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[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘重旭 王凭青 张宝云 储明星 邓腊梅 谭颖 樊奇
【目的】阐明西南地区具有代表性的山羊品种脂联素(adiponectin)基因的多态性及其与繁殖性能之间的关系,为山羊高繁殖力的标记辅助选择提供科学依据。【方法】根据牛的ADIPOQ序列设计4对引物,采用PCR-SSCP技术检测ADIPOQ在川东白山羊、大足黑山羊、贵州白山羊、金堂黑山羊、板角山羊、成都麻羊、南江黄羊、古蔺马羊和马头山羊等9个山羊品种中的单核苷酸多态性,同时在贵州白山羊和古蔺马羊两个群体中研究脂联素基因多态性与山羊繁殖力之间的关系。【结果】4对引物中只有引物P4存在多态性。对于P4的扩增片段,在不同的山羊品种中检测到AA、AG和GG 3种基因型,测序分析表明与AA型相比,GG型有...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
安小鹏 韩丹 侯金星 李广 王娅娜 李玲 朱广琴 王建刚 宋宇轩 曹斌云
【目的】寻找与产羔数相关的遗传标记,为山羊高繁殖力标记辅助选择提供依据。【方法】根据绵羊FSHβ基因序列设计2对引物,采用PCR-SSCP技术检测山羊FSHβ基因外显子2的多态性,利用最小二乘均数法对其与产羔数的关系进行分析,同时对多态位点的遗传方差进行分析,通过标记位点与产羔性状的遗传相关预测选择反应。【结果】在引物(P2)扩增片段中检测到1个多态位点,出现3种基因型(EE、EF和FF)。对于西农萨能奶山羊,在1～4胎和平均产羔数中,EE型个体产羔数显著高于EF和FF型个体(P<0.05),EF型个体的第2胎和平均产羔数显著高于FF型个体(P<0.05);对于波尔山羊,在2～3胎和平均产羔数...
关键词：
山羊 卵泡刺激素β亚基 多态性 产羔数
[期刊] 中国农业科学
[作者]
安清明 周辉通 吴震洋 罗玉柱 Jon G.Hickford
【目的】检测绵羊ADIPOQ基因多态性及连锁现状,评估该基因突变对绵羊生长及胴体性状的影响,以期丰富绵羊相关重要经济性状的分子遗传研究基础。【方法】以8个不同品种的商品绵羊为研究对象,利用PCR-SSCP方法检测ADIPOQ基因Exon-1区和Exon-2区变异,利用GLMs模型进行评估该基因突变对绵羊生长及胴体性状的影响。【结果】绵羊ADIPOQ基因Exon-1区和Exon-2区共检测到13个突变位点,其中Exon-2区发现的c.46T/C突变导致编码氨基酸p.Tyr16His转变。Exon-1区等位基因A1和B1为优势等位基因,Exon-2区等位基因A2和D2为优势等位基因,且两个区域的等位基因均存在种群差异,大多数品种在两个区域中的变异为中度多态(0.25
[期刊] 西南农业学报
[作者]
冯会利 石照应 田兴贵 曲月秀 主性 刘若余
以贵州黑山羊和黔北麻羊为材料,根据山羊MSTN基因序列(GenBank登录号:EF588035)设计1对引物,用PCR-RFLP法对该序列进行多态性分析。结果表明:PCR扩增片段207 bp处存在TTTTA的插入,导致出现1个DraI酶切多态性位点,黑山羊纯合野生型(AA)为优势基因型,杂合型(AB)和纯合突变型(BB)为非优势基因型,A等位基因为优势基因;黔北麻羊纯合野生型(CC)为优势基因型,杂合型(CD)和纯合突变型(DD)为非优势基因型,C等位基因为优势基因。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
陈志 罗卫星 刘若余 蔡惠芬 承杰 宋桃伟 张依裕
【目的】研究贵州地方山羊品种黔北麻羊、贵州白山羊和贵州黑山羊ras-related and estrogen-regulated growth inhibitor(RERG)基因第2、3和4外显子的多态性及其与生长性状的相关性。【方法】本试验通过PCR-SSCP技术和直接测序法,对3个品种外显子SNPs位点进行检测,利用一般线性模型分析其与生长性状的关联性。【结果】3个供试群体中在第4外显子上都检测到4个SNPs位点,即56 bp(C/G)、826 bp(A/G)、1 434 bp(T/C)和1 798 bp(A/T)。最小二乘法分析结果表明,AA型和BB型的体重对AB型达到差异极显著水平(P...
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘斌 李玉荣 马跃军 赵存发 尉光荣 李金泉
该研究以内蒙古阿尔巴斯型白绒山羊为研究对象,选择绒山羊催乳素(PRL)及其受体(PRLR)基因部分序列作为候选基因,采用PCR-SSCP分子标记技术和DNA测序技术研究其多态性,然后运用最小二乘方差分析方法,对各基因型间生产性状指标进行差异显著性检验,分析绒山羊PRL、PRLR基因的SNP与绒山羊产绒性状的关系,寻找可用于辅助选择的分子标记。结果表明:PRL基因P1和PRLR基因P3引物位点存在SSCP多态,在PRL基因Exon 5区域存在X76049:g.576 bp C-A突变,该突变导致第176个密码子CCC变成ACC,从而使脯氨酸变成苏氨酸(Pro-Thr)。方差分析表明,该位点多态与...
[期刊] 华北农学报
[作者]
韩浩园 李涛 李世凯 宋小雨 李君 哈斯 赵金艳 魏红芳 权凯
为探究GJB6和PRKAA1基因对槐山羊繁殖性能的影响，以122只不同产羔数的槐山羊群体为研究对象，参照NCBI数据库中山羊GJB6和PRKAA1基因参考序列设计引物，利用PCR与测序技术扫描GJB6和PRKAA1基因单核苷酸多态性(SNP),并进行遗传多态性、群体遗传参数分析和基因型与产羔数的关联分析。结果表明，在GJB6基因中检测到2个SNP位点：g.50694819 C>T和g.50694816 T>C,均为同义突变；在PRKAA1基因中检测到3个SNP位点：g.33691489 T>C、g.33693395 A>T和g.33693100 T>C,均位于非编码区。GJB6基因g.50694819 C>T位点和PRKAA1基因g.33693100 T>C位点为低度多态；GJB6基因g.50694816 T>C位点、PRKAA1基因g.33691489 T>C和g.33693395 A>T位点为中度多态。卡方检验结果表明，5个SNP位点均处于Hardy-Weinberg平衡。基因型与产羔数的关联分析结果表明，GJB6基因2个SNP的各个基因型间槐山羊产羔数的差异不显著，不适用于槐山羊群体的多羔性状选育。PRKAA1基因g.33691489 T>C位点的TC基因型个体产羔数显著高于CC基因型，g.33693395 A>T位点AT基因型个体产羔数显著高于AA、TT基因型(P<0.05),且g.33691489 T>C和g.33693395 A>T位点呈现强连锁平衡状态(D′>0.8,r~2>0.33)。单倍型关联分析结果显示，PRKAA1基因TCA单倍型个体的产羔数显著高于CTA、CTT、TTA单倍型个体的产羔数(P<0.05)。因此，槐山羊PRKAA1基因g.33691489 T>C位点TC基因型与g.33693395 A>T位点AT基因型以及TCA单倍型个体具有较高的产羔数，可作为槐山羊产羔数选育的潜在分子标记。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
简承松 张亚平 李通权 廖正录 史宪伟 贾永红 朱文适 余应淮 何正权
用Bam HⅠ、BglⅠ、BglⅡ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、HindⅢ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅡ、SacⅠ、SalⅠ、Sm aⅠ、StuⅠ、XhoⅠ15 种识别6 碱基的限制性内切酶对黔东南小香羊和贵州原有3 个地方山羊品种的93 只个体的m tDNA 进行分析表明, Bam HⅠ、HindⅢ和SalⅠ3 种酶表现多态性; 共检出18 种限制性多态型,归纳得到3 种单倍型, 以单倍型Ⅰ和Ⅱ为基本单倍型。根据此2 种基本单倍型在所比较各品种中的不同分布比例, 以及遗传距离分析和品种间的聚类关系, 表明黔东南小香羊的群体遗传构成与贵州省原有其它3 个山羊品种不同, 从而为进一步确认其...
[期刊] 华北农学报
[作者]
柳楠 马晓丽 程明 刘开东 贺建宁 刘积凤
为阐明GnRHR基因的多态性与崂山奶山羊产羔数的关系,设计7对引物,采用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术检测GnRHR基因在不同产羔数崂山奶山羊的单核苷酸多态性,并分析其与产羔数的关系。结果显示:该基因存在2个多态位点,A261G突变对于初产母羊GA型产羔数比AA型多0.06只,比GG型多0.04只,差异不显著(P>0.05);对于经产母羊GA型产羔数比AA型多0.35只,差异显著(P0.05)。G55A位点共检测到GG和GA这2种基因型,其中对于初产母羊GG型比GA型产羔数多0.13只,经产母羊GG型比GA型产羔数多0.19只,但差异...
关键词：
GnRHR基因 奶山羊 产羔数
[期刊] 西南农业学报
[作者]
徐龙鑫 朱丽莉 陈浩林 韩雪 伍革民
【目的】为瑶山鸡繁殖性能的遗传改良、辅助育种提供理论依据。【方法】采用DNA测序技术,对瑶山鸡STAT5基因外显子的遗传多样性进行研究,并分析多态位点与繁殖性状的相关性。【结果】瑶山鸡STAT5基因存在11229 T→C、11298 T→C、10275 T→C、6571 T→C、6669 G→A、6732 G→A、6898 G→A、7142 G→A、7211 G→A、7219 G→A和7260 G→A等11个突变位点,其中,6898 G→A变异位点的杂合度和多肽信息含量最高,分别为0.5000和0.375
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
胡沈荣 蓝贤勇 陈宏 苏利红 雷初朝
为了将GH基因应用于山羊标记辅助选择中,利用PCR-SSCP技术分析了西农萨能奶山羊、关中奶山羊、陕北白山羊、安哥拉山羊和波尔山羊5个山羊品种生长激素(gGH)基因外显子Ⅱ、Ⅴ的多态性及其与西农萨能奶山羊生产性能的关联。结果表明,gGH基因外显子Ⅱ在西农萨能奶山羊和关中奶山羊群体中存在多态性,外显子Ⅴ在除波尔山羊外的其他山羊品种中均存在多态性;品种间gGH基因外显子Ⅴ位点的基因型频率、基因频率分布与品种特性显著相关(P<0.05);gGH基因外显子Ⅱ的多态性与产羔数之间存在显著关联(P<0.05),外显子Ⅴ的多态性与产奶量之间显著关联(P<0.05)。说明gGH基因位点对产奶量、产羔数有显著影...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
孙瑞萍 王利心 朱广琴 王建刚 宋宇轩 梁昭义 曹斌云
针对GHR基因exon 9和exon 10设计了2对引物,采用PCR-SSCP技术检测该基因这2个位点在西农萨能羊群上的单核苷酸多态性,同时研究其对产奶性能的影响。结果表明:exon 9具有多态,exon 10不存在多态性。Exon 9位点在西农萨能山羊中检测到NN型和NT型,纯化测序发现有1个SNP位点,NN型与NT型相比在该片段第241 bp处有1个G→T的突变;NN和NT基因型之间产奶量的最小二乘均值差异显著(P<0.05):NN基因型在各胎次产奶量和平均产奶量等指标上均好于NT基因型,其中在第3胎的产奶量和第4胎产奶量2项指标上都达到显著水平(P<0.05)。研究结果提示:GHR基因e...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
贾永红 简承松 朱文适 张亚平 史宪伟 余应淮 廖正录 李通权
采用１５种限制性内切酶对贵州威宁绵羊和六盘水绵羊各５只个体的ｍｔＤ－ＮＡ多态性进行研究。其中只有ＢａｍＨⅠ一种酶的酶切类型表现多态，产生三种酶切类型。共得到１７种限制性态型，可归结为三种ｍｔＤＮＡ单倍型，在威宁绵羊中单倍型Ⅰ所占比较较大（８０％），单倍型Ⅲ只占２０％，而在六盘水绵羊中则单倍型Ⅰ和Ⅱ所占比例相当；根据单倍型在群体中的分布和单倍型间遗传距离，推测贵州绵羊的ｍｔＤＮＡ单倍型Ⅰ和Ⅱ可能代表两个母系祖先的基本单倍型，其分化时间约有１６～３２万年之久，单倍型Ⅲ则可能是由单倍型Ⅰ随机突变而来；两个地方绵羊群体间的分化时间大约为６．３～１２．６万年，群体间的ｍｔＤＮＡ遗传多态度较低，但六盘水绵...
关键词：
贵州绵羊 mtDNA RELP
[期刊] 中国农业科学
[作者]
宋桃伟 蔡惠芬 罗卫星 刘若余 张依裕 孙岩岩 刘彬
【目的】探讨GHSR和GHRL基因作为山羊体重体尺性状候选基因的可能性,寻找与山羊生长性状相关的分子遗传标记。【方法】以贵州白山羊和贵州黑山羊为研究素材,采用DNA混合池结合PCR产物直接测序及PCR-SSCP技术检测GHSR和GHRL基因的单核苷酸多态性,利用SPSS(18.0)软件GLM统计模型分析基因SNPs不同基因型及合并基因型与贵州山羊生长性状的关联性,同时采用在线软件对GHSR基因进行生物信息学分析。【结果】在GHSR基因外显子2和3′UTR分别检测到G200A同义突变和T628C位点,而在5′UTR区和外显子1则未发现多态性。设计一对特异性引物对G200A位点进行PCR-SSCP...
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
胡文萍 董新龙 田志龙 汤继顺 刘秋月 王翔宇 狄冉 张效生 张金龙 王金玉 储明星
为研究Izumo1基因多态性及与产羔数关系,本研究利用PCR和直接测序法对小尾寒羊和苏尼特羊的Izumo1基因DNA序列进行扩增、测序和BLAST分析,并和本课题组前期绵羊重测序数据进行比对,筛选出Izumo1基因SNP位点。同时,采用Sequenom MassARRAY~?技术进行基因分型,并对其SNP位点的基因型和等位基因频率在各群体中的分布进行研究。结果表明:小尾寒羊Izumo1基因DNA全长序列3 385 bp,苏尼特羊Izumo1基因DNA全长序列3 382 bp;筛选出8个Izumo1基因SNP位点,经过初步筛选,将在小尾寒羊、苏尼特羊、滩羊、萨福克羊、杜泊羊、草原藏羊这6个绵羊品种中位点分布没有差异的SNP位点排除,最终筛选获得的g.54412135A>G和g.54412107C>A 2个位点。Izumo1基因g.54412135A>G位点在多羔和单羔绵羊品种中存在GG、GA和AA 3种基因型,G基因为优势等位基因;g.54412107C>A在多羔品种中存在CC和CA 2种基因型,而在单羔品种中存在CC、CA和AA 3种基因型,C基因为优势等位基因,其基因型频率和基因频率在单、多羔绵羊群体间的分布差异均极显著(PG多态位点在6个品种中的多态信息含量(PIC)都属于低度多态(PICA多态位点在杜泊羊中属于中度多态(0.25A位点的不同基因型与小尾寒羊不同胎次产羔数之间不存在显著关联(P>0.05)。
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