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[期刊] 中国水产科学
[作者]
余成晨 张伟 徐晓雁 王荣泉 李家乐 沈玉帮
为了分析草鱼(Ctenopharyngodonidella)选育群体不同世代的遗传变异和遗传结构,本研究利用了已建立的一套标准微卫星标记对草鱼长江选育群体F0、F3、F4进行了遗传变异的评估,并与黑龙江选育群体和珠江选育群体进行了遗传变异的比较分析。实验结果表明长江选育群体的各世代均具有高度的遗传多样性(PIC>0.05),且长江选育群体的遗传多样性相对于黑龙江和珠江选育群体的遗传多样性水平更高(P<0.05)。遗传分化指数(Fst)分析结果表明,长江选育群体F0、F3、F4之间遗传分化的水平较低(0
[期刊] 水产学报
[作者]
王沈同 沈玉帮 孟新展 王荣泉 李家乐
为探究经过2个选育世代后选育群体遗传多样性和遗传结构的变化,实验采用多重PCR技术对4个野生草鱼群体(邗江、九江、石首、吴江)和2个选育群体(F1和F2)进行了微卫星序列遗传变异分析。结果显示,6个草鱼群体遗传多样性水平较高,2个选育群体除了平均等位基因数外,其他遗传多样性参数均小于4个野生群体。哈迪—温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium)检测显示,在120个群体—位点组合中有62个位点显著偏离哈迪—温伯格平衡,62个群体—位点组合中只有11个组合其近交系数值为负值,其余的51个组合的Fis均为正值。6个草鱼群体AMOVA分析结果显示,3.75%的变异来自于群体间,96.25%的变异来自于群体内,整体的遗传分化指数值为0.038。进一步分析各个群体间Fst,只有石首群体与F1、F2群体之间的Fst大于0.05,处于中等分化,其余群体间分化程度较低,且F2群体与4个野生群体之间Fst比F1群体与4个野生群体之间的Fst大。奈氏标准遗传距离分析结果显示,2个选育群体与野生群体之间的遗传距离大于野生群体之间的遗传距离。基于Dn建立的UPGMA系统发育树得出了相同的结果,即2个选育群体与野生群体之间的亲缘关系比4个野生群体之间的亲缘关系要远。研究表明,经过2个世代选育后,相比4个野生群体,2个选育群体遗传多样性虽有部分下降,但仍处于较高的水平,2个选育群体的遗传结构已发生变化,但其遗传分化程度尚不明显。本研究结果为制定出更加完善有效的选育方案提供了重要参考。
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
缪一恒 沈玉帮 徐晓雁 张猛 张学书 白玉麟 王荣泉 李家乐
为研究本课题组获得的长江、珠江和黑龙江草鱼选育系间完全双列杂交组合遗传多样性及遗传结构的变化情况，本实验采用多重PCR技术对构建的6组杂交组合[珠江♀×黑龙江♂（ZH）、黑龙江♀×珠江♂（HZ）、长江♀×珠江♂（CZ）、长江♀×黑龙江♂（CH）、珠江♀×长江♂（ZC）、黑龙江♀×长江♂（HC）]和3组自交组合[黑龙江♀×黑龙江♂（HH）、长江♀×长江♂（CC）及珠江♀×珠江♂（ZZ）]共9个草鱼组合群体进行了微卫星遗传变异分析。结果显示，9个群体平均等位基因数（N_(a)）为(5.75～12.33)，平均有效等位基因数（N_(e)）为(3.8077～6.3065) ，平均观测杂合度（H_(o)）为(0.7682～0.9036) ，9个草鱼群体均显示出较高的遗传多样性水平，平均期望杂合度（H_(e)）为(0.8385～0.6210)，12个草鱼微卫星位点的多态信息含量（PIC）分别为0.892 、0.823 、0.857 、0.894 、0.927 、0.859 、0.850 、0.859 、0.907 、0.929 、0.879 和0.749，均表现为高度多态位点（PIC=0.749～ 0.929）。基于不同群体的Nei’s遗传相似性和遗传距离构建的UPGMA系统发育树显示，9个群体中黑龙江♀×珠江♂（HZ）与长江♀×珠江♂（CZ）首先聚类，表明两个组合亲缘关系更近，珠江♀×黑龙江♂（ZH）与黑龙江♀×长江♂（HC）组合遗传距离最远。本研究结果将为草鱼目前种质退化现象提供解决思路，为草鱼优良品系的选育提供理论依据。
关键词：
草鱼 完全双列杂交 遗传分析 微卫星
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
张志允 李思发 蔡完其 谢中富 殷黎明
以中华鳖黄河群体的选育基础群体(F0)和太湖群体为对照群体,采用微卫星标记技术对黄河群体的选育世代F1、F2及F3的遗传变异进行了测定和分析。结果表明:(1)从所筛选的10个微卫星位点中,5个测试群体共检测出240个等位基因;平均等位基因数(Na)为4.60～5.30,平均有效等位基因数(Ne)为3.24～3.59,平均观察杂合度(Ho)为0.483 3～0.530 0,平均期望杂合度(He)为0.594 9～0.645 9,平均多态信息含量(CPI)为0.534 0～0.568 4,这些遗传参数表明中华鳖存在丰富的可供选育用的遗传多样性基础。(2)F1、F2及F3选育世代的遗传多样性参数Ho...
关键词：
中华鳖 黄河 选育 微卫星 遗传变异
[期刊] 海洋渔业
[作者]
刘连为 陈新军 许强华 傅建军
利用微卫星标记分析阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)冬生群体与秋生群体的遗传变异性,并检验冬生群体在时间上的遗传差异。结果表明,7个位点平均等位基因数为23.14,平均有效等位基因数为10.43,各位点均为高度多态性位点(PIC=0.590～0.931)。3个群体显示出较高的遗传多样性水平(Ho=0.796～0.904)。两两群体间的Fst值以及AMOVA分析表明,群体遗传分化不显著(Fst=0.008 3,P>0.05);阿根廷滑柔鱼冬生与秋生2个群体间及冬生群体在时间上的遗传差异不显著。基于Nei’s遗传距离构建的UPGMA聚类树显示,冬生群体2个群体聚在一起。阿根廷滑柔鱼为...
[期刊] 海洋渔业
[作者]
马春艳 马洪雨 马凌波 杨柯
利用8个微卫星标记对引进的SPF凡纳滨对虾G0和两个养殖群体(G1,G2)进行遗传多样性分析。8个座位共获得64个等位基因,位点的等位基因数在5~l3之间。多态信息含量PIC在0.405 2~0.869 3之间,其中有6个位点为高度多态位点,适合于多态性分析。8个座位丢失的和新产生的等位基因共30个,占总数的47%。3个群体的平均观测杂合度分别为0.193 8、0.196 1、0.232 5,说明3个群体的遗传多样性较低。对近交系数Fis分析显示3个群体中存在近交,通过对哈迪温伯格平衡检验,显示所有座位均显著偏离平衡,存在杂合子缺失。通过配对Fst和Ne i遗传距离分析,显示3个群体之间有明显...
[期刊] 海洋渔业
[作者]
张志允 谢中富 李亚根 殷黎明 李思发 蔡完其
利用微卫星分子标记技术,对中华鳖(Trionyx sinensis)黄河群体选育F3世代与其基础群体—黄河野生群体以及淮河、鄱阳湖、洞庭湖、太湖野生群体的遗传变异进行了测定和比较分析。结果表明:①从所筛选的14个微卫星位点中,6个群体共检测出334个等位基因;平均等位基因数(N a)为3.6~4.2,平均有效等位基因数(N e)为2.53~2.99,平均观察杂合度(H o)为0.4714~0.5821,平均期望杂合度(H e)为0.551 5~0.599 7,平均多态信息含量(PIC)为0.487 2~0.540 6,平均Shannon多样性指数(H')为1.001~1.106,表明这6个中华...
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
缪一恒 沈玉帮 徐晓雁 张猛 张学书 白玉麟 王荣泉 戴银根 冯晓宇 谢楠 李家乐
为研究本课题组筛选获得的长江、珠江和黑龙江草鱼优秀种质间完全双列杂交组合遗传多样性及遗传结构的变化情况,采用多重PCR技术对构建的6组杂交组合[珠江♀×黑龙江♂(ZH)、黑龙江♀×珠江♂(HZ)、长江♀×珠江♂(CZ)、长江♀×黑龙江♂(CH)、珠江♀×长江♂(ZC)、黑龙江♀×长江♂(HC)]和3组自交组合[黑龙江♀×黑龙江♂(HH)、长江♀×长江♂(CC)及珠江♀×珠江♂(ZZ)]共9个草鱼组合群体进行微卫星遗传变异分析。结果显示,9个群体平均等位基因数(N_a)为(5.75～12.33),平均有效等位基因数(Ne)为(3.8077～6.3065),平均观测杂合度(H_o)为(0.7682～0.9036),9个草鱼群体均显示出较高的遗传多样性水平,平均期望杂合度(H_e)为(0.8385～0.6210),12个草鱼微卫星位点的多态信息含量(PIC)分别为0.892、0.823、0.857、0.894、0.927、0.859、0.850、0.859、0.907、0.929、0.879和0.749,均表现为高度多态位点(PIC=0.749～0.929)。基于不同群体的Nei’s遗传相似性和遗传距离构建的UPGMA系统发育树显示,9个群体中黑龙江♀×珠江♂(HZ)与长江♀×珠江♂(CZ)首先聚类,表明两个组合亲缘关系更近,珠江♀×黑龙江♂(ZH)与黑龙江♀×长江♂(HC)组合遗传距离最远。本研究结果将为草鱼目前种质退化现象提供解决思路,为草鱼优良品系的选育提供理论依据。
关键词：
草鱼 完全双列杂交 遗传分析 微卫星
[期刊] 中国农业大学学报
[作者]
孙少华 桑润滋 师守堃 贾青 李运起 田树军 李雪梅
利用6个微卫星位点分析了8个肉牛杂交亲本群体的遗传结构和遗传变异,结果表明:8个肉牛群体平均多态信息含量和平均杂合度较高.其范围分别为0.57～0.71和0.59～0.73。以海伏特牛和利木赞牛与三个母牛种群(FN,ZH,FU)间遗传距离为最大。由邻结法绘制的系统聚类图能清晰、客观地反映8个肉牛群体的地理分布、遗传分化特点,以及亲缘关系远近程度。这些研究为肉牛的杂交改良奠定了基础。
关键词：
肉牛 微卫星 DNA 群体遗传变异
[期刊] 水产学报
[作者]
胡雪松 李池陶 马波 石连玉
利用10个多态微卫星标记对我国北方不同地区3个德国镜鲤(Cyprinus carpioL.mirror)群体(绥化,BL;哈尔滨,BZ;天津,TJ)的遗传多样性及群体间的亲缘关系进行研究。结果显示,3个养殖群体在10个位点上表现出较高的多态性,其中9个位点表现为高度多态(PIC>0.5);平均杂合度为0.629 3;10个位点共检测出144个等位基因;BL与TJ群体的总体变异水平高于BZ群体。Nei氏DA遗传距离分析显示,BL与TJ群体的遗传距离最近,而与BZ群体的遗传距离最远;群体间遗传分化微弱(Fst=0.031 5),群体内变异占总变异的96.85%,3个群体各自特有的等位基因频率普遍较...
关键词：
德国镜鲤 微卫星 遗传变异
[期刊] 中国水产科学
[作者]
王军 吴惠仙 杨新鑫 马玉清 钱龙 李思发 王成辉
本研究应用18个微卫星分子标记,对白斑狗鱼(Esox lucius L.)3个中国新疆群体(乌伦古湖、吉力湖和6号湖)和1个匈牙利巴拉顿湖群体的遗传结构进行了分析。结果表明,3个中国白斑狗鱼群体的平均等位基因丰富度(AR)、平均观测杂合度(HO)和平均期望杂合度(HE)均显著低于匈牙利巴拉顿湖群体(P<0.05),而匈牙利群体的平均近交系数(FIS)高于中国群体;经SMM和TPM模型检测,匈牙利白斑狗鱼群体存在显著的遗传瓶颈信号(P<0.001);AMOVA和群体两两比较的FST值表明,中国与匈牙利白斑狗鱼的遗传分化十分显著(P<0.01);NJ树、主成分分析(PCA)进一步证实中国白斑狗鱼与...
关键词：
白斑狗鱼 微卫星 遗传结构 瓶颈效应
[期刊] 海洋水产研究
[作者]
刘云国 陈松林 李八方
应用10对微卫星引物对中国牙鲆一个养殖群体的30个个体进行了群体遗传结构分析。结果显示,微卫星标记比其他标记具有更高的多态性,10个微卫星座位的等位基因数在4～10之间,有效等位基因数在2.23～5.82之间,平均等位基因数为7.6,群体平均杂合度为0.6960,Hardy-wein-berg遗传偏离指数的平均值为0.1774。
关键词：
牙鲆 养殖群体 遗传变异 微卫星标记
[期刊] 水产学报
[作者]
颉晓勇 李思发 蔡完其
采用微卫星标记技术对选育新品种新吉富罗非鱼(F8-9)群体、基础群体(F0)、以及选育中群体(F6-7)在选育过程中出现的遗传变异进行观察与分析。19个微卫星位点扩增后的等位基因数为3～11个,随引物不同而异,合计得到115个等位基因,大小在70～270bp之间。五群体平均基因多样性指数分别为,F0:(0.3083±0.1834)、F6:(0.2982±0.1889)、F7:(0.2923±0.1898)、F8:(0.2572±0.1923)、F9:(0.2743±0.1597),表明随着选育的进展,群体呈现出纯化趋势。AMOVA分析表明,在总遗传变异中,93.24%来自选育群体内,仅6.67...
关键词：
新吉富罗非鱼 选育 遗传变异 微卫星
[期刊] 上海海洋大学学报
[作者]
于爱清 李思发 蔡完其
利用微卫星分子标记技术,对"新吉富"罗非鱼选育后期的F10、F11、F12、F13 4个世代群体的遗传结构及异同进行了分析。结果表明:13个微卫星位点扩增后,共得到78个等位基因,扩增片段长度大小在100～295bp之间,4个选育世代的平均有效等位基因数(Ne)为2.84～3.27,平均期望杂合度(He)为0.627 1～0.676 2,平均多态信息含量(CPI)为0.567 6～0.622 9,3个遗传参数都一致呈现随着选育世代数累进而稳定下降的趋势,表明"新吉富"罗非鱼在长期选育过程里越来越趋于纯化之中。另一方面,4个选育世代两两间遗传分化FST值为0.019 07～0.133 54,世代...
关键词：
“新吉富”罗非鱼 选育世代 遗传变异
[期刊] 水产学报
[作者]
季晓芬 段辛斌 刘绍平 陈大庆 汪登强
利用筛选的13对草鱼多态性微卫星标记,开展了2011至2015年长江中游草鱼亲本增殖放流对野生群体遗传多样性的影响评估。通过对各位点的遗传多样性分析,13个微卫星位点的多态信息含量为0.8622(0.6570.950),基因多样度为0.8555(0.6750.936)。15个群体的有效等位基因数为7.450310.1536,等位基因丰度为11.48315.204,说明15个草鱼群体的遗传多样性水平总体较高。遗传分化指数分析表明,群体间不存在显著遗传分化(FST<5%)。通过贝叶斯聚类分析和主成分分析可将草
关键词：
草鱼 微卫星 遗传多样性 增殖放流
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