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[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
王陈 任少华 童琪 陈玫婷 张驰强 周鑫伟 韦小丽
【目的】探究贵州地区黄化香榧的菌根真菌种类及优势菌群差异，比较4个地区黄化香榧根内真菌及根际土壤真菌群落组成差异，探讨黄化香榧根系真菌多样性及群落结构。【方法】选取贵州省贵阳市、修文县、正安县、务川仡佬族苗族自治县4个地区出现黄化现象的香榧群落为研究对象，采集黄化香榧根系及根际土壤进行高通量测序，分析其根系真菌多样性及群落结构差异性，对比4个地区根内与根际土壤的真菌结构差异。【结果】取得黄化香榧根系558 253条有效序列，香榧根际土壤568 821条有效序列；黄化香榧根系-根际真菌分布于5门15纲23目33科46属61种。优势真菌门为子囊菌门Ascomycota、被孢霉门Mortierellomycota、担子菌门Basidiomycota，占整体真菌群落总丰度的90%以上；从真菌种群结构上看，4个地区根内生真菌中，子囊菌门Ascomycota为最大优势门，根际土壤真菌中被孢霉门Mortierellomycota为最大优势门，根内与根际最大优势门存在差异。在各地区中，务川县和正安县被孢霉门Mortierellomycota、被孢霉纲Mortierellomycetes丰度较高，修文县与省植物园被孢霉门Mortierellomycota、被孢霉纲Mortierellomycetes丰度较低，务川县与正安县在真菌结构上相似度较高，修文县与省植物园在真菌结构上相似度较高，而务川县、正安县与修文县、省植物园在真菌结构上又有差异；4个地区黄化香榧样品共有2 485个真菌OTUs，根际土壤共有1 198个真菌OTUs，根内生真菌共有1 287个真菌OTUs。【结论】根际微生物群落结构除了受植株健康影响外，还受地区所影响，4个地区的黄化香榧根系真菌种群在组成和结构上存在明显差异。
关键词：
香榧 黄化 根系真菌 多样性
[期刊] 林业科学研究
[作者]
闵会 程诗明 康志雄 黄坚钦
利用AFLP分子标记技术,采用8对引物对6个香榧天然群体的92个个体进行了总基因组DNA水平上的多态性检测,共检测出364个位点,其中多态性位点63个。方差分析表明:基因谱带频率在群体间差异不明显,方差分量贡献率在群体间占11.14%,群体内占88.86%。6个群体均具有丰富的遗传多样性,多态位点百分率为79.73%~98.41%,其中绍兴>东白湖>磐安>钟家岭>嵊州>黄山,且群体内遗传多样性大于群体间遗传多样性。等位基因数为1.793 9~1.984 1,有效等位基因数为1.541 6~1.675 9,Shannon信息指数为0.454 8~0.547 1。群体分化系数为0.113 6,群体...
[期刊] 西南农业学报
[作者]
彭黎明 蒋显锋
【目的】根系真菌能够显著影响植物的养分利用效率，继而影响植物的生长状态，针对广泛分布于中国云南、四川和西藏高海拔地区的红棕杜鹃，本研究开展了大理马耳山红棕杜鹃群落的根系真菌多样性研究，以期深入了解作为群落建群种或优势种的红棕杜鹃在高海拔区域的生态优势。【方法】本研究采集了大理马耳山30 m×30 m样方内的10株红棕杜鹃成年植株的须根，通过高通量测序检测样本内的真菌多样性。并基于操作分类单元(Operational taxonomic unit，OTU)实现真菌群落分类学注释，同时开展了根系真菌群落的多样性、功能型与关联网络分析。【结果】试验共获得有效序列587644条，132个OTU，分属于3门11纲22目37科42属。主要隶属于子囊菌门(73.71%)、担子菌门(17.81%)和球囊菌门(0.119%)；优势纲、目、科分别为锤舌菌纲(60.52%)、伞菌纲(17.77%)、座囊菌纲(5.87%)、柔膜菌目(58.02%)、伞菌目(13.94%)、煤炱目(5.79%)、水盘菌科(27.95%)、晶杯菌科(16.18%)、口蘑科(9.96%)；在属的水平上，瓶头霉属(27.95%)，小杯伞属(9.96%)和树粉孢属(6.56%)占比最高。通过FUNGuild软件解析出杜鹃根系真菌多种生态群，主要包括植物内生菌，排泄物腐生菌，木腐生菌，兰花根菌真菌等多种生态类型。总体而言，杜鹃花类菌根真菌(ERM)在红棕杜鹃根系真菌群落的组成中占比较少，多数为各种类型的腐生菌和其他多种营养型的真菌。【结论】与相同区域同海拔的其他杜鹃花属植物相比，大理马耳山红棕杜鹃根系的真菌群落表现出较高的多样性，但相比起低海拔地区其他杜鹃群落的根系真菌群落而言，试验区域的根系真菌多样性明显较低，符合高海拔地区真菌多样性降低的趋势。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
杨琴 邹凯 陈爱佳 郭雪 刘学端 梁伊丽
以湖南省壶瓶山国家级自然保护区生长的9株(3组)不同树龄银杏为研究对象,应用IlluminaHiSeq高通量测序技术,分析银杏叶片组织内生真菌的多样性及群落结构。结果表明:银杏叶片内生真菌群落的多样性、群落结构与组成均存在显著性差异,且随着树龄的增加,叶片内生真菌群落结构差异增大;子囊菌门(Ascomycota)为绝对优势菌门;曲霉属(Aspergillus)、假丝酵母属(Candida)、球腔菌属(Mycosphaerella)等真菌为银杏叶内生真菌群落优势菌属;通过对银杏叶黄酮含量进行检测,发现不同树龄银杏叶的黄酮含量存在显著差异,且随着树龄的增加,3种黄酮醇苷(槲皮素、山奈酚和异鼠李素)含量均呈递减趋势;进一步分析表明,黄酮类化合物作为重要环境因子,可能通过影响优势菌门子囊菌中优势菌属的定殖与生长对内生真菌群落的形成与变化产生显著影响。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
胡雲飞 张玥 张彩丽 杨路成 陈暄 庄静 黎星辉
从不同季节的茶树根系和根际土壤中分离得到真菌2 019株,包括茶树根系内生真菌826株、根际土壤真菌1 193株。采用分子生物学鉴定方法,对rDNA-ITS区段进行扩增及分析,共鉴定出13个属28种真菌,其中茶树根系内生真菌12种,根际土壤真菌20种。对不同季节分离得到的真菌进行多样性分析,结果表明:春、夏、秋季分离出茶树根系内生真菌种类分别为12、11、12;3个季节Shannon-Wiener多样性指数差异不明显;而均匀度指数夏季最高,秋季次之,春季最低。春、夏、秋季分离出根际土壤真菌种类分别为18、17、20;3个季节Shannon-Wiener多样性指数及均匀度指数差异均不明显。根际土...
关键词：
根际土壤 根系 真菌 茶树 多样性指数
[期刊] 西南农业学报
[作者]
方宇 白涛 刘冬梅 韩小女 刘舜 王瑞宝 郭永升 陈小龙 王柄权 程凌寒 黄飞燕 余磊 蔡永占 刘佳妮
【目的】为改善云南烟区植烟土壤微生态环境及从土壤生防菌筛选等角度防治烟草黑胫病提供基础数据及理论依据。【方法】采用Illumina MiSeq高通量测序技术分析了健康与患病烟株根际土壤真菌群落结构。【结果】健康烟株根际土壤（ZCTY）和患病烟株根际土壤（HJTY）真菌OTU数分别为1809个和1479个，同时ZCTY的OTU数、特有OTU数分别是HJTY的1.22、1.62倍，且HJTY中的真菌物种量、丰富度和多样性显著降低，ACE、Chao1和Shannon指数较ZCTY分别降低了31.87%、30.47%和0.68%；同时，优势种属中的Soilcoccozyma、镰刀菌属(Fusarium)、Spiromastix和青霉属(Penicillium)在两组间存在显著差异，较ZCTY相比，HJTY中的Soilcoccozyma、镰刀菌属和青霉属相对丰度分别增加了177.06%、54.32%和144.27%，而毛壳菌属(Chaetomium)等有益菌属显著减少，且Spiromastix是HJTY的特有菌属；烟株根际土壤真菌群落与土壤理化因子（pH、有机质、碱解氮、有效磷、速效钾）变化存在一定的相关性，其中油壶菌属与有机质、碱解氮均呈显著负相关，镰刀菌属与碱解氮呈显著正相关，Soilcoccozyma与pH呈显著负相关，与速效钾呈显著正相关，Plectosphaerella与碱解氮、有效磷呈显著负相关，而青霉菌属与碱解氮、有效磷呈显著正相关，外瓶柄霉属(Exophiala)与有机质呈显著正相关。【结论】烟株根际土壤真菌多样性、丰富度的降低及群落结构的改变是烟株患黑胫病后的重要指征之一，其中镰刀菌属、被孢霉属(Mortierella)、青霉属等相关病原菌及腐生菌显著增加，毛壳菌属等有益菌属显著减少，且根际土壤真菌群落受到土壤微生态环境中生物因子和非生物因子的共同影响。
关键词：
烟草黑胫病 根际土壤 真菌群落 多样性
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
吕增伟 文国卫 赖文峰 施晨阳 陈启华 刘益鹏 黄秋良 张国防
【目的】探究水栒子不同组织内生真菌多样性及其群落结构差异，为水栒子内生真菌的综合开发、利用提供一定的理论基础。【方法】利用高通量测序技术对水栒子不同组织内生真菌进行鉴定与分析。【结果】共获得1 590个OTUs序列，其中茎的OTUs数量最多(597个),其次为叶(545个),根最少(448个)。水栒子不同组织内生真菌的群落结构、丰度存在一定差异。各组织均以子囊菌门(Ascomycota)为优势菌门，其中，根、茎和叶的相对丰度分别为41.65%、22.29%和10.16%。球旋霉属(Spirosphaera,相对丰度8.89%)、Anguillospora(对丰度7.92%)、刺孢菌属(Subulicystidium,相对丰度2.10%)为根部优势属；亚隔孢壳属[Didymella(相对丰度2.52%)、Arthrocatena(相对丰度2.19%)]为茎部优势属；线黑粉酵母属(Filobasidium,相对丰度2.47%)、棘壳孢属(Pyrenochaeta,相对丰度2.05%)为叶部优势属。通过LEfSe分析发现，水栒子根、茎和叶都存在差异指示种，球旋霉属为根部差异指示种，Arthrocatena为茎部差异指示种，线黑粉酵母属为叶部差异指示种。【结论】水栒子不同组织内生真菌的种群结构存在差异；水栒子组织器官中内生真菌资源丰富。
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
李茂 申敬民 张耀荣 杨成华
【目的】了解广南木莲在贵州的群落结构和物种多样性，探究贵州亚热带常绿阔叶林中木莲属群落的群落特点。【方法】采用样方法调查贵州已知的3个广南木莲群落，分析群落生境、物种组成、区系特征、生活型、群落结构及生物多样性。【结果】3个群落共记录到维管束植物75科119属144种，种类丰富；优势科为樟科，优势属为胡椒属、悬钩子属等；生活型谱以高位芽植物为主；科、属地理成分都是热带性质的分布区类型占绝对优势，但群落Ⅰ北温带分布类型较多；群落垂直结构分为乔木层、灌木层、草本层和层间植物，各层次间存在差异，群落Ⅰ和群落Ⅱ的乔木层以高大乔木为主、灌木层一般、草本层丰富，群落Ⅲ的乔木层高度不高、种类丰富，灌木层被方竹覆盖，草本层稀少；群落径级结构显示，群落Ⅰ和群落Ⅱ处于群落演替后期，群落Ⅲ处于人为破坏后的恢复中期；3个群落的科属种的相似性系数表明群落Ⅰ和群落Ⅱ更为相似；3个群落中，Margalef指数是群落Ⅱ>群落Ⅰ>群落Ⅲ，Simpson指数是群落Ⅲ>群落Ⅰ>群落Ⅱ，Shannon-Wiener指数是群落Ⅰ>群落Ⅲ>群落Ⅱ，Pielous指数是群落Ⅰ>群落Ⅲ>群落Ⅱ。【结论】广南木莲群落在贵州的环境是海拔为1 388～1 650 m的温暖湿润的喀斯特地貌或沙页岩地貌，与广南木莲模式标本的原生环境有相似之处；群落乔木层的物种多样性与区域气候和群落发展阶段关联性强，并决定群落外貌，而灌木层和草本层的物种多样性则多由林下小生境和人为干扰程度决定。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
张福平 朱秋劲 王文涛 蹇世舟
为研究柳源香鸡与瑶山鸡、黔东南小香鸡的亲缘关系,探讨柳源香鸡的起源和品种遗传多态性,采用mtDNA D-loop序列变异对柳源香鸡、瑶山鸡和黔东南小香鸡进行遗传多态性的研究。结果表明:A、G、C和T等4种核苷酸的平均比例分别为25.22%、13.51%、25.82%、35.45%;共发现29个变异位点(不包含种内变异位点),占分析位点总数的3.71%,其中18个转换,11个颠换;具有29种单倍型,其中有11种共享单倍型。群体遗传多态性与亲缘关系分析表明,柳源香鸡个体具有瑶山鸡、黔东南小香鸡的遗传贡献。
[期刊] 浙江林学院学报
[作者]
黎章矩 骆成方 程晓建 冯肖军 喻卫武
2003-2004年经多点多样品对香榧Torreya grandis‘Merrilli’种仁的营养成分分析证明,香榧种仁含油率为546.2~614.7 g.kg-1,脂肪酸组成以亚油酸和油酸为主,不饱和脂肪酸占脂肪酸总量的79.41%。种仁含蛋白质为121.0~164.3 g.kg-1,具有17种氨基酸,其中7种为人体必需氨基酸。种仁含有19种矿物元素。钾、钙、磷、镁含量丰富,其中钾达7.0~11.3 g.kg-1。种仁中重金属元素除个别样品镉元素超标外,其他均未检出或在安全标准以下,各种农药残毒均未检出。香榧种仁含有极其丰富的烟酸和叶酸,两者含量高于一般干水果数十倍,此类维生素具有助消化,滋...
关键词：
香榧 种子 成分分析 营养评价
[期刊] 西南农业学报
[作者]
阿拉坦存布尔 曹乌吉斯古楞 包金花 查苏娜 胡红霞 王秀兰
【目的】分析手参[Gymnadeniaconopsea(L.)R.Br.]根际土壤真菌群落多样性及与土壤环境因子的相关性，为探究手参人工栽培、生态种植等资源保护及可持续利用提供参考。【方法】采用Illumina MiSeq 高通量测序技术对内蒙古阿鲁科尔沁旗、东乌株穆沁旗和翁牛特旗手参根际土壤真菌群落的多样性进行高通量测序和分析，并对植株根际土壤理化性质与相关性进行分析。【结果】手参根际土壤呈酸性，富含有机质和速效钾，但少氮低磷，且不同分布区土壤理化性质差异显著。从3个分布区土壤样品中共获得 5125个OTUs，隶属于11门、31纲、65目、161科、158属。在门水平，3个分布区手参根际土壤真菌的优势菌门均为子囊菌门（Ascomycota）和担子菌门（Basidiomycota）。在属水平，毛舌菌属（Trichoglossum）、湿伞属（Hygrocybe）、被孢霉属（Mortierella）为手参根际土壤真菌的优势类群。Alpha多样性指数表明，3个分布区手参根际土壤真菌群落多样性和丰富度总体趋势表现为阿鲁科尔沁旗（A1）>东乌珠穆沁旗（D3）>翁牛特旗（W2）；Beta多样性指数表明，3个分布区手参的根际土壤真群落组成存在一定差异。土壤全钾、全磷、全氮和水分含量可能是影响内蒙古地区的手参根际土壤真菌群落组成的关键因子。湿伞属（Hygrocybe）和锁瑚菌属（Clavulinopsis）与土壤环境关键因子呈显著正相关；而具有致病特性的肉座菌属（Hypocrea）和镰刀菌属（Fusarium）与土壤环境关键因子呈显著负相关。【结论】明确了内蒙古地区分布的手参生长的土壤条件及根际土壤真菌群落特征，在3个分布区中，阿鲁科尔沁旗手参根际土壤真菌群落多样性和丰富度最高。土壤理化性质对手参根际土壤真菌多样性影响较大，其他影响因素需进一步研究。
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
范志辉 李素艳 孙向阳 曲炳鹏 郑燚 周伟 杜田甜
【目的】本试验旨在探究不同覆盖材料对土壤真菌多样性及群落结构的影响。【方法】通过控制试验，运用Illumina MiSeq高通量测序技术对以脲醛树脂为胶黏剂制备的有机覆盖垫（NQ）、有机覆盖物（Y）、树皮（S）、木片（M）、鹅卵石（E）、陶粒（T）覆盖和无覆盖（CK）6种覆盖材料下的土壤真菌群落进行测定，并对其进行多样性和群落结构的分析。【结果】6种覆盖材料中，树皮处理下的土壤真菌群落的物种多样性和丰富度最高，以脲醛树脂为胶黏剂制备的有机覆盖垫处理下的土壤真菌多样性和丰富度最低。不同覆盖处理的土壤中，真菌物种和优势物种存在差异。在门水平上，子囊菌门为最优势菌门，相对丰度为70.84%～86.86%，远远大于次优势的担子菌门（相对丰度为3.27%～12.78%）。在属水平上，有机覆盖垫、鹅卵石、陶粒、树皮以及无覆盖处理中g＿unclassified＿o＿Hypocreales为最优势属，在木片覆盖处理中，最优势属为毛壳菌属，在园林绿化废弃物覆盖处理中g＿unclassified＿o＿Eurotiales为最优势属。相关性分析结果显示，土壤速效磷含量与土壤真菌多样性呈极显著负相关（P <0.01）。毛壳菌属、g＿norank＿p＿Mucoromycota、g＿unclassified＿f＿Pyronemataceae、镰刀菌属受环境因子影响较大。【结论】覆盖措施能够影响土壤真菌多样性和丰富度以及群落结构，不同覆盖材料对土壤真菌群落的物种多样性和丰富度以及群落结构影响不同。土壤速效磷、有机质含量是影响土壤真菌多样性和丰富度的重要因素，不同物种对于环境因子的响应也存在差异。本研究设置的6种覆盖材料中，使用树皮作为覆盖物处理下的土壤真菌多样性和丰富度最高。
关键词：
覆盖物 有机覆盖垫 真菌多样性 群落结构
[期刊] 西南农业学报
[作者]
王欣 兰国玉 舒常庆 魏亚情 许心诺
【目的】探究热带雨林2种典型植物（陆均松和青梅）根际真菌群落多样性与组成差异，为保护热带雨林生态系统中珍稀濒危物种的生物多样性提供科学依据。【方法】通过Illumina Miseq 高通量测序法对海南热带雨林陆均松和青梅根际真菌群落组成、多样性及功能进行分析。【结果】担子菌门（Basidiomycota）和子囊菌门（Ascomycota）是根际不同生态位间的优势菌门。PCoA结果表明，与生态位相比，物种更能影响陆均松和青梅真菌群落结构，且对根际不同生态位的影响程度不同（根际: R = 0.1983， P = 0.007; 根表: R = 0.2622， P = 0.004; 根内: R = 0.7342， P = 0.001）。在OTU水平上陆均松和青梅真菌群落α多样性差异不显著，但同一树种的根表与根内真菌群落α多样性差异显著（P < 0.05），且与其它生态位相比，根内真菌群落α多样性最低。CCA分析结果表明，环境因子中pH、铵态氮（AN）是影响2个树种根际真菌群落结构的重要环境因子。FUNGuild功能预测结果显示，外生菌根真菌-未定义腐生菌、外生菌根、未定义的腐生菌及寄生真菌-未定义的腐生菌为主要功能类群，且在不同树种中存在差异。【结论】植物种类显著影响根际真菌群落组成，但生态位是在小尺度区域上影响真菌群落多样性的重要因素。pH、AN是驱动陆均松和青梅根际真菌群落组成差异的重要环境因子。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
高鑫媛 赵红玲 白茹玥 李哲 魏金月 赵蓝青青 赵春颖
【目的】分析根腐病北苍术植株根际土壤真菌群落的多样性，为探索北苍术根腐病的发病机理和防治工作提供参考。【方法】利用Illumina HiSeq 高通量测序技术，分析北苍术根腐病植株与健康植株根际土壤真菌群落结构特征，并对植株根际土壤理化性质与酶活性进行分析。【结果】患根腐病北苍术植株根际土壤真菌较健康植株总量和多样性显著降低。患根腐病北苍术植株根际土壤中真菌菌群在门水平的丰度相对健康土壤增高的是子囊菌门（Ascomycota），减少的是担子菌门（Basidiomycota）、壶菌门（Chytridiomycota）；在目水平增多的是肉座菌目（Hypocreales）、假球壳目（Pleosporales）、小丛壳目（Glomerellales）等，减少的是被孢霉目（Mortierellales）、粪壳菌目（Sordariales）、散囊菌目（Eurotiales）、刺盾炱目（Chaetothyriales）等；在属水平上增多的是镰刀菌属（Fusarium），赤霉属（Gibberella）等，减少的是被孢霉属（Mortierella）、亚隔孢壳属（Didymella）、毛壳属（Cheatomium）及木霉属(Trichoderma)等。统计学分析表明，患根腐病北苍术植株根际土壤的pH值显著低于健康北苍术植株根际土壤，速效N、速效P、速效K含量显著增高。且不同处理的北苍术植株根际土壤的酶活性检测显示根腐病北苍术植株根际土壤的土壤脲酶、土壤蔗糖酶及土壤碱性磷酸酶的酶活性显著高于健康植株的根际土壤。【结论】常见生防菌毛壳属（Cheatomium）在根腐病北苍术植株根际土壤中占比较少，Schizotheciumj菌在健康北苍术植株根际土壤中占比丰度更高。致病菌镰刀菌（Fusarium）在根腐病北苍术植株根际土壤中占比多。北苍术根腐病的成因可能与其根际真菌丰度降低、土壤的理化性质及酶活显著变化有关，但差异菌群的功能多样性及与北苍术植株根腐病病原菌的互作关系尚待验证。
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