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[期刊] 华北农学报  [作者] 鲁玉霞  王洪梅  安利国  李建斌  李秋玲  仲跻峰  
选用牛的12个STR基因座,利用PCR和电泳银染技术对来自不同牛场的100头荷斯坦牛进行遗传多态性检测。结果表明,12个STR基因座的杂合度、多态信息含量、有效等位基因数的均值为0.8711,0.8574,8.1666,这些基因座的遗传杂合度及多态信息含量高,均为高度多态位点,适用于动物的遗传分析和个体鉴定。
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 严林俊  陈宏  房兴堂  张润锋  鲍斌  张海军  
利用PCR技术和复合电泳银染技术检测了中国荷斯坦牛ETH225、BM1824、BM2113和ETH152 4个微卫星座位的多态性分布,计算了各个基因座的杂合度(H)、有效等位基因数(Ne)、Shannon信息熵(S)、多态信息含量(PIC)和固定指数(F)。结果显示,4个微卫星基因座的基因型分布均不符合Hardy-Weinberg平衡,其中,基因座ETH225的H、Ne、S、PIC、F均为最高,分别为0.913 0,11.488 2,2.574 4,0.906 6和-0.095 3,表明该座位的遗传多态性比其他座位丰富,具有更大的选择潜力。
[期刊] 华北农学报  [作者] 张翠霞  王洪梅  李建斌  王长法  赖松家  李秋玲  仲跻峰  
以297头中国荷斯坦奶牛为研究对象,以TLR2(Toll like receptor 2)基因为目的基因,扩增目的片段,结合测序结果采用PCR-RFLP和CRS-RFLP技术方法来检测TLR2基因第2外显子的遗传多态性。结果发现:exon 2存在10098(T/G),10111(G/A)和11541(C/T)3个单核苷酸突变,其中11541位点的T/C突变为首次报道。分别选择EcoRV、HaeⅢ、DraⅠ等3种限制性内切酶检测其多态性。10098位点有3种基因型(AA,AB,BB),A、B等位基因频率分别为0.784 5,0.215 5;10111位点有2种基因型(CC,CD),C、D等位基因...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 陈仁金  杨章平  毛永江  陈莹  常玲玲  吴海涛  施雪奎  周里根  王建勇  尹召华  梁祥焕  
【目的】研究中国荷斯坦奶牛CXCR1基因的多态性及其与体细胞评分(Somaticcellscore,SCS)的关系,寻找与中国荷斯坦牛SCS相关的分子遗传标记,加快抗病育种进程。【方法】采用PCR-SSCP技术对来自30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛CXCR1基因进行多态性检测,利用最小二乘均数法对CRCR1基因的多态位点与SCS进行相关分析,利用PHASE软件对4个多态位点进行单倍型分析。【结果】检测到4个SNPs,在5侧翼区发现了3个SNPs(-1830(A/G)、-1768(T/A)、-344(T/C)),在编码区783(C/A)位点为新发现的SNP。-1830(A/G)位点AA基因型...
[期刊] 华北农学报  [作者] 张翠霞  王洪梅  李建斌  王长法  赖松家  李秋玲  仲跻峰  
利用PCR-RFLP方法检测TLR2基因在297头中国荷斯坦牛中的多态性,并分析其多态性与体细胞评分(SCS)的相关性。结果表明,TLR2基因exon2扩增片断的109 bp处产生C→A的突变,并导致天冬氨酸突变为谷氨酸。TLR2基因exon2被EcoR V消化后表现多态性,表现AA,AB,BB 3种基因型,其中B等位基因为优势等位基因,等位基因频率为0.7845,而A等位基因频率则为0.2155。经χ2适合性检验,中国荷斯坦牛在该位点达到Hardy-Weinberg平衡状态。同时,群体EcoR V基因座不同基因型与SCS相关分析的结果表明,BB,AB型个体的SCS指标显著高于AA型(p<0....
[期刊] 华北农学报  [作者] 程维杰  李秋玲  孙延鸣  王洪梅  王长法  李建斌  仲跻峰  
研究中国荷斯坦牛HSP70-1基因与奶牛耐热性之间的关系。根据NCBI登陆号为AY149618(19526 bp)的HSP70-1基因序列设计9对引物分段扩增该基因全长,并用PCR-SSCP、PCR-RFLP和CRS-RFLP相结合的方法寻找中国荷斯坦牛HSP70-1基因编码区的多态位点,分析山东省3个现代化牛场产奶牛127头,并以直肠温度和红细胞钾离子浓度为荷斯坦牛的耐热指标,用SAS软件最小二乘分析一般线性模型分析试验牛HSP70-1基因型与耐热指标的相关性。发现1 623 bp处发生G→A→C的复等位突变位点,2409 bp处发生G→A的突变;χ2检验结果表明在试验牛群中两位点均未达到H...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 鲍斌  房兴堂  陈宏  张润锋  严林俊  张海军  
【目的】研究STAT5A基因多态性与中国荷斯坦牛泌乳性状的相关性,为进一步加快育种进程提供参考依据。【方法】利用PCR-SSCP技术对279头中国荷斯坦牛的STAT5A基因的P1和P2两个位点进行群体遗传学检测;计算其基因频率和基因型频率,并对多态性与泌乳性状进行相关性分析。【结果】发现在STAT5AP1和STAT5AP2两个位点上分别存在3种多态以及7种单倍型组合。STAT5AP1位点的AA、GG和AG的基因型频率分别为0.2401、0.1470和0.6129,A和G的基因频率分别为0.5466和0.4534,不同基因型对第1胎产奶量、乳蛋白率和第2胎乳蛋白率存在显著影响;STAT5AP2位...
[期刊] 华北农学报  [作者] 白文林  尹荣焕  郑玉才  赵素君  张守纯  王杰  
为了解非乳用山羊不同群体编码乳蛋白结构基因座的遗传多态性,揭示不同群体间的遗传关系。采用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)技术,分析中国9个非乳用山羊群体共316只个体编码乳蛋白(酶)7个结构基因座的遗传多态性,并基于5个结构基因座等位基因频率计算Nei氏遗传距离,以UPMGA法作聚类分析。研究结果表明,9个山羊群体中,编码乳蛋白(酶)的-κCN,-βCN,sα1-CN,αs2-CN,-βLg,SA和LDH7个结构基因座在PAGE上均呈现出不同程度的遗传多态性;9个山羊群体中在-κCN,-βCN,αs2-CN,-βLg和SA5个结构基因座上的平均基因一致度、平均基因杂合度和平均有效等位基因数分别为...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 孙淑霞  王长法  张连江  鞠志花  黄金明  李建斌  仲跻峰  张嘉保  李秋玲  
【目的】研究中国荷斯坦牛白细胞介素1受体相关激酶2(IRAK2)基因上5个SNP位点的多态性与奶牛体细胞评分(SCS)的相关性,为奶牛抗乳腺炎育种提供理论基础。【方法】采用PCR-RFLP技术、CRS-PCR技术和DNA测序,对1 292头中国荷斯坦牛、129头鲁西黄牛、32头渤海黑牛IRAK2基因g.28879、g.28916、g.29212、g.40035和g.40120共5个SNP位点进行研究,通过SAS软件进行相关性分析并采用SHEsis软件进行单倍型分析。【结果】共构建出30种单倍型,发现71种单倍型组合;对个体数量大于8头的单倍型组合与SCS进行关联分析表明,H21H23(TTAG...
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 胡言  桂林生  余横伟  Haider Abbas Raza  昝林森  
【目的】研究中国荷斯坦牛CSN3基因的多态性,并探索其与泌乳性状的关系。【方法】采用DNA测序方法,对565头中国荷斯坦牛CSN3基因进行群体变异分析,将检测到的单核苷酸多态性(SNP)位点与中国荷斯坦牛泌乳性状进行关联性分析,同时分析不同双倍型对中国荷斯坦牛泌乳性状的影响。【结果】从中国荷斯坦牛CSN3基因中共检测到4个SNP位点,分别为g.463A>G、g.1012A>C、g.2015T>A和g.2396A>T,除g.2396A>T外,其余3个SNPs位点与中国荷斯坦牛泌乳性状紧密关联,其中g.463
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)  [作者] 辛亚平  高雪  马云  郭亚宁  陈若愚  昝林森  许尚忠  张英汉  
提取鲁西牛血液DNA样品,PCR扩增后用基因自动测序仪进行基因扫描分型,研究Y-STR微卫星位点UMN0929,UMN0108,UMN0920和INRA124在鲁西牛群体中的遗传多态性。结果发现,156头无亲缘关系的鲁西牛公牛在4个Y-STR微卫星位点均有遗传多态性;UMN0929检测到4种等位基因,UMN0108检测到5种等位基因,UMN0920和INRA124均检测到2种等位基因。UMN0929、UMN0108、UMN0920和INRA124位点各等位基因的频率分别为0.25,0.41,0.17,0.17;0.14,0.28,0.28,0.14,0.16;0.38,0.62和0.73,0....
[期刊] 华中农业大学学报  [作者] 郎咸政  刘小林  储明星  安永福  狄冉  方丽  
设计5对引物P1-P5,利用PCR-SSCP技术检测227头荷斯坦母牛促破骨细胞因子1(osteoclaststimulating factor 1,OSTF1)基因部分序列的多态性。结果发现只有P3扩增的外显子7区域存在A45416G和C45436T2个突变位点,其中A45416G突变位点导致蛋氨酸(M)变为缬氨酸(V)。经SSCP分析存在AA、AB、BB、AC和CC 5种基因型,其频率分别为0.515、0.366、0.075、0.035、0.009。用最小二乘法分析OSTF1基因多态性与荷斯坦母牛体细胞评分(somatic cell score,SCS)的关系,结果表明:对于P3扩增产物多...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 陈仁金  杨章平  毛永江  陈莹  常玲玲  吴海涛  冀德君  李云龙  张亚琴  
【目的】通过研究中国荷斯坦牛溶菌酶基因(lysozyme,LYZ)编码区多态性与乳房炎的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种进程。【方法】利用PCR-SSCP技术对30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛LYZ基因进行多态性检测,利用最小二乘均数法对LYZ基因的多态位点与SCS和305d产奶量进行相关分析【结果】LYZ基因的外显子1上存在115(T>G)突变位点,突变使精氨酸变为亮氨酸;突变位点经PCR-SSCP法检测发现了3种基因型TT、TG和GG,频率分别为0.270、0.508和0.222,χ2检验表明中国荷斯坦牛在该位点偏离Hardy-Weinberg平衡;GG基...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 李春苗  石万海  储明星  安永福  陈宏权  狄冉  方丽  
【目的】阐明Toll-like receptor 1(TLR1)基因多态性与荷斯坦母牛乳房炎抗性之间的关系,为奶牛乳房炎抗性的标记辅助选择提供依据。【方法】采用PCR-SSCP和PCR-RFLP检测208头荷斯坦母牛TLR1基因多态性,用最小二乘法分析基因多态性与荷斯坦母牛体细胞评分(somaticcell score,SCS)的关系。【结果】TLR1基因mRNA序列中存在G1409A、A1475C、G1550A和G1596A突变位点,其中G1596A突变使异亮氨酸变为缬氨酸;G1409A突变位点经BsiYⅠ酶切产生2种基因型AA和AB,频率分别为0.375和0.625,χ2检验表明荷斯坦母牛...
[期刊] 中国农业科学  [作者] 郭洋  王洪梅  侯明海  王长法  何洪彬  吕文发  仲跻峰  
【目的】通过研究中国荷斯坦牛SLC11A1基因多态性与乳腺炎性状间的相关性,为奶牛乳腺炎抗性选育提供参考。【方法】采用巢式PCR、降落PCR和DNA测序等技术,研究分析771头牛SLC11A1基因外显子10、内含子9和11的基因多态性,采用SHEsis和PHASE软件进行配对连锁不平衡和单倍型分析。【结果】发现4个不连锁的SNPs,分别为内含子9的6 067(A/G)、6 358(C/T),外显子10的7 155(A/G)和内含子11的7 809(A/T);其中,6 067(A/G)、6 358(C/T)和7 809(A/T)为新SNPs。不同基因型与乳腺炎相关性分析结果表明,SLC11A1基...
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