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[期刊] 林业科学
[作者]
周兴隆 刘竟星 吕宁 李健荣 杨金娟 于丽 杨俊丽 姬宇翔
【目的】探讨我国西北地区枸杞木虱Paratrioza sinica种群遗传多样性、遗传分化及种群系统发育关系，为枸杞木虱区域性发生规律和制定防控策略等提供分子生物学理论依据。【方法】本研究对2023年6－8月采自西北地区18个不同地理种群的512份枸杞木虱样品的mt DNA COI基因进行了PCR扩增、测序，并利用MEGA7.0、Dna SP 5.0、Arlequin 3.5和Network 10.0等软件分析了mt DNA COI基因序列变异、系统发育及遗传分化等情况。【结果】1）测定片段长度为474 bp，序列碱基T、C、A、G含量分别为35.6%、22.2%、26.8%、15.4%，A+T含量（62.4%）明显高于G+C含量（37.6%），表现出明显的碱基偏倚性，核苷酸多样度为0.002 5，核苷酸平均差异数K为1.110。2）共检出5个单倍型，单倍型多样度为0.512，其中，单倍型H2为优势单倍型，该单倍型出现了344次，占所有检测个体的67.19%。3）18个枸杞木虱地理种群Taijima’s D及Fu’s Fs值分别为0.876、0.911，均未达到显著水平。4）群体遗传分化指数为0.642 78，基因流为0.21，种群内遗传变异百分率为35.72%，种群间遗传变异百分率为64.28%，种群内变异显著小于种群间变异（P＜0.01）。5）单倍型NJ系统发育树及网络中介图均显示5个单倍型明显聚为4个聚类簇；6）各种群间的遗传距离在0.000 ～ 0.007之间。UPGMA聚类图结果显示德令哈（DLH）和格尔木（GEM）种群、古浪县（GLX）和石河子（SHZ）种群与其他种群相比分化明显。7）Mantel检测结果显示，18个枸杞木虱地理种群间遗传距离与地理距离存在显著中度正相关（r=0.675，P＜0.05）。【结论】西北地区18个枸杞木虱地理种群遗传多样性较低，地理种群间和种群内均出现了遗传变异，种群总体变异的主要因素为种群间变异，种群内遗传分化相对较低。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
褚栋 刘国霞 范仲学 陶云荔 张友军
烟粉虱Bemisiatabaci(Gennadius)是由具有遗传分化的不同地理种群组成的复合种。本文介绍了烟粉虱不同地理种群遗传分化的最新研究进展,并在世界各国对烟粉虱核糖体ITS1(rDNAITS1)、线粒体COI(mtDNACOI)基因大量测序的基础上,进一步分析了烟粉虱不同地理种群的遗传分化。根据mtDNACOI和rDNAITS1基因序列分析的结果,烟粉虱不同地理种群可分为5组,即亚洲组(Asiagroup)、美洲组(Americagroup)、非洲组(Africagroup)、澳洲组(Australiagroup)、B型/地中海/中东/北非/Ms型组(BiotypeB/Mediter...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
张建勤 孙兆军 陈宏
利用4个微卫星标记对西北地区的固原鸡、固原红鸡和略阳乌鸡群体进行遗传变异分析。结果表明,地方品种固原鸡、略阳鸡和培育品种固原红鸡在4个位点的平均杂合度分别为0.748 7,0.709 2和0.733 2,平均有效等位基因数分别为5.129 0,3.505 8和4.468 9,平均多态信息含量分别为0.716 6,0.646 6和0.570 4。表明固原鸡、略阳鸡和固原红鸡均具有较大的遗传变异。
关键词：
鸡 微卫星标记 遗传变异 西北地区
[期刊] 林业科学
[作者]
钱路 安榆林 徐梅 杨晓军 朱宏斌
舞毒蛾是一种食性很广、危害很大的世界性林木害虫,根据其地理分布和生活特性,现在被分为亚洲型和欧洲型2种。对来自俄罗斯远东地区、蒙古、日本、美国和中国5个地理种群,共26份舞毒蛾样品进行AFLP分子标记研究。成功建立并优化舞毒蛾AFLP分析体系,从16对引物组合中筛选出3对扩增条带多、多态检出率高的荧光标记引物组合,利用CEQ-8000遗传分析仪进行毛细管电泳及数据分析,共检测到507个多态性位点。通过PAUP软件对AFLP数据进行UPGM和NJ树的聚类分析以及遗传距离分析,结果表明:5个地理种群舞毒蛾明显分成欧洲型(美国种群)和亚洲型,其中亚洲型又可分成俄罗斯、日本、中国及蒙古3个类群。美国种...
关键词：
舞毒蛾 AFLP 分子标记 遗传多样性
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
刘坤 刘福利 王飞久 孙修涛 汪文俊 丁昌玲 梁洲瑞 马兴宇
应用RAPD技术,对自然分布于山东半岛莱州湾、小石岛、俚岛、楮岛和汇泉湾的5个大叶藻种群的遗传多样性和遗传结构进行了分析,并基于研究结果对山东半岛大叶藻种群保护和移植修复提出了建议。实验用10条RAPD引物共扩增出42条条带,多态条带39条,多态性位点比率为92.86%。研究结果表明山东半岛大叶藻种群具有较高的遗传多样性和较高的遗传分化;AMOVA分析显示5个种群99.68%的变异来源于种群内部,而0.32%的变异来源于种群间;Mantel测试表明5种群遗传距离与地理距离之间没有相关性;遗传多样性最低的是莱州湾种群,应该得到优先保护;遗传多样性较高的是俚岛种群和汇泉湾种群,可以作为山东半岛海草...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
李义良 赵奋成 胡燕菲 蔡坚 吴惠姗 张应中 郭文冰
应用SRAP分子标记技术,对来自非洲的5个不同地理群体非洲桃花心木的遗传多样性和遗传分化进行了分析。结果表明:筛选出28对SRAP引物组合用于群体遗传分析,共扩增出条带77条,其中多态性条带59条,多态性水平为76.62%;5个群体遗传距离在0.036 1~0.131 7之间,总的Nei’s基因多样性指数为0.209 3,总的Shannon’s信息指数分别为0.330 0,遗传变异主要来自群体内个体间(70.04%),群体基因流(Nm)为1.1858。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
魏玉清 许兴 王璞
利用RAPD分子标记技术,从400条10碱基的随机引物中筛选出了40条适用于枸杞RAPD分析的引物,选取其中9条引物对10份不同来源的宁夏枸杞材料进行了扩增,检测了宁夏不同地区种植的宁夏枸杞(Ly cium barbarum L.)主栽品种和新育成的枸杞品系基因组DNA的多态性,并对其遗传背景进行了初步分析。结果表明,宁夏不同地区主要栽培的宁夏枸杞品种遗传上无明显差异,但新品系大果枸杞与标准宁杞1号在基因组上有差异;同时构建了主要推广品种宁杞1号的RAPD图谱。
关键词：
宁夏枸杞 RAPD 遗传多样性
[期刊] 西南农业学报
[作者]
陈德西 封传红 何忠全 向运佳 胡荣平
采用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＡＰＤ）技术，研究了四川省甘孜州地区蝗虫的遗传结构。用筛选出的１２条随机引物对９个种群９１个个体进行扩增。结果表明，１２条引物共检测到９５个位点，其中多态位点共计７２个。ＳｈＡＮＮｏＮ信息指数（Ｉ）和ＮｅＩ＇Ｓ遗传多样性（ｈ）估计的９个种群的遗传多样性水平分别是０．４１６１和０．２８１０。利用ＮｅＩ＇Ｓ基因多样性指数进行群体内遗传多样性评价，ＳｈＡＮＮｏＮ多样性指数（Ｉ）具有相同的结果，来自四川甘孜雅县雅江（ＹＪＧＬ）种群值最高，为０．１６７４，白玉县金沙乡（ＢＹＪＳ）种群最低为０．０４０５；居群内基因多样度ｈＳ为０．０７７７，表明遗传变异主要存在于居群间。基因分化．．．
关键词：
蝗虫 种群 RAPD 遗传多样性
[期刊] 沈阳农业大学学报
[作者]
孙嵬 张柱亭 类成平 董辉 钱海涛 丛斌
应用线粒体细胞色素b(Cytb)基因序列对10个地理种群黄胫小车蝗(Oedaleus infernalis Saussure)的遗传多样性及遗传分化进行了初步研究。结果表明:在获得的168条序列样本中,共发现了14个变异位点,定义了15种单倍型。总单倍型多样性指数Hd为0.462,种群内单倍型多样度在0.125~0.625范围之内。总群体的Fst为0.0812,Gst为0.0991,Nm为4.55,表明黄胫小车蝗各地理种群之间存在着较为充分的基因交流。分子方差分析(AMOVA)结果表明,黄胫小车蝗的遗传差异主要发生在种群内部,占方差比率的91.53%。单倍型中介网络图及系统树显示,各种群中的单...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘永刚 漆永红 李惠霞 郭满库 吕和平 张俊莲 贺春贵
【目的】探讨甘肃不同地理种群桃蚜Myzus persicae的遗传相似性和遗传差异,遗传距离与地理距离、海拔之间的关系,以期得到桃蚜种群遗传分化和迁飞的分子证据。【方法】利用7对SSR引物对13个桃蚜地理种群进行遗传相似性和聚类分析。【结果】7对SSR引物共检测到43个多态性位点,多态性条带百分率PPB为95.56%。13个桃蚜地理种群观测等位基因数Na为1.3333,有效等位基因数Ne为1.2293,Nei′s基因多样性指数为0.1311,Shannon信息指数I为0.1898,多态位点百分率P为33.33%。临洮、临夏、岷县、兰州种群的遗传多样性较高,天水、酒泉、漳县种群相对较低。种群聚类...
[期刊] 中国水产科学
[作者]
杨慧荣 江世贵 周发林 龚世园
利用RAPD技术对取自胶州湾(青岛)、台湾海峡(厦门)和北部湾(海南)3个天然群体的24尾黑鲷(Sparusmacro cephalus)进行群体内与群体间的遗传变异分析。在事先优化的反应条件下,所使用的60个随机引物中,有28个引物扩增出清晰稳定的片段,共计200条,大小在200～2500bp,其中多态性片段135条(多态性片段的比例为67.50%)。青岛、厦门和海南黑鲷群体内的遗传距离分别是0.1068、0.0939和0.1206,相似系数为0.8932、0.9061和0.8794;群体间的遗传距离分别是0.1550、0.1318和0.1228,其中青岛和海南黑鲷群体间的遗传距离最大,青岛...
关键词：
黑鲷 遗传变异 RAPD
[期刊] 水产学报
[作者]
江世贵 杨慧荣 苏天凤 龚世园
Random amplified polymorphic DNA( RAPD) technique was applied to assess the genetic variations among inter- and intra-population of three wild stocks(24 individuals) in Red Sea Bream from Jiaozhou Gulf(Qingdao), Taiwan Strait(Xiamen)and Beibu Gulf(Hainan). Under predetermined optimal reaction condit...
[期刊] 北京林业大学学报
[作者]
苗禹博 方攀 杨志恒 朱晓梅 高琼 刘洋 李伟
【目的】本研究旨在探究樟子松在不同地理环境下的生态适应性问题,了解遗传多样性与环境因子之间的关系,在群体遗传结构层面揭示樟子松林分衰退现象。【方法】本文以红花尔基(HHEJ)种源天然林和章古台(ZGT)、围场(WC)、榆林(YL)3个人工引种林,共计4个樟子松群体为研究对象,利用SSR分子标记方法对樟子松不同群体的遗传多样性、遗传平衡、遗传结构稳定性、遗传距离以及影响遗传变异主要因素进行了系统分析。【结果】结果表明:4个群体的遗传多样性大小由低到高依次为HHEJ、ZGT、WC、YL;只有YL群体符合哈迪-温伯格平衡,ZGT群体的连锁不平衡位点达到128对,偏离哈迪-温伯格平衡的程度最大;HHEJ和ZGT群体之间的遗传距离最为接近,WC群体相距较远,YL群体的遗传距离最远;4个樟子松群体的遗传分化相对稳定,不易产生遗传分化;多元回归分析显示樟子松期望杂合度(He)与地理纬度(La)具有显著的负相关关系(r=-0.957),线性关系在α=0.05的水平上显著(P=0.012)。【结论】本研究发现樟子松的遗传多样性可能随着纬度的升高而降低,阐明了不同地区樟子松群体的遗传差异情况,及其林分衰退的可能因素,为樟子松科学的遗传资源保护、引种造林提供了数据支撑和理论指导。
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
张鲜艳 陈发棣 张飞 陈素梅 房伟民
利用ISSR和SRAP分子标记对11份不同地理居群野生菊的遗传多样性进行了分析。结果发现:25个ISSR引物共扩增到203条扩增带,其中有187条呈多态性,多态性比率平均为91.9%;29对SRAP引物组合共扩增到446条扩增带,其中有435条呈多态性,多态性比率平均为97.5%;11个居群间的Ne′is遗传距离分布在0.088 7~0.615 5之间。聚类分析表明,紫花野菊、野路菊及其变种能很好地区分开来,但是野生菊资源的遗传变异与地理分布相关性似乎并不明显。
[期刊] 华北农学报
[作者]
鲍红春 李小雷 王建平 王建民
为明确10个枸杞品种在DNA分子水平上的遗传差异,利用ISSR分子标记技术对其多态性进行了分析。试验从100个ISSR引物中筛选出8个适宜引物,8个引物共扩增出90条清晰可辨的条带,其中44条带具有多态性,多态性条带百分率为48.9%,通过聚类分析,以阈值0.41为基准,把供试的10个材料划分为2个类群,宁杞5号和张成枸杞的遗传距离为0.629 6,遗传关系最远。这将为枸杞的种质遗传多样性分析和杂交育种提供了初步理论依据。
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