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[期刊] 水产学报
[作者]
王沈同 张猛 沈玉帮 李家乐
为了解草鱼GH基因多态性与早期生长性状及肌肉成分的相关性,实验利用直接测序法从156尾草鱼GH基因的3′部分序列中共筛选到9个变异位点(分别命名为SNP1SNP9:G2825A、G2914T、T2966G、A3002T、T3022C、A3301G、C3463T、C3547T、C3620T)。卡方检验结果显示,9个位点均未显著偏离Hardy-Weinberg平衡,且均表现为中等多态性(0.25
[期刊] 中国水产科学
[作者]
傅建军 张猛 沈玉帮 陈勇 徐晓雁 李家乐
为了探索草鱼（Ｃｔｅｎｏｐｈａｒｙｎｇｏｄｏｎ ｉｄｅｌｌａ）ｐｒｌ（ｐｒｏｌａＣｔｉｎ）基因多态性与草鱼生长性状和肌肉成分的关联性，通过测序法从１０尾草鱼的ｐｒｌ基因中筛选到６个突变率高于３０％的变异位点，包括５个单核苷酸变异位点和１个插入型突变（–／ＣａＣｔＣａＣｔａ），分别命名为２５５１ｇ＞ａ、２６３９ｇ＞Ｃ、３２４７ａ＞ｇ、５１９７ｔ＞ｇ、５８９７ｇ＞ａ和３３９１–＞＋。利用ａＳ－ｐＣｒ（ａｌｌｅｌｅ－ＳｐｅＣｉｆｉＣ ｐＣｒ）和基因分型技术对１９２尾４月龄草鱼的ｐｒｌ基因变异位点进行检测；基于一般线性模型对变异位点多态性与草鱼生长性状和肌肉成分进行相关性分析。研究发现，２６３９ｇ＞Ｃ．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
张猛 陈勇 沈玉帮 傅建军 徐晓雁 孙俊龙 胡默俨 李家乐
为研究草鱼ＭＳＴＮ－１基因多态性及与早期生长性状和肌肉成分的相关性，本研究扩增出全长为３８２４ ｂｐ的草鱼ＭＳＴＮ－１基因，用长江选育草鱼群体对ＭＳＴＮ－１基因多态性进行筛选和验证。结果共发现３个多态性位点（ＬｏｃｕＳ １：ｃ１７９９Ｔ，野生型ＥＥ／突变型ＥＦ；ＬｏｃｕＳ２：ｃ１８４２Ｔ，野生型ＨＨ／突变型ＨＩ；ＬｏｃｕＳ ３：ＴＧＡＡＧｃＧｃＴＧＧＴＴｃＴ／２５８５－，野生型ｂｂ／缺失型ｂＤ）。利用一般线性模型分析３个位点及其组合型（剔除个体数少于３的组合）与生长性状和肌肉成分的相关性，发现２个位点对幼鱼生长性状表型差异有显著影响，但３个位点对肌肉成分差异均无显著影响。多重比较发现，单倍型Ｈ．．．
[期刊] 水产学报
[作者]
曹婷婷 白俊杰 于凌云 樊佳佳
通过佛山市白金水产良种选育场提供的草鱼EST库的醛缩酶B基因重叠群的2个Contig扩增该基因的序列片段,采用直接测序法,经过序列比对,共筛到C+687G、C+1042A和A117C等3个颠换SNPs位点。C+687G位于醛缩酶B基因外显子6的63 bp处,为同义突变;C+1042A位于外显子8的43 bp处,为错义突变;A117C位于内含子7的117 bp处。采用Snapshot方法对同一群体的296尾草鱼的这3个SNPs位点进行检测和分型,并统计基因型频率。3个SNPs位点中AA的频率分别为42.9%、32.8%、32.8%;AB的频率分别为42.9%、45.9%、45.6%;BB的频率分...
[期刊] 淡水渔业
[作者]
傅建军 张猛 沈玉帮 陈勇 李家乐
为了探索草鱼(Ctenopharyngodon idella)线粒体DNA(mitochondrial DNA,mt DNA)多态性对生长性状的影响,鉴于mt DNA的母性遗传特征,本研究基于2011年繁殖用的20尾母本的D-loop序列信息,与通过亲子鉴定获得的853尾40日龄子代的体长、体质量进行关联分析。结果显示,草鱼6种D-loop单倍型对生长性状表型差异具有极显著影响(P<0.01);其中,单倍型为Hap16的子代的体长最大,并显著大于单倍型为Hap4的子代的体长(P<0.05);单倍型为Hap
[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
刘鑫 施启顺 柳小春 黄生强 蒋隽
以IGF2基因作为控制猪生长性状主基因的候选基因,采用PCR-RFLP方法对7个品种/群体共528头猪进行了NciⅠ酶切位点基因型检测,计算了该位点的基因频率与基因型频率,并对品种间基因型频率进行了x2差异性检验.结合生长性能记录,运用SAS软件分析了IGF2不同基因型对生长性状的遗传效应.结果表明:在杜洛克、长白、大白中,AA基因型比BB基因型生长速率快,生长性能指数高4.06%～8.31%,等位基因A对猪的生长具有正效应.
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
马彦男 贺鹏迦 马永生 董艳娇 朱静 雷赵民 刘哲 吴建平
【目的】研究奶牛脂肪酸合成酶(Fatty acid synthase,FASN)基因多态性对产奶量和乳成分的影响,为中国荷斯坦牛的优化育种提供相应的分子遗传学依据。【方法】以464头中国荷斯坦牛为研究材料,参照奶牛生产性能测定(Dairy herd improvement,DHI)方法采集产奶量和乳成分数据;采集试验牛血样,提取DNA,PCR扩增FASN基因,用单链构象多态性(Single-strand conformation polymorphism,SSCP)技术并结合测序确定基因型;用最小二乘法进行基因多态性与泌乳性状的关联性分析。【结果】FASN基因外显子34存在2个等位基因、2种基...
[期刊] 福建农林大学学报(自然科学版)
[作者]
林长光 刘亚轩 吴悌霖 林金玉 郭长明 朱志明
采集395头核心群的种猪耳样,采用PCR-SNaPshot方法检测长白猪和大白猪胰岛素样生长因子2(IGF2)基因内含子3的位点多态性,并分析各基因型与生长性状的相关性.结果表明,长白和大白猪中均存在3种基因型,大白猪3种基因型分布为:AA>GA>GG,长白猪3种基因型分布为:GA>AA>GG.大白和长白猪的A等位基因频率分别为0.710、0.541,G等位基因频率分别为0.290、0.459.AA基因型个体比GA和GG基因型个体生长速度快,等位基因A对猪的生长具有正效应,同时背膘厚变薄.3种基因型个体在达100 kg活体背膘厚及其估计育种值(EBV)的大小为:GG>GA>AA.因此,在种猪选...
[期刊] 水产学报
[作者]
于凌云 白俊杰 樊佳佳 李小慧 叶星
采用PCR-SSCP和PCR-RFLP技术对大口黑鲈肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因全序列进行了SNPs位点筛选和分型,共筛选到2个单核苷酸多态性(SNPs)位点(C-1453T和T+33C),其中C-1453T位于启动子E8box和Octamer(+)调控元件之间的区域,T+33C的突变位于第一外显子区域,属于同义突变,氨基酸没有发生变化;利用一般线性模型分析单标记位点与大口黑鲈生长性状(体重、体长、体高、体宽和眼间距)相关性,均未达到显著水平(P>0.05)。将2个SNPs位点不同基因型组合成6种双倍型(去掉频率小于3%的组合),关联分析表明,双倍型D2在体重、体长、体高...
[期刊] 华北农学报
[作者]
张恩宇 罗玉柱 李少斌 王继卿 刘秀 闫伟 管生栋 徐洪福
为给甘肃高山细毛羊生长标记候选基因的筛选提供参考依据,研究了绵羊GH基因第3内含子突变对甘肃高山细毛羊生长性状可能产生的影响。采用PCR-SSCP技术检测甘肃高山细毛羊及其与特克赛尔、邦德和澳洲美利奴羊的杂交品种GH基因第3内含子多态性,分析GH基因第3内含子突变对羔羊初生重、3月龄重、断奶重及日增重的影响。结果表明,甘肃高山细毛羊及其杂种羔羊GH基因第3内含子第98 bp处有一个C>T突变,共有AA、AB和BB 3种基因型,甘肃高山细毛羊和对照组杂种羊的GH基因第3内含子PIC值均为0.25~0.50,为中度多态。其中BB型为优势基因型。等位基因存在与缺失对体重及日增重的关联分析表明,存在等...
[期刊] 水产学报
[作者]
张猛 沈玉帮 徐晓雁 王荣泉 冷向军 李家乐
对草鱼生长性状进行数量性状基因座(quantitative trait locus,QTL)定位过程中,在15号连锁群中定位到一个与体质量相关的QTL,本研究根据已有的草鱼遗传连锁图谱和基因组序列,拟用短片段重复序列(short tandem repeat,STR)分型技术对该连锁群的3个scaffolds中插入/缺失型突变位点进行筛选,以降低分型成本,同时将筛选出的7个多态性位点与草鱼幼鱼生长性状进行关联分析。结果显示,(1)草鱼3个scaffolds中44个插入/缺失型突变位点中有17个简单重复序列(又称微卫星,simple sequence repeats,SSRs),2个位点引物设计不成功,设计的25对引物中仅22对扩增和分型成功;(2) 22个位点中仅有7对引物在4个亲本中存在多态性,直接测序结果发现,STR分型技术不仅可准确对插入/缺失型突变位点进行分型,同时可降低分型成本;(3)将7个插入/缺失型突变位点与323尾选育F2草鱼的生长性状进行关联分析发现,除了位点ID-10H和ID-41F以外,其余5个位点都与草鱼幼鱼的一个或多个生长性状显著相关,其中ID-6H与幼鱼肥满度性状显著相关,位点ID-11F、ID-15F、ID-32F和ID-39F分别与草鱼幼鱼体质量、体长、体宽和体高性状显著相关,可将以上5个与草鱼幼鱼生长性状相关的突变位点用于草鱼生长性状QTL加密和分子标记辅助育种。
关键词：
草鱼 突变 多态性 生长 关联分析
[期刊] 西南农业学报
[作者]
丁燕玲 王鹏飞 杨朝云 张岩峰 周小南 史远刚 康晓龙
【目的】探究IGF2第2外显子多态位点与秦川牛、西门塔尔牛、安格斯牛及新疆褐牛4种品种牛群体的多态性及与生长性状的相关性，为肉牛遗传改良提供依据。【方法】以秦川牛等4个肉牛品种共91头为研究对象，利用PCR-RFLPs技术分析IGF2基因第2外显子多态性，并将IGF2的基因型与生长性状进行相关分析。【结果】IGF2基因第2外显子多态性在不同牛品种中均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05），且均属于中度多态（0.25
[期刊] 西南农业学报
[作者]
宋娜娜 柴志欣 胡丹 向超 钟金城
本研究利用DNA池和测序技术,结合PCR-RFLP方法,筛查了POU1F1基因第2外显子和第5内含子的SNP位点,分析了西藏申扎(SZ)、类乌奇(LWQ)、斯布(SB)和帕里(PL)4个牦牛类群(品种)共182个个体的POU1F1基因的多态性及其与体重、体高、体长等生长性状指标之间的相关性。结果表明:①POU1F1基因第2外显子高度保守,未发现任何突变,第5内含子中发现2个突变位点,分别为T727C(BglⅡ酶切)位点和T284C(StuⅠ酶切)位点。②申扎(SZ)、类鸟奇(LWQ)、斯布(SB)和帕里(
[期刊] 水产学报
[作者]
傅建军 张猛 沈玉帮 徐晓雁 孙俊龙 李家乐
为了研究草鱼幼鱼阶段生长性状和肌肉成分的遗传改良潜力，随机采集２８８尾人工繁育的４月龄草鱼幼鱼，基于１２对微卫星标记，鉴定出来自１６个家系（８个母本，９个父本）的２７３尾个体，各家系、母本和父本对应子代贡献率存在极显著差异（Ｐ＜０．０１）。对草鱼３个生长性状（体质量、体长和肥满度）和２个肌肉成分（粗蛋白含量和粗脂肪含量）比较发现，３个生长性状和粗蛋白含量在家系和母系半同胞间存在显著差异（Ｐ０．０５）。基于动物模型和限制性最大似然法，草鱼４月龄体质量、体长、肥满度、粗蛋白含量和粗脂肪含量的遗传力估值分别为０．３４、０．３３．．．
关键词：
草鱼 生长性状 肌肉成分 遗传参数
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