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[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 李象松  魏丽华  李炫丽  汪艳杰  王冰  吴江生  龙鸿  
以人工合成的萝卜-芥蓝异源四倍体的F4和F10世代为材料,用MSAP法检测2种材料DNA甲基化变异情况,以期为远缘杂交后不同世代间基因组DNA甲基化遗传和变异规律提供实验依据。结果表明:F4代和F10代甲基化程度分别为30.61%和33.10%,共检测12种甲基化变异模式,可以分为5种类型,甲基化变异位点占所有甲基化位点的41.71%。用甲基化抑制剂5-氮胞苷处理F4代,F10代材料,检测到甲基化程度分别为20.67%和25.75%,F代比F代受到了更大冲击,说明不稳定世代对环境的影响更加敏感。
[期刊] 中国农业科学  [作者] 朱红菊  刘文革  赵胜杰  路绪强  何楠  豆峻岭  高磊  
【目的】研究二倍体和同源四倍体西瓜幼苗NaCl胁迫后形态学指标差异和DNA甲基化变化情况,分析不同倍性西瓜幼苗之间耐盐差异,结合形态学指标从表观遗传学角度解释二倍体和四倍体抗逆性差异机制。【方法】以3组不同倍性(二倍体、四倍体)西瓜幼苗为研究对象,待长至三叶一心时,用含有0、100、200、300和400mmol·L-1 NaCl的1/2 Hoagland营养液处理西瓜幼苗,NaCl处理8 d之后,鉴定西瓜幼苗受到的盐害指数,并运用甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)技术,分析NaCl处理8 d之后二倍体和四...
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 张曼曼  冯兵  罗双双  王卫民  周小云  
以二倍体和四倍体泥鳅为研究对象,采用甲基化修饰依赖性内切酶测序技术(MethylRAD-Seq)在全基因组水平上分析泥鳅的DNA甲基化特点及倍性间的DNA甲基化变异。测序结果共得到302 111 684条Methyl-RAD序列标签。与参考基因组比对结果显示,泥鳅的甲基化位点主要分布在基因体区(gene body),其次为内含子区(intron)和基因间区(intergenic),而在其他功能元件上的分布较少。四倍体泥鳅的整体甲基化水平比二倍体高,尤其是在第一外显子区(1st Exon)和转录起始位点上游1 500bp至200bp区(TSS1500),且倍性间差异极显著(P
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 吕炜  户秋稳  李艳艳  吴兴勇  彭丹  张蜀宁  
[目的]对秋水仙素诱导同源四倍体苗期性状进行筛选,提高加倍率,为市场提供更优质高产四倍体萝卜。[方法]以二倍体萝卜‘小顶红’为材料,用1.5、2.0和2.5 g·L-1秋水仙素点滴子叶期生长点,分别处理4次和6次,拉十字期时对叶片响应进行形态分类、形态解剖学和流式细胞仪鉴定,测定二、四倍体农艺性状、肉质根营养成分,以及二、四倍体‘小顶红’和‘穿心红’种子发芽相关物质。[结果]2.0 g·L-1秋水仙素处理4次获得的四倍体植株加倍率最高,为4.76%。幼苗真叶响应形态可分为正常叶、簇状叶、棒状叶和勺状叶,簇状叶类型当代选株中四倍体加倍率最高,占88.24%。与二倍体相比,四倍体的气孔、花粉粒、花...
[期刊] 中国水产科学  [作者] 姜群  于红  孔令锋  李琪  
采用荧光标记的甲基化敏感性扩增多态性(F-MSAP)技术对太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)的6个组织进行全基因组CCGG位点甲基化水平的检测。结果表明:鳃、闭壳肌、外套膜、唇瓣、性腺、消化盲囊6个组织的甲基化水平分别为:31.77%、36.41%、32.00%、36.47%、32.77%和37.92%。甲基化模式分为全甲基化和半甲基化,在太平洋牡蛎中,全甲基化模式与总体甲基化水平一致,消化盲囊、唇瓣、闭壳肌组织的甲基化水平较高,而鳃、外套膜、性腺组织的甲基化程度较低;半甲基化位点显著少于全甲基化位点,并且不同组织间的半甲基化位点不存在显著性差异,而从全甲基化位点及总甲基化水平分...
[期刊] 水产学报  [作者] 李建中  鲁双庆  刘少军  刘正华  张轩杰  刘筠  
在优化RAPD检测条件的基础上,从100个随机引物中筛选出60个扩增较好的引物对异源四倍体鲫鲤及其原始亲本红鲫和湘江野鲤相互间扩增DNA片段的异同性进行比较研究。结果显示,60个引物共产生1554条带,单一引物扩增的DNA片段数在6~20条之间,片段大小在200~3500bp之间。遗传相似率分析表明,异源四倍体鲫鲤与其原始母本红鲫的相似率为69.41%,与其原始父本野鲤的相似率为64.47%,说明异源四倍体鲫鲤接受原始母本红鲫的遗传物质要多一些;而红鲫和野鲤之间的相似率为42.18%,说明两者的基因组成有较大的相似性,从分子水平证实了红鲫和野鲤的远缘杂交具有较大的亲和性。在分析中,还发现异源四...
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 徐伟钰  张蜀宁  张杰  张振超  侯喜林  
在田间试验条件下,比较了自然高温下二倍体和四倍体萝卜的生长情况、株型和产量,并在光照培养箱中研究了高温胁迫(36℃/26℃(昼/夜),10 d)对膜的伤害。研究结果表明,四倍体萝卜的耐热性强于二倍体,四倍体表现出抗热特征:株型直立,叶片增厚,叶形缺刻少趋近板型叶,叶片深绿色且高产,与二倍体相比差异显著。在控制高温胁迫过程中,四倍体的电解质渗透率、可溶性糖和MDA含量均低于二倍体,但两者变化趋势相似;四倍体的SOD、POD和CAT活性,可溶性蛋白及总叶绿素含量均高于二倍体。因此,田间试验结合人工模拟高温可以很好地鉴定萝卜耐热性。
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 王红娟  韩盼盼  李雅婷  向增旭  
[目的]本文旨在探索白术同源四倍体基因组在分子水平上的变化规律。[方法]以二倍体及其同源四倍体白术的试管苗为试验材料,应用MSAP和ISSR技术研究其DNA甲基化情况及遗传差异性。[结果]白术二倍体及其同源四倍体MSAP扩增总条带数均为373条,四倍体半甲基化率高于二倍体,而总甲基化率和全甲基化率却低于二倍体,54.96%的四倍体DNA甲基化模式发生了变化。采用5条ISSR引物检测1个白术二倍体和5个同源四倍体株系,共发现25个清晰的扩增位点,多态性位点13个,多态性为52.0%。[结论]白术二倍体人工加倍后遗传机制发生了变化。
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 张红亮  张蜀宁  张伟  张振超  
采用不同质量浓度的秋水仙素处理子叶期二倍体萝卜茎尖生长点,通过对突变株进行形态学、细胞学、农艺学及营养品质鉴定,获得同源四倍体。结果表明:经2.0 g.L-1秋水仙素处理6次获得同源四倍体的效果最佳,四倍体诱导率达到4.5%。与二倍体相比,四倍体植株在叶片厚度、气孔大小、保卫细胞内叶绿体数目、花器官大小、花粉粒纵横径、种子单粒径等表现出"巨大性";四倍体植株株高、十叶厚、直根重等农艺学性状指标显著大于二倍体;四倍体萝卜维生素C、可溶性蛋白、有机酸、可溶性糖、还原糖等营养品质指标也高于二倍体。
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 张曼曼  高泽霞  冯兵  罗双双  曹文怡  周小云  
为探讨胰岛素样生长因子结合蛋白-1(IGFBP-1)基因在二倍体和四倍体泥鳅之间的表达差异及其与DNA甲基化的相关性,克隆二倍体、四倍体泥鳅的CDS序列和启动子序列,并分别采用qRT-PCR和亚硫酸氢盐测序技术(BSP)分析IGFBP-1在二倍体、四倍体泥鳅中的表达水平及启动子区和第一外显子区的甲基化水平。结果显示,泥鳅的IGFBP-1基因CDS序列长789bp,编码262个氨基酸,二倍体、四倍体泥鳅间有5bp的差异,但氨基酸序列完全相同。在二倍体、四倍体中分别克隆得到2 341bp和2 331bp的启动子序列,倍性间的序列相似度达99%,启动子序列中包含典型元件TATA-box,以及SP1、CREB、C/EBP、POU2F2、GATA-2/3/4和SRY等转录因子结合位点。泥鳅的IGFBP-1基因主要在肝脏中表达,且四倍体泥鳅肝脏中IGFBP-1的表达水平显著高于二倍体(P<0.01)。四倍体泥鳅IGFBP-1基因启动子及第一外显子区的甲基化水平均比二倍体低,其中四倍体肝脏中的甲基化水平显著低于二倍体(P<0.01)。综合分析研究结果表明,在IGFBP-1基因主要表达的肝脏组织中,其mRNA表达水平与DNA甲基化水平呈负相关,启动子区较高的甲基化可能抑制了二倍体泥鳅IGFBP-1基因的表达。
[期刊] 水产学报  [作者] 黎双飞  刘少军  张轩杰  罗琛  周工建  刘筠  
用密度梯度离心和DNase Ⅰ、RNase消化法从异源四倍体鲫鲤(F8)和鲫鲤F2肝组织中提取和纯化线粒体DNA(mtDNA)。用9种限制性内切酶对异源四倍体鲫鲤和鲫鲤F2的mtDNA进行了分析,结果表明XbaⅠ和BglⅡ两种限制性内切酶在异源四倍体鲫鲤mtDNA上存在酶切位点多态性。通过凝胶电泳测得异源四倍体鲫鲤mtDNA相对分子量平均约 10.29 × 106道尔顿,分子大小为 16.20kb;鲫鲤 F2 mtDNA相对分子量为 10. 18 × 106道尔顿,分子大小为16.02kb。根据单酶解和双酶解的片段数目和分子大小,构建了异源四倍体鲫鲤mtDNA的7种限制性内切酶(Kpn Ⅰ、P...
[期刊] 水产学报  [作者] 王凤华  周毅  刘少军  钟欢  张纯  陶敏  刘筠  
载脂蛋白E(Apolipoprotein E,ApoE)作为胆固醇代谢过程中的关键因子,参与脂蛋白转运和性腺发育。为进一步了解该基因的作用,本实验克隆并测序了异源四倍体鲫鲤及其父母本ApoE基因的全长序列。异源四倍体鲫鲤、红鲫和鲤的ApoE全长分别为1393 bp、1384 bp和1396 bp,均编码281个氨基酸。序列对比表明,异源四倍体鲫鲤ApoE与父本鲤更为相似。另外有2个氨基酸位点发生了与父母本均不同的变异,证明异源四倍体鲫鲤除了有杂交特征外也产生了变异。通过Mega软件构建的哺乳动物ApoE进化树与系统分类相一致:鲤科鱼类的ApoE聚类在一起而分离于其它物种。Real time P...
[期刊] 林业科学  [作者] 张晓申  范国强  赵振利  曹喜兵  赵改丽  邓敏捷  董焱鹏  
植物多倍化既是对自然环境适应的结果,也是推动其进化和物种形成的重要因素。自然界大约70%的被子植物在进化史中经历过一次或多次多倍化过程(Masterson,1994;Wendel,2000)。多倍体植物具有器官和生物量增大的特征及较强适应生物和非生物胁迫的能力(Hilu,1993;Liu et al.,2002)。植物多倍化过程中,在染色体结构(Swapna et al.,
[期刊] 中南林业科技大学学报  [作者] 翟晓巧  张晓申  范国强  赵振利  曹喜兵  
分别用AFLP和MSAP分子标记技术,研究了毛泡桐二倍体及其同源四倍体幼苗DNA碱基序列及其甲基化的变化。结果表明,毛泡桐二倍体及其同源四倍体DNA碱基序列在AFLP水平上没有发生变化;在MSAP扩增电泳凝胶上,毛泡桐二倍体及其同源四倍体分别检测到2 262和2 180个扩增位点,DNA甲基化位点占总扩增位点的比例分别为35.32%和38.58%,其中DNA全甲基化比例则为12.86%和14.13%;毛泡桐同源四倍体DNA甲基化和去甲基化频率高于其二倍体,总DNA甲基化多态性低于二倍体。
[期刊] 南京农业大学学报  [作者] 张蜀宁  张伟  张红梅  
采用常规压片法观察了同源四倍体萝卜花粉母细胞减数分裂过程。结果表明:二、四倍体减数分裂主要过程基本相似,均为同时型胞质分裂。区别在于:四倍体前期Ⅰ19.3%的花粉母细胞具有双核仁;中期Ⅰ染色体构型复杂,二价体占53.8%,四价体占33.9%,多价体占7.4%;在25.5%的花粉母细胞中观察到染色体落后和染色体桥现象;中期Ⅱ纺锤体有"八"字、垂直和平行3种类型;非正常四分体达6.7%,败育率达32.0%。
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