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[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
高禾苗 任爱天 张绍聪 袁龙义
【目的】土壤细菌对土壤生态系统功能和健康维持起着重要作用。在了解核桃林土壤细菌群落随林龄的变化规律的基础上，结合土壤因子进一步探究土壤微生物群落与土壤理化性质及土壤酶活性之间的关系。阐明土壤微生物群落变化的驱动因素，为该地区核桃林的高效可持续经营管理提供科学依据。【方法】以不同种植年限（平均年龄8年、50年和100年以上）西藏核桃林为研究对象，基于高通量测序技术，研究不同树龄下土壤微生物组成及多样性的变化，并结合土壤理化因子进一步探究种植年限对土壤微生物群落的影响。【结果】（1）核桃种植年限没有显著影响细菌丰富度，但是古核桃林（100年以上）显著降低了细菌香农指数、优势度指数和均匀度指数。（2）变形菌门、酸杆菌门、厚壁菌门、芽单胞菌门、黏球菌门、放线菌门、拟杆菌门和绿弯菌门是土壤细菌优势菌门。不同树龄下部分微生物类群的相对丰度差异显著，随着种植年限的增长，土壤放线菌门的相对丰度增加，绿弯菌门的相对丰度降低，此外拟杆菌门的相对丰度呈现先增加后降低的趋势。（3）非度量多维尺度分析结果显示，不同种植年限核桃林土壤细菌群落组成之间存在显著差异。同时，冗余分析表明，土壤硝态氮含量对细菌群落组成影响显著。（4）相关性分析也显示土壤酶和土壤理化性质与微生物多样性以及优势菌门之间存在显著相关关系。【结论】核桃定植年限通过改变土壤理化性质和酶活性，改变了土壤微生物群落的多样性和群落结构，其中古核桃林细菌群落多样性显著降低，加剧了土壤微生态失衡。研究结果为明确不同龄林核桃林土壤微生物群落特征研究提供重要补充。在实际生产中除更新核桃树外，可合理使用无机和有机肥或者微生物菌肥，从而维护核桃林土壤生态系统的稳定。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
浦滇 石明 周雪孟 张仲富 蓝增全
【目的】为研究不同树龄的茶树土壤细菌群落变化规律。【方法】采用16S rRNA高通量绝对定量测序的方法,选取树龄10年(10yrs)、40年(40yrs)、80年(80yrs)和100年以上(100yrs)的茶树土壤为研究对象,同时选取相邻没有茶树种植历史的林地(0yrs)土壤作为对照。【结果】土壤细菌群落多样性表现为10yrs>0yrs>40yrs>80yrs>100yrs; Acidobacteria(酸杆菌门)、Proteobacteria(变形菌门)、Chloroflexi(绿弯菌门)、Planctomycetes(浮霉菌门)、Actinobacteria(放线菌门)、Myxococcous(粘球菌门)、Gemmatimonadetes(芽单胞菌门)是林地和茶树土壤细菌主要的优势门,占了整个细菌群落的76.30%～88.90%;植茶后土壤细菌总绝对丰度表现为40yrs>80yrs>10yrs>100yrs, 0yrs和80yrs的总绝对丰度差异较小;基于各样本的ASV绘制的韦恩图分析,植茶后特有的ASV个数随树龄的增加而减小;Heatmap(热图)和PCoA(主坐标)分析共同表明,40yrs和80yrs的土壤细菌群落结构较相似,其他树龄茶树土壤和林地土壤的细菌群落结构差异较大。【结论】随着茶树树龄的增加,土壤细菌群落多样性降低;土壤细菌绝对丰度随树龄增加呈先增加后减小的趋势。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
戚珊珊 周礼红 胡久平 刘敏 赵辉 熊燕
【目的】了解西藏多地区土壤可培养细菌的多样性。【方法】采用梯度稀释涂布分离法分离土壤细菌,根据形态特征、生理生化试验去除冗余,对细菌进行16S r DNA序列系统发育分析,鉴定其种属,研究其亲缘关系及多样性。【结果】经形态特征、生理生化试验以及16S r DNA序列测定,38株细菌菌株归属于四个类群,厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes),变形菌门(Proteobacteria),12个科,13个属,包含链霉菌属(Streptom
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
杨琴 邹凯 陈爱佳 郭雪 刘学端 梁伊丽
以湖南省壶瓶山国家级自然保护区生长的9株(3组)不同树龄银杏为研究对象,应用IlluminaHiSeq高通量测序技术,分析银杏叶片组织内生真菌的多样性及群落结构。结果表明:银杏叶片内生真菌群落的多样性、群落结构与组成均存在显著性差异,且随着树龄的增加,叶片内生真菌群落结构差异增大;子囊菌门(Ascomycota)为绝对优势菌门;曲霉属(Aspergillus)、假丝酵母属(Candida)、球腔菌属(Mycosphaerella)等真菌为银杏叶内生真菌群落优势菌属;通过对银杏叶黄酮含量进行检测,发现不同树龄银杏叶的黄酮含量存在显著差异,且随着树龄的增加,3种黄酮醇苷(槲皮素、山奈酚和异鼠李素)含量均呈递减趋势;进一步分析表明,黄酮类化合物作为重要环境因子,可能通过影响优势菌门子囊菌中优势菌属的定殖与生长对内生真菌群落的形成与变化产生显著影响。
[期刊] 林业科学研究
[作者]
覃鑫浩 梁艳 陈超凡 覃林
[目的 ]探讨我国南亚热带地区不同树种人工林对土壤细菌群落多样性的影响,为该地区实施人工林生态系统适应性经营策略的树种选择提供土壤微生物生态学方面的科学依据。[方法 ]采用PCR-DGGE技术,比较分析位于广西凭祥市中国林业科学研究院热带林业实验中心的4个乡土树种(马尾松、红锥、米老排和火力楠)人工林和外来树种尾巨桉人工林土壤(0～20 cm)细菌群落的丰富度、多样性和均匀度,并探讨了土壤细菌群落多样性与土壤理化性质因子之间的相互关系。[结果 ]5种不同树种人工林土壤细菌群落多样性之间无显著差异(p> 0.05),其土壤细菌群落多样性与土壤全氮和全磷呈显著正相关(p
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
孙志鹏 罗建勋 王刚
【目的】探究川黄檗不同树龄各部位和根际土壤中矿质元素含量变化规律，以及矿质元素和土壤因子相关性，以期为川黄檗幼龄林营养诊断、科学施肥提供依据。【方法】以川黄檗1～3年生苗木为试材，对不同部位（叶、当年生枝和根）和根际土壤中矿质元素含量及其变化规律进行研究，并分析了根际土壤与不同部位间以及各部位中矿质元素间的相关性，进而评价不同部位对土壤中矿质营养元素的富集能力。【结果】1）不同树龄和不同部位矿质元素含量具有一定的差异，且随着树龄的增加，叶中N、Ca、Cu和Zn，当年生枝中P和Cu以及根中Mg含量显著下降（P <0.05）。2）不同树龄根际土壤矿质元素含量差异显著（P <0.05），随着树龄增加，Ca、Mn和Zn含量显著增加（P <0.05）,Fe含量显著下降（P <0.05）；元素含量大小为：N> K> Ca> Fe> P> Mn> Mg> Cu> Zn。3）川黄檗对根际土壤中矿质元素的富集能力不同，对Ca、Mg的富集能力较强，对N、P和K的富集能力居中，对Fe、Mn和Cu的富集能力较低。4）叶中K与P，当年生枝及根中的N与K间均存在显著正相关（P <0.05），各部位N与多种元素相关性显著（P <0.05）；土壤中元素与叶、根中多种元素显著相关（P <0.05）。【结论】川黄檗幼龄林不同生长年限各部位及土壤中矿质元素含量呈现不同的变化规律，各部位元素之间及与土壤中矿质元素既有协同作用又有拮抗作用，不同部位对矿质营养元素具有不同的富集能力。依据研究结果，川黄檗幼龄林施肥时应该注意补充叶中N、Ca、Cu和Zn，同时合理搭配P和Mg等元素，注意用量的协调，保证植株营养均衡。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
孔垂思 李友勇 孙云南 尚卫琼 刘本英 杨涛
【目的】云南是中国茶树资源最大的遗传多样性中心，研究不同茶树品种新梢高氮磷钾含量形成的机制，不同茶树品种根际土壤养分含量及细菌群落多样性的差异，揭示不同茶树品种新梢高氮磷钾含量与其根际土壤养分含量及细菌群落多样性之间的关系，为优化商品茶叶种植生产提供理论支撑。【方法】本研究选择不同茶树品种，利用土壤农业化学结合16SrRNA高通量测序技术分析不同品种氮磷钾含量茶树的根际土壤理化性质及细菌群落多样性的差异，并对其做相关性分析。【结果】不同茶树品种新梢氮磷钾含量差异较大，不同茶树品种中，氮含量高的茶树品种根际土壤的pH值、有机质、全氮、水解性氮含量均较高，磷含量高的茶树品种根际土壤的全磷、有效磷含量均较高，钾含量高的茶树品种根际土壤的全钾、速效钾含量较高。群落结构分析表明，不同茶树品种根际土壤优势菌群在门水平为变形杆菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、蓝藻门(Cyanobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、浮霉菌门(Planctomycetes)、厚壁菌门(Firmicutes)等。根际土壤pH、有机质含量、水解性氮含量、有效磷含量、速效钾含量对细菌群落结构影响较大，尤其是对变形杆菌门、放线菌门、绿弯菌门、浮霉菌门、厚壁菌门、蓝藻门影响较大。【结论】不同茶树品种中，新梢氮含量高、磷含量高、钾含量高的茶树土壤pH、有机质、全钾、有效磷、速效钾的含量较高，进而引起细菌群落丰富度、细菌群落多样性较大，是茶树养分差异形成的重要环境因子。不同茶树品种中，高养分含量茶树根际土壤中变形杆菌门、放线菌门、绿弯菌门、浮霉菌门、厚壁菌门、蓝藻门的细菌群落相对丰度较高。
[期刊] 林业科学
[作者]
杜小刚 唐明 陈辉 张海涵 张永安
采用BIOLOG检测法,研究丛枝菌根与黄土高原不同树龄刺槐人工林及次生林根际微生物群落多样性的关系。结果表明:8、15、23和30年刺槐人工林随着树龄的增加,菌根侵染率先增加后降低,微生物活性(AWCD值)增大,碳源代谢丰富度指数(S)和Shannon指数(H)逐渐增加,23年达到峰值后趋于稳定,并逐渐降低,不同林地菌根侵染率与根瘤数呈显著正相关(y=414.82x-188.73,r=0.927,p<0.05)。主成分分析表明:刺槐人工林根际微生物群落结构与功能随着树龄的增加存在时间上的连续性,次生林优于相同树龄人工林,在碳源利用上表现为与树龄更长的人工林相近。菌根侵染率与根瘤数、细菌量、丰富...
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
彭辉 周红敏 张弓乔 王宏翔
【目的】研究不同林龄红豆树土壤真菌群落结构及多样性，为红豆树人工林土壤质量动态变化和土壤微生物生态学机制的理解提供基础数据，为红豆树人工林的可持续经营提供依据。【方法】以红豆树幼龄林、中龄林和成熟林为研究对象，采用Illumina Miseq测序平台，分析了土壤真菌群落的Alpha多样性、真菌群落结构组成，群落多样性与环境因子的相关关系，并对土壤理化性质与真菌群落相关性进行分析。【结果】1）α多样性指数表明，幼龄林和中龄林、成熟林土壤真菌多样性差异显著，红豆树幼龄林土壤中真菌多样性高且分布均匀；成熟林土壤真菌的数量和丰度最大；2)3个林龄的土壤样品中共检测到真菌26个门，67个纲，101个目，127个科，145个属。子囊菌门和担子菌门丰度占真菌总量的74.2%～90.2%。中龄林和成熟林土壤真菌群落结构相似度较高。3个林龄土壤中前3位优势菌纲为：银耳纲、粪壳菌纲和散囊菌纲。RDA分析表明土壤速效钾、有效磷、全钾和pH是影响真菌群落的主要因子。【结论】土壤真菌群落结构和多样性指数在不同林龄间有一定差异，幼龄林和中龄林、成熟林的群落结构差异显著，中龄林和成熟林的真菌群落结构多样性差异较小。随着林龄的增大真菌多样性增加，本研究结果为不同林龄红豆树土壤肥力和土壤微生物群落结构研究提供理论支撑。
关键词：
真菌群落 土壤养分 红豆树 高通量测序
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
徐永杰 吴强盛 汪芳玲 徐雅雯 韩梦壮 肖之炎
【目的】探讨油茶和薄壳山核桃间作对土壤养分和真菌多样性的影响。【方法】以油茶单作模式（Cam）、油茶+薄壳山核桃间作模式（Cam&Car）和薄壳山核桃单作模式（Car）3种林地为研究对象，采用Illumina Miseq高通量测序等技术，分析0～30 cm林地土壤主要理化性质和酶活性、真菌群落组成结构和多样性以及真菌与土壤环境因子的相关性。【结果】间作模式林地土壤pH值和水解性氮、有效磷、有机质含量均居于Car单作模式和Cam单作模式之间。间作模式一定程度上提升了薄壳山核桃土壤酶活性，降低了土壤有效钾（AK）、有效硫（AS）、交换性钙（ECa）含量。3种模式土壤真菌测序共获得1 084个OTUs，共有OTUs数量为111个，特有OTUs的数量表现为Car> Cam&Car> Cam。3种模式共鉴定出8门11纲56目131科201属257种真菌，其中Saccharomycetes、Sordariomycetes、Agaricomycetes是3种模式共有优势菌纲，Wickerhamomyces是共有优势菌属。Alpha多样性分析表明，3种模式土壤真菌ACE指数存在显著差异，即Car> Cam&Car> Cam，而Shannon指数和Simpson指数没有显著差异。基于Bray-Curtis距离的土壤真菌群落组成主坐标分析结果表明，Cam&Car间作模式与Car单作模式和Cam单作模式均有交集，其中与Car单作模式交集较多。相关性分析结果表明，属水平主要真菌与土壤环境因子存在相关关系，其中与交换性钙含量、有效钾含量、有效硫含量存在显著性负相关。【结论】油茶与薄壳山核桃间作增大了林地养分消耗，但也一定程度上提升了薄壳山核桃土壤酶活性和微生物多样性。建议油茶和薄壳山核桃间作时，加大肥力管理，特别是含钙、钾和硫元素肥料的投入。
[期刊] 长江流域资源与环境
[作者]
林耀奔 叶艳妹 刘书畅 杨建辉
为了研究不同农地整治措施对土壤细菌的影响,通过高通量测序技术,对不同农地整治措施下土壤细菌多样性与种群结构进行对比分析。结果表明:(1)从细菌多样性来看,实施农地整治的样点土壤细菌多样性显著提高;(2)从细菌种群结构来看,实施田块归并、平整土地、筑造沟渠以及土壤培肥等措施有效提高了甲基暖菌属(Methylocaldum)、亚硝化单胞菌(Nitrosomonas)、脱硫线菌属(Desulfonema)等有益菌属的丰度;(3)通过与土壤环境因子的相关性分析,酸碱度、铜和铅含量是影响农地整治区土壤细菌多样性与结构的重要因素。该研究证实了农地整治对提高土壤细菌多样性和改善土壤质量的重要作用,也为农地整治工作的开展提供了科学依据。
[期刊] 林业科学
[作者]
丁新景 敬如岩 黄雅丽 陈博杰 马风云
【目的】研究黄河三角洲4个不同树种人工林根际土壤细菌群落结构及多样性,揭示人工林改善土壤生产力的微生物学机制,为人工林的栽培和管理提供理论依据。【方法】应用高通量测序技术,比较臭椿、榆树、绒毛白蜡和刺槐4种人工林根际土壤细菌群落结构及多样性,并结合根际土壤理化性质进行相关性分析。【结果】1)臭椿、榆树、白蜡和刺槐人工林根际土壤细菌分别有27、26、28和28门,酸杆菌门、变形菌门和放线菌门3门细菌在4种人工林根际土壤中相对丰度大于10%,是根际土壤中的优势群落;硝化螺旋菌门、绿弯菌门、浮游菌门、芽单胞菌门
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
魏亚情 吴志祥 杨川 兰国玉
【目的】橡胶林是海南重要的森林植被之一，探究海南岛橡胶林土壤细菌群落多样性的季节变化特征及其环境驱动因子，为天然橡胶产业的可持续发展提供科学依据。【方法】使用Illumina Miseq高通量测序法对海南岛橡胶林旱季和雨季的土壤细菌的α、β多样性和群落结构组成及与环境因子的关系进行了分析。【结果】1）共检测到细菌41门、108纲、247目、465科、876属。细菌群落中，优势菌门依次为变形菌门(Proteobacteria)(33.28%)、酸杆菌门(Acidobacteria)(19.27%)、绿弯菌门(Chloroflexi)(13.63%)、放线菌门(Actinobacteria)(12.41%)。2）橡胶林雨季土壤细菌丰富度和多样性均高于旱季，基于Bray–Curtis距离的PCoA分析表明，不同季节土壤细菌群落β多样性差异显著(P=0.001),PERMANOVA分析结果表明，季节变化解释了细菌群落组成差异的2.48%(R~2=0.024 8,P=0.001)。3）细菌多样性与环境因子的线性分析结果表明，细菌α多样性与pH值、全钾(TK)、有效钾(AK)、温度(Tem)、土壤含水量(WC)、降雨(Pre)显著相关(pH:R~2=0.43,P
关键词：
橡胶林 土壤细菌 多样性 季节变化
[期刊] 西南农业学报
[作者]
汤涤洛 涂修亮 潘国雄 熊伟 汪红武
【目的】本文研究了不同苎麻品种根际土壤细菌群落组成和多样性的变化。【方法】利用Illumina平台Miseq高通量测序技术结合相关生物信息学对深根型、中根型、浅根型苎麻根际土壤细菌进行高通量测序及分析。【结果】测序共获得230 664个OTUs,257 100条读数,平均读长420 bp。Venn图表明不同处理之间共有的细菌OTU数目为459个,深根型苎麻与中根型苎麻共有的细菌类群最多。深根型苎麻Chao指数显著高于浅根型苎麻13.86%,与中根型苎麻差异不显著。深根型苎麻Shannon指数显著高于中根型
关键词：
高通量测序 苎麻 土壤微生物 细菌多样性
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
鲍佳书 汤玉洁 刘俊萍 彭方仁
【目的】研究不同品种薄壳山核桃林地土壤微生物多样性及群落组成特征,旨在为维护薄壳山桃人工林土壤健康和实现林地的可持续经营管理提供理论依据。【方法】利用高通量测序技术对‘Pawnee’‘Jinhua’‘Mahan’3个品种薄壳山核桃根际土壤和非根际土壤微生物多样性和群落组成进行分析。【结果】1）α多样性指数分析结果表明，3个品种薄壳山核桃土壤微生物的多样性存在显著差异，尤其体现在真菌上。其中不同品种根际土壤细菌的多样性差异不显著，而‘Jinhua’的非根际土壤细菌多样性显著高于‘Pawnee’。真菌多样性在根际和非根际土壤中均表现为‘Jinhua’显著低于‘Mahan’和‘Pawnee’。2)NMDS分析结果表明，在根际样本中‘Jinhua’品种的薄壳山核桃土壤真菌及细菌的群落结构与其他两个品种间存在显著差异，而3个品种的薄壳山核桃非根际样本中土壤微生物的群落结构则相对相似。门水平上，3个品种薄壳山核桃土壤细菌主要由放线菌门Actinobacteriota、变形菌门Proteobacteria、酸杆菌门Acidobacteriota和绿弯菌门Chloroflexi组成，土壤真菌主要由子囊菌门Ascomycota、担子菌门Basidiomycota和被孢霉菌门Mortierellomycota组成，其中担子菌门在‘Mahan’根际土壤和非根际土壤中的丰度明显高于‘Pawnee’和‘Jinhua’；科水平上，土壤细菌优势菌群为norank＿o＿＿Gaiellales和黄色杆菌科Xanthobacteraceae，且norank＿o＿＿Gaiellales和黄色杆菌科在‘Pawnee’非根际土壤丰度明显高于‘Jinhua’和‘Mahan’。真菌的优势菌群为革菌科Thelephoraceae和盘菌科Pezizaceae，其中盘菌科在‘Jinhua’根际土壤的丰度明显高于‘Pawnee’和‘Mahan’。【结论】薄壳山核桃的土壤真菌多样性及群落组成因品种而存在差异，而根际土壤细菌多样性受品种的影响较小。
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