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[期刊] 林业科学研究
[作者]
刘梦培 乌云塔娜 朱高浦 赵罕 杜红岩
仁用杏为我国六大木本粮油战略性树种之一,是"三北"地区适应性最强、发展潜力最大的重要生态经济树种之一,被誉为"铁杆庄稼",其抗逆性强,也是集抗旱、抗寒(可低至-35℃)、抗风沙为一体的"先锋"树种。杏仁油中不饱和脂肪酸含量95%左右,其中单不饱和脂肪酸——油酸含量在70%以上,与橄榄油相近,富含丰富的蛋白质、不饱和脂肪
关键词：
蔷薇科 S-RNase基因 仁用杏
[期刊] 西南农业学报
[作者]
戴国礼 张兆萍 程慧 张波 焦恩宁 李彦龙 秦垦
【目的】以16个枸杞品种(系)为试材,进行S-RNase基因型鉴定。【方法】利用茄科S基因高度保守区序列设计兼并引物,进行PCR扩增,片段回收、克隆及同源性检索和序列分析,同时,通过田间授粉测定自交亲和指数进行验证。【结果】11个品种(系)为自交不亲和材料,5个为自交亲和材料。共克隆9个S-RNase等位基因,分别为S-BARB2、S-BARB3、S-BARB6、S-BARB8、SBARB9、S-CHIN3、S-CHIN6,并发现2个新的S等位基因,分别命名为S-BARB6n,S-PUMI5un。所克隆获得的9个枸杞S-RNase等位基因均包含了C2、C3、C4保守区,和2个高变异区(Hva和HVb)。【结论】枸杞属植物存在S-RNase等位基因,其基因序列与茄科植物具有一定相似性,枸杞S-RNase基因是控制枸杞自交不亲和性的关键基因。
关键词：
枸杞 自交不亲和性 S基因型
[期刊] 华北农学报
[作者]
王小国 梁红艳 张薇
引物的通用性研究对于降低引物开发的成本具有重要的意义。为此,本试验选取来源于小麦基因组的41对SSR引物,对其在早熟禾亚科不同属4种植物中的通用性进行了分析。所选取的41对引物在大麦、燕麦、小黑麦和三芒草4种供试植物中的扩增成功率分别为73.2%,82.9%,87.8%和85.4%,有些引物在特定植物中还会出现特异性条带,以上结果表明,从小麦基因组上开发的SSR引物,在早熟禾亚科不同种属植物间有较高的通用性。
关键词：
小麦基因组 SSR 早熟禾亚科 通用性
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
程瑞 张虎平 程寅胜 王英珍 刘兴 王国明 张绍铃
[目的]本文旨在对蔷薇科果树液泡膜单糖转运蛋白(TMT)基因家族成员进行鉴定,分析其染色体定位、序列特性、进化关系及在白梨中的表达特征,为蔷薇科果树TMT基因功能研究和利用奠定基础。[方法]基于苹果、草莓、梅、桃、白梨、西洋梨和黑树莓7个蔷薇科果树物种的全基因组测序结果,应用生物信息学方法进行序列分析,通过RT-q PCR技术分析白梨TMT基因在各器官组织中和果实不同发育阶段的表达特性。[结果]苹果、草莓、梅、桃、白梨、西洋梨和黑树莓等TMT基因家族成员数量分别为5、2、4、4、6、4、2,各物种TMT基
[期刊] 林业科学
[作者]
张琳 谭晓风 周建 何小勇 袁德义 胡姣 龙洪旭
砂梨是重要的经济树种,表现出典型的配子体自交不亲和性,在生产和育种上需鉴定品种的S基因型以确定品种间的亲和性。选取7个砂梨品种为试验材料,使用梨S-RNase(S基因)通用引物进行基因组PCR扩增,产物通过1.8%的琼脂糖凝胶电泳分析。结果表明:‘楚比香’等4个品种中产生了预期的2条电泳条带,而其他3个品种都只产生1条带产物,通过6%的聚丙烯酰胺电泳对该3个品种的PCR产物进一步分析,结果产物被成功分离。将7个品种中分离到的14个条带分别回收、克隆、测序及序列分析,从中鉴别出10个具有梨S-RNase基因序列特征的S基因,其中‘政和大雪梨’中494bp的基因片段被鉴定为新的S基因,暂命名为S4...
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
吴俊 谷超 张绍铃 张树军 宋宏峰 赵习平 刘铁铮
以11个未知基因型的中国杏品种为试材,根据李属植物S-RNase基因保守区设计2对引物组合检测各品种S-RNase基因,共获得22条等位扩增片段,电泳检测表明所有品种的扩增条带集中在300~1100bp的范围内,且表现出一定的长度多态性。序列分析进一步确定22个S-RNase基因为10个不同的等位基因,其中6个为首次发现,根据Gen-Bank中已登陆的杏S-RNase基因的顺序,分别命名为S19、S20、S23、S24、S25、S26,序列登陆号为:EF185300、EF185301、EU037262、EU037263、EU037264、EU037265。推导氨基酸序列的同源分析表明,杏的S-...
[期刊] 华北农学报
[作者]
刘礼瑶 熊仁次 何璐 马思洁 杨叔青
为全面系统地挖掘蔷薇科小G蛋白ROP,在分子水平上为蔷薇科抗病育种提供候选基因。物种系统进化关系分析、ROP蛋白全基因组筛查、Rho功能域分析、蛋白聚类分析及理化性质分析分别运用了NCBI、iTOLv6、GDR、SMART、MEGA11.0和Maximum-likelihood algorithm1及Protparam和expasy等数据库及生物信息学在线软件。11种蔷薇科植物聚为6个亚支;11种蔷薇科植物中筛查到80个ROP蛋白;80个蔷薇科ROP蛋白和11个拟南芥ROP蛋白聚为6个进化分支;蛋白长度、等电点、分子量、脂肪指数及不稳定指数分别为143～215 aa、5.59～9.63、15.74～23.07 ku、85.28～94.95和27.96～57.14。80个蔷薇科ROP蛋白在草莓中数量最多,甜樱桃最少;蔷薇科ROP蛋白分布于第Ⅳ、Ⅴ和Ⅵ分支中,拟南芥ROP蛋白分布于Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ分支中,即分支Ⅵ为蔷薇科特异性分支,分支Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ为拟南芥特异性分支。
[期刊] 西南农业学报
[作者]
苟本富
采用单酶切和双酶切AFLP技术分别对5种不同蔷薇品种基因组DNA的遗传多态性进行了检测,比较了2种方法的多态性比率。单酶切采用10条人工设计的与接头序列相识别的AFLP选择性引物,用PstⅠ酶切,共获得108个AFLP标记,片段大小在100~2000 bp,得到33个多态位点,多态性位点百分率为30.56%;双酶切采用25对双酶切AFLP引物,在50~600 bp扩增出清晰条带658条,得到182个多态位点,占总扩增带的27.6%。对多态性片段进行统计,计算出不同品种间的相似系数和遗传距离。结果表明:硕苞蔷薇同其它4种蔷薇的遗传距离偏远,且其它四种蔷薇的遗传距离均较近,这与蔷薇品种来源和培育史...
[期刊] 中国林业科学研究院
[作者]
包文泉
仁用杏是我国特有的生态经济型树种,也是我国六大木本粮油树种之一。仁用杏浑身是宝,被誉为“铁杆庄家”。与其他杏相比,仁用杏具有适应性强、丰产、出仁率高、营养和经济价值高等优良特点,具有极高的生态维护功能和开发利用潜力。但目前关于仁用杏的分类地位在学术界尚有争议,遗传背景不清晰,阻碍了仁用杏长期育种工程研究的进展,从而制约了这一优良遗传资源的产业化开发。本研究选取仁用杏、普通杏和西伯利亚杏,分别采用形态学分类法、叶绿体全基因组序列比对分析及核基因组SSR分析技术,对仁用杏的分类地位进行了系统研究。主要研究结果
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
陈秋菊 孟冬 李威 顾钊宇 段续伟 袁晖 张懿 李天忠
为探索新疆桃自交亲和的原因及其与普通桃的分类关系，以４个新疆桃（Ｐｒｕｎｕｓ ｆｅｒｇａｎｅｎｓｉｓ Ｋｏｓｔ．ｅｔ ｒｉａｂ）品种为试材，分别在花柱ｓ－ｒｎａｓｅ和花粉ｓｆｂ基因保守区设计引物，在Ｄｎａ中鉴定其ｓ基因型，并通过全长引物分别克隆４个品种中的ｓ－ｒｎａｓｅ和ｓｆｂ全长基因。测序后经分析确定ｓ基因型分别是：‘和田黄肉’ｓ２ｓ２ｍ，‘喀什１号’ｓ１ｓ２，‘喀什４号’ｓ２ｓ２，‘黄李光’ｓ１ｓ２。Ｄｎａｍａｎ软件比对结果表明：ｓ２ｍ－ｒｎａｓｅ的第６０２个碱基鸟嘌呤ｇ变成了腺嘌呤ａ，导致半胱氨酸变成了酪氨酸；ｓｆｂ１ｍ在第９７８个碱基后插入１５５ｂＰ的片段，导致蛋白质翻译提前终止；ｓｆ．．．
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
陈慧 张树军 张妤艳 衡伟 吴俊 张绍铃
利用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离及DNA序列分析,对我国主栽的4个梨系统的40个梨品种的S基因型进行了鉴定。结果表明:‘早生喜水’和‘玉水’,‘湘南’和‘大青梨’,‘水红霄’、‘红霄’和‘云南黄皮水’,‘青皮酥’和‘白皮酥’,‘斯尔克甫梨’和‘沙-01号香梨’都具有相同的S基因型,分别为S3S4、S1S3、S16S19、S34S n和S22S28,鉴于梨自花授粉不结实的特性,应避免这些品种间的配置授粉。同时,对这40个梨品种中出现的29个S基因的分布频率进行了分析,结果表明:不同的S基因出现的频率不同,S1和S3出现的频率最高为10.0%,其次为S19(8.75%)、S22和S34(6.25%)...
关键词：
梨 自交不亲和 S基因型 频率
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
程梦雨 李小强 王鹏 张华 张绍铃 吴巨友
[目的]本文旨在鉴定分析CLE(CLAVATA3/Embryo surrounding region)多肽家族的特点及进化特征,深入了解蔷薇科果树CLE多肽的功能。[方法]基于全基因组测序结果,采用生物信息学方法,参考拟南芥中CLE多肽序列鉴定梨、苹果、桃、梅、草莓和黑树莓6个蔷薇科果树物种CLE多肽家族序列信息,重点分析梨CLE多肽家族的基因结构和理化特性等;通过转录组数据分析PbrCLE成员在不同组织以及在花柱和花粉不同发育阶段的表达模式;并通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术分析5个PbrCLE成员在花粉和花柱中的表达模式。通过外源CLE多肽处理梨花粉,研究其调控花粉管生长的功能。[结果]本研究在蔷薇科果树中共筛选到91个CLE候选基因。各物种CLE基因不均匀分布在5～12条染色体上。聚类分析将所有CLE基因分为4组。K_a/K_s分析表明大部分PbrCLE基因都经历了纯化选择。转录组结果表明大部分CLE基因在梨不同组织中的表达量均较低,这与多肽信号分子在植物体内含量较低相一致。外源合成的PbrCLE31多肽可以抑制体外培养的梨花粉管生长。[结论]蔷薇科果树中存在保守的CLE基因,并且PbrCLE31多肽可以抑制梨花粉管的生长。
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
乌云塔娜 杜红岩 李洪果 杨绍彬
用蔷薇科S基因4对引物对40个李、杏地方品种的S基因进行PCR扩增、测序确定了40个李、杏品种的S基因型。‘蜜李’、‘水晶李’、‘不祥李’的S基因型均为Sc/Se;‘空心李’、巴塘李’的S基因型均为S10/S11;‘绥棱红李’、‘早黄李’的S基因型均为S10/Sg;‘离核1号’、‘离核4号’的S基因型均为S11/Se。其他品种的S基因型如下:‘新疆1号’S17/S8、‘朱砂李’S11/S8、‘、‘平顶香’Sk/Se、‘大青稞’S10/S8、‘连平三花李’S10/S6、‘早李’S10/S15、‘李子梅’S10/S22、‘横道河子大红李’S17/S10、‘苹果李’S15/S16、‘紫云鸡血李’S1...
关键词：
S基因型 李 杏 基因鉴定
[期刊] 中国农业科学
[作者]
唐亮 马香 李明霞 周志钦
【目的】通过分析苹果属植物自交不亲合性位点S-RNase基因的序列,研究S-RNase基因在苹果属的进化历史,序列分歧特点和遗传多态性。【方法】利用栽培苹果的S-RNase基因序列在GenBank数据库中检索和鉴定所有已知的苹果属植物的S-RNase基因,同时利用S-RNase基因的保守引物获得陇东海棠和变叶海棠的S-RNase基因序列。通过系统发育分析研究S-RNase基因的进化历史,进而计算dN/dS比值揭示S-RNase基因序列分歧的特点,最后估计并比较苹果属不同类群S-RNase基因的遗传多态性及其遗传分化。【结果】苹果属植物的S-RNase基因可以分为16个亚类,同一亚类S-RNas...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
侯哲 李昂 黄长兵
月季、蔷薇和玫瑰是隶属于蔷薇科蔷薇属的姊妹树种，由于长时间的杂交和人工栽培，三者的形态很难区分，急需开发一套分子标记对三者进行鉴定。据此，本研究获取了月季、蔷薇和玫瑰的叶绿体基因组序列，对其基因组序列的特点、简单重复序列(SSR)分子标记、核苷酸多态性及月季、蔷薇和玫瑰在蔷薇属内的系统发育关系进行了分析。结果表明：月季、蔷薇和玫瑰的叶绿体基因组全长分别为156 591、156 592、157 110 bp,均具有非常典型的四分体结构；月季、蔷薇和玫瑰叶绿体基因组分别含有131、137、136个基因，总GC含量均为37.00%;月季、蔷薇和玫瑰叶绿体基因组的结构高度相似，共线性关系良好，蛋白编码区域保守度与相似度最高；在月季、蔷薇和玫瑰的叶绿体基因组中分别鉴定出57、59、46个SSR,且绝大多数是单核苷酸重复序列；以筛选到的matK基因作为分子标记构建的系统发育树显示，蔷薇科蔷薇属植物聚为一个单系类群，可以区分月季、蔷薇和玫瑰，且月季与蔷薇的亲缘关系最近。本研究结果可为后续蔷薇属植物的遗传多样性、遗传结构及系统发育研究提供参考。
关键词：
月季 蔷薇 玫瑰 叶绿体基因组
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