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[期刊] 中国农业科学
[作者]
冯献君 王丽 王彤 侯雷平 李梅兰
【目的】菜心口感脆嫩，营养价值高，是华南地区人们最喜爱的蔬菜之一，其中糖的种类和含量是决定菜心甜度和风味的主要因素。分析菜心不同器官糖含量及与糖代谢和转运相关基因的表达，以探明导致菜心不同器官糖含量差异的分子机制。【方法】采用高效液相色谱法测定菜心叶片、薹茎和花蕾中可溶性糖、蔗糖、葡萄糖和果糖的含量；通过转录组测序技术对菜心叶片、薹茎和花蕾基因的表达量进行全面系统的分析，并利用DESeq2软件鉴定3个不同器官间的差异表达基因，分析糖代谢通路及转运过程涉及的酶编码基因的表达，在基迪奥生信云平台将筛选到的与糖代谢转运相关的差异表达基因和糖含量进行相关性分析，同时利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对部分基因的表达量进行验证。【结果】糖含量测定结果表明，菜心不同器官之间糖含量差异明显。可溶性糖、蔗糖、葡萄糖和果糖含量均呈现花蕾>薹茎>叶片的趋势。花蕾中葡萄糖含量分别为薹茎和叶片的1.3倍和1.6倍，果糖含量分别为薹茎和叶片的1.42倍和1.78倍。通过分析糖代谢关键酶和转运蛋白编码基因与糖含量变化趋势的一致性，共找出18个与糖含量变化趋势一致的基因。通过分析糖代谢转运中相关差异基因的表达与糖种类及含量的相关性和一致性，鉴定了14个与糖含量变化趋势一致的DEG。合并7个共有基因（Bra020096、Bra029914、Bra033419、Bra037980、Bra027398、Bra006129和Bra006130），共计25个基因与糖含量变化趋势一致。qRT-PCR结果分析表明筛选到的8个差异基因的表达量FPKM值与相对表达水平高度一致，说明测序结果准确可靠。【结论】菜心花蕾中的糖含量高于薹茎和叶片，是由合成相关酶编码基因的表达在薹茎和花蕾中高于叶片所致，研究结果为揭示菜心不同器官中糖代谢及转运的分子机制奠定了一定基础。
关键词：
菜心 器官 糖类 转录组 基因
[期刊] 中国农业科学
[作者]
李占省 刘玉梅 方智远 杨丽梅 庄木 张扬勇 吕红豪
【目的】克隆青花菜细胞色素家族P450CYP79F1,分析其序列特征,阐明其在不同发育时期器官中的表达情况及其与莱菔硫烷含量的关系,为进一步揭示莱菔硫烷合成机理提供科学依据,为青花菜品种改良和新品种选育奠定基础。【方法】通过5′和3′端RACE克隆技术获得青花菜CYP79F1全长序列,利用DNAMAN 6.0进行基因拼接、氨基酸序列分析和蛋白二级结构预测,结合在线分析程序和软件进行基因和编码蛋白生物信息学分析;利用荧光定量PCR技术研究CYP79F1在不同发育器官中的表达情况;结合HPLC方法测定各相应时期器官中莱菔硫烷含量,包括青花菜发育时期的根、茎、叶,成熟花球,抽薹期花蕾(顶端蕾、成熟蕾、开花前1 d的蕾和花)和种子;对CYP79F1表达量与和莱菔硫烷含量进行相关性分析。【结果】获得了CYP79F1全长序列,Gen Bank登录号为MG012890,该基因全长2 014 bp,包含一个1 620 bp的开放读码框(ORF),编码540个氨基酸;编码的蛋白与甘蓝、白菜、芥蓝和油菜等同源蛋白的相似性均在95%以上;生物信息学分析表明该基因编码的酶蛋白有2个信号肽和2个跨膜结构域,为亲水性稳定蛋白,Wolf Psort预测其亚细胞定位于细胞质中;CYP79F1在根和茎中的表达量较高,叶中表达量最低,在花器官发育时期,自顶端蕾到花发育过程中呈现逐渐降低的表达趋势,种子中该基因表达量与花处于同一水平。Pearson相关性分析显示,青花菜发育时期的根、茎、叶、成熟花球、抽薹期花蕾和种子中莱菔硫烷含量与CYP79F1表达量无显著相关关系,但抽薹期花蕾自顶端花蕾到花中莱菔硫烷生成量与CYP79F1表达量呈显著正相关关系(R=0.96,P<0.05),CYP79F1在调控莱菔硫烷的生成方面起重要作用,尤其是在生殖器官花蕾的发育过程中,能够显著上调莱菔硫烷的生成量。【结论】CYP79F1在青花菜不同发育器官中对莱菔硫烷的生成发挥着重要调控作用,可能与青花菜不同器官中莱菔硫烷含量多样性密切相关。
[期刊] 华北农学报
[作者]
郭琳琳 罗静 庞荣丽 王瑞萍 黄玉南 乔成奎 李君 庞涛 谢汉忠
为了解析采前CPPU处理的猕猴桃果实贮藏性与未处理果实的差异及相关的分子调控机制,以清水为对照,评价了盛花后用20 mg/L CPPU处理果实在常温贮藏下可溶性固形物、可滴定酸及可溶性糖含量的变化,并用转录组分析鉴定出与可溶性糖变化相关的候选基因。结果表明,无论处理还是对照,可溶性糖含量在贮藏过程中呈逐渐上升趋势,但CPPU处理果实的可溶性糖含量始终低于对照果实。转录组分析表明,CPPU处理抑制了淀粉和蔗糖代谢中的基因Achn087691(编码磷酸己糖异构酶)以及果糖和甘露糖代谢中基因Achn203191(编码磷酸丙糖异构酶)的表达,并促进淀粉和蔗糖代谢中基因Achn069851(编码己糖激酶)前期表达,但对基因Achn161931(编码尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶)、基因Achn206141(编码尿苷二磷酸-葡萄糖醛酸酯-4-表异构酶)和基因Achn295291(编码果胶甲酯酶)表现为前期抑制、中期促进、后期抑制。由此推测,20 mg/L CPPU处理明显影响了徐香猕猴桃果实中可溶性糖含量及糖代谢相关基因的表达,致使果实常温贮藏过程中可溶性固形物和可溶性糖含量降低,且提前软化。
关键词：
猕猴桃 贮藏 转录组测序 糖含量
[期刊] 华北农学报
[作者]
曹淑燕 荣毅 古咸杰 李清南 廖玲 叶霜 邱霞 汪志辉
为了探究不同砧木对黄果柑果实有机酸含量、酸代谢相关酶活性及基因表达的影响，为黄果柑砧木的选择提供理论依据。以枳壳、红橘、香橙为砧木，黄果柑实生苗为对照进行研究。黄果柑果实以积累柠檬酸为主，香橙砧能够最有效地降低果实有机酸含量，成熟期比实生苗低２４．３５％；嫁接能够一定程度的降低ＣＳ活性，而对ＰＥＰＣ、ＭＤＨ活性的影响较小；花后２５０～３３０ Ｄ，ＡＣＯ和ＮＡＤＰ－ＩＤＨ活性均表现出香橙砧＞枳壳砧＞红橘砧＞ＣＫ的趋势；除实生苗外，黄果柑ＮＡＤＰ－ＩＤＨ表达水平与总酸含量间呈显著性负相关，而ＣＳ、ＭＤＨ、ＡＣＯ与总酸含量均未表现出显著相关性。香橙是黄果柑理想的砧木品种，砧木间果实有机酸差异是ＡＣＯ．．．
关键词：
黄果柑 砧木 有机酸 酶活性 基因表达
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
曹雄军 卢晓鹏 熊江 谢深喜
以枳为试验材料,进行干旱胁迫处理(对照组的基质相对持水量维持在55%~65%),分别在处理后第7、17、27、37天采样,研究干旱胁迫对枳侧根、主根、茎、叶片中全氮含量的影响以及氮代谢途径中NRT、NR、NiR、GS、GOGAT、GDH等16个相关基因在侧根和叶片中的表达。结果表明:随着干旱时间的延长,枳的侧根、主根、茎、叶中全氮含量与对照相比均显著下降,其中侧根全氮含量下降最为显著;枳叶片中与氮代谢相关的16个基因均能被干旱胁迫诱导而上调表达,且多数基因在干旱第27天上调至最高水平,而后随着叶片的萎蔫而下调;枳侧根中有8个基因(NRT1.2、NRT1.7、GS2、NADH–GOGAT2、NADP–GDH、GDH1、GDH2、GDH3)在干旱处理后27天呈现不同程度的上调表达,有4个基因(NRT1.1、NRT1.5、GS1、NADH–GOGAT3)的表达基本不受干旱胁迫的影响,还有4个基因(NR、NiR、Fd–GOGAT、NADH–GOGAT1)的表达显著下调。
关键词：
枳 干旱胁迫 氮代谢 基因表达
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
郭诗芬 钟婷婷 卢文斌 刘忠松 邬贤梦 官春云 肖钢
为明晰油菜BnaYUCCA10基因与油酸含量之间的关系，以miRNA测序得到的BnaYUCCA10基因为对象，采用实时荧光定量PCR(RT–PCR)技术研究BnaYUCCA10基因在30份不同油酸含量的甘蓝型油菜不同部位和生长时期的表达情况，并对BnaYUCCA10基因是否参与油酸的代谢进行分析。结果表明：营养生长期大部分油菜材料的BnaYUCCA10基因表达量随生育进程逐渐增加，高油酸材料与非高油酸材料间无显著差异；在开花1 d的花中的表达量高于花蕾和开花5 d的花中的表达量，且在高油酸材料与非高油酸材料中的表达量差异显著；在角果期的表达量随生育进程逐渐降低，在高油酸材料与非高油酸材料中的表达量差异显著；BnaYUCCA10基因在角果期及开花5 d的花中的表达量与油酸含量呈极显著正相关，在高油酸材料中的表达量显著高于非高油酸材料的。推测BnaYUCCA10基因可能参与了种子中的油酸代谢，可为油菜油酸调控机制的研究提供参考依据。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
郭诗芬 钟婷婷 卢文斌 刘忠松 邬贤梦 官春云 肖钢
为明晰油菜BnaYUCCA10基因与油酸含量之间的关系，以miRNA测序得到的BnaYUCCA10基因为对象，采用实时荧光定量PCR(RT–PCR)技术研究BnaYUCCA10基因在30份不同油酸含量的甘蓝型油菜不同部位和生长时期的表达情况，并对BnaYUCCA10基因是否参与油酸的代谢进行分析。结果表明：营养生长期大部分油菜材料的BnaYUCCA10基因表达量随生育进程逐渐增加，高油酸材料与非高油酸材料间无显著差异；在开花1 d的花中的表达量高于花蕾和开花5 d的花中的表达量，且在高油酸材料与非高油酸材料中的表达量差异显著；在角果期的表达量随生育进程逐渐降低，在高油酸材料与非高油酸材料中的表达量差异显著；BnaYUCCA10基因在角果期及开花5 d的花中的表达量与油酸含量呈极显著正相关，在高油酸材料中的表达量显著高于非高油酸材料的。推测BnaYUCCA10基因可能参与了种子中的油酸代谢，可为油菜油酸调控机制的研究提供参考依据。
[期刊] 华北农学报
[作者]
王晓丹 胡庆一 张振乾 王悦 官春云
提高油菜籽品质一直是育种家们不懈追求的目标之一,不同的栽培措施对油菜不通脂肪酸合成有一定影响,为从分子方面促进油菜脂肪酸组成改良研究的发展,以甘蓝型油菜420为材料,采用三元二次回归正交组合设计方法,对不同生育时期、不同栽培条件下叶绿素含量及fad2、fad3基因的表达量变化情况进行分析。研究发现:叶绿素含量随着氮、硼施用量的增加呈先升后降,随种植密度增加而降低;fad2、fad3的表达量变化与叶绿素含量规律相同,且通过线性拟合分析发现,fad2、fad3基因表达量与叶绿素含量呈正相关关系。结果表明,fa
[期刊] 渔业科学进展
[作者]
徐菲 刘志峰 赵海池 杨明超 孙志宾 徐荣静 马爱军
为了研究脂水平是否对低盐胁迫导致的大菱鲆(Scophthalmus maximus)脂代谢紊乱具有缓解作用，本研究进行了低盐胁迫下不同脂含量饲料的投喂实验，以确定大菱鲆在应对低盐度时的最佳脂质需求量。本研究设置了3个盐度梯度(10、20和30)，每个盐度组设置4个脂含量梯度(8%、12%、16%和20%)，分析在不同盐度下不同脂含量饲料对大菱鲆幼鱼生长性能、脂质代谢及其相关基因表达的影响。结果显示，脂质含量为16%时，盐度20与30组之间大菱鲆幼鱼的生长性能无显著差异，盐度10组的生长性能要低于20和30组；盐度10下大菱鲆幼鱼的生长性能随脂含量的增加而增加，最高值出现在20%组，且高于盐度30与20下的20%组。脂代谢相关基因表达方面，在盐度10和20养殖条件下，与脂合成相关的基因lxrα、cyp7a1和srebp-1的表达量基本随脂含量升高呈先升高后降低的趋势，尤其在盐度10下，12%组的表达量高于其他各组，20%组显著低于其他各组(P<0.05)。此外，在盐度10下，acc和fas基因的表达水平类似，在高脂20%组中均被抑制，在12%组的表达量较高。与脂吸收相关的基因apoa-IV在盐度10下20%组的表达量远高于相同盐度条件下其他各组(P<0.05)，而且在脂含量20%条件下呈随盐度升高而降低的趋势，这与其他脂质组中的趋势完全相反。以上结果表明，低盐胁迫影响脂代谢后，通过不同脂含量的饲料可以从脂合成和脂吸收的角度来缓解胁迫带来的不利影响，且这种缓解作用更多的体现在脂吸收层面上，进而提高低盐胁迫下的生长表现。研究结果从盐度影响脂代谢的角度探索鱼类对低盐的适应性，可为大菱鲆耐低盐良种选育提供理论和技术支撑。
关键词：
盐度 大菱鲆 生长性能 脂代谢相关基因
[期刊] 淡水渔业
[作者]
黄陈翠 孙健 吉红 黄小城 边晨晨
为了探究硫辛酸对草鱼(Ctenopharyngodon idellus)脂肪细胞脂质代谢的影响,分离草鱼腹腔脂肪组织,消化得到脂肪细胞进行体外培养,分别用0、50和200μmol/L硫辛酸孵育细胞6 h,收取细胞和培养基样品后检测细胞甘油三酯(TG)含量、甘油和非酯化脂肪酸(NEFA)释放量及脂代谢相关基因表达。结果显示:50和200μmol/L硫辛酸处理显著降低草鱼脂肪细胞TG含量,200μmol/L硫辛酸显著增加细胞甘油和NEFA的释放量。200μmol/L硫辛酸组脂肪细胞脂肪分解相关基因(HSL、PPARα、CPT1、CD36)mRNA表达显著高于对照组,且ACC和PPARγ的mRNA表达水平显著上升,ATGL、MGL、SREBP-1c、FAS、DGAT等脂代谢基因表达状况无显著变化。综上所述,硫辛酸可能通过诱导草鱼脂肪细胞HSL和CPT1的基因表达促进脂质水解和β-氧化,从而降低脂肪细胞脂质含量。
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
李泓江 刘婉 刘大志 钟艺文 谭进 刘小燕
采用荧光定量PCR技术,检测翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)快肌和慢肌中与糖代谢相关的16个基因的表达情况,并比较其表达差异性,分析翘嘴鳜肌肉糖代谢调控特点。结果显示:在快肌和慢肌中,与葡萄糖摄取和磷酸化相关的基因存在显著性差异表达的各有4个;与糖原代谢相关的基因有显著性差异表达的有2个;PI3K、MAPK5、MAPK63个基因在快肌中的相对表达量极显著高于在慢肌中的,表明与这3个基因相关的葡萄糖的摄取和利用快肌强于慢肌;而MEF2α、PGC–1α、PGC–1β、PDK1、MAPK4、GYS1、GSK3β7个基因在慢肌中的相对表达量显著高于快肌,表明与这7个基因相关的葡萄糖的摄取和利用慢肌强于快肌。
关键词：
翘嘴鳜 快肌 慢肌 糖代谢 基因表达
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
帅良 庞纪伟 胡美华 廖玲燕 殷菲胧 刘云芬 李小洁 何妹英
[目的]本文旨在探究采后常温（RT）和低温（LT）贮藏过程中龙眼果实糖含量和代谢相关酶活性及基因表达变化的规律，为龙眼果实采后贮藏保鲜提供参考依据。[方法]以‘储良’龙眼为试验材料，设置4 ℃和25 ℃处理，探究其TSS、蔗糖、葡萄糖和果糖含量变化情况及相关糖代谢酶活性和相关基因表达量的变化规律。[结果]不同贮藏温度下的糖含量变化不同，常温贮藏过程中蔗糖含量下降，葡萄糖和果糖含量上升，而低温贮藏保持较高的蔗糖含量，促进葡萄糖和果糖含量快速下降。与常温贮藏相比，低温贮藏提高了蔗糖磷酸合成酶（SPS）活性，抑制中性转化酶（NI）活性、酸性转化酶（AI）活性、蔗糖合成酶（SS）活性、果糖激酶（FRK）活性和己糖激酶（HXK）活性，抑制了DlNI、DlAI、DlSPS、DlFRK和DlHXK基因的表达。相关性分析表明，低温贮藏改变了龙眼果实中蔗糖含量与糖代谢相关酶活性和基因表达的关系。主成分分析也显示，低温贮藏延缓了龙眼果实蔗糖代谢的发生，保持较好的果实品质。[结论]低温贮藏通过调控龙眼果实糖代谢相关基因的表达，影响相关酶活性进而使糖组分发生变化，使龙眼果实保持较高的蔗糖含量，延缓龙眼果实品质劣变。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
许海峰 王楠 姜生辉 王意程 刘静轩 曲常志 王得云 左卫芳 张晶 冀晓昊 张宗营 毛志泉 陈学森
【目的】研究新疆红肉苹果（Ｍａｌｕｓ ｓｉｅｖｅｒｓｉｉ ｆ．ｎｅｉｄｚｗｅｔｚｋｙａｎａ（ｄｉｅｃｋ）ｌａｎｇｅｎｆ．）与‘富士’（Ｍ．ｄｏＭｅｓｔｉｃａ ｃｖ．ｆｕｊｉ）等苹果品种杂交后代株系间果实类黄酮合成差异的分子机理，为进一步完善功能型苹果育种的理论与技术体系提供科学依据。【方法】以紫红２号及红脆１、２、４号等红肉程度存在明显差异的４个苹果株系发育后期的果实为试材，进行ＭｙＢ１０启动子基因型鉴定，并测定类黄酮组分和含量，分析类黄酮合成相关基因的表达。【结果】红脆１、２、４号ＭｙＢ１０启动子基因型均是ｒ６ｒ１型，而紫红２号启动子类型为ｒ６ｒ６型。红脆１号和紫红２号果实成熟期类黄酮含量分．．．
[期刊] 华北农学报
[作者]
梁计峻 林亚秋 俞雨阳 王永 朱江江
旨在获得山羊肉毒碱棕榈酰基转移酶Ⅰ肝脏亚型CPT1A(Carnitine palmitoyltransferase 1A,CPT1A)基因序列,分析其生物学特征,阐明其组织及细胞分化时序表达规律,同时揭示CPT1A基因在背最长肌、股二头肌、臂三头肌中与肌内脂肪含量(IMF)的关系。选取7只1周岁健康简州大耳羊为试验动物,屠宰后迅速采集心、肝、脾、肺、肾、背最长肌、股二头肌、臂三头肌、皮下脂肪和腹间脂肪组织样品,利用TRIzol法提取总RNA。采用RT-PCR法克隆山羊CPT1A基因,进行生物信息学分析。利用实时荧光定量PCR技术检测CPT1A基因在不同组织中的表达水平以及CPT1A在山羊前体脂肪细胞分化过程中的时序表达。使用皮尔逊相关系数进行CPT1A基因表达量与IMF含量相关性分析。通过克隆得到CPT1A基因序列(MH345735)为2 380 bp,包含CDS全长2 319 bp,5′UTR 38 bp和3′UTR 23 bp,编码773个氨基酸。组织表达结果显示,CPT1A在简州大耳羊肝脏和肾脏中的表达水平极显著高于其他组织(P
[期刊] 中国农业科学
[作者]
孙朝霞 侯思宇 杨武德
【目的】克隆与苦荞芦丁生物合成相关基因序列,探讨外源前体物质及UV-C辐射条件下芦丁含量及基因表达水平的影响,为分子选育高芦丁含量荞麦品种奠定基础。【方法】基于简并引物结合3′RACE的方法,克隆苦荞芦丁合成途径相关基因;高效液相色谱(HPLC)测定持续添加外源苯丙氨酸(L-phenylalanine,Phe)前体(1、2、4 mg.L-1)1—5 d和辐射时间(1、3、5、7 h)UV-C处理条件下叶片芦丁含量的变化,qRT-PCR分析相关基因表达水平。【结果】Phe(4 mg.L-1)处理1 d,芦丁含量(26.15 mg.gFW-1)为未处理对照(12.55 mg.gFW-1)的2倍;U...
关键词：
苦荞 芦丁 苯丙氨酸 UV-C 基因表达
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