各项遗传参数，同时进行分子方差分析（ＡＭＯＶＡ）。随后计算遗传距离矩阵并进行主坐标分析（ＰＣＯ Ａ）、邻接法聚类分析（ＮｅｉｇｈｂＯｕＲ－ＪＯｉＮｉＮｇ）以及遗传距离和地理距离ＭＡＮｔｅｌ相关性分析。【结果】从７８３对ＳＲＡＰ引物中筛选出的２０对引物可扩增出２５７条清晰的条带，其中１４５条具有多态性。引物多态性信息指数（ＰｉＣ）为０．２６２～０．４７８，均值为０．３８５。ＰｉＣ．．．
关键词：
苦楝 SRAP 遗传多样性 亲缘关系
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
令狐斌 侯思宇 孙朝霞 黄可盛 路阳 韩渊怀 许冬梅
通过正交试验设计,比较苦荞序列相关多态性-聚合酶链式反应(Sequence related amplified polymorphism-polymerase chain reaction,SRAP-PCR)扩增反应体系的组合,选出最佳扩增体系用于苦荞SRAP分子标记进行遗传多样性分析。其中最佳SRAP-PCR反应扩增体系为Taq DNA聚合酶2 U、Mg2+1.5 mmol/L、DNA模板75ng、引物0.5μmol/L。从238对SRAP引物组合中筛选出20对多态性较高的引物组合,并对15个苦荞品种进行遗传多样性分析。结果表明:20对引物组合共扩增出128个位点,其多态性信息量(Polym...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
高帆 张宗文 吴斌
【目的】从分子水平优化并构建用于中国苦荞种质资源遗传多样性分析的SSR分子标记体系,为综合评价中国苦荞种质资源提供依据。【方法】以50份苦荞种质为试验材料,用正交设计法[L16(45)]筛选适用于苦荞SSR标记分析的PCR反应体系,浓度梯度检测最佳胶分离效果,并从250对不同科属作物SSR引物中筛选出19对引物进行苦荞遗传多样性分析。【结果】优化的苦荞SSR反应体系为DNA模板30 ng,Taq酶2.0 U.L-1,dNTP、引物和Mg2+终浓度分别为150μmol.L-1、0.1μmol.L-1、2.0 mmol.L-1,总体积为25μL,6%聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。SSR引物筛选率为7.6...
关键词：
苦荞 SSR 遗传多样性
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘永财 孟林 张国芳 毛培春 张德罡
利用ISSR标记对15份新麦草(Psathyrostachys juncea)种质资源进行遗传多样性检测。为获得稳定的新麦草ISSR反应体系,对反应条件中的dNTP、Taq酶浓度、引物浓度、Mg2+浓度等因子进行了优化,建立起的最佳反应体系为:25μL的反应体系中含有dNTP 2.5μL、Taq酶0.2μL、Primers 1μL、Mg2+1.5μL、2.5μL 10×Buffer、2μL模板DNA和ddH2O 15.3μL。ISSR标记结果显示,筛选出的重复性好、谱带清晰的ISSR引物8条,共获得84个扩增位点,其中多态性位点72个,多态性比率(PPB)为85.7%。通过遗传相似系数(GS)...
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