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[期刊] 湖南农业大学学报(自然科学版)
[作者]
黄建安 黄意欢 罗军武 龚志华 刘仲华 欧秋良
通过对影响茶树AFLP—银染技术体系的关键因素作对比研究,建立了一套优化的茶树AFLP分子标记体系.应用该体系研究不同茶树品种的AFLP指纹,结果同一引物对不同品种扩增及不同引物对同一品种扩增都呈现出十分丰富的多态性,图谱清晰,分辨率高.
[期刊] 西南农业学报
[作者]
潘璐璐 丁兆堂 段伦才 王玉
本研究以筛选出的12条ISSR引物对14个茶树单株进行PCR扩增。结果表明,共扩增出清晰、重复性好的谱带151个,其中,特异带140条,多态性比例为92.72%;应用引物IR43、IR51组合获得了每份茶树单株的特征谱带,可以有效区分出所有供试材料,建立了14份茶树单株的ISSR指纹图谱;经聚类分析,在相似性系数为0.507处,所有材料被分为4个群体。
关键词：
黄山种 ISSR 指纹图谱
[期刊] 南京农业大学学报
[作者]
房经贵 刘大钧 章镇
对ＡＦＬＰ技术在芒果上的应用进行了尝试，并利用１６对引物构建了两个芒果育种亲本的指纹图谱，获得了两个品种间分子水平上的多态性信息。
关键词：
芒果 AFLP 指纹图谱
[期刊] 西南农业学报
[作者]
郭燕 刘声传 曹雨 赵华富 魏杰 鄢东海 周富裕
为了贵州古茶树资源的有效保护和充分利用提供理论依据，采用ＥＳＴ－ＳＳＲ标记对４０份贵州古茶树资源进行了遗传多样性分析和分子指纹鉴定。结果表明：２０个ＳＳＲ标记在４０份资源中共检测到７６个等位基因，平均每个标记３．８个，ＰＩＣ和Ｓｈａｎｎｏｎ信息指数平均值分别为０．４６２和０．９３６，多态性适中。７６个等位基因在参试古茶树资源中的出现频率差异较大，变异范围为１．３２％～８９．７４％。参试材料的ｎＥＩ＇Ｓ遗传距离（Ｄ）为０．０７５～０．８７５，当Ｄ≈０．１６０时，４０份古茶树资源可聚为６类，包括３个单独聚类和３个复合聚类。利用４个核心标记即可鉴定４０份古茶树资源，并根据等位基因带型，获得１８位数的．．．
[期刊] 林业科学研究
[作者]
贾会霞 胡建军 卢孟柱
以5个美洲黑杨新品种(丹红杨、南杨、中林2025杨、中红杨和全红杨)为实验材料,利用CE-AFLP(毛细管电泳-AFLP)技术,采用EcoR I+3/Mse I+3和Pst I+2/Mse I+3引物组合构建指纹图谱,并进行遗传多样性分析。结果表明:从36对引物组合中筛选出12对扩增条带数目多、稳定且清晰的引物进行扩增,共获得条带数877条,多态性条带数315条,平均多态率为35.92%。采用UPGMA法进行聚类分析,相似系数为0.74～1.00;丹红杨与南杨之间的差异较大;在相似系数0.98时,中林2025杨与中红杨和全红杨分为两类,11条稳定特异的条带可以作为鉴别它们的依据;全红杨和中红杨...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
雷天刚 何永睿 吴鑫 姚利晓 彭爱红 许兰珍 刘小丰 陈善春
【目的】构建柑橘栽培品种(系)的DNA指纹图谱数据库,为建立柑橘种苗纯度及真实性鉴定技术体系和技术规范奠定基础。【方法】利用SSR标记和ISSR标记对102个柑橘栽培品种(系)进行DNA指纹分析,筛选适合的特征引物,构建柑橘栽培品种(系)的指纹图谱数据库。【结果】从200对SSR引物中筛选到重复性好、多态性丰富的12对引物作为柑橘品种(系)鉴定的特征引物,12对SSR特征引物组合可鉴别42个品种(系);在此基础上,对未出现SSR特征指纹的60个品种(系)进行ISSR指纹分析,从40个ISSR引物中筛选到2个可用于品种鉴定的特征引物,结合SSR标记,可快速、准确地鉴别70个柑橘的品种(系)。并利...
[期刊] 华北农学报
[作者]
姜伟 李雪源 何觉民 陆建农
利用ISSR对8个新疆品种(系)进行指纹图谱构建。通过基因组多态性分析,从60条引物中筛选到11条扩增效果好的引物,用其中2条引物UBC809,UBC841建立8个品种的指纹图谱,统计品种鉴定的置信概率达到1/8388608。结果显示,ISSR分子标记技术对棉花品种的指纹图谱构建具有高效性和准确性。
关键词：
ISSR标记 品种鉴定 指纹图谱
[期刊] 中国农业科学
[作者]
宋海斌 崔喜波 马鸿艳 朱子成 栾非时
【目的】建立甜瓜品种的DNA指纹图谱数据库,实现对甜瓜品种进行快速、准确的鉴定。【方法】应用SSR分子标记技术,首先利用20份具有代表性的甜瓜品种(系)筛选SSR引物,然后对105份不同甜瓜品种(系)进行指纹图谱的构建。【结果】从1 219对SSR引物中筛选出18对引物为105份材料形成了多态性的指纹图谱,其中每对引物可以检测到4—14条数目不等的多态性条带,平均为9条;多态性信息含量(PIC)平均为0.68,变化范围为0.55—0.82。105份材料间的相似系数为0.70—0.99。利用这18对SSR核心引物构建的指纹图谱库能够有效区分所有供试材料,并且为每份材料建立了一份独特的指纹图谱。【...
关键词：
甜瓜 指纹图谱 SSR标记 核心引物
[期刊] 华北农学报
[作者]
王晋 尤佳 王溪桥 文朝慧 王军平
为实现对甜瓜品种快速准确鉴定，利用ＳＳＲ分子标记技术对６个甜瓜品种及其亲本共１８份材料构建指纹图谱。通过利用５０对多态性好的甜瓜ＳＳＲ引物，经扩增电泳分析得到Ｃ１７、Ｃ２１、Ｃ３０共３对引物，可用于构建１８份材料的指纹图谱，实现了对这些材料的分子鉴定。另外利用Ｃ２１引物对材料Ｍ３２４的杂种品种进行纯度鉴定，结果纯度为８９％，与田间性状统计结果 ９０％相符。
关键词：
甜瓜 SSR标记 指纹图谱 纯度鉴定
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
刘春英 樊军锋 高建社 周永学
【目的】构建2个白杨新杂交种无性系及其亲本的指纹图谱,为杨树林木的品种鉴定和白杨的育种提供理论依据。【方法】以2个白杨新杂种无性系(品种编号为02-9-22和02-12-29)及其母本银白杨I-101杨、父本84K杨为4个供试杨树品种,先以2个亲本为材料,从30个ISSR引物中选取多态性好的引物,再用筛选出的引物对4个杨树品种进行基因组多态性分析和遗传关系分析,并构建指纹图谱。【结果】利用筛选出的10个引物共扩增出95条条带,其中多态性条带70条,多态性条带率为73.68%,条带大小为100～1 000bp。聚类分析表明,2个杂交新品种与父本84K的亲缘关系较近,相似系数分别为0.737和0....
关键词：
ISSR 杨树 杂种 指纹图谱
[期刊] 西北农林科技大学学报(自然科学版)
[作者]
石恒波 罗军 王维 许会芬 朱江江 李君
【目的】分析奶山羊间性个体的遗传背景,探讨间性个体发生的遗传机制,为山羊性别调控以及性别决定的研究提供参考。【方法】通过核型分析、特异性性别调控基因(Sex-determining region of Y chromosome,SRY)的PCR扩增以及AFLP(Amplified fragment length polymorphism)指纹图谱分析等方法,研究西农萨能羊间性个体的遗传本质。【结果】间性山羊与正常母山羊的核型一致,为58+XX;间性个体基因组中未能扩增出SRY基因;AFLP指纹图谱分析发现,有9对引物扩增出清晰的条带,共1 833条,片段长度为70～500bp,9对引物的扩增结...
[期刊] 中国农业科学
[作者]
成浩 王丽鸳 周健 刘栩 叶阳 陆文渊
【目的】探索化学指纹图谱在建立绿茶原料品种属性鉴别验证技术方面应用的可行性与潜力。【方法】利用HPLC和信息融合原理,按单一产地和混合产地两种原则,建立根据不同原料品种分组的绿茶样本的多元数字化化学指纹图谱,并采用逐步判别分析技术进行样本的分类判别研究和验证。【结果】采用杭州西湖区、绍兴新昌县和丽水莲都区共3个产地的样本各自建立的单一产地判别函数,其回判正确率、交叉验证正确率和外部验证正确率均为100%;采用8市(县)混合样本建立的判别函数,其回判正确率为99.2%,交叉验证成功率为97.7%,外部验证正确率为100%。【结论】HPLC建立的绿茶多元化学指纹图谱能够较好地表征茶叶样本的品种属性...
关键词：
绿茶 化学指纹图谱 判别分析 品种
[期刊] 林业科学
[作者]
贾会霞 姬慧娟 胡建军 卢孟柱
【目的】对24份杨树种质进行指纹图谱构建、系谱关系鉴定和遗传多样性分析,并进行倍性检测,为杨树新品种鉴定和知识产权保护提供科学的理论依据,同时为杨树的育种工作奠定坚实的基础。【方法】利用TP-M13-SSR技术对24份杨树种质进行指纹图谱构建和系谱关系鉴定。从杨树SSR数据库中选取200对SSR引物,利用遗传背景差异大的4份杨树种质进行引物筛选,选出19对扩增条带清晰、具有多态性且重复性好的引物对24份杨树种质进行扩增,利用Ge XP毛细管电泳对PCR荧光产物进行检测,采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,利用流式细胞术(FCM)进行倍性检测。【结果】19对SSR引物共扩增出102条条...
[期刊] 中南林业科技大学学报
[作者]
廖宏泽 孙曼曼 黄小娟 郝丙青 孙佳星 江泽鹏 王东雪 刘凯
【目的】基于简化基因组，挖掘油茶单核苷酸多态性（SNP）位点，筛选可用于油茶种质鉴定的简化SNP组合位点，构建SNP指纹图谱，建立一种快速准确鉴定广西油茶主栽良种苗木的SNP分子标记方法。【方法】以12个油茶无性系种质的两个重复共24份油茶标准样本为材料，采用ddRADseq流程进行文库构建，使用BWA将过滤后的测序数据比对到已发布的南荣油茶Camellia oleifera var.“Nanyongensis”参考基因组上，利用GATK进行SNP位点筛选，ANNOVAR软件进行SNP位点注释，STRUCTURE软件进行群体结果分析，使用PLINK进行主成分分析；利用R语言，使用条件随机筛选法（CRS），筛选能够区分出油茶种质的最简SNP组合，绘制指纹图谱。【结果】测序数据质量良好，可用于SNP分子标记位点的开发筛选。与参考基因组比对后，共获得622 064个为SNP标记位点，其中无基因型缺失的SNP位点40 147个，多态性信息含量（PIC）大于0.35的SNP位点2 094个，前后60 bp碱基保守无变异的SNP位点共184个。最终筛选出可以将12个油茶无性系种质区分开的15个核心SNP标记位点组合，并以此绘制出SNP指纹图谱。【结论】基于简化基因组，建立了广西主要栽培油茶种质的SNP标记开发和指纹图谱绘制的方法，为苗期油茶种质的快速准确鉴定提供了理论依据和技术指导，助力规范油茶苗木市场，促进油茶产业健康发展。
[期刊] 中国农业科学
[作者]
刘娟 廖康 曼苏尔·那斯尔 孙琪 刘欢 贾杨
【目的】从ISSR分子标记水平分析新疆主栽杏品种(系)的遗传多样性和亲缘关系,构建新疆杏品种(系)的DNA指纹图谱数据库,为杂交育种、品种鉴定和品种分类提供理论依据。【方法】从供试样品中选取表型差异较大的6份材料对100个ISSR引物进行筛选,最终筛选出条带清晰、主带明显、多态性丰富、能够稳定重复且对品种具有较高鉴别力的ISSR特征引物,对48个新疆杏品种(系)进行扩增,采用POPGENE version 1.32软件计算多态性位点数、多态性位点百分率、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),及各材料间的Nei’s遗传相似系数(...
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